Generazione, purificazione e caratterizzazione di specie DISC1 Cell-invasive Protein

Sommario

Invasione La generazione, la purificazione e la cellula del intracellulari, aggresomes citoplasmatici pieno di proteine ​​DISC1 lunghezza da colture cellulari e di una etichetta, multimerico DISC1 frammento di proteina ricombinante in E. coli Sono descritti. Invasività cella è indicato per cellule riceventi in coltura cellulare e per i neuroni In vivo Dopo l'inoculazione del cervello stereotactical.

Abstract

Aggregazione proteica è visto come una caratteristica generale croniche, condizioni degenerative del cervello, come, per esempio, nelle malattie neurodegenerative malattia di Alzheimer (Ap, tau), morbo di Parkinson (α-sinucleina), malattia di Huntington (polyglutamine, huntingtina), e altri. L'aggregazione delle proteine ​​è pensato per verificarsi a causa di proteostasis disturbato, cioè lo squilibrio tra il sorgere e degradazione delle proteine ​​mal ripiegate. Da notare che le stesse proteine ​​si trovano aggregati in forme sporadiche di queste malattie che sono mutante in rare varianti di forme familiari.

La schizofrenia è una malattia cronica progressiva del cervello che in molti casi va di pari passo con un deficit cognitivo permanente e irreversibile. In un approccio del gene candidato, abbiamo studiato se turbativa-in-1 schizofrenia (DISC1), un gene clonato in una famiglia scozzese con concatenamento a cronica malattia mentale ^{1, 2,} potrebbe essere trovato come aggregati insolubili in brain di casi sporadici di schizofrenia ^3. Utilizzando il CC SMRI, abbiamo identificato in circa il 20% dei casi con CMD, ma non controlli normali o in pazienti con malattie neurodegenerative sarcosile insolubile immunoreattività DISC1 dopo frazionamento biochimica. Successivi studi in vitro hanno rivelato che la propensione aggregazione di DISC1 stata influenzata dalla malattia associata polimorfismo S704C ^4, e che DISC1 aggresomes generati in vitro cellule erano invasivo ^5, simile a quello che era stato mostrato per Ap ^6, tau ^7-9, α -sinucleina ^10, polyglutamine ^11, o SOD1 aggregati ^12. Questi risultati ci hanno spinto a proporre che almeno un sottoinsieme di casi con CMD, quelli con DISC1 aggregato potrebbe essere disordini conformazionali proteiche.

Qui si descrive il modo in cui generare DISC1 aggresomes in cellule di mammifero, purificarle su un gradiente di saccarosio e li usa per cellula-invasività studies. Allo stesso modo, si descrive il modo in cui generare un esclusivo multimerico C-terminale DISC1 frammento, etichetta e purificarlo per gli studi di invasività delle cellule. Utilizzando i multimeri ricombinanti di DISC1 otteniamo l'invasività delle cellule simili come per una simile etichetta sintetico α-sinucleina frammento. Abbiamo anche dimostrato che questo frammento è ripreso in vivo quando stereotassica iniettato nel cervello di animali recipienti.

Protocollo

1. Preparazione di cellule del donatore aggresome: trasfezione di monomerico proteina fluorescente rossa (MRFP) o Enhanced Green Fluorescent Protein (eGFP)-tagged Figura umana intera (FL) DISC1

1. Seed 1,5 x 10 ^6/10 cm parabola umana neuroblastoma NLF (FLN; Children Hospital di Philadelphia, Philadelphia, PA), le cellule in dieci 10 piatti cm e crescere durante la notte. NLF cellule vengono coltivate in mezzo RPMI-1640 integrato con 10% FBS, penicillina / Strepomycin, L-glutammina. Il giorno successivo, le cellule devono essere al 70-80% di confluenza.
2. Transitoriamente transfettare ogni piatto 10 cm con 15 pg di DNA plasmidico e reagenti di trasfezione Metafectene (Biontex, Martinsried, Germania). In breve, per un piatto 10 cm, 15 pg di DNA plasmidico e 30 Metafectene microlitri sono stati aggiunti a 750 pl Opti-MEM, miscelate e incubate a temperatura ambiente per 20 min. 5 piatti sono state trasfettate con pcDNA3.1 MRFP / eGFP-tagged umane (FL) DISC1 e 5 piatti con il eGFP-plasmide solo.

