Name: Visualisation hyporhéique Flow Through bedforms utilisant des expériences de colorant et Simulation (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-11-18T15:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 49 s
Description: Découvrez la visualisation du flux hyporhéique à l'aide d'expériences de colorant et de simulations NetLogo. Cette méthode combine expérimentation physique et modélisation informatique pour illustrer les principes hydrologiques.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Ce matériel est basé sur des travaux soutenus par les subventions EAR-0810270, EAR-1215898 et EAR-1344280 de la National Science Foundation, ainsi que par une bourse de recherche supérieure de la NSF.

1. Logiciel de simulation <ol><li> Utilisez le logiciel décrit dans cette section. <ol><li> Téléchargez et installez l&#39;open-source multi-agent langue libre / de modélisation et de plateforme de simulation, NetLogo (Disponible: <a href="http://ccl.northwestern.edu/netlogo/">http://ccl.northwestern.edu/netlogo/,</a> la version 5.1 ou ultérieure). Remarque: Ce logiciel est disponible sans frais et fonctionne sur tous les principaux systèmes d&#39;exploitation (Windows / Mac / Linux). </li><li> Téléchargez les deux fichiers de script de simulation spécifiques (mousedrop.nlogo et interface.nlogo) qui accompagnent cette procédure de laboratoire. (Available: <a href="http://modelingcommons.org/browse/one_model/4259">http://modelingcommons.org/browse/one_model/4259</a> and <a href="http://modelingcommons.org/browse/one_model/4258">http://modelingcommons.org/browse/one_model/4258</a> ) REMARQUE: Une fois la plate-forme de simulation est installé et ces fichiers ont été téléchargés, double-cliquant sur ces fichiers ouvre automatiquement til simulations, prêt à fonctionner. </li></ol></li></ol> 2. Flume démonstration <ol><li> Mettre en place le canal de laboratoire afin que tous les paramètres (Tableau 1) relèvent de la simulation de mousedrop contraintes de la gamme de paramètres. Remarque: Les contraintes peuvent être ajustées en mousedrop, si nécessaire pour le système physique en modifiant les curseurs. <ol><li> Verser une couche d&#39;environ 15-25 cm de sable dans le canal. Mesurer et enregistrer la conductivité hydraulique et la porosité du sable suivant les méthodes standard 32,33. </li><li> Remplissez le canal à environ 20-30 cm d&#39;eau. </li><li> Démarrez le canal et d&#39;augmenter le débit à un niveau qui est suffisamment rapide pour déplacer des grains de sable et de créer ainsi ondulations. Remarque: Le débit peut être ajusté en outre d&#39;affiner les caractéristiques de la forme du lit avec la pratique. Tailles forme du lit sont le résultat de débit, la profondeur de l&#39;eau et des propriétés de sable. </li><li> Autoriser les ondulations de développer foR 12-24 h pour former dune naturelle / morphologie d&#39;ondulation. Pour accélérer ce processus, manuellement façonner dunes réguliers, puis permettre le transport des sédiments pour 4-12 h. Sinon, constituer manuellement dunes triangulaires réguliers. Remarque: dunes triangulaires régulières donneront des motifs réguliers de change hyporhéique, mais ne seront pas montrer autant la complexité comme dune naturelle / bedforms ondulation. </li><li> Une fois les ondulations souhaités sont atteints, réduire le débit d&#39;eau jusqu&#39;à ralentit de transport lit de sédiments et les caractéristiques de la forme du lit arrêter de changer. <ol><li> Observer visuellement le mouvement des grains de sédiments comprenant le lit, et réduire le débit jusqu&#39;à ce que le mouvement cesse. Remarque: Cela permettra de préserver la morphologie de lit pour la durée de l&#39;expérience. </li><li> Pour confirmer que lent, mouvement épisodique ne se produit pas, les positions de marque ou de la photographie et la forme du lit alors observer à un moment ultérieur. Remarque: Il est seulement important que bedforms ne se déplacent pas de façon significative au cours de la période de l&#39;expérience, de sorte que fournitun temps d&#39;observation suffisante pour confirmer que bedforms sont stables. </li></ol></li><li> Ajustez la pente canal et / ou la profondeur de l&#39;eau pour obtenir un écoulement uniforme dans le cadre du débit réduit. <ol><li> La pente du chenal de contrôle à travers un équipement construit dans le canal, typiquement soit une prise motorisé ou une manivelle. Ajuster la profondeur d&#39;eau en ajoutant ou en éliminant l&#39;eau du canal. Remarque: dans le montage expérimental utilisé ici, l&#39;ensemble de buse est monté sur un pivot sur l&#39;extrémité aval, et la pente est réglée par un vérin motorisé à l&#39;extrémité amont. </li><li> Pendant que la pompe est en marche, sélectionner deux emplacements longitudinaux marqués avec des lignes perpendiculaires au fond du canal. A ces endroits, utiliser une règle pour mesurer la distance le long de ces lignes perpendiculaires, entre la surface de l&#39;eau et le fond du canal. Remarque: Selon la configuration de canal, le fond du canal peut servir de ligne de référence de mieux en pente que le fond du canal. Sélection d&#39;une larger distance longitudinale donnera une plus grande précision. </li><li> Ajuster l&#39;inclinaison de la goulotte et / ou la profondeur de l&#39;eau et re-mesure jusqu&#39;à ce que les mesures de distances verticales sont les mêmes pour obtenir un écoulement uniforme. Mesurer la distance horizontale en pente le long du fond du canal entre ces deux emplacements longitudinaux. </li></ol></li><li> Arrêtez la pompe et attendre que l&#39;eau cesse de bouger; ce qui fournira une surface plane. Re-mesurer la distance entre la partie supérieure du canal et la surface de l&#39;eau à chaque emplacement longitudinal. Remarque: La pente de canal est égale à la différence entre ces mesures, divisée par la distance horizontale en pente entre elles. </li><li> Re-démarrer la pompe. </li><li> Sélectionnez une section d&#39;essai, qui devrait être un emplacement près de la fin du Moyen ou en aval du canal où les dunes ont formé un motif régulier. Assurez-vous que cette section comprend au moins une forme du lit plein. </li><li> Mesurer et enregistrer la profondeur moyenne de sédiments (D) dans esection d&#39;essai de e avec un legs de mesure de la main (dirigeants transparentes sont idéales). Pour plus de simplicité, utilisez la distance moyenne d&#39;une crête et le creux à bas canal. </li><li> Mesurer et enregistrer la hauteur moyenne des formes de relief dans la section d&#39;essai, défini comme la différence entre la profondeur des sédiments à une crête et la profondeur des sédiments à un creux avec une règle. Mesurer plusieurs ondulations d&#39;obtenir une bonne estimation de la moyenne. </li><li> Encore une fois en utilisant la règle, et enregistrer la mesure de la profondeur moyenne de l&#39;eau (d) dans la section de mesure, définie comme la distance moyenne de la surface de l&#39;eau dans le lit de sable. Encore une fois, utiliser la profondeur moyenne de l&#39;eau au crêtes des dunes et des creux pour plus de simplicité. </li><li> Noter le débit de canal (Q) à partir du débitmètre, et calculer la vitesse moyenne comme Q / (d * p), où w est la largeur du canal et d est la profondeur de l&#39;eau. Note: Notre débitmètre est inséré dans la boucle de recirculation du canal. </li><li> Mesureet enregistrer la longueur d&#39;onde moyenne des formes de relief dans la section de mesure. Typiquement, mesurer la longueur d&#39;onde que la distance entre les crêtes des dunes successives. </li><li> Ouvrez la simulation Mousedrop (dans la plate-forme NetLogo) et vérifier que toutes les mesures sont dans les plages variables spécifiées dans l&#39;interface utilisateur de simulation. Si un paramètre mesuré tombe en dehors de la plage de contrainte, d&#39;ajuster la plage de paramètres de simulation en cliquant-droit sur le paramètre &quot;curseur&quot;, en sélectionnant &quot;Modifier&quot;, et en ajustant les valeurs min / max. </li></ol></li><li> Visualisez échange hyporhéique. <ol><li> Réglez l&#39;appareil photo dans un lieu fixe (de préférence sur un trépied) fait perpendiculairement à la paroi du canal avec une seule forme du lit dans la section de test centrée dans l&#39;image. Note: Ceci permettra d&#39;éviter les problèmes de la perspective oblique. </li><li> Prenez une photo de test pour vérifier les conditions. Réglez l&#39;éclairage si réflexions sont un problème. </li><li> Utilisation de la seringue et l&#39;aiguille, faire 2-3 petites colorant injections près de la paroi du canal. Assurez-vous que ces injections forment ~ 2 cm taches rondes de couleur de l&#39;eau interstitielle à une variété d&#39;endroits verticaux et horizontaux. Faire attention à minimiser la perturbation du lit de sable au cours de l&#39;injection. Remarque: Les injections de plus petits volumes de colorant permettent à l&#39;utilisateur voir plus de détails et voir les chemins de flux individuels. </li><li> Notez l&#39;heure de début des injections de colorant et de prendre une photo initiale. Facultatif: Il peut être éducatif pour tracer les fronts de colorants initiales avec des marqueurs sur le papier de la transparence, de sorte que le mouvement de colorant est facilement observable en laboratoire, mais ces contours bloquera également de petites portions des fronts de colorants dans les images, donc il est un arbitrage de. </li><li> Capturez les positions colorant avant à des intervalles de temps appropriés. Pour photographie laps de temps, utiliser des intervalles de 30 sec pour donner des résultats lisses. </li></ol></li></ol> 3. Simulation <ol><li> Exécutez Simulation 1: Mousedrop et comparer avec le transport de colorant observée.<ol><li> Ouvrez le script de simulation nommé Mousedrop.nlogo. <img alt="Figure 3" src="/files/ftp_upload/53285/53285fig2.jpg" width="600" /> Figure 2. Mousedrop. Cela montre où traceurs sont à 7 instances différentes dans le temps. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/53285/53285fig2large.jpg" target="_blank">S&#39;il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de cette figure.