1. Extraction du collagène des queues de rat
- Placez congelés queues de rat frais dans l'éthanol à 70%.
- Deglove la peau recouvrant avec un scalpel, d'exposer les tendons.
- Bande tendons loin de la queue et sa place dans l'éthanol à 70% pour stériliser.
- Peser les tendons collectées et transfert à l'acide acétique (tendon 1g à 250ml d'acide acétique 0,5 M). Mélanger pendant 48 h à 4 ° C.
- Centrifuger le mélange d'acide tendon / acide acétique à 10.000 g pendant 30 minutes et jeter le culot.
- Ajouter un volume égal de 10% (p / v) de NaCl au surnageant et laisser le mélange reposer une nuit à 4 ° C.
- Recueillir les riche en collagène, couche inférieure insolubles et centrifugat pour une autre 30min à 10.000 g.
- Reprendre le collagène matière riche en acide acétique 0,25 M à 4 ° C et on dialyse contre 1:1000 acide acétique à 4 ° C pendant 3 jours, en changeant le tampon de dialyse deux fois par jour.
- En outre stériliser la solution de collagène par centrifugation (20000 g pour 2h) et stocker à 4 ° C.
- Diluer collagène tel que requis par l'ajout de l'acide acétique 1:1000 stériles à une concentration stock de 1mg/ml.
2. Création Assay 3D
Le test 3D est basée sur un dosage de la lignée cellulaire, publiés précédemment 2.
- Biopsies multiples sont récoltées de patients consentants au moment de la résection chirurgicale curative pour cancer du sein invasif.
- Par les yeux, diviser les noyaux en utilisant un scalpel dans 1mm 3 fragments. Trim et jeter le gras macroscopiquement distincts.
- Plongez les morceaux dans les médias MEGM complète. Le tissu peut être stocké dans cet état jusqu'à 1h.
- Pour créer le gel de collagène, mélanger sur glace 1mg/ml collagène de queue de rat, l'acide filtrée 1:1000 acétique, 10x DMEM/F12 et 0,22 M de NaOH dans un rapport de 3:5:1:1 à créer une concentration de collagène finale de 0,3 mg / ml.
- Injecter 1,2 ml de mélange de collagène dans des puits individuels d'une plaque de 24 puits et la placer dans une étuve à 37 ° C pendant 10min pour initier la gélification.
- Après 10min, enlever la plaque de 24 puits de l'incubateur. Placez les morceaux de tumeur sur le collagène de gélification et délicatement les pousser dans le centre du gel en utilisant une pointe 10 ul pipette. Retour de la plaque à 24 puits à l'incubateur pendant 1 heure.
- Pour les tumeurs ER +, supplément MEGM média complet avec β-estradiol à une concentration de 3.2x10 -10 M. Une fois les tests de gel ont gélifié pour 1h, 1,2 ml introduire prudemment des médias complétées dans chaque puits. La finale β-oestradiol concentration dans le dosage sera s'équilibrer à 1.6x10 -10 M de récapituler les niveaux d'oestrogène physiologiques dans les tissus mammaires 3.
- Exécuter une pointe de pipette 10 ul autour du bord intérieur de chaque puits, libérant chaque gel circonférentiellement, permettant ainsi à chaque gel à flotter librement dans les médias. Retour de la plaque à 24 puits à l'incubateur.
- Bourse complété les médias deux fois par semaine jusqu'à la fin de l'expérience. Fin à l'expérience par la suppression des médias et en ajoutant un fixateur de formol.
3. Coloration des anticorps du dosage dans la préparation de la tomographie optique de projection
Nous avons adopté une méthode précédemment publiée pour 4 échantillons coloration entier.
- Lavez le formol échantillons fixés pendant 30min dans du PBS. Déshydrater les gels par étapes dans le méthanol dilué dans du PBS contenant 0,05% de Tween 20 (0,05% PBST): 33%, 66% et 100% pour ≥ 15min à chaque étape.
- Incuber les tissus fraîchement préparés MeOH: DMSO: 30% H 2 O 2 à un ratio de 02:01:03 (15% v / v H 2 O 2) à température ambiante pendant 24 heures pour étancher l'autofluorescence.