2. AggresomePurificazione di cellule del donatore trasfettate

Il protocollo qui descritto è una combinazione di un metodo per purificare Lewy-Body da tessuto cerebrale ¹³ e un protocollo per isolare grandi aggregati e aggresomes ^14. Poiché i metodi già esistenti sono basati sull'uso di detergenti, l'isolamento di detersivo privo di proteine ​​per l'applicazione in cella-invasività saggi è critica.

1. 48 ore dopo la trasfezione, monitorare l'espressione di eGFP e mRFP/eGFP-DISC1 e confermare la formazione del aggresomes sotto un microscopio a fluorescenza (Figura 1).
2. Lavare le cellule con PBS pH 7.4, raschiare con 400 microlitri di PBS ciascuna, aggiungere 1X cocktail di inibitori delle proteasi (Roche, Indianapolis, IN) e distruggere le cellule utilizzando un omogeneizzatore Precellys24 (tecnologie di Bertin, Francia). In breve, aggiungere 1 ml di sospensione cellulare in una provetta di lisi 2 ml e aggiungere 10 perle di ceramica. Lisare le cellule con 3 x 60 impulsi al secondo. La forza meccanica del processo puòaumentare la temperatura all'interno del campione superiore a 37 ° C quindi occorre prestare attenzione per raffreddare il campione nel ghiaccio dopo la procedura di lisi.
3. Raffreddare le celle su ghiaccio e aggiungere 10 mM MgCl _2, 40 U / ml DNasi A e incubare per 60 min a 37 ° C
4. Preparare soluzioni di 80%, 50%, 20% saccarosio (w / v) in PBS pH 7,4 (10 ml ciascuna).
5. Preparare il gradiente di saccarosio in una provetta da 15 ml falcon, partendo con 2 ml di saccarosio 80%, seguito da 50% e 20%. Versare il gradiente lentamente e fare attenzione a non disturbare i livelli già versato. Strato il lisato digerito sopra il gradiente e centrifugare per 15 min a 1000 xga 4 ° C.
6. Raccogliere accuratamente l'interfase tra lo strato di saccarosio del 50-80% con una pipetta e mescolare con 5 volumi di PBS pH 7,4. Centrifugare per 15 min a 1000 xga 4 ° C. Ripetere il lavaggio altre due volte. In questa interfase, aggresomes sono fluorescenti e possono essere visualizzati in un microscopio a luce UV.
7. Eliminare il supernatante erisospendere il pellet in 250-500 microlitri di PBS pH 7.4. Questo pellet contiene il aggresomes purificata (Figura 2).

3. Trattamento dei destinatari cellule SH-SY5Y con mRFP/eGFP-DISC1 Aggresomes

1. Sementi 5 x 10 ⁴ destinatario SH-SY5Y neuroblastoma umano esprimono costitutivamente GFP-DISC1 (598-854) su vetrini sterili in ciascun pozzetto di una piastra a 24 pozzetti. SH-SY5Y cellule sono coltivate in DMEM/F-12 terreno supplementato con penicillina / streptomicina, aminoacidi non essenziali (NEAA) e 10% di FBS.
2. 24 ore più tardi, aggiungere 10 microlitri in ciascun pozzetto e incubare per 48-72 ore.
3. Lavare le cellule 3 x con PBS pH 7.4 e spegnere fluorescenza extracellulare con 0,04% Trypan Blue per 5 min.
4. Fissare le cellule con 4% PFA in PBS pH 7.4 per 10 min in ghiaccio, lavare una volta con sterile H ₂ O e montare i coprioggetti su vetrini con prolungare oro con DAPI montaggio medio (Invitrogen, USA).
5. Confermare l'assorbimento /invasione di esogenamente aggresomes applicati dalla colocalizzazione con proteine ​​assunti espresse da cellule riceventi in Z-stack immagini.