</a> </li><li> Réglez les paramètres physiques du système indiqués dans le tableau 1 en fonction des conditions expérimentales canal (spécifiquement: Lambda, BedformHeight, BedDepth, HydrCond, porosité, ChannelVelocity, la profondeur et la pente). Assurez-vous de porter une attention particulière aux unités lors de la saisie des paramètres d&#39;entrée. </li><li> Réglez les curseurs Time1, TIME2, etc. pour indiquer des moments où la simulation de suivi couleur changera. Définissez ces changements de couleur pour correspondre à des temps d&#39;observation dans le but de faciliter la comparaison des résultats de la simulation avec les observations. Note: Si les paramètres de temps sont tous mis à 0, la simulation affiche une seule couleur partout. </li><li> Après tous les paramètres sont définis, cliquez sur le bouton d&#39;installation. Remarque: La forme du lit devrait apparaître dans la vue de simulation. </li><li> Cliquez sur le bouton de la souris-goutte pour indiquer les emplacements à partir de traceurs virtuelles. Notez que plusieurs endroits dans le lit peuvent être cliqués. Maintenez la souris vers le bas pour libérer traceur plus virtuel. Lors de la simulation mouvement de colorant, utiliser la souris pour tracer soit fronts de colorants (la frontière autour de la teinture) ou de remplir toute la surface de la région de teint. Remarque: Présentation plus traceur virtuel va provoquer la simulation de fonctionner plus lentement. Les meilleurs résultats visuels varient en fonction des performances de l&#39;ordinateur. </li><li> Une fois tous les traceurs virtuelles ont été placés, vous pouvez soit cliquer sur le bouton Avance à la prochaine fois, qui va commencer la simulation, puis l&#39;arrêter à la première fois ou vous pouvez cliquer sur le bouton Go / arrêt pour commencer le simulation indéfiniment. Ne pas re-cliquez sur le bouton de configuration, ou les traceurs devront être replacé. Note: Une fois la simulation démarre, la vitesse est calculée pour l&#39;emplacement de chaque traceur en fonction des paramètres de simulation dans les équations 4 et 5. Les traceurs se déplace en fonction du champ de vitesse pendant 100 secondes simulées puis la vitesse au nouvel emplacement est calculé et la procédure est répétée jusqu&#39;à ce que le palpeur quitte le système. </li><li> Eventuellement, cliquez sur le bouton / d&#39;arrêt d&#39;aller à plusieurs reprises pour mettre en pause / reprendre la simulation. Comparez les distributions de colorant simulées et mesurées à différents points dans le temps. </li></ol></li><li> Simulation de 2: Interface. <ol><li> Ouvrez le script intitulé Interface. <img alt="Figure 3" src="/files/ftp_upload/53285/53285fig3.jpg" width="600" /> Figure 3. Interface. Cela montre 370 traceurs qui coule à travers le sous-sol en utilisant la simulation de l&#39;interface. Le traceur paTHS indiquent où chaque traceur a été depuis qu&#39;il a été lancé à l&#39;interface surface eau souterraine. Finalement, tous les chemins d&#39;écoulement devraient retourner à l&#39;eau de surface. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/53285/53285fig3large.jpg" target="_blank">S&#39;il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.</a> Remarque: Ce script introduit traceurs virtuels sur la surface cours d&#39;eau d&#39;une manière flux pondérés en fonction des vitesses de subsurface calculées. Ceci fournit une représentation visuelle des quantités relatives de l&#39;eau qui se jettent dans (et sur) du cours d&#39;eau à des endroits différents. </li><li> Commencez par cliquer sur l&#39;installation suivi par GO / STOP. Remarque: Ce sera exécuté la simulation avec les paramètres par défaut. Le commutateur re-chute? Est initialement désactivée, de sorte que la distribution des temps de séjour cumulé sera tracée comme le temps passe. </li><li> Après avoir observé la simulation avec les paramètres par défaut, cliquez sur GO / STOP pour arrêter la simulation. </li><li&gt; Changer un ou plusieurs paramètres et puis cliquez sur Configuration suivie par GO / STOP. Remarque: Cela va redémarrer la simulation avec les paramètres qui ont été sélectionnés. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Huettel, M., Webster, I. T. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHuettel%2C+M+%22Porewater+flow+in+permeable+sediments.+In%3A+The+benthic+boundary+layer%3A+Transport+processes+and+biogeochemistry%22">Porewater flow in permeable sediments. In: The benthic boundary layer: Transport processes and biogeochemistry</a>. Bordeau, B. P., Jørgensen, B. B. , Oxford University Press. New York. 144-179 (2001).</li>
<li>Bencala, K. E., Walters, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simulation+of+Solute+Transport+in+a+Mountain+Pool-and-Riffle+Stream+-+a+Transient+Storage+Model%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Simulation of Solute Transport in a Mountain Pool-and-Riffle Stream - a Transient Storage Model.</a> Water Resour Res. 19, 718-724 (1983).</li>
<li>Williams, D. D., Hynes, H. B. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Occurrence+of+Benthos+Deep+in+Substratum+of+a+Stream%5BTitle%5D)+AND+%22Freshwater+Biol%22%5BJournal%5D)">Occurrence of Benthos Deep in Substratum of a Stream.</a> Freshwater Biol. 4, 233-255 (1974).</li>
<li>Benner, S. G., Smart, E. W., Moore, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metal+Behavior+during+Surface+Groundwater+Interaction%2C+Silver-Bow+Creek%2C+Montana%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Metal Behavior during Surface Groundwater Interaction, Silver-Bow Creek, Montana.</a> Environ Sci Technol. 29, 1789-1795 (1995).</li>
<li>Fuller, C. C., Harvey, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reactive+uptake+of+trace+metals+in+the+hyporheic+zone+of+a+mining-contaminated+stream%2C+Pinal+Creek%2C+Arizona%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Reactive uptake of trace metals in the hyporheic zone of a mining-contaminated stream, Pinal Creek, Arizona.</a> Environ Sci Technol. 34, 1150-1155 (2000).</li>
<li>Jones, J. B., Mulholland, P. J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aJones%2C+JB+%22Streams+and+Ground+Waters%22">Streams and Ground Waters</a>. , Academic Press. San Diego, CA. (1999).</li>
<li>McKnight, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrofluorometric+characterization+of+dissolved+organic+matter+for+indication+of+precursor+organic+material+and+aromaticity%5BTitle%5D)+AND+%22Limnol+Oceanogr%22%5BJournal%5D)">Spectrofluorometric characterization of dissolved organic matter for indication of precursor organic material and aromaticity.</a> Limnol Oceanogr. 46, 38-48 (2001).</li>
<li>Mulholland, P. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inter-biome+comparison+of+factors+controlling+stream+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22Freshwater+Biol%22%5BJournal%5D)">Inter-biome comparison of factors controlling stream metabolism.</a> Freshwater Biol. 46, 1503-1517 (2001).</li>
<li>Peterson, B. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Control+of+nitrogen+export+from+watersheds+by+headwater+streams%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Control of nitrogen export from watersheds by headwater streams.</a> Science. 292, 86-90 (2001).</li>
<li>Goolsby, D. A., Battaglin, W. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-term+changes+in+concentrations+and+flux+of+nitrogen+in+the+Mississippi+River+Basin%2C+USA%5BTitle%5D)+AND+%22Hydrol+Process%22%5BJournal%5D)">Long-term changes in concentrations and flux of nitrogen in the Mississippi River Basin, USA.</a> Hydrol Process. 15, 1209-1226 (2001).</li>
<li>Rabalais, N. N., Smith, L. E., Harper, D. E., Justic, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+seasonal+hypoxia+on+continental+shelf+benthos%5BTitle%5D)+AND+%22Coast+Est+S%22%5BJournal%5D)">Effects of seasonal hypoxia on continental shelf benthos.</a> Coast Est S. 58, 211-240 (2001).</li>
<li>Huettel, M., Gust, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+bioroughness+on+interfacial+solute+exchange+in+permeable+sediments%5BTitle%5D)+AND+%22Mar+Ecol+Prog+Ser%22%5BJournal%5D)">Impact of bioroughness on interfacial solute exchange in permeable sediments.</a> Mar Ecol Prog Ser. 89, 253-267 (1992).</li>
<li>Cardenas, M. B., Wilson, J. L., Haggerty, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Residence+time+of+bedform-driven+hyporheic+exchange%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Water+Resour%22%5BJournal%5D)">Residence time of bedform-driven hyporheic exchange.</a> Adv Water Resour. 31, 1382-1386 (2008).</li>
<li>Stonedahl, S. H., Harvey, J. W., Detty, J., Aubeneau, A., Packman, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physical+controls+and+predictability+of+stream+hyporheic+flow+evaluated+with+a+multiscale+model%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Physical controls and predictability of stream hyporheic flow evaluated with a multiscale model.</a> Water Resour Res. 48, (2012).</li>
<li>Stonedahl, S. H., Harvey, J. W., Wörman, A., Salehin, M., Packman, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+multiscale+model+for+integrating+hyporheic+exchange+from+ripples+to+meanders%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">A multiscale model for integrating hyporheic exchange from ripples to meanders.</a> Water Resour Res. 46, (2010).</li>
<li>Wörman, A., Packman, A. I., Marklund, L., Harvey, J. W., Stone, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fractal+topography+and+subsurface+water+flows+from+fluvial+bedforms+to+the+continental+shield%5BTitle%5D)+AND+%22Geophys+Res+Lett%22%5BJournal%5D)">Fractal topography and subsurface water flows from fluvial bedforms to the continental shield.</a> Geophys Res Lett. 34, (2007).</li>
<li>Tonina, D., Buffington, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+three-dimensional+model+for+analyzing+the+effects+of+salmon+redds+on+hyporheic+exchange+and+egg+pocket+habitat%5BTitle%5D)+AND+%22Can+J+Fish+Aquat+Sci%22%5BJournal%5D)">A three-dimensional model for analyzing the effects of salmon redds on hyporheic exchange and egg pocket habitat.</a> Can J Fish Aquat Sci. 66, 2157-2173 (2009).</li>
