Summary
Nöronal öncülerin in vitro lentiviral mühendisliğine dayanarak, vahşi tip beyinleri ve "test" ve "kontrol" türevlerinin eş-transplantasyonu, bu yöntem, neokortikal in vivo gen kontrolünde doğru modelleme sağlar basit ve ekonomik bir şekilde nöron morfoloji.
Abstract
Nöronal sitanmiminin gen kontrolü Şu anda yoğun soruşturmanın konusu. Burada tarif edilen, neokortikal projeksiyon nöron morfolojisinin in vivo gen kontrolünü incelemek için geliştirilen basit bir yöntemdir. Bu yöntem, (1) "test" ve "kontrol" hücreleri olarak nöronal öncülerin in vitro lentiviral mühendislik dayanmaktadır (2) vahşi tip beyinleri içine onların Co-transplantasyonu, ve (3) onların nöronal türevleri eşleştirilmiş morfometrik değerlendirilmesi. Özellikle, e 12.5 pallial öncüleri panneuronal, genetik olarak etiketlenmiş bağışçılar, bu amaçla istihdam edilmektedir. Bunlar, seçilen organizatör ve Teton/off teknolojisinin avantajlarından yararlanmak için tasarlanmıştır ve onlar yenidoğan lateral ventrikül içine serbest el nakledilir. Daha sonra, alıcı beyinleri immünofluorescence profil üzerine, nakledilen nöronların siluetleri NeurphologyJ açık kaynaklı yazılım içine beslenir, onların morfometrik parametreleri ayıklanır, ve ortalama uzunluğu ve dallanma endeksi hesaplanır. Diğer yöntemlerle karşılaştırıldığında, bu üç ana avantaj sunar: uygun maliyetlerde transgen ifadesinin ince kontrolünü elde etmesini sağlar, sadece temel cerrahi becerileri gerektirir ve sınırlı bir analiz üzerine istatistiksel olarak güvenilir sonuçlar verir hayvan sayısı. Onun tasarımı nedeniyle, ancak, nöromimarlık non Cell-otonom kontrol adrese yeterli değildir. Dahası, tercihen nöronal göç tamamlandıktan sonra nörit morfoloji kontrolünü incelemek için kullanılmalıdır. Şu anki formülasyonunda, bu yöntem glutamatergik neokortikal nöron mimarisinin gen kontrolünü incelemek için zarif bir şekilde ayarlanmıştır. Diğer belirli nöral hücre türlerinde EGFP ifade transgenik hatları yararlanarak, kendi mimarisi gen kontrolünü ele almak için yeniden yapılabilir.
Introduction
Burada, nöronal sitonyonunda in vivo gen kontrolünü incelemek için geliştirdiğimiz basit bir yöntem açıklanmaktadır. Nöronal öncülerin in vitro mühendisliğine dayanarak, yenidoğan beynine nakli ve "test" ve "kontrol" hücrelerinin eşlenmiş morfometrik değerlendirilmesi, test genlerinin fonksiyonel etkilerini, nöronal morfolojinin ince kontrolünde bir hızlı ve uygun fiyatlı bir şekilde. Nöronal mimarinin in vivo gen kontrolünü araştırmak için, üç önemli teknik sorun ele alınmalıdır: (1) yeterince desenli gen-of-faiz (GOı) ifade ve doğru bir nicel kontrolü elde; (2) farklı nöronal siluetlerin düzgün segmentlenmiş görselleştirme elde etmek; (3) hayvanların sınırlı sayıda istihdam ederken sonuçların istatistiksel önemi eliciting.
Mevcut olduğunda, tetrasiklin (Tet) kontrollü transgenler taşıyan fare mutant hatları ilk sorunu gidermek için en iyi araç olabilir1. Alternatif olarak, somatik nakliyle istihdam edilebilir. Bu gibi durumlarda transgeni Elektroporasyon2 veya viral dönüştürücü3ile teslim edilir. Sonra, bir episome olarak korunur (örneğin, standart Elektroporasyon4), ya da GENOMA entegre edilmiştir (rasgele, retroviral integrase5ile; veya tanımlanmış bir konumda, Crispr tarafından terfi Homolog rekombinasyon (slendr)6 ).
İkinci olarak, nöronal siluet görselleştirme (a) seyrek üniforma etiketleme veya (b) yoğun diferansiyel etiketleme yoluyla elde edilebilir. Seyrek etiketleme gelince, gelişmiş Golgi benzeri metodolojiler istihdam edilebilir7, seçilmiş nöronal minisetler biocytin tarafından doldurulabilir8, ve tuz-ve-biber etiketleme seyrek ifade transgeni sayesinde elde edilebilir. Böyle bir transgeni (THY-EGFP)9 ya da Stokastik rekombinasyon (Morf)10tarafından aktive edilebilir alacalı transkripsiyon gösterebilir. Gibi (b), devlet sanat stratejileri bir multi-floxed fluoroprotein transgene dizi içinde CRE-aracılı Stokastik rekombinasyon içerir (bRainbow)11, flororoprotein genler piggyBac-transposaz odaklı genomik entegrasyonu yanı sıra, daha önce somatik nakliyle (klon)12ile teslim edilir.
Üçüncü konuya gelince, morfometrik sonuç genellikle büyük bir rasgele değişkenlik etkilenir, hayvan farklılıkları ve hücre enjeksiyon olasılıklardan kaynaklanan. Bu nedenle, çok sayıda hayvan genellikle GOı morfometrik aktivite değerlendirmek için gerekli istatistiksel güç elde etmek için istihdam edilir.
Daha önce açıklanan yaklaşımlar genellikle gelişmiş teknik becerilere güveniyor ve bilimsel toplumlarda difüzyon sınırlarını sınırlayabilen göze çarpan finansal kaynaklara ihtiyaç duyar. Bu sorunları aşmak için, biz hızlı ve uygun bir şekilde nöromimarlık in vivo gen kontrolünü parçalamak için kolay ve basit bir boru hattı tasarlanmış. Bu, daha önce antiblastik transgen aktivitesi13' ün hızlı in vivo değerlendirilmesi için geliştirilen benzer bir ortak transplantasyon tasarımından esinlenilmiştir.
