Journal
/
Genética
/
Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten

DOI:
10.3791/59635-v

•

11:34 min

•

August 09, 2019

•

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado at Boulder

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Sequentie specificiteit is essentieel voor genregulatie. Regelgevende eiwitten die specifieke sequenties herkennen zijn belangrijk voor genregulatie. Het definiëren van functionele binding sites voor dergelijke eiwitten is een uitdagend biologisch probleem. Een iteratieve benadering voor de identificatie van een bindingsplaats voor een RNA-bindend eiwit wordt hier beschreven en is toepasbaar op alle RNA-bindende eiwitten.

Tags

Sequence SpaceBinding SitesRegulatory RNA-binding ProteinsSaturation MutagenesisProtein-binding SiteDisease DiagnosisTherapyRandom LibraryRNA PoolBinding ReactionHigh AffinitySpecific BindersPCRT7 RNA PolymeraseTranscriptionGel PurificationAutoradiography

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Novel-RNA-bindende eiwitten Isolatie door de snelle Methodologie

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie

-Peptide afgeleide methode om genen en eiwitten Across Cellulaire en organellen Barriers in Planten Transport

Analyse van Cap-bindende eiwitten in menselijke cellen blootgesteld aan Physiological Oxygen Voorwaarden

Retrovirale Scanning: Mapping MLV Integration Sites om de specifieke codespecifieke regio's te definiëren

Real-time analyse van transcriptiefactor bindend, transcriptie, vertaling en omzet globale u gebeurtenissen wilt weergeven tijdens de activatie van de cellulaire

Formaldehyde-bijgewoonde isolatie van regelgevende elementen maatregel chromatine toegankelijkheid in zoogdiercellen

Een roman verzadiging mutagenese aanpak: Macrostap karakterisering van regelgevende proteïne bindend Sites in RNA met behulp van fosforthioaten

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Read Article