<li>Elliott, A. H., Brooks, N. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transfer+of+nonsorbing+solutes+to+a+streambed+with+bed+forms%3A+Theory%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Transfer of nonsorbing solutes to a streambed with bed forms: Theory.</a> Water Resour Res. 33, 123-136 (1997).</li>
<li>Elliott, A. H., Brooks, N. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transfer+of+nonsorbing+solutes+to+a+streambed+with+bed+forms%3A+Laboratory+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Transfer of nonsorbing solutes to a streambed with bed forms: Laboratory experiments.</a> Water Resour Res. 33, 137-151 (1997).</li>
<li>Wörman, A., Packman, A. I., Marklund, L., Harvey, J. W., Stone, S. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exact+three-dimensional+spectral+solution+to+surface-groundwater+interactions+with+arbitrary+surface+topography%5BTitle%5D)+AND+%22Geophys+Res+Lett%22%5BJournal%5D)">Exact three-dimensional spectral solution to surface-groundwater interactions with arbitrary surface topography.</a> Geophys Res Lett. 33, (2006).</li>
<li>Janssen, F., Cardenas, M. B., Sawyer, A. H., Dammrich, T., Krietsch, J., de Beer, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparative+experimental+and+multiphysics+computational+fluid+dynamics+study+of+coupled+surface-subsurface+flow+in+bed+forms%5BTitle%5D)+AND+%22Wat+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">A comparative experimental and multiphysics computational fluid dynamics study of coupled surface-subsurface flow in bed forms.</a> Wat Resour Res. 48, (2012).</li>
<li>Shen, H. W., Fehlman, H. M., Mendoza, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bed+Form+Resistances+in+Open+Channel+Flows%5BTitle%5D)+AND+%22J+Hydraul+Eng-Asce%22%5BJournal%5D)">Bed Form Resistances in Open Channel Flows.</a> J Hydraul Eng-Asce. 116, 799-815 (1990).</li>
<li>Wilensky, U. NetLogo. , Center for Connected Learning and Computer-Based Modeling, Northwestern University. Evanston, IL. Available from:
 <a target="_blank" href="http://ccl.northwestern.edu/netlogo/">http://ccl.northwestern.edu/netlogo/</a> (1999).</li>
<li>Ma, J., Nickerson, J. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hands-on+simulated%2C+and+remote+laboratories%3A+A+comparative+literature+review%5BTitle%5D)+AND+%22Acm+Comput+Surv%22%5BJournal%5D)">Hands-on simulated, and remote laboratories: A comparative literature review.</a> Acm Comput Surv. 38, (2006).</li>
<li>Nersessian, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Conceptual+change+in+science+and+in+science+education%5BTitle%5D)+AND+%22Synthese%22%5BJournal%5D)">Conceptual change in science and in science education.</a> Synthese. 80, 163-183 (1989).</li>
<li>Magin, D., Kanapathipillai, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Engineering+students%27+understanding+of+the+role+of+experimentation%5BTitle%5D)+AND+%22European+Journal+of+Engineering+Education%22%5BJournal%5D)">Engineering students' understanding of the role of experimentation.</a> European Journal of Engineering Education. 25, 351-358 (2000).</li>
<li>Shin, D., Yoon, E. S., Lee, K. Y., Lee, E. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+web-based%2C+interactive+virtual+laboratory+system+for+unit+operations+and+process+systems+engineering+education%3A+issues%2C+design+and+implementation%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Chem+Eng%22%5BJournal%5D)">A web-based, interactive virtual laboratory system for unit operations and process systems engineering education: issues, design and implementation.</a> Comput Chem Eng. 26, 319-330 (2002).</li>
<li>Smith, P. R., Pollard, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Role+of+Computer-Simulations+in+Engineering-Education%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Educ%22%5BJournal%5D)">The Role of Computer-Simulations in Engineering-Education.</a> Comput Educ. 10, 335-340 (1986).</li>
<li>Gillet, D., Ngoc, A. V. N., Rekik, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Collaborative+web-based+experimentation+in+flexible+engineering+education%5BTitle%5D)+AND+%22Ieee+T+Educ%22%5BJournal%5D)">Collaborative web-based experimentation in flexible engineering education.</a> Ieee T Educ. 48, 696-704 (2005).</li>
<li>Subramanian, R., Marsic, I. ViBE: Virtual biology experiments. Proceedings of the 10th international conference on World Wide Web. , 316-325 (2001).</li>
<li>Blikstein, P., Fuhrmann, T., Greene, D., Salehi, S. Bifocal Modeling: Mixing Real and Virtual Labs for Advanced Science Learning. Proceedings of Idc 2012: The 11th International Conference on Interaction Design and Children. , 296-299 (2012).</li>
<li>Freeze, R. A., Cherry, J. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aFreeze%2C+RA+%22Groundwater%22">Groundwater</a>. , Prentice-Hall. New Jersey. (1979).</li>
<li>Todd, D. K., Mays, L. W. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aTodd%2C+DK+%22Groundwater+Hydrology%22">Groundwater Hydrology</a>. , 3, John Wiley & Son, Inc. New Jersey. (2005).</li>
<li>Box, G. E., Draper, N. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBox%2C+GE+%22Empirical+Model-Building+and+Response+Surfaces%22">Empirical Model-Building and Response Surfaces</a>. , John Wiley & Sons. (1987).</li>
<li>Flavell, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metacognition+and+cognitive+monitoring%3A+A+new+area+of+cognitive%E2%80%93developmental+inquiry%5BTitle%5D)+AND+%22American+Psychologist%22%5BJournal%5D)">Metacognition and cognitive monitoring: A new area of cognitive–developmental inquiry.</a> American Psychologist. 34, 906(1979).</li>
<li>Bransford, J. D., Brown, A. L., Cocking, R. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBransford%2C+JD+%22How+People+Learn%22">How People Learn</a>. , National Academy Press. Washington, DC. (2000).</li>
<li>Pintrich, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+metacognitive+knowledge+in+learning%2C+teaching%2C+and+assessing%5BTitle%5D)+AND+%22Theor+Pract%22%5BJournal%5D)">The role of metacognitive knowledge in learning, teaching, and assessing.</a> Theor Pract. 41 (4), 219-225 (2002).</li>
<li>Zohar, A., Ben David, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Paving+a+clear+path+in+a+thick+forest%3A+a+conceptual+analysis+of+a+metacognitive+component%5BTitle%5D)+AND+%22Metacogn+Learn%22%5BJournal%5D)">Paving a clear path in a thick forest: a conceptual analysis of a metacognitive component.</a> Metacogn Learn. 4, 177-195 (2009).</li>
<li>Fox, A., Boano, F., Arnon, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+losing+and+gaining+streamflow+conditions+on+hyporheic+exchange+fluxes+induced+by+dune-shaped+bed+forms%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Impact of losing and gaining streamflow conditions on hyporheic exchange fluxes induced by dune-shaped bed forms.</a> Water Resour Res. 50, 1895-1907 (2014).</li>
<li>Norman, F. A., Cardenas, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heat+transport+in+hyporheic+zones+due+to+bedforms%3A+An+experimental+study%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Heat transport in hyporheic zones due to bedforms: An experimental study.</a> Water Resour Res. 50, 3568-3582 (2014).</li>
<li>Precht, E., Huettel, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+wave-driven+advective+pore+water+exchange+in+a+permeable+coastal+sediment%5BTitle%5D)+AND+%22J+Sea+Res%22%5BJournal%5D)">Rapid wave-driven advective pore water exchange in a permeable coastal sediment.</a> J Sea Res. 51, 93-107 (2004).</li>
<li>Salehin, M., Packman, A. I., Paradis, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hyporheic+exchange+with+heterogeneous+streambeds%3A+Laboratory+experiments+and+modeling%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Hyporheic exchange with heterogeneous streambeds: Laboratory experiments and modeling.</a> Water Resour Res. 40, (2004).</li>
<li>Cardenas, M. B., Wilson, J. L., Zlotnik, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+heterogeneity%2C+bed+forms%2C+and+stream+curvature+on+subchannel+hyporheic+exchange%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Impact of heterogeneity, bed forms, and stream curvature on subchannel hyporheic exchange.</a> Water Resour Res. 40, (2004).</li>
<li>Sawyer, A. H., Cardenas, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hyporheic+flow+and+residence+time+distributions+in+heterogeneous+cross-bedded+sediment%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Hyporheic flow and residence time distributions in heterogeneous cross-bedded sediment.</a> Water Resour Res. 45, (2009).</li>
<li>Boano, F., Camporeale, C., Revelli, R., Ridolfi, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sinuosity-driven+hyporheic+exchange+in+meandering+rivers%5BTitle%5D)+AND+%22Geophys+Res+Lett%22%5BJournal%5D)">Sinuosity-driven hyporheic exchange in meandering rivers.</a> Geophys Res Lett. 33, (2006).</li>
<li>Cardenas, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+model+for+lateral+hyporheic+flow+based+on+valley+slope+and+channel+sinuosity%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">A model for lateral hyporheic flow based on valley slope and channel sinuosity.</a> Water Resour Res. 45, (2009).</li>
<li>Tonina, D., Buffington, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hyporheic+exchange+in+gravel+bed+rivers+with+pool-riffle+morphology%3A+Laboratory+experiments+and+three-dimensional+modeling%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Resour+Res%22%5BJournal%5D)">Hyporheic exchange in gravel bed rivers with pool-riffle morphology: Laboratory experiments and three-dimensional modeling.</a> Water Resour Res. 43, (2007).</li>
<li>Harbaugh, A. W., Banta, E. R., Hill, M. C., McDonald, M. G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHarbaugh%2C+AW+%22MODFLOW-2000%2C+the+US+Geological+Survey+modular+ground-water+model%3A+User+guide+to+modularization+concepts+and+the+ground-water+flow+process%22">MODFLOW-2000, the US Geological Survey modular ground-water model: User guide to modularization concepts and the ground-water flow process</a>. , US Geological Survey. Reston, VA, USA. (2000).</li>
</ol>

