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Articolo metodologico

Espianti tumorali derivati dal paziente come piattaforma preclinica "live" per prevedere la resistenza ai farmaci nei pazienti

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DOI:

10.3791/62130

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7 febbraio 2021

In questo articolo

Sommario

Questo documento descrive i metodi per la generazione, il trattamento farmacologico e l'analisi di espianti derivati dal paziente per valutare le risposte ai farmaci tumorali in un sistema modello preclinico vivo, rilevante per il paziente.

Abstract

La comprensione della resistenza ai farmaci e lo sviluppo di nuove strategie per sensibilizzare i tumori altamente resistenti si basano sulla disponibilità di modelli preclinici adatti in grado di prevedere con precisione le risposte dei pazienti. Uno degli svantaggi dei modelli preclinici esistenti è l'incapacità di preservare contestualmente il microambiente tumorale umano (TME) e rappresentare accuratamente l'eterogeneità intratumorale, limitando così la traduzione clinica dei dati. Al contrario, rappresentando la coltura di frammenti vivi di tumori umani, la piattaforma di espianto derivato dal paziente (PDE) consente di esaminare le risposte ai farmaci in un contesto tridimensionale (3D) che rispecchia il più possibile le caratteristiche patologiche e architettoniche dei tumori originali. Precedenti rapporti con PDE hanno documentato la capacità della piattaforma di distinguere i tumori chemiosensibili da quelli chemioresistenti, ed è stato dimostrato che questa segregazione è predittiva delle risposte dei pazienti alle stesse chemioterapie. Allo stesso tempo, le PDE consentono l'opportunità di interrogare le caratteristiche molecolari, genetiche e istologiche dei tumori che predicono le risposte ai farmaci, identificando così i biomarcatori per la stratificazione del paziente e nuovi approcci interventistici per sensibilizzare i tumori resistenti. Questo documento riporta in dettaglio la metodologia PDE, dalla raccolta di campioni di pazienti fino all'analisi degli endpoint. Fornisce una descrizione dettagliata della derivazione dell'espianto e dei metodi di coltura, evidenziando le condizioni su misura per particolari tumori, se del caso. Per l'analisi degli endpoint, ci si concentra sull'immunofluorescenza multiplexata e sull'imaging multispettrale per la profilazione spaziale di biomarcatori chiave all'interno di entrambe le regioni tumorali e stromali. Combinando questi metodi, è possibile generare dati quantitativi e qualitativi sulla risposta ai farmaci che possono essere correlati a vari parametri clinicopatologici e quindi potenzialmente utilizzati per l'identificazione dei biomarcatori.

Introduzione

Lo sviluppo di agenti antitumorali efficaci e sicuri richiede modelli preclinici appropriati che possano anche fornire informazioni sui meccanismi d'azione che possono facilitare l'identificazione di biomarcatori predittivi e farmacodinamici. L'eterogeneitàinter- e intratumorale1,2,3,4, 5 e la TME6,7,8,9,10, 11,12

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Protocollo

1. Raccolta dei tessuti

  1. Dopo l'intervento chirurgico, trasferire campioni di tumore umano appena resecati in un tubo contenente 25 ml di terreno di coltura fresco (il mezzo Eagle modificato di Dulbecco integrato con 4,5 g / L di glucosio e L-glutammina + 1% (v / v) siero fetale del vitello + 1% di penicillina-streptomicina) e conservato su ghiaccio. Elaborare l'espianto entro 2 ore dall'intervento chirurgico in una cappa sterile di classe II.

2. Preparazione Explant

  1. Pulire tutte le attrezzature chirurgiche (lame di innesto / superficie di cera dentale / pinzette) c....

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Risultati

L'imaging multispettrale di sezioni istologiche colorate con mIF consente l'identificazione e la fenotipizzazione di singole popolazioni cellulari e l'identificazione di componenti tumorali e stromali nell'espianto TME (Figura 2). L'imaging multispettrale è particolarmente utile per l'analisi di tessuti ad alta autofluorescenza intrinseca, come tessuti ad alto contenuto di collagene, in quanto consente di deconvolure il segnale di autofluorescenza da altri segnali ed escluderlo da analisi su.......

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Discussione

Questo documento descrive i metodi per la generazione, il trattamento farmacologico e l'analisi delle PDE ed evidenzia i vantaggi della piattaforma come sistema modello preclinico. La coltivazione ex vivo di un tumore appena resecato, che non comporta la sua decostruzione, consente la ritenzione dell'architettura tumorale13,24 e, quindi, le interazioni spaziali dei componenti cellulari nella TME e l'eterogeneità intratumorale. Questo metodo dimostra come, utilizz.......