Eppure, assorbimento / invasione proteina esogena non potrebbe essere rilevata sostanzialmente in parallelo con l'assunzione di proteine ​​della cellula ospite. Nel nostro esempio MRFP-tagged DISC1 aggresomes recluta solubile GFP-tagged DISC1 (598-854) proteina espressa dalla cellula ospite (vedi Figura 3). Foto sono state scattate in un confocale Zeiss LSM 510 o di un microscopio Zeiss AxioVision Apotome2.

4. Generazione di DISC1 ricombinante (598-785)

In una pubblicazione precedente abbiamo analizzato la capacità di vari DISC1 frammenti proteici di auto-interazione basata sulla presenza di auto-associazione domini. Tra tutte le proteine ​​frammenta testato DISC1 umano (598-785) visualizzata la forte propensione multimerizzazione ⁴ (Figura 4). Pertanto, DISC1 umano (598-785) è stato clonato in pET15b (nvagen, Madison, Wisconsin) contenente un 6-istidina N-terminale, espressa in E. coli BL21-(lDE3) Rosetta (Novagen, USA), e purificato in condizioni denaturanti a 8 mol / l urea come descritto ^4. In breve, il protocollo è descritto di seguito.

1. BL21-(IDE3) Rosetta E. coli sono state coltivate in 2 x 500 ml 2YT contenente 5 mM-arginina-HCl, 5 mM MgSO4, 100 pg / ml carbencillin, 35 mg / ml di cloramfenicolo fino ad una OD _600: 0,6-0,8 e DISC1 (598-785) è stata indotta l'espressione con 1 mM IPTG.
2. DISC1 (598-785) è stata espressa per 4 ore a 37 ° C, l'espressione è stata terminata per raccogliere i batteri mediante centrifugazione.
3. Il pellet batterico è stato risospeso in 50 ml di tampone TE (50 mM Tris-HCl pH 8,0, 5 mM EDTA) più 2 mM PMSF, 1% TX-100, 250 ug / ml lisozima, 20 mM MgCl ₂ e 400 ml U/50 DNasi I. Per garantire la completa lisi, la reazione è stata incubata per 30 min a temperatura ambiente con delicata agitazione.
4. Aggiungere 10 mM β-mercaptoethanol (ME) e 500 mM NaCl e incubare per altri 30 min.
5. Spin down corpi di inclusione batterici a 20,000 g per 30 min a 4 ° C.
6. Risospendere il pellet in 50 ml di tampone di estrazione contenente 50 mM Tris pH 8,0, 5 mM di imidazolo, 500 mM NaCl, urea 8 M e 10 mM β-ME e rimuovere detriti mediante centrifugazione a 20,000 g per 30 min a 4 ° C.
7. Lavare il Ni-NTA agarosio matrice con tampone di estrazione. Incubare la risospeso, estratto precleared proteina con Ni-NTA matrice per 2 ore a RT.
8. Lavare il Ni-NTA matrice con tampone di estrazione contenente 12 mM imidazolo.
9. Eluire la proteina lentamente con 15 ml di tampone di eluizione contenente 50 mM Tris, 500 mM NaCl, 300 mM imidazolo, 8 M urea, 1 mM PMSF, 5 mM EDTA e 10 mM β-ME.
10. Dializza la proteina graduale di PBS pH 7,4 contenente 10 mM β-ME.

Dal 1 ° L cultura batterica di partenza, è possibile isolare fino a 50 mg di ricombinante DISC1 (598-785) protein.

α-sinucleina ripiegamento

Per esperimenti con α-sinucleina, 500 microgrammi della proteina ricombinante (Sigma-Aldrich, USA) è stato sciolto in PBS ad una concentrazione di 1 mg / ml. Per ottenere oligomeri, ripiegatura è stata eseguita la notte a 37 ° C, come descritto in una pubblicazione precedente ^10.

5. Etichettatura di DISC1 ricombinante (598-785) con DyLight594

1. Prima del processo di etichettatura successivo, DISC1 (598-785) proteina ha la essere liberato dalla β-ME. Pertanto, la proteina viene dializzato 3 volte al PBS pH 7,4 ad una diluizione di 1:2000.
2. Etichetta 1 mg DISC1 (598-785) con DyLight 594 maleimide (Thermo Scientific, USA) secondo le istruzioni del produttore. In breve, sciogliere 1 mg / ml di proteina in PBS pH 7,4 e si aggiungono 5 TCEP mM di recuperare liberi gruppi tiolici. Aggiungere 20 ml di DMF colorante disciolto nella reazione e incubare per 2 ore a RT.
3. 3 x dializza la proteina di PBS pH7,4 con un rapporto di 1:2000 per 2 h ciascuna.

