משופר מופחת ייצוג Bisulfite רצף להערכה של DNA מתילציה ברזולוציה בסיסי זוג

27.5K צפיות

צוטט 115 פעמים

13:47 דק׳

24 בפברואר 2015

10.3791/52246-v

24 בפברואר 2015

27.5K צפיות

Francine E. Garrett-Bakelman^*¹ , Caroline K. Sheridan^*¹ , Thadeous J. Kacmarczyk¹ , Jennifer Ishii¹ , Doron Betel¹^,² , Alicia Alonso¹ , Christopher E. Mason³ , Maria E. Figueroa⁴ , Ari M. Melnick¹

¹Department of Medicine, Weill Cornell Medical College, ²Institute for Computational Biomedicine, Weill Cornell Medical College, ³Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medical College, ⁴Department of Pathology, University of Michigan

^* These authors contributed equally

ייצוג מופחת משופר ריצוף ביסולפיט הוא שיטה להכנת ספריות ריצוף לניתוח מתילציה של DNA המבוססת על עיכול אנזימי הגבלה בשילוב עם המרת ציטוזין ביסולפיט. פרוטוקול זה דורש 50 ננוגרם של חומר התחלתי ומניב נתוני רזולוציית זוגות בסיסים באזורים גנומיים עשירים ב-GC.