RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ko_KR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
식물에서 영양소 및 독성 플럭스의 측정은 식물 영양 및 독성 연구에 필수적입니다. 여기에서는 칼륨(K+) 및 암모니아/암모늄(NH3/NH4+) 플럭스를 예로 사용하여 온전한 식물 뿌리의 유입 및 유출 측정을 위한 방사성 추적자 프로토콜을 다룹니다. 이러한 기술의 장점과 한계에 대해 설명합니다.
영양분과 독성 물질의 단방향 유입 및 유출, 그리고 그에 따른 순 플럭스는 식물의 영양 및 독성학의 핵심입니다. 방사성 동위원소 추적은 식물 내부, 식물과 환경 사이에서 이러한 플럭스를 측정하는 데 사용되는 주요 기술입니다. 방사성 추적자 프로토콜로 얻은 플럭스 데이터는 특정 미네랄 영양소 또는 독성 물질에 대한 수송 시스템의 용량, 메커니즘, 조절 및 에너지를 설명하는 데 도움이 될 수 있으며 세포 내 미네랄 및 대사 산물 풀의 구획 및 회전율에 대한 통찰력을 제공할 수 있습니다. 여기에서는 식물 생물학에 사용되는 두 가지 주요 방사성 동위원소 프로토콜인 직접 유입(DI)과 추적자 유출에 의한 구획 분석(CATE)에 대해 설명합니다. 우리는 모델 종 보리(Hordeum vulgare L.)의 온전한 묘목에서 영양소로서의 칼륨(K+)과 독성 물질로서의 암모니아/암모늄(NH3/NH4+)의 플럭스 측정에 중점을 둡니다. 이러한 프로토콜은 다른 실험 시스템(예: 다른 종, 절제된 식물 재료 및 기타 영양소/독성 물질)에 쉽게 적용할 수 있습니다. 이러한 프로토콜의 장점과 한계에 대해 설명합니다.
영양분과 독성 물질의 흡수 및 유통 강하게 식물의 성장에 영향을 미친다. 따라서, 기본 전송 프로세스의 조사가 특히 영양 최적화 및 환경 스트레스의 문맥에서, 식물 생물학 연구 및 농업 과학 1,2의 주요 영역을 구성한다 (예를 들어, 염 스트레스, 암모늄 독성). 식물체에서 플럭스의 측정을위한 방법들 중 최고 상당히 1950 개발 된 방사성 동위 원소 추적자의 사용 오늘날 널리 사용가되고 (도 3 등 참조)이다. 이러한 MIFE (자속 추정 이온 미세 전극)과 SIET (스캔 이온 선택성 전극 기법), 및 사용과 같은 조직에서의 루트 매체 및 / 또는 축적 이온 선택성 진동 미소 전극의 사용으로부터 영양분 고갈의 측정과 같은 다른 방법 이온 - 선택적 형광 염료는 또한 널리 적용되지만, 네트 독감을 검출 할 수있는 능력에 제한이XES (즉, 유입과 유출의 차이). 방사성 동위 원소의 사용은, 다른 한편으로는, 연구원 동역학 매개 변수를 해결하는 데 사용될 수있는 단방향 플럭스를 분리 및 정량화하는 독특한 능력을 허용한다 (예를 들면, K M과 V 최대) 및 용량에 대한 통찰력을 제공 지학, 교통 시스템의 메커니즘 및 규제. 방사성 트레이서 만든 단방향 플럭스 측정은 반대 방향의 자속이 높은 조건에서 특히 유용하고, 세포 풀의 회전율은 4 급이다. 추적 동위 원소는 같은 원소의 다른 동위 원소의 배경에 대해 관찰되어 있기 때문에 또한, 추적자 방법 (아래, '토론'참조) 측정은 많은 다른 기술과는 달리, 상당히 높은 기질 농도에서 수행 할 수 있습니다.
여기서 우리는 단방향 및 N의 방사성 동위 원소 측정을위한 자세한 단계를 제공그대로 식물 등 미네랄 영양소의 플럭스 및 독성 물질. 중점 플럭스 칼륨 (K +)의 측정, 식물 영양소 (5), 암모니아 / 암모늄에 이루어집니다 (NH 3 / NH 4 +), 그러나, 예를 들어, 높은 농도 (에 존재하는 경우 독성이 다른 다량 영양소, 1 10 mM의) 2. 우리는 방사성 동위 원소 (42) K + (t 2 = 12.36 시간)과 13 NH 13분의 3 NH 4 + (t 2 = 9.98 분), 각각 모델 시스템 보리의 손상 모종 (Hordeum의 vulgare의의 L를 사용합니다 .), 두 가지 핵심 프로토콜의 설명 : 추적 유출 (CATE)으로 직접 유입 (DI) 및 compartmental 분석. 우리는이 문서가 단순히 각 프로토콜을 수행하는 데 필요한 단계를 설명합니다 처음부터주의해야한다. 각 기술의 적절한 계산과 이론에 대한 간단한 설명을 제공하지만, 자세한 아르 박람회의 배경과 이론은 주제 4,6-9에 대한 몇 가지 주요 기사에서 찾을 수 있습니다. 중요한 것은,이 프로토콜은 다른 영양소 / 독성 물질의 분석을 플럭스 광범위하게 양도 (예를 들어, 24 나 +, 22 나 +, 86 굽은 +, 13 NO 3 -) 및 다른 식물 종에 대한 몇 가지주의 사항이기는하지만 (아래 참조) . 우리는 또한 방사성 물질로 작업하는 모든 연구자가 기관의 이온화 방사선 안전 규제를 통해 제공 라이센스에 따라 작동해야 중요성을 강조한다.