Özellikle, in vitro mühendislik "yeşil" sinir öncüleri ("test" ve "kontrol" hücrelerinin) bir "siyah" alıcı yenidoğan beyin içine Co-transplantasyonu aynı anda yukarıda listelenen üç önemli sorunları düzeltebilirsiniz düşünülmektedir. Aslında, iyi kontrollü koşullarda, precursors In vitro lentiviral mühendislik, en az, genellikle in vivo somatik manipülasyonlar ile ilişkili nöronal transgen ifade değişkenlik bakım sağlar (daha önce gerçekleştirilen 14 , 15 ve bizim yayımlanmamış sonuçlar). Gen ifadesinin elde edilen doğru kontrolü, Tet kontrollü transgenik modellerde elde edilen ile karşılaştırılabilir. Ancak, bu prosedürün maliyetleri, transgenik fare çizgisinin bakımından kaynaklanan bunlardan çok daha fazladır. Sonra, serbest hücre enjeksiyonu kolaydır ve minimal eğitim gerektirir. Dahası, her beyne enjekte etiketli öncülerin miktarı kolayca seyrek dağıtılmış öncüleri yeterli birikimli sayısı elde etmek için ayarlanabilir, aynı zamanda en az nakledilen hayvanların toplam sayısını tutarak. Son olarak, Co-enjeksiyon farklı Fluoro etiketli, "test" ve "kontrol" öncüleri ve sonuçların sonraki ikili istatistiksel analiz, inter-hayvan deneysel değişkenlik etkilerini karşı, ulaşmasına izin sonuçlar istatistiksel önemi, bireylerin sınırlı sayıda Analizi bile13.
Bu, hızlı ve ucuz olsa da, bu yöntemin iki ana sınırlamalara sahip olduğu vurgulanmalıdır. İlk olarak, nöronal mimarinin hücre otonom gen kontrolünü araştırmak için tasarlanmıştır ve çevre kontrolünü ele almak uygun değildir. İkinci olarak, nakledilen nöronal öncüleri heterokronik bir program ile son konumuna ulaştığınızda, bu yöntem geçmiş göç tamamlanma oluşan nöromimarilik kontrolü modeli için tercih edilir.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
Burada açıklanan tüm yöntemler ve prosedürler SıSıS Organizmo preposto al Benessere Animale (SıSAM ıERUC) tarafından onaylanmıştır.
1. Mühendislik "yeşil" progenitör havuzları üretimi
- "Yeşil" havuzun hazırlanması
- Mate bir Wild-tip CD1 kadın bir MtaptEGFP/+ kurucusu16. 12,5 gün Post-coitum (gün 0 vajinal fiş denetimi ile belirlenir) ve embriyonik gün 12,5 (e 12.5) embriyolar hasat servikal çıkığı tarafından hamile baraj euthanize. Soğuk PBS solüsyonlarında 24 multiwell plakanın bireysel kuyularında ayarlayın.
- Hızlı bir şekilde, mavi ışık lambası altında görsel muayene ile embriyolar genotip, beyinde yeşil floresan emisyon kontrol.
- % 0,6 glikoz ile soğuk 1x PBS dolu 10 cm çap Petri çanak içine "yeşil" embriyo yerleştirin ve bir stereomicroscope altına aktarın.
- Standart makas kullanarak embriyo kafaları kesip #3 ve #5 forseps yoluyla onlardan telencephalon ayıklamak.
- İki telensefalik vezikülleri ayırın ve forseps kullanarak neokortikleri çıkarın; Hippocampus ve bazal ganglionlar kaldırmak için emin olun17.
- Bir P1000 pipet ile bir 1,5 mL tüp buz üzerinde tutulan içine aktararak neokortikler toplayın.
- Disseke neokortikler tüp altına yerleşmek edelim.
- Süpernatant mümkün olduğunca aspirate.
- Yeni proliferatif Orta 400 μL içinde neokortikat resuspend [dmem-F12, 1x glutamax, 1x N2, 1 mg/ml Sığır serum albümin (BSA), 0,6% glikoz, 2 μg/ml heparin, 20 ng/ml temel fibroblast büyüme faktörü (bFGF), 20 ng/ml epidermal büyüme faktörü (EGF), 1x pen-strep, ve 10 pg/ml Amfoterisin B].
- Bulutlu bir hücre süspansiyonu elde etmek için bir uç başına, P1000, P200 ve P20 ipuçları ile ardışık olarak, neokortikleri yukarı ve aşağı hafifçe pipet.
Not: E 12.5 neokortikal doku çok yumuşak; tek hücrelere bunalımları tüm enzimatik sindirim gerektirmez; tekrarlanan pipetleme yeterlidir. - Menenjlerin ve kalıntı neokortikal kümeleri 2 dakika boyunca yerleşmek edelim.
- Transfer 150 μL hücre süspansiyon üst (ağırlıklı olarak tek hücreler içeren) yeni bir 1,5 mL steril tüp içine.
- Ekle 150 yeni proliferatif orta μL ve 1.1.10-1.1.12 daha fazla doku kümeleri belirgin olana kadar adımları tekrarlayın. Bunu yaparken, P1000 pipetleme adımını (adım 1.1.10) atlayın.
Not: 1.1.10-1.1.12 adımlarının üç yineleme genellikle tam doku dissociation elde etmek için yeterlidir. - BüRkEr odası17 ' de tripan mavi dışlama yöntemiyle hücreleri sayma ("yeşil" havuz) ve konsantrasyonu 103 hücreye/μL 'ye ayarlamak için taze proliferatif ortam ekleyin.
Not: adım 1.1.7-1.1.14,% 70 etanol tarafından dezenfekte edilmiş steril bir laminar akış kaputu altında yapılmalıdır ve en az 20 dakika boyunca havalandırılmış tutulmalıdır.
- "Yeşil" alt havuzları mühendislik
- İki ayrı 1,5 mL tüpler lentiviral enfeksiyon için iki alt havuzları içine "yeşil" havuzu alt bölümlere ayırın.
- İki adanmış lentiviral karışımları ile bağımsız olarak alt havuzları bulaştırmak. Her Mix "kırmızı etiket" virüs (Pgk1_mCherry) veya "siyah" virüs (pCAG_lacZ) bir kontrol olarak, yanı sıra tetOFF tahrik transgene (Pgk1p_tTA ve TRE_transgene) veya kontrol (Pgk1p_tTA ve TRE_PLAP) ifade için virüsler içerir.
DIKKAT: BLS-2 ortamında lentivirüsleri geçerli kurallar ve yasalar tarafından reçete edilen tüm koruyucu ölçümlerle değiştirin.
Not: her Lentivirus, (önceden gösterilen14) bu tür deneysel koşullarda nöral hücrelerin büyük çoğunluğunu vermek için yeterli olan 8 ' lik bir ENFEKSIYONUN (MOI) çokluğu ile yönetilmelidir (Şekil 1). Lentivirus kullanan Tet transaktipiyatörler, tTA/rtTA ifadesi (örn., pTα1, pSyn, Pcamkıa, pGAD1, vb.) sürüş farklı nöronal promotörler istihdam ederek inşa edilebilir (Şekil 2). MOı (a) ' nın (b) hedef hücrelerinin sayısına teslim edilen enfeksiyöz viral partiküllerin sayısına oranıdır. Burada, eski (a)14başka bir yerde açıklanan geleneksel prosedüre göre hesaplanır, ikincisi (b) sadece bir BüRkEr odası kullanılarak değerlendirilir. - Plaka 600.000, 2 μg/mL Doksisiklin ile proliferatif orta 600 μL olarak, 12 multiwell plaka başına her enfekte alt havuz hücreleri.