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Conjointement, la démonstration et le suivi de particules simulations flume fournissent une introduction complète à l&#39;écoulement hyporhéique pour un éventail d&#39;auditoires. Les participants de tous les niveaux sont fournies des preuves visuelles de l&#39;apparition de l&#39;échange hyporhéique induite par ondulations, et la forte variabilité des voies d&#39;écoulement de subsurface sous ondulations. Ces procédures peuvent être utilisées comme une simple démonstration de débit de l&#39;eau interstitielle pour les ...

À mesure que l&#39;eau de surface dans un ruisseau, une rivière ou zone de marée, il crée des gradients de tête qui conduisent l&#39;eau dans et hors des sédiments 1. Dans les systèmes fluviaux de la partie des sédiments lit fluvial où se produit cet échange est connu comme la zone hyporhéique 2,3. Cette zone est important parce que beaucoup de nutriments et de polluants sont stockés, déposés ou transformés au sein de la zone hyporhéique 4-9. La quantité de temps un traceur passe dans les sédiments est appelé un temps de séjour. Les deux temps de séjour et les emplacements des chemins d&#39;écoulement affectent les processus de transformation. Une meilleure compréhension des processus qui affectent l&#39;écoulement à travers les sédiments est nécessaire pour prévoir le transport de soluté dans les rivières et aborder les grands problèmes environnementaux résultant de la propagation de matériaux tels que des nutriments (par exemple, l&#39;hypoxie côtière 10,11). En dépit de l&#39;importance de l&#39;échange hyporhéique, il est souvent décrit en cours de premier cycle en hydrologie,mécanique des fluides, hydraulique, etc. éducateurs qui souhaitent ajouter échange hyporhéique à leurs cours pourraient trouver utile d&#39;avoir des visualisations expérimentales et numériques qui montrent clairement ce processus. Canal sinuosité de Stream, les niveaux d&#39;eaux souterraines environnantes, et la topographie cours d&#39;eau (à savoir, des bars, des ondulations, et des monticules biogènes) affectent tous échange hyporhéique à des degrés divers 12-17. Cette étude a porté sur les formes de lit, comme les dunes et les ondulations, qui sont généralement des caractéristiques géomorphologiques clés affectant l&#39;écoulement hyporhéique 14,15. Nous avons créé une simulation et de laboratoire expérience numérique de visualiser l&#39;écoulement à travers une série régulière d&#39;ondulations. Cette simulation est basée sur un ensemble de recherches antérieures concernant des voies d&#39;écoulement hyporhéiques caractéristiques du système pour facilement observables 15,18-21. Comme cette recherche constitue la base scientifique pour la simulation, un bref résumé des principaux aspects de la théorie suit. La forme du lit topographie, T (x),est donné par: Equation 1: <img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/53285/53285eq1.jpg" /> où H est le double de l&#39;amplitude de la forme du lit, k est le nombre d&#39;onde, et x est la dimension longitudinale parallèle à la surface cours d&#39;eau moyenne. Un exemple de cette forme du lit topographie est représenté sur la Figure 1. <img alt="Figure 1" src="/files/ftp_upload/53285/53285fig1.jpg" /> Figure 1. Définitions des grandeurs et paramètres contrôlés par l&#39;utilisateur. Dans l&#39;interface, particules de traceur sont libérés de façon flux pondérée à la / interface des sédiments d&#39;eau et suivis par les sédiments. Si show-chemins? Est &quot;sur&quot; la marque des traceurs d&#39;eau où ils ont été, montrent leurs chemins. Lorsqu&#39;un traceur renvoie à la surface de l&#39;eau, cela change til nombre total de traceurs dans le système, lors d&#39;une nouvelle baisse? est réglé sur &quot;off&quot;. La courbe de distribution cumulative des temps de séjour montre ce changement en traçant le rapport entre le nombre de traceurs restants dans le lit de sédiment au nombre initial comme une fonction du temps. Si re-chute? Est &quot;on&quot; puis traceurs qui quittent le système sont remplacés de la même manière flux pondérés comme des particules d&#39;origine, et l&#39;intrigue cumulatif est désactivé. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/53285/53285fig1large.jpg" target="_blank">S&#39;il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.</a> <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td> Nom du paramètre </td><td> Unités </td><td colspan="3"> Définition </td><td> Interface </td><td> Mousedrop </td></tr><tr><td> Lambda (λ) </td><td> cm </td><td colspan="3"> Longueur d&#39;onde de la forme du lit (voir Figure 1) &lt;/ td&gt; <td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> BedformHeight (H) </td><td> cm </td><td colspan="3"> Deux fois l&#39;amplitude des formes de relief (voir Figure 1) </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> BedDepth (D) </td><td> cm </td><td colspan="3"> Profondeur des sédiments (voir la figure 1) </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> HydrCond (K) </td><td> cm / s </td><td colspan="3"> Conductivité hydraulique </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Porosité (θ) </td><td></td><td colspan="3"> Porosité </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> ChannelVelocity (U) </td><td> cm / s </td><td colspan="3"> Vitesse moyenne dans l&#39;eau de surface ou d&#39;un canal </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Profondeur (d) </td><td> cm </td><td colspan="3"> La profondeur d&#39;eau (voir la figure 1) </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Pente (S) </td><td></td><td colspan="3"> Pente des ondulations et surface de l&#39;eau </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td&gt; <img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> NumParticles </td><td></td><td colspan="3"> Le nombre de particules libérées dans le système. </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td></td></tr><tr><td> Timex (Time1, Time2 ..) </td><td> min </td><td colspan="3"> Heure à laquelle chaque changement de couleur se produit </td><td></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Simulation Boutons </td><td></td><td colspan="3"> Définition </td><td> Interface </td><td> Mousedrop </td></tr><tr><td> Installer </td><td></td><td colspan="3"> Set de la simulation à l&#39;aide de paramètres montré </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> GO / STOP </td><td></td><td colspan="3"> Démarre et arrête la simulation </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Marche d&#39;escalier </td><td></td><td colspan="3"> Étape cliquant provoque un pas de temps à passer. Cela permet aux utilisateurs de ralentir le code et voir exactement ce qui se passe en 100 sec. </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td></td></tr><tr><td> chemins clairs </td><td></td><td colspan="3"> Efface tout ce qu&#39;il chemins de particules bleues de l&#39;écran </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> Avancez jusqu&#39;à la prochaine fois </td><td></td><td colspan="3"> Cela provoque le programme à exécuter jusqu&#39;à la prochaine fois de changement de couleur (Timex)</td><td></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> souris-goutte </td><td></td><td colspan="3"> Ce bouton doit être cliqué avant particules peuvent être placés dans le sous-sol en cliquant sur les lieux dans le sous-sol. </td><td></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> show-chemins? </td><td></td><td colspan="3"> Si show-chemins? est &quot;sur&quot; les particules d&#39;eau laissent une trace de bleu montrant où ils ont été (voir la figure 1). </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td></tr><tr><td> re-déposer? </td><td></td><td colspan="3"> Si re-chute? est &quot;sur&quot; les particules sont remplacés de manière pondérée de flux pour chaque particule, qui sort du système, et l&#39;intrigue cumulatif ne fonctionne pas. Quand un partiarticle sort de la zone hyporhéique le nombre de particules dans le système diminue si re-chute? est &quot;off&quot; (voir Figure 1). </td><td><img alt="coche" src="/files/ftp_upload/53285/checkmark.jpg" /></td><td></td></tr></tbody></table> Tableau 1. Paramètres hyporhéiques et simulation contrôles. Chaque bouton de paramètre, et curseur qui peuvent être ajustés par l&#39;utilisateur est donné dans ce tableau avec une définition. Dans cette simulation, deux processus induisent la vitesse du fluide dans le lit de sable. La première est due aux interactions de l&#39;écoulement des cours d&#39;eau avec des ondulations. La tête de la vitesse à l&#39;interface eau / sédiment induite par bedforms est également approximativement sinusoïdale, et déplacé par un quart d&#39;onde de la forme du lit lui-même 22. L&#39;amplitude de la fonction de tête de la vitesse à l&#39;interface surface-sous-sol a été approchée à partir des mesures 16: GE = &quot;always&quot;&gt; Équation 2: <img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/53285/53285eq2.jpg" /> où U est la vitesse de l&#39;eau de surface moyenne, g est la constante gravitationnelle, et d est la profondeur de l&#39;eau (représenté sur la figure 1). La fonction de la tête de vitesse est alors donnée par: Équation 3: <img alt="Équation 3" src="/files/ftp_upload/53285/53285eq3.jpg" /> Cette fonction de tête peut ensuite être utilisé pour calculer la forme du lit-composant à base des fonctions de la vitesse du sous-sol en résolvant l&#39;équation de Laplace avec une profondeur de lit de sable 20 constante. La seconde composante de la vitesse de l&#39;eau interstitielle est déterminée par la pente du système, S, ce qui correspond à un gradient gravitationnel de la tête que les rendements circulent dans la direction en aval proportionnelle às / ftp_upload / 53285 / 53285eq_S_inline.jpg &quot;/&gt; Les fonctions finales pour la vitesse de l&#39;eau interstitielle sont.: Equation 4: <img alt="Equation 4" src="/files/ftp_upload/53285/53285eq4.jpg" /> Equation 5: <img alt="Equation 5" src="/files/ftp_upload/53285/53285eq5.jpg" /> où u est la composante longitudinale de la vitesse, v est la composante verticale de vitesse, K est la conductivité hydraulique moyenne du sédiment, est la porosité moyenne des sédiments, y est la coordonnée verticale, et D est la profondeur des sédiments. Simulations de suivi de particules ont été créés, qui utilisent le langage de modélisation de NetLogo et plateforme de simulation 23. Les deux implémentations (Mousedrop.nlogo et Interface.nlogo) utilisent ces équations pour modéliser Hyporheic flux avec le même noyau de simulation. La principale différence est l&#39;emplacement de départ des particules de traceur. Mousedrop permet à l&#39;utilisateur de placer n&#39;importe où traceur simulé sous la surface. Les équations de vitesse de sous-sol 4 et 5 sont utilisées pour déplacer le traceur de simuler des expériences d&#39;injection de colorant. Dans l&#39;interface, traceur est toujours placé le long de la frontière surface / souterrain d&#39;une manière flux pondérés. Cela imite la livraison de matières dissoutes et en suspension de l&#39;eau de surface dans le l&#39;eau interstitielle, qui est cruciale pour comprendre l&#39;échange hyporhéique. Le traceur se déplace ensuite dans le sous-sol jusqu&#39;à ce qu&#39;il atteigne à nouveau l&#39;eau du ruisseau. Traçage des chemins de colorant dans le canal et simulant les chemins à l&#39;aide NetLogo donne les lignes de courant du champ d&#39;écoulement, pourvu que les conditions d&#39;écoulement et de forme du lit morphologie restent stables au cours de la période d&#39;observation. Interface.nlogo crée une distribution de temps de séjour cumulé, qui montre le rapport du nombre departicules de traceur restant dans les sédiments au nombre initial de particules de traceur temps mis à 0 en fonction du temps. Comme indiqué dans une étude récente de la littérature 24, il reste un débat considérable au sein de la communauté de la recherche en éducation sur les mérites relatifs de mains sur les expériences de laboratoire par rapport à des laboratoires de simulation et des modèles informatiques. D&#39;une part, certains estiment que &quot;l&#39;expérience pratique est au cœur de l&#39;apprentissage&quot; 25, et la prudence que les arguments d&#39;économies peuvent être alimentent le remplacement de mains sur les activités de laboratoire par des simulations sur ordinateur, au détriment des la compréhension des élèves 26. D&#39;autre part, certains chercheurs en sciences de l&#39;éducation / d&#39;ingénierie font valoir que les simulations sont au moins aussi efficaces que les traditionnels ateliers pratiques 27, ou de discuter des avantages de la simulation par ordinateur dans la promotion centrée sur l&#39;étudiant &quot;apprentissage par la découverte&quot; 28. Alors que le consensus n&#39;a pas été relui faisait mal, de nombreux chercheurs ont conclu que, dans l&#39;idéal, des simulations informatiques devraient compléter, plutôt que remplacer, les mains sur les expériences de laboratoire 29,30. Il ya également eu des initiatives au sein de la science et de l&#39;éducation d&#39;ingénierie pour coupler simultanément l&#39;expérimentation physique et de détection avec des simulations informatiques de phénomènes du monde réel; voir, par exemple, &quot;la modélisation bifocale&quot; 31. Les étudiants peuvent acquérir une connaissance conceptuelle plus profonde et une meilleure compréhension du processus de la recherche scientifique en interagissant avec à la fois un système physique, et une simulation par ordinateur de ce système. Cette procédure implique d&#39;avoir des étudiants réaliser une expérience de transport de soluté qui démontre flux d&#39;échange hyporhéique gravitationnelle et induite par la forme du lit, et correspondent à leur propre dispositif expérimental et les résultats d&#39;une simulation informatique des mêmes phénomènes. Cette comparaison facilite les résultats des élèves-apprentissage importants, et une discussion plus approfondie de til la méthode scientifique, et l&#39;interaction entre la théorie bâtiment-modèle / et validation empirique à travers la collecte de données. Après avoir effectué cette comparaison, les étudiants peuvent également profiter des avantages de la simulation sur ordinateur pour explorer rapidement une multitude de scénarios alternatifs en changeant les paramètres du modèle.