- Lavez échantillons à deux reprises pour 30min dans le méthanol. Congeler les échantillons à -80 ° C à cinq reprises au moins 1h à chaque fois et revenir à température ambiante (TA) pour s'assurer que les antigènes dans les parties les plus profondes du tissu sont rendus accessibles.
- Réhydrater les tissus Retour à PBST 0,05% avec du méthanol comme diluant (33%, 66% et 100% pour 15min à chaque étape).
- Bloquer le tissu dans une solution de blocage (10% de sérum dans le PBST 0,05%) pour 24 heures.
- Incuber le tissu avec l'anticorps primaire afin d'identifier le contenu épithéliales, en utilisant de lapin anti-cytokératine à une concentration de 1:500 dilué dans 1,5 ml de solution de blocage contenant 5% de DMSO pour 48h.
- Lavez échantillons quatre fois avec PBST 0,05% pendant 30 minutes chacun.
- Incuber le tissu avec fluorescentes anticorps secondaire (1:100 chèvre anti-lapin Alexa555), dilué dans une solution de blocage 1.5ml contenant du DMSO 5% pour 48h.
- Laver les échantillons à nouveau avec 0,05% PBST quatre fois pendant 30 minutes chacun.
4. Tomographie optique de projection
La tomographie optique de projection est une technique de microscopie précédemment développés pour produire des images haute résolution en 3D de spécimens biologiques fluorescentes avec une épaisseur allant jusqu'à 15 millimètres 5.
- Montez le scontenue dans un gel à 1% d'agarose à faible point de fusion et déshydrater dans le méthanol à 100% pour 24 heures. Effacer le spécimen à Babb solution (01h02 alcool benzylique, le benzoate de benzyle) pour 48h et de numérisation en utilisant le scanner OPT 3001M (Bioptonics).
- Les deux cibles et autofluorescence sont capturés en utilisant l'ensemble Cy3 filtre (l'excitateur 545nm/30 nm, émetteur 610/75 nm) et GFP1 ensemble de filtres (d'excitation 425nm/40 nm, émetteur LP475 nm) respectivement.
5. Reconstruction 3D et la quantification
- L'ensemble des projections angulaires acquises par l'OPT peut être reconstituée à l'aide du logiciel NRecon (SkyScan) pour créer une série de tranches de section transversale à travers l'analyse d'invasion. Ce logiciel est disponible au téléchargement gratuitement à http://www.skyscan.be/products/downloads.htm .
- Analyser les données reconstruites en utilisant le logiciel Volocity (PerkinElmer). Logiciel de démonstration gratuite est disponible pour téléchargement à http://www.cellularimaging.com/products/Volocity/demo/ .
- Afin de quantifier le volume épithéliales par coloration cytokératine, fixer un seuil minimum d'intensité de voxels pour réduire les interférences de la fluorescence de fond dans le canal cible. Nous avons défini ce seuil empiriquement à 9000 UA utilisant une liste de paramètres disponibles dans l'application de mesure, nous avons quantifié le volume de l'épithélium en continuité avec le noyau originel (délimitées dans le canal autofluorescente). Cela nous a permis de quantifier les volumes d'excroissance épithéliale entre les différents échantillons tumoraux.
6. Les résultats représentatifs:
Pendant le développement de l'analyse, un total de 52 cancers du sein biopsies avec une large gamme d'histopathologie ont été utilisés. Parmi ces <10% (5 / 52) a omis de fournir au moins un dosage d'invasion viable. L'échec de dosage a été due à des bactéries soit supra-infection ou d'insuffisance matérielle biopsie tumorale. Par conséquent l'application du test n'est pas limité à un sous-type spécifique de cancer du sein.
Dosages typiques (figure 1) fixée au bout de 20 jours en culture de collagène et ensuite colorées pour la cytokératine. Logiciels Volocity est capable de reconnaître à la fois la plus grande partie épithéliale continue avec le noyau originel et les groupes détachés d'envahir les cellules et quantifier chaque volume séparément.

Figure 1 Invasion des dosages. Après la fixation et à la quantification. Le test prend en charge les échantillons obtenus à partir de plusieurs sous-types de cancer du sein: a) ER + b) HER2 + et c) ER-.