Not: burada, kuyuları Poly-lizin ile önceden tedavi edilmez, hangi kendi diplerine nöral hücre eki önler. - 37 °C ' de% 5 CO2 ' de hücreleri inkükoye aktarın.
- 2 gün sonra, enfeksiyonun verimliliğini ve mühendislik havuzlarının diferansiyel işaretlemesi değerlendirmek için, geleneksel floresan mikroskop altında hücreleri inceleyin. İki alt havuzlar küçük nörokürlerin süspansiyonları olarak görünür, homojen kırmızı floresan protein ifade ("kontrol" örnek) ya da değil ("test" örnek). Bu nöroküreler içinde, MtaptEGFP transgeni bir hücre azınlığı (sonrası mitotik nöronlar) ile sınırlıdır ve bunların çoğunda sessiz (proliferasyon Öncüller) (Şekil 3).
2. cerrahi enstrümanların ve çalışma alanının ayarlanması
-
Borosilikat iğneler hazırlanması
- Sırasıyla 1,5 mm ve 1,12 mm 'lik dış ve iç çaplı borosilikat cam kapillarlerini kullanın.
- Bir P 1000 çektirme ile kapiller çekin.
- Çekme programını ayarla. Tipik program parametreleri şunlardır: ısı = 614; Vel = 60; zaman = 1; basınç = 600. Onlar çektirme modeli ve Isıtma direnci istihdam göre ayarlanması gerekir.
- Kapiller çektirme tutucular yerleştirin ve onları sıkın.
- Programı başlatın ve iki çekti mikrokapillaries alın.
- Harici çapı ~ 200-250 μm ile bir ipucu elde etmek için stereomikoskop altında, bir neşter ile, el ile kılcal ucu kes.
- Kapiller bir modelleme kil (örn., plastikin) kapalı bir petri tabak destek ve kaput altına aktarmak yerleştirin.
-
Kapağı kurma ve hücre izleyici çözümünü hazırlama
- Yatay Akış kaputu dikkatle temizleyin ve% 70 etanol kullanarak dezenfekte edin.
- % 70 etanol kullanarak optik lifleri dezenfekte edin ve kaput altına yerleştirin.
- "Hücre izleyici çözümünü" hazırlamak ve kaput altına yerleştirmek için 10 μL 125 mM EGTA çözeltisi ve 10 μL Fast Green karıştırın.
- Hücre süspansiyon tespit için laboratuvar sızdırmazlık filmi (4 cm x 2 cm) küçük parçalar kes.
- 1 mg/ml steril doksisiklin çözeltisi hazırlayın ve 0,3 ml şırınga içine Aspire.
- Kaputu açın ve operasyondan önce 20 dakika boyunca laminar akışını tutun.
-
Enjeksiyon tüpünün montajı
- Sabit plastik bir ağızlık, iki lateks tüpler (her biri 30 cm uzunluğunda) ve kalibre edilmiş mikrokapiller pipetler için bir aspiratör tüp montaj kiti bir kapiller tutucu alın.
- Sert plastik ağızlı bir lateks tüp bir ucunu düzeltin.
- Başka bir lateks tüpün bir ucuna kapiller tutucu düzeltin.
- Operatör mikropları karşı bir bariyer olarak, bir 0,45 μm steril filtre ile iki lateks tüpler serbest uçları bağlayın.
- Elde edilen aspiratör tüp aksamını, başlık altında tutulacak bir modelleme kil tutucusuna yerleştirin.
3. hücre karışımı ve intraventriküler transplantasyon
- "Test" ve "kontrol" yeşil hücre alt havuzları karıştırma
- Toplamak "test" ve "kontrol" nörokürler (adım 1.2.5 bakın) ayrı 1,5 mL tüpler.
- Santrifüjler, 5 dakika 200 g 'de süspansiyon
- Toplamak ve hücre Pellet rahatsızlık kaçınarak, supernatant atın.
- 500 μL 1x PBS 'de yavaşça pelletini nörokürler.
- 1 dakika için 200 g 'de Santrifüjü.
- Süpernatant çıkarın.
- 3.1.4 adımları yineleyin-3.1.6 iki kez daha.
- 200 μL 2x tripsin çözeltisi (2x tripsin, 1x PBS) ve pipet hücresi Pelet yukarı ve aşağı 4X-5x yavaşça pelletini küreler.
Not: hava kabarcıkları yapmak için dikkat edin. - Tek hücreli süspansiyon elde etmek için 37 °C ' de 5 dakika boyunca kuluçte hücreleri bırakın.
- 200 μL tripsin inhibitörü çözeltisi ile blok tripsin (DMEM-F12, 10 μg/mL DNAse ı, 0,28 mg/mL tripsin inhibitörü) yukarı ve aşağı 4X-5x pipetleme ile.
- 5 dakika için 200 x g 'de santrifüjler ve 1 ml taze proliferatif Orta (dmem-F12, 1x glutamax, 1x N2, 1 mg/ml BSA, 0,6% glikoz, 2 μg/ml heparin, 20 ng/ml bFGF, 20 ng/ml EGF, 1x kalem strep, 10 pg/ml Amfoterisin B).
- BüRkEr odasında tripan mavi dışlama yöntemiyle iki havuzun hücrelerini saymak.
- Proliferatif ortamdaki Cells/μL 100.000 için konsantrasyonlarını ayarlayın.
- Mix 1:1 "kontrol" olanlar ile "test" hücreleri.
- Karışımı iki havuzların tek hücreli bir süspansiyon olduğundan emin olmak için Floresan Mikroskobu (objektif büyütme: 10X) altında elde edilen karışımı kontrol edin (Şekil 3c).
- Karışımı kaput altında buz üzerine yerleştirin.
- İntraventriküler transplantasyon
- Kafesi anne ve P0 yavruları ile cerrahi operasyon alanından uzak bir masada hazırlayın.
- Kaput yakın bir sepetinize bir kurtarma kafesi yerleştirin.
- Kurtarma kafesi altındaki annenin kafesinden alınan talaş karışımı koyun ve bir lamba altına yerleştirin.
- Bir kenara, P0 pups anestezi için bir alüminyum folyo ile kaplı bir buz kutusu ayarlayın.
