Questo documento descrive i metodi per la generazione, il trattamento farmacologico e l'analisi di espianti derivati dal paziente per valutare le risposte ai farmaci tumorali in un sistema modello preclinico vivo, rilevante per il paziente.
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Articolo metodologico
Questo documento descrive i metodi per la generazione, il trattamento farmacologico e l'analisi di espianti derivati dal paziente per valutare le risposte ai farmaci tumorali in un sistema modello preclinico vivo, rilevante per il paziente.
La comprensione della resistenza ai farmaci e lo sviluppo di nuove strategie per sensibilizzare i tumori altamente resistenti si basano sulla disponibilità di modelli preclinici adatti in grado di prevedere con precisione le risposte dei pazienti. Uno degli svantaggi dei modelli preclinici esistenti è l'incapacità di preservare contestualmente il microambiente tumorale umano (TME) e rappresentare accuratamente l'eterogeneità intratumorale, limitando così la traduzione clinica dei dati. Al contrario, rappresentando la coltura di frammenti vivi di tumori umani, la piattaforma di espianto derivato dal paziente (PDE) consente di esaminare le risposte ai farmaci in un contesto tridimensionale (3D) che rispecchia il più possibile le caratteristiche patologiche e architettoniche dei tumori originali. Precedenti rapporti con PDE hanno documentato la capacità della piattaforma di distinguere i tumori chemiosensibili da quelli chemioresistenti, ed è stato dimostrato che questa segregazione è predittiva delle risposte dei pazienti alle stesse chemioterapie. Allo stesso tempo, le PDE consentono l'opportunità di interrogare le caratteristiche molecolari, genetiche e istologiche dei tumori che predicono le risposte ai farmaci, identificando così i biomarcatori per la stratificazione del paziente e nuovi approcci interventistici per sensibilizzare i tumori resistenti. Questo documento riporta in dettaglio la metodologia PDE, dalla raccolta di campioni di pazienti fino all'analisi degli endpoint. Fornisce una descrizione dettagliata della derivazione dell'espianto e dei metodi di coltura, evidenziando le condizioni su misura per particolari tumori, se del caso. Per l'analisi degli endpoint, ci si concentra sull'immunofluorescenza multiplexata e sull'imaging multispettrale per la profilazione spaziale di biomarcatori chiave all'interno di entrambe le regioni tumorali e stromali. Combinando questi metodi, è possibile generare dati quantitativi e qualitativi sulla risposta ai farmaci che possono essere correlati a vari parametri clinicopatologici e quindi potenzialmente utilizzati per l'identificazione dei biomarcatori.
Lo sviluppo di agenti antitumorali efficaci e sicuri richiede modelli preclinici appropriati che possano anche fornire informazioni sui meccanismi d'azione che possono facilitare l'identificazione di biomarcatori predittivi e farmacodinamici. L'eterogeneitàinter- e intratumorale1,2,3,4, 5 e la TME6,7,8,9,10, 11,12
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1. Raccolta dei tessuti
2. Preparazione Explant
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L'imaging multispettrale di sezioni istologiche colorate con mIF consente l'identificazione e la fenotipizzazione di singole popolazioni cellulari e l'identificazione di componenti tumorali e stromali nell'espianto TME (Figura 2). L'imaging multispettrale è particolarmente utile per l'analisi di tessuti ad alta autofluorescenza intrinseca, come tessuti ad alto contenuto di collagene, in quanto consente di deconvolure il segnale di autofluorescenza da altri segnali ed escluderlo da analisi su.......
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Questo documento descrive i metodi per la generazione, il trattamento farmacologico e l'analisi delle PDE ed evidenzia i vantaggi della piattaforma come sistema modello preclinico. La coltivazione ex vivo di un tumore appena resecato, che non comporta la sua decostruzione, consente la ritenzione dell'architettura tumorale13,24 e, quindi, le interazioni spaziali dei componenti cellulari nella TME e l'eterogeneità intratumorale. Questo metodo dimostra come, utilizz.......
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Niente da rivelare
Ringraziamo i chirurghi e i patologi degli ospedali universitari di Leicester NHS Trust per aver fornito tessuto tumorale resecato chirurgicamente. Ringraziamo anche la struttura di istologia all'interno di Core Biotechnology Services per l'aiuto con la lavorazione dei tessuti e il sezionamento dei blocchi di tessuto FFPE e Kees Straatman per il supporto con l'uso di Vectra Polaris. Questa ricerca è stata sostenuta e finanziata dal Consorzio Explant composto da quattro partner: l'Università di Leicester, l'Unità di Tossicologia MRC, i Laboratori di Scoperta Terapeutica di Cancer Research UK e LifeArc. Un ulteriore supporto è stato fornito dal CRUK-NIHR Leicester Exper....