Per aumentare ulteriormente la purezza della proteina etichettata una sua _{6-etichettato} affinità basata-purificazione su una colonna di Ni-NTA viene eseguita.

4. Lavare 1 ml Ni-NTA matrice (Qiagen, Germania) con 10 ml di PBS pH 7,4.
5. Applicare l'etichetta, proteine ​​dializzato alla colonna e farlo funzionare sulla colonna lentamente.
6. Lavare la proteina con 3 x 20 ml di PBS pH 7,4
7. Eluire la proteina con PBS pH 7,4, 500 mM imidazolo gocce monitorando la banda colorata sulla colonna Ni-NTA per ridurre il volume eluato.
8. Dializza l'eluato a 3 x 10 mM pH 7,4 napi ad una diluizione di 1:2000 per 2 h ciascuna.
9. Utilizzare una siringa sterile 0,45 micron filtro per filtrare l'eluato, aliquota in 5 x 100 campioni ul e congelare in azoto liquido a scatto. La quantità totale di proteine ​​dovrebbe essere di 0,5-1 mg / ml in ciascuna aliquota 100 ul.

opzionale Concentrazionezione passo

10. Per iniezioni stereotactical ratto, la proteina è stata concentrata 10 volte in una velocità-vac (Concentratore Eppendorf 5301). La condizione di buffer finale era di 100 Napi mM.

α-sinucleina Etichettatura

L'etichettatura e purificazione (Ni-NTA colonna) ricombinante della α-sinucleina è stata eseguita in parallelo DISC1 (598-785). Il materiale di partenza è stato totale 500 mg invece di 1 mg per DISC1 (598-785).

6. Trattamento dei destinatari cellule SH-SY5Y con etichetta ricombinante DISC1 (598-785) Proteine

1. Seme 5x10 ⁴ destinatario SH-SY5Y neuroblastoma umano costitutivamente esprimono GFP-DISC1 (598-854) su vetrini sterili in ciascun pozzetto di una piastra a 24 pozzetti.
2. Aggiungi proteina marcata al mezzo di coltura cellulare ad una concentrazione di 5-10 mg / ml ed incubare per 48-72 hr.
3. Lavare le cellule 3 x con PBS pH 7.4 e dissetare estrazionefluorescenza ellular con il 0,04% Trypan Blue per 5 min.
4. Fissare le cellule con 4% PFA in PBS pH 7.4 per 10 min in ghiaccio, lavare una volta con sterile H ₂ O e montare i coprioggetti su vetrini con prolungare oro con DAPI montaggio medio (Invitrogen, USA).
5. Confermare l'assorbimento / invasione di proteina ricombinante esogena applicata da colocalizzazione con proteine ​​assunti espresse da cellule riceventi in Z-stack immagini generate da scansione laser microscopia confocale. Eppure, assunzione di proteina endogena potrebbe non essere rilevata sostanzialmente in parallelo con invasione di proteine ​​della cellula ospite, Z-stack immagini possono ancora confermare la natura invasiva della proteina.

Nel nostro esempio, rec. DISC1 (598-785) * almeno in parte solubile reclute GFP-tagged DISC1 (598-854) proteina espressa dalla cellula ospite (vedi Figura 5A). Per ricombinante α-sinucleina invasione, ma non il reclutamento viene mostrato (Figura 5B). Le foto sono state presesu un confocale Zeiss LSM-510 o un microscopio Zeiss AxioVision Apotome2.

L'iniezione del concentrato (ca. 4 pl di 2,5 mg / mL), etichettati DISC1 (598-785) * nei risultati mPFC nella diffusione della proteina intorno al sito di iniezione, che può essere rilevato anche dopo perfusione dell'animale con 4% PFA in PBS pH 7,4 con una filterset rodamina. Nel nostro esempio DISC1 (598-785) è occupata da una serie distinte di neuroni e può essere monitorato con Z-stack di immagini (Figura 6).