- Transplantasyondan hemen önce, 1/10 hacim (adım 2.2.3) hücre süspansiyonunun 1 hacmine (adım 3.1.16) ve sonuç olarak 3 μL 'den oluşan "enjeksiyon karışımı" nın bir parça laboratuar sızdırmazlık filmi üzerine ekleyin.
- 1 dakika boyunca serin alüminyum folyo üzerinde PUP yerleştirin ve tam anestezize olduğunu kontrol edin.
Not: anestezi onaylamak Için, yavaşça bir pençe sıkmak ve hareketleri eksikliği için PUP izlemek, hala nefes alırken. - Bu arada, 3 μL enjeksiyon karışımı (adım 3.2.5) cam kapiller içine Aspire.
- % 70 etanol ile anestezili yavru kafasını yavaşça silin.
- Açıkça kortikal yarımküreler tanımlamak için optik fiber ucunda yavru 's çene yerleştirin.
Not: at P0-P1, baş cilt çok ince, sadece gözbebekleri üzerinde ve koku ampuller arkasında hemheres basit görsel kimlik için izin. - İki orta parasagittal düzlemlerden biri (sol veya sağ), koku ampul yukarıda (adım 3.2.7 içinde açıklandığı gibi) kapiller tutun ve gözbebekleri merkezleri içeren frontal düzlem ile kesişiminde alın Cilt delinme. Kan damarlarına zarar vermemek için dikkat edin. Frontal korteks içine kapiller girin ve ventriküler boşluğa erişim (Şekil 4A).
- Ganglionik Kardinal 'in kazara zarar görmesini önlemek için, iğneyi 30 derece yanal olarak döndürün, ucu caudal-mediel-Ward ' ı (Şekil 4b) işaret ediyor.
- Hücreleri yavaşça ventriküler boşluğa enjekte eder ve hızlı yeşil (Şekil 4c) ile difüzyonlarını izleyin.
- Bekleyin 5-10 s.
- Hücre süspansiyonunu Aspire değil, uygun bir bertaraf kutusu içinde atmak için dikkat çekerken cam iğne çıkarın.
- Anestezi önce PUP kurtarma enjekte 150 enjitoneally trangen ifade hala kapalı transplantasyon sonra tutmak için doksisiklin çözeltisi μL.
- Enjeksiyon sonra, kurtarma için lamba hemen altında PUP yerleştirin.
- 5-10 dk için lamba altında pups bırakın ve, bir kez tam uyanık, Anne ile kafese yerleştirin.
- Anne onları kabul emin olmak için, 2-3 h için işletilen pups gözlemlemek.
- 0,5 mg/mL doksisiklin ve 50 g/L sakaroz içeren içme suyu ile kafes tedarik transgen ifade kapalı korumak için.
- Doksisiklin içeren suyu, transplantasyondan sonraki 4 gün sonra doksi içermeyen suyla değiştirin, böylece sonrası mitotik nöronların transgeni aktive edilir. 6 gün boyunca bir Doxy-Free rejimde fareler tutun ve onları ötenize ile P10 karbon dioksit inhalasyon tarafından takip debelasyonu.
4. nakil beynin Analizi
-
Histoloji ve immünofluoresesans
- Nakledilen yavruları, karbon dioksit inhalasyonu ile hücre nakli yapıldıktan 10 gün sonra deptübasyon sonrasında ötenize eder. 4 °c ' de gece 4% civarında formaldehite (PFA) içinde ötenize yavruları düzelt.
DIKKAT: PFA son derece zehirlidir; bir kimyasal duman kaputu altında, kesinlikle üreticinin reçeteleri ile uyumlu, bakım ile ele; etiketli bir atık kabında PFA çözeltisi kalıntılarını atabilirsiniz. - PFA çözümünü çıkarın ve% 30 sakaroz çözeltisi ile değiştirin.
- Beyni 4 °C ' de ya da şişenin dibine kadar batırıncaya kadar bırakın.
- Bir tek kullanımlık gömme kalıp içine beyin transfer yaklaşık yarı Cryo-dahil orta dolu.
- Dahil edilen beyinleri-80 °C ' de dondur.
- Kesme 60 μm kalın koronal bölümler bir kriyostat kullanarak.
Not: Bu tek nöronların tüm mimarisi ile ilgili kabul edilemez bilgi kaybına neden olabilir, daha ince bölümler istihdam kaçının. - İmmünofluorescence için proses bölümleri18,19, Anti-Gfp kullanarak [1:400] ve anti-RFP (MCherry) [1:500] antikorlar. 1 mg/mL DAPı çözeltisi ile karşı leke çekirdekleri [1:200].
- Nakledilen yavruları, karbon dioksit inhalasyonu ile hücre nakli yapıldıktan 10 gün sonra deptübasyon sonrasında ötenize eder. 4 °c ' de gece 4% civarında formaldehite (PFA) içinde ötenize yavruları düzelt.
-
Morfometri
- Konfokal mikroskobun çalışma parametrelerini aşağıdaki gibi ayarlayın: z-yığın yüksekliği = 40 μm; Adım = 2 μm.
- GFP pozitif nöron zengin fotoğraf alanları, RFP sinyal dağılımı kör seçerek immünassayed dilimleri resimleri toplayın.
- Görüntüleri. ND2 dosyaları olarak dışa aktarın.
- En fazla Z-projeksiyonları. tiff dosyaları (Şekil 5A) olarak oluşturun.
- Hücre Genotype için alt sıralı nöronal çerçeve yapısı çıkarma kör izin vermek için, kırmızı sinyali gizlemek. Bunu yapmak için, her. tiff dosyasını uygun bir yazılım ile açın ve bir ayarlama katmanı ekleyin. "Seviyeleri", "kırmızı" seçin ve sonra "çıkış" sıfırı ayarlayın. Dosyayı böyle kaydedin.
Not: Iskeletonization daha sonra orijinal düz kırmızı dosyalara önceki erişimi olmayan yeni bir operatör tarafından gerçekleştirilir. - Her gizli kırmızı dosya için, birincil görüntüye bir çizim katmanı ekleyin ve Kalem aracını (beyaz renk) seçin. GFP sinyal temelinde Soma iz, sonra nöronlar iz.
Not: kalem aracı Soma için 40 piksel ve neurites için üç piksel olarak ayarlanabilir. - Nöronal siluetler de dahil olmak üzere çok katmanlı dosyayı kaydedin (Şekil 5B).
Not: nöronal iskelet sonraki Analizi her iki operatör tarafından gerçekleştirilebilir. - Yeni bir 1024 x 1024 16-bit gri tonlamalı dosya siyah arka plan, bir nöron başına oluşturun.