<table><tbody><tr><td>Canal</td> de laboratoire <td>d’ingénierie de</td> conception <td>de canal Canal de laboratoire personnalisé</td><td>avec côtés transparents pendant 24 à 48 heures. Alternativement, un petit toboggan pédagogique peut être construit pour moins de 300 dollars en suivant les directives fournies dans nos documents supplémentaires.</td></tr><tr><td>Débitmètre</td><td>Rosemount&nbsp ;</td><td>8800 vortex&nbsp ;</td><td>Celui-ci est situé à l’intérieur de la boucle de recirculation du canal</td></tr><tr><td>Sable</td><td>US. Silice</td><td>F30</td><td>Sable de qualité recherche pour former une couche de 10 à 20 cm de profondeur dans tout le canal</td></tr><tr><td>Colorant</td><td>Échantillons d’entreprises</td><td></td> alimentaires <td>Colorant soluble dans l’eau transformé en solution aqueuse. Les couleurs sombres comme le rouge, le bleu et le vert fonctionnent mieux. (Évitez les colorants alimentaires dans le propylène glycol.)</td></tr><tr><td>Seringue</td><td>HSW</td><td>4100.000V0</td><td>5-10 ml, p.ex. HSW Norm-Ject Seringue jetable en 2 parties</td></tr><tr><td>Aiguille à pipeter</td><td>Cadence Science</td><td>7942</td> calibre <td>14, extrémité émoussée de 6 po, pour injecter le colorant profondément dans le sable.</td></tr><tr><td>Appareil photo numérique</td><td>N’importe quel</td><td></td><td>appareil photo numérique avec trépied stable. (Les caméras Time Lapse peuvent être utilisées pour collecter des données rapides et régulièrement espacées.) Nous avons utilisé un Nikon D7000.</td></tr><tr><td>Règle</td><td>: N’importe quel</td><td></td><td>transparent est le meilleur.</td></tr><tr><td>Mètre ruban</td><td>Any Netlogo</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Software</td><td>CCL</td><td></td><<td>a href="http://ccl.northwestern.edu/netlogo/">http://ccl.northwestern.edu/netlogo/</a></td></tr><tr><td>Mousedrop.nlogo</td><td>Netlogo Commons</td><td>4259</td><td><a href="http://modelingcommons.org/browse/one_model/4259">http://modelingcommons.org/browse/one_model/4259</a></td></tr><tr><td>Interface.nlogo</td><td>Netlogo Commons</td><td>4258</td><td><a href="http://modelingcommons.org/browse/one_model/4258">http://modelingcommons.org/browse/one_model/4258</a></td></tr></tbody></table>