In generale, l'iniezione di altre proteine ​​poi quelle qui utilizzato non comportano necessariamente invasione cellulare. L'evento invasione dipende essenzialmente dalla natura della proteina, tuttavia una purificazione pulita è un prerequisito per ulteriori analisi.

7. Risultati rappresentativi

Aggresomes costituiti ricombinante DISC1-eGFP FL purificato da cellule NLF invaso destinatario SH-SY5Y ceLLS a bassa efficienza (circa 0.3% ^5), come visto da colocalizzazione con microscopia confocale (Figura 3). Come precedentemente segnalato, DISC1 (598-785) espressa e purificata da E. coli formano multimeri ⁴ erano ugualmente cellula-invasiva ad un'efficienza di circa il 20% ⁵ (figura 5A), simile a quella di α-sinucleina che è stato utilizzato in parallelo come controllo positivo (Figura 5B). Labeled DISC1 ricombinante (598-785) espressa e purificata da E. coli è stato anche cellule invasive ai neuroni in vivo quando la proteina è stata multimerico stereotassica iniettato nella corteccia prefrontale mediale di un topo (figura 6; Pum, Bader, Huston, Korth, non pubblicato).

Figura 1. Cellule di neuroblastoma NLF transitoriamente esprimere FP-DISC1 (rosso). Red aggresomes fluorescenti possono essere deteCTED all'interno delle cellule.

Figura 2. Purificata MRFP-tagged DISC1 aggresomes dopo la purificazione in un gradiente di saccarosio.

Figura 3. Immagine fluorescente di aggresomes invaso. MRFP-tagged flDISC1 aggresomes sono stati purificati e incubate con cellule SH-SY5Y neuroblastoma overexpressing solubile GFP-tagged DISC1 (598-854). La presa di una aggresomes etichettati è monitorata da Z-stack immagini su un Laser-Scan microscopio (Zeiss LSM 510).

Figura 4. SEC-profilo di rec. DISC1 (598-785) contenente la S704 e C704 polimorfismi a singolo nucleotide (SNP). Entrambe le varianti mostrano una perturbazione di oligomerizzazione ordinata e la formazione di alto peso molecolare multemporizzatori (freccia rossa). Questa immagine è modificata rispetto alla pubblicazione di Leliveld et al., Biochimica 2009.

Figura 5. Fluorescente Z-pila di foto di invasivo DyLight marcato DISC1 ricombinante (598-785). SH-SY5Y neuroblastoma esprimenti GFP-solubile DISC1 (598-854) sono state incubate con etichettati, proteina ricombinante ad una concentrazione di 5 mg / ml. (A) aggregati rossa mostra l'invasione di rec. DISC1 (598-785), proteine ​​e punti gialli indicano una assunzione di solubile GFP-DISC1 (598-854) in aggregati. (B) ricombinante α-sinucleina (rosso) invade le cellule senza assunzione con una frequenza di circa il 20%. Clicca qui per ingrandire la figura .

Figura 6. Immagine di immunofluorescenzal'etichetta iniettato, DISC1 ricombinante (598-785) della proteina. Z-stack immagini conferma la presenza di rec. DISC1 (598-785) proteina in neuroni corticali di ratto colorate con un anticorpo contro nuclei neuronali (NeuN, verde).

Discussione

In questo studio si descrive la purificazione di mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes da una linea cellulare di neuroblastoma trasfettate, la preparazione e l'etichettatura di una specie di proteine ​​ricombinanti DISC1 e la loro applicazione in cella-invasione delle cellule riceventi esperimenti in vitro e in vivo.

La purificazione di nativi mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes stato sviluppato da protocolli per isolare Lewy corpo come le strutture e grandi aggregati ^{13, 14,} ma modificato per evitare l'uso di detergenti e per minimizzare il rischio di falsi positivi invasione cellulare che potrebbe verificarsi a causa di detergenti facilitato la penetrazione della membrana.