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| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| Acido acetico | Sigma | 320099 | Reagente colorante |
| Diluente per anticorpi / Blocco, 1x | Perkin Elmer | ARD1001EA | Diluente per anticorpi/tampone bloccante |
| Barnstead NANOpure Diamond | Barnstead | Ultra Pure (UP) H2O machine | |
| Acido citrico monoidrato | Sigma-Aldrich | C7129 | Reagente per tampone citrato |
| Costar Piastre per colture cellulari a pozzetti multipli | Corning Incorporated | 3516 | Piastra multipozzetto a 6 pozzetti |
| DAPI Dilattato | Life Technologies | D3571 | |
| 100 x 17 mm Piatto, Nunclon Delta | ThermoFisher Scientific | 150350 | Piatto da 100 mm di diametro per coltura tissutale |
| DMEM (1x) Dubelcco's Modified Eagle Medium + 4,5 g/L D-glucosio + 110 mg/mL di sodio piruvato | Gibco (Life Technologies) | 10569-010 | Terreno di coltura tissutale (500 mL) |
| DPX mountant | VWR | 360294H | Terreno di montaggio |
| DPX mountant | Merck | 6522 | Terreno di montaggio |
| Acido etilendiamminotetraacetico (EDTA) | Sigma-Aldrich | 3609 | Reagente per tampone |
| TEEosin | CellPath | RBC-0100-00A | Reagente colorante |
| Siero fetale bovino | Gibco | 10500-064 | Per l'uso in coltura tissutale medio |
| 37% Formaldeide | Fisher (Acros) | 119690010 | 10% Formalina |
| iGenix, forno a microonde IG2095 | iGenix | IG2095 | Microonde utilizzato per il recupero dell'antigene |
| Alcool metilato industriale (IMS) | Genta Medical | 199050 | 99% Alcool denaturato industriale (IDA) |
| Software avanzato per l'analisi avanzata delle immagini | Akoya Biosciences | InForm | |
| Leica ASP3000 Tissue Processor | Leica Biosystems | Automated Vacuum Tissue Processor | |
| Leica Arcadia H e C | Leica Biosystems | Bagno di cera per inclusione | |
| Leica RM2125RT | Leica Biosystems | Colorful lineare per microtomo | |
| Leica ST4040 | Leica Biosystems | H& E stainer | |
| Mayer's Haematoxylin | Sigma | GHS132-1L | Reagente di colorazione |
| Millicell Inserti per colture cellulari, 30 mm, PTFE idrofilo, 0,4 &; m | Merck Milipore | PICMORG50 | Inserto per coltura organotipica disc |
| Novolink Polymer Detection System | Leica Biosystems | RE7150-K | Kit di colorazione DAB |
| OPAL 480 | Akoya Biosciences | FP1500001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO) |
| OPAL 520 | Akoya Biosciences | FP1487001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO |
| )OPAL 570 | Akoya Biosciences | FP1488001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO) |
| OPAL 620 | Akoya Biosciences | FP1495001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO |
| )OPAL 650 | Akoya Biosciences | FP1496001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO |
| )OPAL 690 | Akoya Biosciences | FP1497001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO) |
| OPAL 780 / OPAL TSA-DIG Reagente | Akoya Biosciences | FP1501001KT | Fluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO) e reagente TSA-DIG |
| Opal Polimero HRP Ms Plus Rb, 1x | Perkin Elmer | ARH1001EA | HRP polimero |
| Penicillina/soluzione di streptomicina | Fisher Scientific 11548876 | Per l'uso in colture tissutali medium | |
| PhenoChart Whole Slide Contextual Viewer | Akoya Biosciences | PhenoChart | Viewer software per immagini scansionate |
| Compresse saline tamponate con fosfato | Thermo Scientific Oxoid | BR0014G | PBS |
| 1x Plus Amplification Diluent | Perkin Elmer | FP1498 | Diluente fluoroforo |
| Prolong Diamond Antifade Mountant | Invitrogen | P36961 | Supporto per |
| diapositive mediumSlide | Perkin Elmer | Per caricare i vetrini nel Slide Carrier Hotel per la scansione con Vectra Polaris | |
| Sodium Chloride | Fisher | Scientific S/3160/63 | 10% Formalin |
| Sodium Hydroxide pellets | Fisher Scientific | S/4920/53 | Reagente per tampone citrato |
| Tenatex Cera temperata - Rosa (500 g) | KEMDENT | 1-601 | Superficie in cera dentale |
| Thermo Scientific Shandon Sequenza Slide Rack per Immunocolorazione Center | Fisher Scientific | 10098889 | Holder per vetrini e clip per vetrini |
| Thermo Scientific Shandon Plastic Coverplates | Fisher Scientific | 11927774 | Clip per vetrini |
| Tris(idrossimetil)aminometano (Tris) | Sigma-Aldrich | 252859 | Reagente per tampone TE |
| VectaShield | Vecta Laboratories | H-1000-10 | Supporto di montaggio |
| Vectra Polaris Slide Scanner | Perkin Elmer | Vectra Polaris | Slide scanner |
| Xylene | Genta Medical | XYL050 | Agente decerante |
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