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Dichiarazioni

Niente da rivelare

Ringraziamenti

Ringraziamo i chirurghi e i patologi degli ospedali universitari di Leicester NHS Trust per aver fornito tessuto tumorale resecato chirurgicamente. Ringraziamo anche la struttura di istologia all'interno di Core Biotechnology Services per l'aiuto con la lavorazione dei tessuti e il sezionamento dei blocchi di tessuto FFPE e Kees Straatman per il supporto con l'uso di Vectra Polaris. Questa ricerca è stata sostenuta e finanziata dal Consorzio Explant composto da quattro partner: l'Università di Leicester, l'Unità di Tossicologia MRC, i Laboratori di Scoperta Terapeutica di Cancer Research UK e LifeArc. Un ulteriore supporto è stato fornito dal CRUK-NIHR Leicester Exper....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Acido aceticoSigma320099Reagente colorante
Diluente per anticorpi / Blocco, 1xPerkin ElmerARD1001EADiluente per anticorpi/tampone bloccante
Barnstead NANOpure DiamondBarnsteadUltra Pure (UP) H2O machine
Acido citrico monoidratoSigma-AldrichC7129Reagente per tampone citrato
Costar Piastre per colture cellulari a pozzetti multipliCorning Incorporated3516Piastra multipozzetto a 6 pozzetti
DAPI DilattatoLife TechnologiesD3571
100 x 17 mm Piatto, Nunclon DeltaThermoFisher Scientific150350Piatto da 100 mm di diametro per coltura tissutale
DMEM (1x) Dubelcco's Modified Eagle Medium + 4,5 g/L D-glucosio + 110 mg/mL di sodio piruvatoGibco (Life Technologies)10569-010Terreno di coltura tissutale (500 mL)
DPX mountantVWR360294HTerreno di montaggio
DPX mountantMerck6522Terreno di montaggio
Acido etilendiamminotetraacetico (EDTA)Sigma-Aldrich3609Reagente per tampone
TEEosinCellPathRBC-0100-00AReagente colorante
Siero fetale bovinoGibco10500-064Per l'uso in coltura tissutale medio
37% FormaldeideFisher (Acros)11969001010% Formalina
iGenix, forno a microonde IG2095iGenixIG2095Microonde utilizzato per il recupero dell'antigene
Alcool metilato industriale (IMS)Genta Medical19905099% Alcool denaturato industriale (IDA)
Software avanzato per l'analisi avanzata delle immaginiAkoya BiosciencesInForm
Leica ASP3000 Tissue ProcessorLeica BiosystemsAutomated Vacuum Tissue Processor
Leica Arcadia H e CLeica BiosystemsBagno di cera per inclusione
Leica RM2125RTLeica BiosystemsColorful lineare per microtomo
Leica ST4040Leica BiosystemsH& E stainer
Mayer's HaematoxylinSigmaGHS132-1LReagente di colorazione
Millicell Inserti per colture cellulari, 30 mm, PTFE idrofilo, 0,4 &; mMerck MiliporePICMORG50Inserto per coltura organotipica disc
Novolink Polymer Detection SystemLeica BiosystemsRE7150-KKit di colorazione DAB
OPAL 480Akoya BiosciencesFP1500001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO)
OPAL 520Akoya BiosciencesFP1487001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO
)OPAL 570Akoya BiosciencesFP1488001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO)
OPAL 620Akoya BiosciencesFP1495001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO
)OPAL 650 Akoya BiosciencesFP1496001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO
)OPAL 690Akoya BiosciencesFP1497001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO)
OPAL 780 / OPAL TSA-DIG ReagenteAkoya BiosciencesFP1501001KTFluoroforo con diluente dimetilsolfossido (DMSO) e reagente TSA-DIG
Opal Polimero HRP Ms Plus Rb, 1xPerkin ElmerARH1001EAHRP polimero
Penicillina/soluzione di streptomicinaFisher Scientific 11548876Per l'uso in colture tissutali medium
PhenoChart Whole Slide Contextual ViewerAkoya BiosciencesPhenoChartViewer software per immagini scansionate
Compresse saline tamponate con fosfatoThermo Scientific OxoidBR0014GPBS
1x Plus Amplification DiluentPerkin ElmerFP1498Diluente fluoroforo
Prolong Diamond Antifade MountantInvitrogenP36961Supporto per
diapositive mediumSlidePerkin ElmerPer caricare i vetrini nel Slide Carrier Hotel per la scansione con Vectra Polaris
Sodium ChlorideFisherScientific S/3160/6310% Formalin
Sodium Hydroxide pelletsFisher ScientificS/4920/53Reagente per tampone citrato
Tenatex Cera temperata - Rosa (500 g)KEMDENT1-601Superficie in cera dentale
Thermo Scientific  Shandon Sequenza Slide Rack per Immunocolorazione CenterFisher Scientific10098889Holder per vetrini e clip per vetrini
Thermo Scientific Shandon Plastic CoverplatesFisher Scientific11927774Clip per vetrini
Tris(idrossimetil)aminometano (Tris)Sigma-Aldrich252859Reagente per tampone TE
VectaShieldVecta LaboratoriesH-1000-10Supporto di montaggio
Vectra Polaris Slide ScannerPerkin ElmerVectra PolarisSlide scanner
XyleneGenta MedicalXYL050Agente decerante

Riferimenti

  1. Gerlinger, M., et al. Intratumor heterogeneity and branched evolution revealed by multiregion sequencing. The New England Journal of Medicine. 366 (10), 883-892 (2012).
  2. Jamal-Hanjani, M., et al. Tracking the evolution o....

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Ristampe e permessi

Tag

Espianti derivati da pazientemicroambiente tumoraleprevisione della resistenza ai farmacicoltura tridimensionaleimmunofluorescenza multipleximaging multispettralesegmentazione cellulareidentificazione dei biomarcatorieterogeneità tumoraleinibitori dei checkpoint immunitari