- Tek nöronal silüetleri birincil görüntüden yeni gri tonlamalı dosyaya kopyalayın ve yapıştırın. Çok katmanlı dosyaya geri dönün ve nöronal genotürleri açığa çıkarmak için ayarlama katmanını kapatın. 16-bit gri tonlamalı dosya karşılık gelen nöronal Genotype açıklama kaydedin.
- Imagej tek tek ile gri tonlamalı görüntüleri ithalat ve ımagej yazılımı NeurphologyJ eklentisi tarafından iskelet analiz20 (Şekil 5c).
- Nörophologyj birincil verileri kopyalayın (neurite_length, attachment_points ve uç noktalar; her biri için "Toplam alan" değerlerini alın), bir elektronik tabloya yapıştırın ve ikincil morfometrik parametreleri hesaplamak için bunları kullanın ( Ortalama nörit uzunluğu, dallanma indeksi) (Şekil 5D).
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Prosedürün temel yönleri hakkında yararlı bilgiler sağlayan beş birincil veri kümesi vardır, ilk varlık (1) nöral öncülerin iletim ve lentiviral vektörler ile ortak Dönüştürücüsü verimliliği. (2) "test gen" sürücü için istihdam organizatörler temel özellikleri bir örnek. (3) transplantasyon için hazır tasarlanmış hücreler örneği. (4) yenidoğan beynin içine hücre Mikroenjeksiyonu anahtar usul detayları da dahil olmak üzere bir karikatür. (5) tüm morfometrik boru hattının bir özeti.
(1) olarak, farklı Moıs teslim prototip lentiviral vektörler yeteneği (2, 4, 8) etkili bir şekilde neokortikal öncüleri transduce değerlendirildi. İlk testte, erken vahşi tip neokortiden kaynaklanan nöral öncüleri bir lentiviral muhabiri tarafından enfekte edildi, mCherry kodlama dizisi (CD 'ler) neuronogenic-Lineage özgü pTα1 Promoter kontrolü altında, MOI = 2, 4, 8, sonra ayırt etmek için izin. MCherry ve Pan-neuronal Marker Tubb3 için kendi progenlerinin Co-immunprofiling nöronların etkili frekans% 64, 69% ve% 78, sırasıyla transed olduğunu gösterdi (Şekil 1a). İkinci bir tahlil olarak, neokortikal öncüleri akut iki lentiviral muhabirler tarafından, EGFP ve MCherry ifade, kurucu pPgk1 Promoter kontrolü altında, mois = (2, 2), (4, 4), ve (8, 8). Birkaç gün sonra, türevlerinin Co-immunprofil oluşturulması, EGFP+MCherry+ ve EGFP+MCherry± hücreler arasındaki oranın sırasıyla% 80,% 88 ve% 93 olduğunu gösterdi (Şekil 1B). Bu veriler, bu çalışma için öngörülen mühendislik protokolünün teslim üzerine, (a) nöronların büyük çoğunluğu dönüştürücü, ve (b) neredeyse tüm transkif nöronlar kendi karakterizasyonu için gerekli tam lentiviral set aldı öneririz.
Şekil 1 : Lentiviral vektörler tarafından nöral habercisi hücrelerinin transksiyon verimliliği. Paneller, e 12.5 neokortikal habercisi hücrelerinin (veya Co-dönüştürücü) enfeksiyon farklı çeşitlilikler özel lentiviral gazetecilerin teslim üzerine (moıs) aktarılmış olduğu verimliliği bir değerlendirme rapor. Eski durumda (A), hücreler akut ile enfekte edildi Lentivirus (LV) ptα1-MCherry at MOI = 2, 4, 8, proliferatif ortamda kültürlü 2 gün, farklılaştırıcı orta transfer, ve ayırt etmek için izin 1 hafta. Günlük in vitro (DıV) 9 ' da sabitleme üzerine, kültürler mCherry ve Pan-neuronal Marker Tubb3 için Co-immunoprofillenmiş idi. mCherry ve EGFP sinyalleri Anti-RFP ve anti-EGFP primer antikorlar tarafından tespit edildi ve Alexa-594-ve Alexa-488-konjuli ikincil antikorlar ile ortaya çıktı. Son olarak, mCherry+Tubb3+/mCherryTubb3+ oranları hesaplanan, ortalamalı ve karşılık gelen moıs karşı çizilir. İkinci durumda (B), hücreler akut iki Lentivirus bir 1:1 karışımı ile bulaşmış, kurucu aktif ppgk-MCherry ve ppgk-EGFP transgenes için kodlama, farklı mois (2, 4, 8 her virüs için). Hücreler proliferatif ortamda 4 gün boyunca kültürleşmiş, tripsinize ve, fiksasyon üzerine, mCherry ve EGFP immünofluorescence için profilli yukarıda. Son olarak, mCherry+EGFP+/mcherryegfp+ oranları hesaplanan, ortalamalı ve ilgili moıs karşı çizilmiş. Hata çubukları S.E.M. lütfen bu rakam daha büyük bir sürümünü görüntülemek için buraya tıklayın temsil eder.
(2), pTα1 ve pSyn aktivite desenleri gelince onların kontrolü altında flororoprotein genler ifade profilleri temelinde ortaya olabilir. Bu örnekte, bu tür kontrol mCherry (Şekil 2a) ve dolaylı olarak [yanı, EGFP (Şekil 2B, C, D) durumunda, Teton Ikinci nesil arayüzü (Şekil 2e)] tarafından aracılaşılır. Her iki Organizatör Tubb3+ postmitotik nöronlar (Şekil 2B, C, D) Içinde özellikle etkindir, ancak ptα1 Ayrıca Ki67+ intermitotik (neuronogenic) öncülerinin bir alt kümesinde yangınlar (Şekil 2a). Burada, hücreler bu standart koşullara göre tasarlanırken (Şekil 2E), Ptα1-ve psyn-DRIVEN EGFP ifade seviyeleri içinde Tubb3+ nöronlar tarafından nicelleşmiş organizatörün aktivite sınırlı değişkenlik bir fikir sağlamak için Photoshop CS6 histogram eklentisi. Daha sonra ham veriler medyan karşı normalleştirilmiş ve rehberleri karşı çizilen (Şekil 2F). Son derece, tek hücreli floresan seviyeleri yoğun medians etrafında kümelendirilmiş: ilk ve üçüncü Çeyrekler egale 0,86 ve 1,16, yanı sıra 0,89 ve 1,12 ptα1 ve psyn durumlarda, sırasıyla.