1 공장 문화와 준비
실험 솔루션 / 소재의 2 준비
내용 "> 참고 : 다음은 일반적으로 이전의 실험에 일일 수행됩니다.3 추적자를 준비
주의 : 다음의 안전 단계가 방사능으로 작업하기 전에주의해야한다.
(4) 직접 유입 (DI) 측정
추적기 유출 (CATE) 측정에 의해 5 Compartmental 분석
그림 1은 높은에서 성장 그대로 보리 모종의 뿌리로 NH 3의 유입에 대한 (13 N)와 DI 기술을 사용하여 찾을 등온선을 보여줍니다 (10 mM)을 NH 4 +, 그리고 하나 (0.02 mM)을 높거나 낮은 (5 mM의 ) K +. (, 용액의 pH 13의 변화에 의해 조정 된 NH 3] 내선) NH 3 플럭스 외부 NH 3 농도의 함수로 플롯 할 때 등온선은 미카엘리스 - 멘텐 반응 속도를 표시합니다. NH 3 플럭스 높은 K의 +보다 낮은 K의 +에서 유의하게 높았다. 미카엘리스 - 멘텐 운동 매개 변수의 분석은 V 최대 강하게 높은 K + (205 대에 감소하는 동안 K M은 K + 수준 (각각 낮고 높은 K +,에서 150 대 90 μ M) 사이의 상대적으로 안정적으로 유지 것을 보여 주었다 80 μmol의 g -1의 시간 -1). 따라서, 데이터를 표시하는 K + 수준 regulatES 질소 수송 (V 최대 효과) 아니지만 수송차의 결합 부위에 대한 K + 및 NH 3 사이의 직접적인 경쟁 (K M 효과)에 의해. 오히려, K + (자세한 내용은, 13 참조) NH에게 같은 아쿠아 포린 활동의 변조를 통해 다른 수단에 의해 3 플럭스를 조절 할 수 있습니다.
DI 인해 영양 변화로도 유입이 상대적으로 빠른 변화를 포착하는 데 유용 또는 약리 에이전트의 응용 프로그램. 예를 들어, 그림이 하이라이트 - K + (0.1 mM)을 중간 및 높은 (10 밀리미터)로 성장 그대로 보리 모종의 뿌리에있는 K + -uptake 시스템의 급속한 소성 -NH 4 + 조건. 여기서 우리는 외부 솔루션에서 NH 4 + 철수의 5 분 이내에 K + 유입에 ~ 3백50% 증가 관찰했다. 이러한 "암모늄 금단 효과"( "AWE")는 K +에 민감한 것으로 밝혀졌다 +), 바륨 (바 2 +), 세슘 (세슘 +). 여러 애기 유전자형에 DI 및 전기 생리 측정을 사용하여, 우리가 할 수 있었던 결정적으로 애기 장대 K + 채널, AtAKT1, 높은 친 화성 K + 수송, AtHAK5 14의 활동 변화에 AWE의 대부분 돌리다.
그림 3은 낮은 (0.1 밀리미터) K +와 (1 mM)을 중간에서 성장 미리 라벨링 보리 모종의 뿌리에서 시간에 42 K +의 정상 상태 유출, NO 3 -. 이러한 추세는 케이트 방법은 다양한 약리 / 영양 에이전트의 응용 프로그램에 따라 유출에 신속하고 상당한 변화를 공개하는 방법을 보여줍니다. K + 유출의 실질적인 즉각적인 억제는 10 mM의 고사 +, K + - 채널 차단제, 또는 급격한 증가의 응용 프로그램 중 하나에 관찰되었다(0.1 ~ 10 mm까지) K + 제공한다. 이러한 결과는 K + 채널 (15)의 외향 정류 게이팅 고유 특성을 나타내는 분자 연구와 일치한다. 대조적으로, 10 mM의 NH 4의 적용은 빠르게 그리고 강하게 K +의 유출을 자극 +. 이 효과는 NH 4 + (17)의 도입시에 발생하는 것으로 알려져 루트 16 세포의 원형질막을 가로 질러 전위 구배의 탈분극을 통해 외향 정류 K + 채널의 활성화에 의해 설명 될 수있다. 따라서,이 방법을 사용하여, 우리는 K + 채널이 보리 (10)의 뿌리에서 K + 유출을 매개 것으로, 발바닥에, 입증 할 수 있었다.