Un miglioramento futuro possibile potrebbe essere la per aumentare ulteriormente la purezza delle aggresomes per sonicazione per membrane completamente separati rimanenti citoscheletro e dalle aggresomes. Aumentando purezza globale, il numero di eventi di invasione totali registrati per grandi aggresomes mAy essere aumentata ^5. Se la definizione limitata della nostra suggerito 3-fase saccarosio è sufficiente per aggresomes di specie altra proteina deve essere testato, in questo senso il protocollo descritto qui dovrebbe essere considerato come un punto di partenza per l'ottimizzazione individuale. Le aggresomes purificati dimostrato di essere molto robusta nelle nostre mani, fasi di lavaggio supplementari (senza detergente) per eliminare le tracce di saccarosio non ridurre in modo significativo il rendimento complessivo.

In una pubblicazione precedente abbiamo descritto che l'assemblaggio di oligomero DISC1 dipende multimerizzazione domini distinti del C-terminale ⁴ (Figura 4). Abbiamo scelto questo frammento solubile di espressione ricombinante in E. coli e successive e Ni-NTA depurazione. Per monitorare la sua multimerizzazione e di confrontare la sua invasività cellulare con un cellulare descritto invasiva proteine ​​come α-sinucleina, abbiamo etichettato DISC1 (598-785) con il colorante fluorescente DyLight594, e rispetto la suacell-invasività con quella altrettanto marcato α-sinucleina. La cella invasività della ricombinante DISC1 frammento è stato notevolmente aumentata rispetto a quella dei nativi, lunghezza DISC1 aggresomes, probabilmente a causa della sua piccola dimensione e purezza molto superiore. Anche in questo caso, la purezza sembra giocare un ruolo decisivo nella cella-invasività.

Nel nostro esempio i aggresomes invasive reclutati proteina solubile omologo della linea cellulare ricombinante bersaglio che è stato espresso in una solubile, cioè cellule disperse forma. L'espressione di una proteina fluorescente (GFP o RFP ad esempio) nella linea cellulare del destinatario è un vantaggio in quanto permette la colocalizzazione di aggresomes invasive e proteine ​​ricombinanti nel termine cellula ricevente tramite Z-stack imaging.

Cellule invasive aggresomes DISC1 e frammenti multimerici espressa e purificata da E. coli potrebbe essere una caratteristica che definisce una malattia conformazionali proteiche relative alla DISC1, DISC1opathies ^15.

Risoluzione dei problemi:

Bassa resa aggresome dopo purificazione gradiente di saccarosio:

Il gradiente di saccarosio introdotto in questo protocollo funziona bene con eGFP/mRFP-DISC1 (FL) aggresomes. Aggresomes costituiti da altre proteine ​​possono essere di dimensioni variabili, pertanto le concentrazioni di saccarosio deve essere ottimizzata da altri utenti.

Insufficiente purificazione di proteine ​​ricombinanti:

Eventuali contaminanti batterici nel processo di purificazione della proteina ricombinante sarà anche essere etichettati in fasi successive del protocollo. Per evitare contaminazioni, eseguire la proteina su una SDS-PAGE e confermare che la proteina ricombinante è almeno del 95% mediante colorazione con Coomassie-blu. Per garantire la massima qualità e resa, il protocollo deve essere ottimizzata per ciascuna singola proteina.

Basso etichettatura efcienza di proteine ​​ricombinanti:

Eventuali contaminazioni che contengono gruppi sulfidrilici liberi diminuirà etichettatura efficiente della proteina. Pertanto, dialisi estensiva e Ni-NTA purificazione basato è obbligatoria.

Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo

Nome	Azienda	Numero di catalogo	Commenti
Reagente nome	Azienda	Numero di catalogo	Commenti
RPMI 1640	Invitrogen	11875-093	Media dipende dalla linea cellulare ospite. La linea cellulare ricevente ottimale deve essere determinato dall'utente.
DMEM/F-12	Invitrogen	11320-033	Media dipende dalla linea cellulare ricevente. La linea cellulare ricevente ottimale deve essere determinato dall'utente.
PBS	Invitrogen	14190-250
Metafectene	Biontex	T020-1.0	Reagenti di trasfezione altri potrebbero funzionare bene, ma non sono stati testati con il nostro protocollo.
Ni-NTA agarosio	Qiagen	30210	Gli esperimenti sono stati fatti con Ni_NTA agarosio da Qiagen, altri fornitori dovrebbero funzionare bene.
DNasi I	Roche	04716728001	Non vi è alcuna necessità di DNasi RNasi libero nel processo di purificazione aggresomes.
Saccarosio	Sigma-Aldrich	S0389
Opti-MEM	Invitrogen	31985-062	Terreno privo di siero funziona così
Penicillina / streptomicina	Invitrogen	15140122	Supplemento per SH-SY5Y e NLF medie
Non-essenziale-aminoacidi (NEAA)	Sigma-Aldrich	M7145	Supplemento per SH-SY5Y medio
Trypan Blue 0,4%	Sigma-Aldrich	T8154	Reagente tossico
DyLight 594 Maleimide	Thermo Fisher Scientific-	46608	Ridotto colorante reattivo cisteina per formare legami stabili tioetere. Disponibile anche in altri colori.
Prolungare oro con DAPI	Invitrogen	P36935	Questo mezzo di montaggio liquido antifade ha dato risultati superiori nelle nostre mani.
Inibitore della proteasi cocktail	Roche	11873580001	Sciogliere 1 tavolo in 500 microlitri H 2 O per soluzione 100X.
Sintetico a-sinucleina	Sigma	S7820	Ripiega come descritto nel testo.
			Tabella di reagenti specifici.
Precellys 24	Bertin Technologies	03119.200.RD000	Non abbiamo testato altri omogenea meccanicanizers diversi da questo. Altro metodo di omogeneizzazione detersivi potrebbe funzionare altrettanto bene, ma non sono stati testati per questo protocollo.
5301 Concentrator (SpeedVac)	Eppendorf	5301 000.210	Necessaria solo se proteina deve essere concentrato.
LSM 510 e AxioVision Apotome2	Zeiss	Vedi catalogo produttori	Entrambi i microscopi porto la capacità di eseguire Z-stack immagini. Questo è un prerequisito per la valutazione solida e seria di eventi invasione.
Coltura cellulare materiale plastico	Nunc	10 piatti cm # 172958, piastre da 24 pozzetti # 142475	L'uso di diverse materie plastiche possa influenzare l'interazione di proteine ​​ricombinanti o aggresomes e le superfici di plastica. Non abbiamo testato materiali diversi da quelli qui descritti.
			Tabella di materiale e attrezzature specifiche.
			Numero Buffer nome contenuto Commenti 1. Crescita media batterica 16 g / l Bacto Tryptone, 10 g / l Bacto estratto di lievito, 5 g / l NaCl, 5 mM-arginina-HCl, 5 mM MgSO4, 100 pg / ml carbencillin, 35 mg / ml di cloramfenicolo Crescere batteri di OD 600: 0,6-0,8 indurre l'espressione con 1 mM IPTG. 2. Risospensione tampone batterica 50 mM Tris-HCl pH 8,0, 5 mM EDTA, 2 mM di PMSF, 1% TX-100, 250 ug / ml lisozima, 20 mM MgCl 2 e 400 U/50 ml DNasi I Resupend pellet batterico da 1 L ovecultura rnight in 50 ml di tampone di risospensione. 3. Proteine ​​estrazione del buffer 50 mM Tris pH 8,0, 5 mM di imidazolo, 500 mM NaCl, urea 8 M e 10 mM b-ME 4. Ni-NTA colonna di tampone di lavaggio 50 mM Tris pH 8,0, 5 mM di imidazolo, 500 mM NaCl, urea 8 M e 10 mM b-ME, 12 mM imidazolo Tampone di estrazione modificato con 12 mM imidazolo aggiunto. 5. Ni-NTA colonna di tampone di eluizione 50 mM Tris, 500 mM NaCl, 300 mM imidazolo, 8 M urea, 1 mM PMSF, 5 mM EDTA e 10 mM b-ME Il tampone di eluizione contiene 10 mm B-ME, che è dializzato in seguito. 6. PBS 8 g / l NaCl, 0,2 g / l KCl, 1,44 g / l Na 2 HPO 4, 0,24 g / l KH 2 PO 4, regolare a pH 7,4 7. Etichettatura del buffer PBS contenente 5 mM TCEP Tabella ricette.