Şekil 2 : GOı overexpression sürücüsüne uygun nöral öncü türe özgü promotörleri profil oluşturma. Paneller tubulin Alfa 1 (pTα1) ve Synapsin (pSyn) Promoters, özellikle tüm nöronal sırtı ve postmitotik nöronlar içinde, sırasıyla aktif karakterizasyonu bakın. Farklı embriyonik (En) çağlarda hasat edilen neokortikal öncülere test yapıldı, akut özel lentiviral karışımları ile enfekte [ptα1-MCherry in (A); ptα1-rtta, tret-EGFP içinde (B); psyn-rtta, tret-EGFP in (C, D); 2μg /ml Doxy AB Initio] ve proliferatif Orta (A), proliferatif (2 gün), farklılaşıcı Orta (B, C) veya Farklılaşıcı (D) orta ile kültürlü. Gün in vitro (DIV) n'de fikmasyon yapıldıktan sonra αTubb3 ve intermitotik öncüleri αKi67 immünofluorescence tarafından tespit edildi; mCherry ve EGFP Şekil 1' de gösterildiği gibi tespit edildi. İşaretler Şekil 1' de gösterildiği gibi ortaya çıktı. Ölçek çubukları: 100 μm in (A, B) ve 50 μm (C, D). Gösterilen (E) Bu çalışmada şekil panelleri referansları ile kullanılan lentiviral karışımları adanmış. Gösterilen bir (F) pTα1 bir scatter plot-ve Tubb3+ hücrelerinde PSYN-Driven EGFP sinyali (B) ve (D), sırasıyla adlandırılır. Kutulu hücreler arasında düşen 25TH ve 75TH yüzde; bıyık 10TH ve 90TH yüzkıllar bakın. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek Için lütfen tıklayınız.
Olarak (3), 3 gün lentiviral dönüştürücü sonra, MtaptEGFP/+ "yeşil" nörokürler Pgk1p Promoter odaklı, MCherry kırmızı floresan protein ("kontrol" küreler) veya değil ("test" küreler) (Şekil 3A, B) ifade. Tüm küreler tek hücrelere ayrılmış, hiçbir kümeleri sollar vardır sağlanması, ve karşılık gelen süspansiyonlar 1:1 karışık. Elde edilen karışım (Şekil 3c) buzun üzerine yerleştirilir ve transplantasyon için 20 dakika içinde kullanılır.
Şekil 3 : Test örneği ("sadece yeşil") ve kontrol ("yeşil-kırmızı") DIV2 nöroküreler ve hücre süspansiyonu transplantasyon için hazırdır. (A, B) Bu küreler mtaptEGFP/+E 12,5 neokortikal öncülerden elde edildi, akut lentiviral karışımları tarafından enfekte "pCAG_lacZ, Pgk1p_tTA, TREt_GOI" (A) ve "Pgk1p_mCherry, Pgk1p_tTA, TREt_PLAP" (B), sırasıyla, MOI 'de her LV = 8 ve proliferatif ortamda tutulur. (C) hücre süspansiyonu "test" ve "kontrol" nöro-küreler (A, B) tek hücrelere ve onları 1:1 karıştırma ile elde edildi. Ölçek çubukları: 200 μm in (A, B) ve 100 μm in (C). Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek Için lütfen tıklayınız.
(4) için, yenidoğan beynin içine hücre enjeksiyonu prosedürü üç önemli adımları içerir. Orta parasagittal düzlemine yerleştirilen kapiller, frontal kortikel duvar yoluyla lateral ventriküler boşluğa girilir (Şekil 4A). Daha sonra, ganglionik Kardinal hasarı önlemek için, kapiller yatay düzlemde 30 ° döndürülür, böylece ucu medially/caudally noktaları (Şekil 4b). Son olarak, hücre süspansiyonu kolayca ayırt edilebilir, açık mavi "bulut" (Şekil 4c) oluşturan lateral ventriküler boşluğa özenle atılır.
Şekil 4 : Yenidoğan beynin içine hücre enjeksiyonu için kullanılan üç adımda prosedürün şematikleri. (A) kapiller frontal neokortikal duvar yoluyla lateral ventrikül içine girilir. Sonra, (B) bu, ganglionik Kardinal hasarı önlemek için medialward döndürülür. Son olarak (C), hücre süspansiyonu hafif mavi bir bulut oluşturan lateral ventrikül içine yavaşça enjekte edilir. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek Için lütfen tıklayınız.
(5) olarak, analitik prosedür dört ana adımları içerir. İlk olarak, nakledilen nöron zengini alanların optik konfeti bölümleri düzleştirilir, MAX Z-projeksiyon modaliteye göre RGB. tiff dosyaları üretiliyor. Burada, bir örnek olarak, sadece "yeşil test" nöronlar ve "sarı kontrol" nöronlar, Co-nakledilen öncüleri kaynaklanan, kolayca ayırt edilebilir (Bu MCherry alternatif "test" nöronlar etiket için kullanılabilir olduğunu unutulmamalıdır) (Şekil 5A). Sonra, bir idealize, İskeletleştirilmiş Kamera Lucida sürümü resim uygun bir grafik yazılımı tarafından oluşturulur (bkz adım 4.2.6) (Şekil 5B) kırmızı kanal bir operatör kör tarafından. Veri değerlendirmesinde kasıtsız önyargı önlemek için kırmızı kanalın körlüğü önemli öneme sahiptir. Daha sonra, tek nöronal siluetler, siyah-beyaz resimler ve üç birincil parametrenin "toplam sayısı" (attachment_points), "Toplam bitiş noktası sayısı" (uç noktalar) ve "Toplam" değerleri gibi NeurphologyJ yazılımına beslenir. nörit uzunluğu "(neurite_length) toplanır (Şekil 5c). Son olarak, her nöronun ikincil parametreleri hesaplanan, ortalama ve Excel yazılımı tarafından istatistiksel olarak değerlendirilir (Şekil 5D).
