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Biochemistry

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JUMPn: Una aplicación optimizada para la agrupación de coexpresión de proteínas y el análisis de redes en proteómica

Article DOI: 10.3791/62796-v • 07:28 min • October 19th, 2021
October 19th, 2021 •
1, 1,2, 2, 2, 2,3, 2, 2, 1,2, 1,2
1Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology, St. Jude Children’s Research Hospital, 2Center for Proteomics and Metabolomics, St. Jude Children’s Research Hospital, 3Department of Computational Biology, St. Jude Children’s Research Hospital

Capítulos

Resumen
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Presentamos una herramienta de biología de sistemas JUMPn para realizar y visualizar análisis de red para datos proteómicos cuantitativos, con un protocolo detallado que incluye preprocesamiento de datos, agrupación de coexpresión, enriquecimiento de vías y análisis de red de interacción proteína-proteína.

Tags

Bioquímica Número 176
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