visualisation hyporhéique flow through bedforms utilisant des expériences de colorant et simulation

Visualizing Hyporheic Flow Through Bedforms Using Dye Experiments and Simulation

Advection échange entre l&#39;espace des pores de sédiments et la colonne d&#39;eau recouvrant, appelé échange hyporhéique dans des environnements fluviaux, entraîne le transport de soluté dans les rivières et de nombreux processus biogéochimiques importants. Pour améliorer la compréhension de ces processus par la démonstration visuelle, nous avons créé une simulation d&#39;écoulement hyporhéique dans la plate-forme multi-agent de modélisation informatique NetLogo. La simulation montre traceur virtuelle circulant dans un cours d&#39;eau recouvert de bedforms deux dimensions. Sédiments, écoulement, formes de relief et les caractéristiques sont utilisés comme variables d&#39;entrée pour le modèle. Nous illustrons comment ces simulations correspondent à des observations expérimentales à partir d&#39;expériences de laboratoire en canal basé sur des paramètres d&#39;entrée mesurées. Colorant est injecté dans les sédiments en canal de visualiser l&#39;écoulement de l&#39;eau interstitielle. A titre de comparaison particules de traceur virtuelles sont placés aux mêmes endroits dans la simulation. Cette expérience de simulation et de laboratoire couplé a été utilisé avec succès dans de premier cycle et Gradualaboratoires te de visualiser directement les interactions fleuve-eau interstitielle et montrent comment des simulations de flux à base physique peuvent se reproduire les phénomènes environnementaux. Les étudiants ont pris des photographies du lit à travers les murs en canal transparentes et les ont comparés à des formes de la teinture à la même heure dans la simulation. Il en est résulté des tendances très similaires, ce qui a permis aux étudiants de mieux comprendre à la fois les régimes d&#39;écoulement et le modèle mathématique. Les simulations permettent également à l&#39;utilisateur de visualiser rapidement l&#39;impact de chaque paramètre d&#39;entrée en exécutant plusieurs simulations. Ce processus peut également être utilisé dans des applications de recherche pour illustrer des processus fondamentaux, concernent les flux d&#39;interface et le transport de l&#39;eau interstitielle, et de soutenir la modélisation quantitative basée sur les processus.