Şekil 5 : Nakledilen beynin morfometrik analizinin temsili akış şeması. Üst satır panelleri gösterir: (a) bir Maks z-projeksiyon. medial neokorteks Tiff görüntü, sabit 10 gün sonra mühendislik hücre nakli (yeşil = mtaptodaklı, nöron-kısıtlı EGFP; kırmızı = MCherry, kurucu "kontrol" hücreleri etiketleme; mavi = DAPI), yeşil kanal sinyali ve (B) onun İskeletleştirilmiş e-kamera Lucida render. Ölçek çubukları: 50 μm. Alt satırda şunlardır: (C) neurphologyj yazılım analizi ile nöronal iskeletler çıkarılan primer morfometrik parametreler (neurite_length olarak Σlı, attachment_points olarak NÇıkış ve uç nokta olarak NEnd) ve (D) ikincil parametreler kendi temelinde hesaplanır. Bu rakam Chiola ve al.21' den değiştirildi. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek Için lütfen tıklayınız.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Bu prosedürün spesifik yönleri/adımları önemlidir ve özel dikkat gerektirir. İlk olarak, (a) operatörler, bir BSL-2 uyumlu laboratuvar ortamında lentivirüsleri güvenli bir şekilde yönetmek için yeterli derecede önceden eğitilmelidir. İkinci olarak, (b) önce Mix "test" ve "kontrol" nöral preparatlar, dikkatle açıklandığı gibi iki karşılık gelen nöroküre süspansiyonları yıkamak için zorunludur, istenmeyen lentiviral nedeniyle iki preparatların herhangi bir gecikme çapraz enfeksiyon önlemek için devam edin. Üçüncü olarak, (c) hücreleri naklederken, ventriküler boşluğu hedeflerken bakım yerleştirilmelidir; Bu bağlamda, hızlı yeşil izleyici hücre süspansiyonunun içine dahil önemli yardım etmektir. Ayrıca, (d) yamyamlık önlemek için, nakledilen pups yeniden anne için sadece anestezi (genellikle 10 dakika yeterli) tam kurtarma sonra transfer edilmelidir. (e) nakledilen dokuların Cryo-bölümleme 60 μm olarak yapılmalıdır; Aslında, bu kalınlık aynı anda doku içine kolay bir antikor penetrasyon sağlar ve artifaktüel nöron parçalanma kaynaklanan bilgi kaybını sınırlar. Son olarak, (f) veri değerlendirmesinde kasıtsız önyargı önlemek için, biz nöron çerçeve yapısı çıkarma kırmızı kanal bir operatör kör tarafından gerçekleştirilmesi gerektiğini vurgulamak.
Burada açıklanan protokol GOF gen manipülasyonları anlamına gelir. Alternatif olarak, "test" nöronlar RNAi effectors için lentivirüsleri kodlama yoluyla GOı işlevini aşağı düzenlemek için tasarlanabilir. Sonra, genellikle "kontrol" nöral hücreleri etiketlemek için mCherry istihdam; Ancak, mCherry/"Control" ve LacZ/"test" şeması açıkça ters olabilir. Son olarak, burada açıklanan protokol intraventriküler hücre enjeksiyonları anlamına gelir; "test" ve "kontrol" nöronlar alternatif olarak sinirsel parankimi21içine enjekte edilebilir.
Avantajlarına rağmen, bu yöntemin iki ana sınırı vardır. Nöromimarinin hücre otonom gen kontrolünü araştırmak için izin verirken, bunun çevresel kontrolü için geçerli değildir. Ayrıca, nakledilen nöronal öncüleri olarak kortikal duvarın ventriküler yönü Doğum sonrası son laminar konuma göç (yani fizyolojik olmayan bir zaman dilimi içinde), bu yöntem tercihen model için istihdam edilmelidir göç tamamlandıktan sonra nöromimaronik kontrol.
Son olarak, özel dikkat sonuçların kritik yorumlanması için ödenmelidir. Özellikle, araştırma X gen konu "test" nöronların morfolojik karmaşıklığı azaltır, bu özellikle nöron mimarisi üzerinde gerçek etkisini yansıtmayabilir. Bunun yerine, bu tür bir fenomen X overexpression tarafından elicited nöronal hasar spesifik olmayan bir dizin olabilir. Bu sorunu gidermek için, "test" ve "kontrol" neurons, daha sonra "test" nüfus olası sayısal daralma aramak, nakledilen yerel yoğunlukları karşılaştırmak için yararlı olabilir, X tarafından indüklenen nöronal acı bir Endeksi olarak [bu daralma bile daha fazla olmalıdır nakledilmiş beynin daha da gecikmeli analizi üzerine telaffuz]. Bu gibi durumlarda, X geni overepression seviyesini düşürmek veya bir fonksiyon kaybı tasarımına hareket sorunu düzeltebilir.
Yöntemimiz, çok çeşitli teknolojilere ekler, nöronal morfoloji gen kontrolünü incelemek için çalışan vivo1,2,3,4,7,8, 9 , 10 ' dan fazla , 11 ' i , 12. olarak giriş geri çağrıldı, bu teknolojiler, GOI ifade düzeylerini Perturb ve biyolojik örneklerden morfolojik bilgilerin çıkarılması kolaylaştırmak amacıyla geçici genetik manipülasyonlar çeşitli güveniyor. Bu teknolojiler genellikle bu denetimin doğru diseksiyon izin; Ancak, onlar değerli deneysel becerileri ve finansal kaynaklar gerektirmez. Bu bağlamda, yöntem üç temel avantaj sunar. Bu transgenik modeller için benzerleri karşılaştırılabilir GOı ifade seviyeleri doğru bir kontrol sağlar; Ancak, mutant koloni bakım maliyetleri yokluğunda. Sofistike deneysel (cerrahi) becerileri gerektirmez. Genellikle nispeten sınırlı sayıda hayvan analizi üzerine sonuçların istatistiksel önemini elde eder.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Yazarların ifşa etmesi gereken hiçbir şey yok.
Acknowledgments
Biz bu prosedürün erken kurulumu için onun katkısı için teşekkür ederiz.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 0.3 mL syringe | BD | 320840 | store at RT |
| 0.45 μm sterile filter | Millex-HV | SLHU033RS | store at RT |
| 12 multiwell plate | Falcon | 353043 | store at RT |
| 1X PBS | Gibco | 14190-094 | store at RT |
| 24 multiwell plate | Falcon | 351147 | store at RT |
| anti-EGFP antibody, chicken polyclonal, RRID:AB_371416 | Tebubio | GTX13970 | store at -20 °C |
| anti-RFP antibody, rat monoclonal, RRID:AB_10795839 | Antibodies Online | ABIN334653 | store at -20 °C |
| anti-Tubb3 antibody, mouse monoclonal, RRID:AB_2313773 | Covance | MMS-435P | store at -20 °C |
| Aspirator tube assemblies kit for calibrated microcapillary pipettes | Sigma | A5177-5EA | store at RT |
| Blue light lamp | Nightsea | BLS2 | store at RT |
| Borosilicate capillaries | Kwik-Fil | TW150-4 | store at RT |
| BSA | Sigma | A9647 | store at -20 °C |
| Bürker chamber | Sigma | BR719520 | 0.0025 mm2, 0.100 mm |
| Cryo-inclusion medium (Killik) | Bio-Optica | 05-9801 | store at RT |
| DAPI | Sigma | D9542 | store at -20 °C |
| Disposable embedding mold | Bio-Optica | 07MP7070 | store at RT |
| DMEM/F-12 | Gibco | 31331-028 | store at +4 °C |
| Dnase I | Roche | 10104159001 | store at -20 °C |
| Doxycicline | Sigma | D1822 | store at -20 °C |
| Dumont forceps #3c | Fine Science Tools | 11231-20 | store at RT |
| Dumont forceps #5 | Fine Science Tools | 11251-20 | store at RT |
| EGF | Gibco | PHG0311 | store at -20 °C |
| EGTA | Sigma | E3889 | store at RT |
| FGF | Gibco | PHG0261 | store at -20 °C |
| Fine scissors - Sharp | Fine Science Tools | 14060-09 | store at RT |
| Fungizone (Amphotericin B) | Gibco | 15290018 | store at -20 °C |
| Glucose | Sigma | G8270 | store at RT |
| GlutaMAX Supplement | Gibco | 35050061 | store at RT |
| Goat anti-chicken Alexa 488 | Invitrogen | A11039 | store at -20 °C |
| Goat anti-rat Alexa 594 | Invitrogen | A11007 | store at -20 °C |
| Heparin Solution | Stem Cell Technologies | 07980 | store at -20 °C |
| N2 Supplement | Gibco | 17502048 | store at -20 °C |
| Optical fibers | Leica | CLS150X | |
| P1000 puller | Sutter Instruments | P-1000 model | |
| Parafilm | Bemis | PM-996 | store at RT |
| Pen Strep | Sigma | P0781 | store at -20 °C |
| Petri dish | Falcon | 353003 | store at RT |
| PFA | Sigma | 158127 | store at RT |
| Plasmid #363 [LV_TREt_(IRES)PLAP] | built in house | store at -20 °C | |
| Plasmid #386 [LV_pTa1_mCherry] | built in house | store at -20 °C | |
| Plasmid #401 [LV_pTa1_rtTA(M2)] | built in house | store at -20 °C | |
| Plasmid #408 [LV_Ppgk1p_rtTA(M2)] | built in house | store at -20 °C | |
| Plasmid #484 [LV_lacZ] | Addgene | 12108 | store at -20 °C |
| Plasmid #529 [LV_Pgk1p_mCherry] | built in house | store at -20 °C | |
| Plasmid #730 [LV_pSyn_rtTA(M2)] | built in house | store at -20 °C | |
| Scalpel | Braun | BB515 | store at RT |
| Steromicroscope | Leica | MZ6 | store at RT |
| Trypan blue | Gibco | 15250-061 | store at RT |
| Trypsin | Gibco | 15400-054 | store at -20 °C |
| Trypsin inhibitor | Sigma | T6522 | store at -20 °C |
References
- Kistner, A., et al. Doxycycline-mediated quantitative and tissue-specific control of gene expression in transgenic mice. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. , (1996).
- Matsui, A., Yoshida, A. C., Kubota, M., Ogawa, M., Shimogori, T. Mouse in Utero Electroporation: Controlled Spatiotemporal Gene Transfection. Journal of visualized experiments: JoVE. , (2011).
- Kim, J. Y., Grunke, S. D., Levites, Y., Golde, T. E., Jankowsky, J. L. Intracerebroventricular Viral Injection of the Neonatal Mouse Brain for Persistent and Widespread Neuronal Transduction. Journal of Visualized Experiments. , (2014).
- Puram, S. V., et al. A CaMKIIβ 2 signaling pathway at the centrosome regulates dendrite patterning in the brain. Nature Neuroscience. , (2011).
- Zuccotti, A., Le Magueresse, C., Chen, M., Neitz, A., Monyer, H. The transcription factor Fezf2 directs the differentiation of neural stem cells in the subventricular zone toward a cortical phenotype. Proceedings of the National Academy of Sciences. , (2014).
- Mikuni, T., Nishiyama, J., Sun, Y., Kamasawa, N., Yasuda, R. High-Throughput, High-Resolution Mapping of Protein Localization in Mammalian Brain by in Vivo Genome Editing. Cell. , (2016).
- Spiga, S., Acquas, E., Puddu, M. C., Mulas, G., Lintas, A., Diana, M. Simultaneous Golgi-Cox and immunofluorescence using confocal microscopy. Brain Structure and Function. , (2011).
- Chen, B., et al. The Fezf2-Ctip2 genetic pathway regulates the fate choice of subcortical projection neurons in the developing cerebral cortex. Proceedings of the National Academy of Sciences. , (2008).
- Feng, G., et al. Imaging neuronal subsets in transgenic mice expressing multiple spectral variants of GFP. Neuron. , (2000).
- Lu, X. H., Yang, X. W. Genetically-directed Sparse Neuronal Labeling in BAC Transgenic Mice through Mononucleotide Repeat Frameshift. Scientific Reports. , (2017).
- Cai, D., Cohen, K. B., Luo, T., Lichtman, J. W., Sanes, J. R. Improved tools for the Brainbow toolbox. Nature Methods. , (2013).
- Garcia-Moreno, F., Vasistha, N. A., Begbie, J., Molnar, Z. CLoNe is a new method to target single progenitors and study their progeny in mouse and chick. Development. , (2014).
- Falcone, C., Daga, A., Leanza, G., Mallamaci, A. Emx2 as a novel tool to suppress glioblastoma. Oncotarget. , (2016).
- Brancaccio, M., Pivetta, C., Granzotto, M., Filippis, C., Mallamaci, A. Emx2 and Foxg1 inhibit gliogenesis and promote neuronogenesis. Stem Cells. , (2010).
- Fimiani, C., Goina, E., Su, Q., Gao, G., Mallamaci, A. RNA activation of haploinsufficient Foxg1 gene in murine neocortex. Scientific Reports. , (2016).
- Tucker, K. L., Meyer, M., Barde, Y. A. Neurotrophins are required for nerve growth during development. Nature Neuroscience. , (2001).
- Currle, D. S., Hu, J. S., Kolski-Andreaco, A., Monuki, E. S. Culture of mouse neural stem cell precursors. Journal of Visualized Experiments. , (2007).
- Park, J. J., Cunningham, M. G. Thin Sectioning of Slice Preparations for Immunohistochemistry. Journal of Visualized Experiments. , (2007).
- Puzzolo, E., Mallamaci, A. Cortico-cerebral histogenesis in the opossum Monodelphis domestica: Generation of a hexalaminar neocortex in the absence of a basal proliferative compartment. Neural Development. , (2010).
- NeurphologyJ Manual. , http://life.nctu.edu.tw/~ehwang/Manual.pdf (2012).
- Chiola, S., Do, M. D., Centrone, L., Mallamaci, A. Foxg1 Overexpression in Neocortical Pyramids Stimulates Dendrite Elongation Via Hes1 and pCreb1 Upregulation. Cerebral Cortex. , (2018).