L&#39;utilisation d&#39;une simulation en conjonction avec des expériences permet aux élèves d&#39;observer les similitudes et les différences entre les modèles mathématiques idéalisés et des systèmes réels plus complexes. La figure 4 montre un exemple comparant colorant photographies d&#39;injection avec des simulations Mousedrop. La photographie initiale est utilisée pour déterminer l&#39;emplacement du traceur de colorant simulée au temps zéro, puis la simulation est exécutée pour 34,2 min e...

Ce manuscrit décrit comment créer des formes de lit régulières dans un canal, visualiser l’écoulement à travers les formes de lit et utiliser des simulations informatiques pour simuler l’écoulement hyporhéique. Les simulations informatiques se comparent bien aux observations expérimentales. Cette simulation et cette expérience couplées sont bien adaptées à la fois à la recherche et à l’éducation.

Visualisation hyporhéique Flow Through bedforms utilisant des expériences de colorant et Simulation

Advective exchange between the pore space of sediments and the overlying water column, called hyporheic exchange in fluvial environments, drives solute ...

L'objectif général de cette procédure est de démontrer expérimentalement l'écoulement hypo EIC à l'aide d'un logiciel de modélisation qui crée une simulation correspondant fortement à l'expérience physique. Cette méthode peut aider à illustrer des concepts clés dans le domaine de l'hydrologie en montrant comment l'écoulement de l'eau à travers les sédiments sous un cours d'eau est influencé par les sédiments, la topographie et les propriétés de l'eau de surface. Bien que cette méthode puisse être utilisée pour étudier l'écoulement hyper EIC, elle peut également être employée dans un laboratoire pédagogique afin de démontrer l'écoulement hyper EIC aux étudiants de tous niveaux.Le principal avantage de cette technique est qu'elle associe des expériences de laboratoire physiques à un logiciel informatique interactif qui simule le même phénomène. La démonstration visuelle met en évidence les similitudes et les différences spatiales entre les expériences physiques et les simulations, ce qui favorise le développement d'une compréhension approfondie des principes hyper. Commencez par installer le logiciel requis, à savoir NetLogo, ainsi que deux scripts à exécuter dans Net.Logo, chute de souris et interface. Ensuite, en suivant les instructions du protocole écrit, configurez le canal expérimental de manière à ce que tous les paramètres se situent dans les limites définies par les contraintes des paramètres de simulation de la chute de souris. Faites fonctionner le canal pendant 12 à 24 heures afin de créer une forme de fond présentant les caractéristiques souhaitées.Réglez la pente du canal et la profondeur de l'eau afin d'obtenir un écoulement uniforme sur la forme du lit. L'objectif est que les grains de sédiment dans les formes du lit ne semblent pas en mouvement, bien qu'un léger déplacement puisse être inévitable. Commencez par établir un écoulement uniforme pendant que la pompe est en marche.Sélectionnez deux points situés au fond du canal et enregistrez la distance entre chaque point et la surface de l'eau. Ensuite, ajustez la pente du canal ou la profondeur de l'eau jusqu'à ce que ces mesures de distance verticale soient identiques. Deuxièmement, arrêtez la pompe et attendez que l'eau cesse de bouger.Ensuite, aux mêmes emplacements qu'auparavant, mesurez les distances entre le fond du canal et la surface de l'eau, puis mesurez la distance horizontale entre ces relevés verticaux. Calculez la pente du canal comme étant la différence entre ces mesures divisée par la distance horizontale en pente qui les sépare. Maintenant, redémarrez la pompe et sélectionnez une section d'essai.Choisissez un emplacement près du milieu ou de l'extrémité aval de la conduite où les dunes ont formé un motif régulier. Cette section doit englober au moins une forme de fond complète. Dans la section d'essai.Effectuez plusieurs mesures à l’aide d’une règle transparente. Déterminez d’abord la profondeur moyenne du sédiment en prenant des mesures au creux d’une dune et au sommet d’une dune. La différence entre ces mesures correspond à la hauteur de la forme du lit.Ensuite, déterminez la profondeur moyenne de l'eau, correspondant à la distance moyenne entre la surface de l'eau et la surface du lit de sable. Puis mesurez et enregistrez la longueur d'onde moyenne des formes du lit en mesurant la distance entre les crêtes successives des dunes. Ensuite, enregistrez le débit du canal à partir d'un débitmètre situé dans la boucle de recirculation et calculez la vitesse moyenne d'écoulement.Ouvrez maintenant la simulation de chute de souris et vérifiez que toutes ces mesures se situent dans les plages spécifiées dans l'interface utilisateur. Si un paramètre mesuré se situe en dehors de la plage de contrainte, ajustez la plage du paramètre en cliquant avec le bouton droit sur le curseur, en sélectionnant « modifier » et en ajustant les valeurs minimale et maximale. Commencez par installer une caméra sur un trépied, orientée orthogonalement par rapport à la paroi du canal.L'image doit être centrée sur une seule forme de lit dans la section d'essai. Si des reflets posent problème, fixez la position de la caméra et ajustez l'éclairage ; inclure une règle sur l'image peut aider à l'échelle. Ensuite, à l'aide d'une seringue et d'une aiguille, effectuez deux ou trois petites injections de colorant près de la paroi de la conduite. Ces injections doivent former des zones de deux centimètres de large d'eau colorée, qui doivent être placées à divers emplacements verticaux et horizontaux. Enregistrez l'heure de début des injections de colorant et prenez une photo initiale. Il peut être instructif d'utiliser du papier transparent pour tracer les fronts initiaux de D et les limites entourant le colorant.Ainsi, il est plus facile d'observer leurs déplacements en laboratoire, mais cette méthode présente des inconvénients. À l’aide de la caméra, enregistrez les positions des fronts de D aux intervalles de temps appropriés. Pour la photographie en accéléré, utilisez des intervalles de 1/32 pour des résultats fluides.Pour une simulation. Exécutez d'abord la chute de souris et comparez les résultats avec le transport de colorant observé. Dans la chute de souris, ajustez les paramètres du système physique afin qu'ils correspondent aux conditions expérimentales des canaux.Veillez à prêter une attention particulière aux unités lors de la saisie de ces paramètres. Ensuite, ajustez les curseurs pour indiquer les moments auxquels la couleur de suivi de la simulation changera. Réglez ces changements de couleur afin qu'ils correspondent aux temps observés.Si les paramètres de temps sont tous réglés à zéro, la simulation affichera une couleur unique sur l'ensemble de la surface. Une fois tous les paramètres définis, cliquez sur le bouton de configuration. La forme du lit devrait apparaître dans la vue de la simulation.Ensuite, cliquez sur le bouton de dépôt de la souris pour indiquer les positions initiales des traceurs virtuels. Vous pouvez cliquer sur plusieurs emplacements dans le lit. Maintenez le bouton de la souris enfoncé pour libérer davantage de traceur virtuel.Une fois que tous les traceurs virtuels ont été placés, vous pouvez cliquer sur le bouton avancer au moment suivant pour exécuter la simulation. Jusqu'au temps un, ne recliquez pas sur le bouton de configuration, sinon les traceurs devront être replacés. Vous pouvez également cliquer sur le bouton démarrer arrêter pour exécuter la simulation.Les traceurs continueront de bouger jusqu'à ce que tous les traceurs virtuels aient quitté le système, sauf si vous appuyez sur le bouton « go stop ». Là encore, cela peut être utilisé pour interrompre la simulation, afin de permettre des comparaisons entre les distributions simulées et mesurées du colorant. Une fois la simulation lancée, la vitesse est calculée pour l'emplacement de chaque traceur.En fonction des paramètres de simulation, le traceur se déplace vers un nouvel emplacement en utilisant cette vitesse, puis la procédure est répétée jusqu'à ce que le traceur quitte le système. Ensuite, exécutez la simulation de l'interface en cliquant sur « setup », suivi de « go stop ». Cela lancera la simulation avec les paramètres par défaut.La simulation de l'interface introduit les traceurs virtuels à la surface du lit de cours d'eau de manière pondérée par le flux, selon les vitesses sous-jacentes calculées. Par défaut, les particules laissent des trajectoires montrant les endroits qu'elles ont parcourus. Désactivez le bouton afficher les trajectoires pour supprimer ces chemins. Activer l'interrupteur de la goutte rouge désactive le tracé de la distribution cumulative du temps de séjour et libère une nouvelle particule à chaque fois.On quitte le système. Après avoir observé la simulation avec les paramètres par défaut, cliquez sur « go stop » pour arrêter la simulation. Ensuite, modifiez un ou plusieurs paramètres, puis redémarrez la simulation avec les nouveaux paramètres en cliquant sur « setup », suivi de « go stop ». Ici, nous avons ajusté la hauteur de la forme du lit, exécuté la simulation, puis répété le processus en modifiant la profondeur du lit afin de comparer la simulation aux résultats expérimentaux.La photographie initiale a été utilisée pour déterminer le positionnement du traceur D simulé au temps zéro. Ensuite, la simulation a été exécutée pendant 34,2 minutes et comparée à une photographie prise à ce moment-là. Dans l'ensemble, le modèle a très bien fonctionné.Chaque blob D se déplace dans les mêmes directions générales que le modèle et se déforme de manière similaire aux blobs D simulés. Toutefois, un examen attentif révèle certaines différences. Par exemple, le blob D situé à droite forme davantage une forme de haricot par rapport à la simulation.Cela est probablement dû à la dépression observable dans la topographie de la forme du lit juste au-dessus de ce blob, qui s'est formée lors de son injection dans le sédiment. Une autre divergence fréquente concerne le chronométrage, qui n'était pas non plus parfait. Cela est probablement dû à de légères erreurs dans les mesures des propriétés du sédiment.Les écarts courants proviennent d'une combinaison d'erreurs de mesure et d'effets physiques du second ordre dus à la variabilité de la géométrie irrégulière des formes du lit et au tassement des sédiments, entre autres. Une fois maîtrisée, cette technique peut être réalisée en 24 heures. Lors de l'exécution de cette procédure, il est important de laisser la forme du lit se stabiliser, de faire preuve de patience et de prêter attention aux unités lors de la prise et de la saisie des mesures.Après avoir suivi cette procédure, d'autres expériences peuvent être réalisées afin de répondre à des questions supplémentaires concernant l'influence de la topographie, de la conductivité hydraulique et des propriétés de l'eau de surface sur l'écoulement hyper. Après avoir visionné cette vidéo, vous devriez avoir une bonne compréhension de la manière de visualiser expérimentalement l'écoulement hyper et de l'utilisation de nos simulations informatiques.

visualizing-hyporheic-flow-through-bedforms-using-dye-experiments

Research

Recherche

JoVE Journal

Engineering

Ingénierie

Dispositifs microfluidiques peuvent être utilisées pour visualiser processus naturels complexes en temps réel et à l'échelle physique approprié. Nous avons développé un dispositif simple microfluidique qui imite les principales caractéristiques des milieux poreux naturels pour étudier la croissance et le transport des bactéries dans le sous-sol.

Fenêtre sur un micromonde: Simple systèmes microfluidiques pour l&#39;étude de Transports microbienne dans les milieux poreux

Les biofilms ont des interactions complexes avec leur environnement. Pour étudier de manière exhaustive les interactions biofilm-environnement, nous présentons ici une série de méthodes permettant de créer un environnement chimique hétérogène pour le développement de biofilms, de quantifier la vitesse d’écoulement locale et d’analyser le transport de masse dans et autour des colonies de biofilms.

Méthodes de caractérisation de la Co-développement de biofilms et Habitat Hétérogénéité

Cette étude présente une méthode d'excavation pour enquêter sur sous-sol hydrologique, géochimiques, et l'hétérogénéité microbiologique d'un lysimètre du sol. Le lysimètre simule un versant artificiel qui était initialement dans des conditions homogènes et avait été soumis à environ 5000 mm d'eau sur huit cycles d'irrigation dans une période de 18 mois.

Sol Lysimètre Excavation pour Coupled hydrologiques, géochimiques et microbiologiques Enquêtes

Le manuscrit présente un protocole pour la conduction des expériences de transport de sédiments de lit-charge où les particules en mouvement sont suivies par une analyse d'image. L'installation expérimentale, les procédures de réalisation de l'exécution et le traitement des données, et enfin certains résultats de preuve de concept sont présentés ici.

Suivi de particules Lagrangian basé sur l&#39;image dans les expériences de charge de lit

Un protocole pour l’étude de la diffusion des traceurs passives en écoulement laminaire de par la pression est présenté. La procédure est applicable aux différentes géométries de tuyau capillaire.

La Diffusion des traceurs passifs dans un écoulement laminaire cisaillé

L'objectif du protocole est de permettre la visualisation des champs d'écoulement détaillés et la détermination du cisaillement proche de la frontière et des contraintes normales dans un trou d'équilibre induit par un pipeline vibrant.

Visualisation du champ de flux autour d'un pipeline vibrant dans un trou d'équilibre

Pour quantifier le flux microvasculaire des séquences d'images capillaires à grande vitesse, nous avons développé le logiciel STAFF (Spatial Temporal Analysis of Fieldwise Flow). Sur l'ensemble du champ d'images et au fil du temps, STAFF évalue les vitesses de débit et génère une séquence de cartes spatiales codées en couleur pour la visualisation et la sortie tabulaire pour les analyses quantitatives.

Analyse temporelle spatiale du flux en champ dans la microvasculature

Ce protocole décrit la simulation, la fabrication et la caractérisation des absorbeurs THz métamatériaux. Ces absorbeurs, lorsqu'il est couplé avec un capteur approprié, ont des applications dans l'imagerie THz et spectroscopie.

Simulation, fabrication et caractérisation de THz Absorbeurs métamatériaux

Les expériences à haute pression et à haute température décrits ici imitent les processus de différenciation intérieur de la planète. Les processus sont visualisées et mieux compris par imagerie à haute résolution en 3D et l'analyse chimique quantitative.

Simulation de la différenciation planétaire Intérieur processus dans le laboratoire

Une cellule de cisaillement est développé pour petits angles des mesures de diffusion de neutrons dans le gradient de cisaillement plan-vitesse et de vitesse est utilisée pour caractériser les fluides complexes. Mesures résolues spatialement dans la direction de gradient de vitesse sont possibles pour l'étude des matériaux cisaillement baguage. Les applications comprennent les enquêtes de dispersions colloïdales, des solutions de polymères, et des structures auto-assemblées.

Mesure microstructure du matériau sous flux utilisant 1-2 Avion Flow-Petit Angle Neutron Scattering

Découvrez la visualisation du flux hyporhéique à l'aide d'expériences de colorant et de simulations NetLogo. Cette méthode combine expérimentation physique et modélisation informatique pour illustrer les principes hydrologiques.

Visualisation hyporhéique Flow Through bedforms utilisant des expériences de colorant et Simulation

Explorer plus de vidéos