마지막으로, 표 1은 42 K + 유출 ([K +] 내선 = 0.1 mM)을 보리 종자에서 정상 상태의 측정에서 추출 케이트 매개 변수를 보여줍니다10 mM의 NH 4 +, 후자는 독성 시나리오를 나타내는 - lings 중 하나를 1 ㎜ NO 3와 함께 성장. 높은 NH 4 + 조건은 모든 K + 플럭스의 억제 및 세포 내 K + 농도의 유의 한 감소를 초래 ([K +] CYT) 관찰 일반적으로 homeostatically (건강한 성장 조건 18 세 ~ 100 밀리미터로 유지된다, 예를 들어, 표 1에서, NO 3 이하 - 공급).

도 1 (13) 3 NH 유입 등온선 K + 질소 공급 장치가 전송을 조절하는 방법을 보여준다. NH 3 유입 NH 외부의 다양한 농도의 함수로서 4 +와 (빨간색 0.02 밀리미터) 낮거나 (파란색, 5 mM)을 높은 중 K + 높은 (10 mM)을 NH 3로 성장 보리 모종의 본래 뿌리> 3 ([NH 3] 내선). 미카엘리스 - 멘텐 높은 K +의 조항이 NH 3 -uptake 수송의 기판 친 화성 (즉, K M)에 상대적으로 적은 효과가 있지만, 크게 (즉, V 최대 전송 용량을 줄일 것으로 나타났다 등온선 분석, '대표 결과를 참조 '). 헨더슨 - Hasselbalch이 방정식에 따라, NH 4 + 비율 : 주, [NH 3] 내선의 변화에 따라서 NH 3 NaOH로 외부 용액의 pH를 변화에 의해 설립되었다. 오차 막대는 4-7의 SEM은 복제 나타냅니다. (COSKUN 등에서 재현. 쓸데없는 횡단 자전거에 대한 신속한 암모니아 가스 수송 계좌를 NH에서 식물 뿌리에서 3 / NH 4 + 독성. 공장 Physiol. 163, 1859에서 1867 사이 (2013).)

그림 2 NH 4 + 철수 크게 낮은 (0.1 밀리미터) K + 높은에서 성장 그대로 보리 모종의 뿌리에서, 정상 상태에서. K +의 유입 채널 매개 K + 유입을 자극하고, NH 4 +의 철수시 (10 mM)을 NH 4 +. 자극 K + 유입에 K + - 채널 차단제 (10 MM의 티 +, 5 mM의 바 2 +, 10 mM의 고사 +)의 효과는 발음. 일원 분산 분석과 Dunnett의 다중 비교 사후, 별표 * 0.01 <P <0.05, *** P <0.001 -NH 4 + 및 치료 쌍 (사이에 의미의 서로 다른 수준을 나타냅니다테스트). 괄호 안의 별표 제어 및 -NH 4 + 쌍 (학생의 t의 -test) 사이에 의미의 수준을 나타낸다. 오차 막대는> 4 회 반복의 SEM을 나타냅니다. (보리와 애기 장대. 공장 Physiol. 162, 496-511 (2013)의 뿌리 COSKUN 등. 용량 및 칼륨 채널과 높은 친 화성 수송의 가소성에서 재현.)

그림 3 K + 유출 채널 매개 낮은 K가 + 조건하에 정상 상태보기 (1 ㎜) 낮은 (0.1 밀리미터) K + 및 중간에서 성장 그대로 보리 모종의 뿌리에 42 K + 유출 NO 3 -.하고, (t에서 = 15.5 분, 화살표 참조) 즉각적인 효과를 10 mM의 웹 기반 협동 학습의, 5 mM의 K 2 SO4 및 5 mM의 (NH 4) 유출 2 SO 4. 각 플롯은 3-13 회 반복 (SEM <평균의 15 %)의 평균을 나타냅니다. (. COSKUN 등 규제 및 보리 뿌리에서 칼륨 방출 메커니즘에서 재현 :. 란타에서 42 K + 분석 새로운 피톨을 188, 1028에서 1038 사이 (2010)..)
| [K +] 내선 | N 소스 | 유입 | 유출 | 순 유출 | E : I 비율 | 풀 크기 | 반감기 |
| (㎜) | (μmol의의 g -1 시간 -1) | (㎜) | (분) | ||||
| 0.1 | 한 NO 3 - | 7.22 ± 0.23 | 1.86 ± 0.18 | 5.36 ± 0.18 | 0.25 ± 0.02 | 98.84 ± 14.08 | 28.18 ± 3.40 |
| 10 NH 4 + | 1.89 ± 0.13 | 0.57 ± 0.05 | 1.32 ± 0.10 | 0.30 ± 0.01 | 28.39 ± 3.40 | 32.50 ± 4.69 |
표 1 정상 상태 K + 플럭스와 C다양한 N의 규정에 따라 ompartmentation 정상 상태 플럭스 및 0.1 mM의 K +에서 성장 보리 모종의 compartmental 분석, 중 중간 NO 3 -. (1 ㎜, 칼슘 염) 또는 높은 NH 4 + (10 mM의 같은 SO 4 2 소금). 오류> 8 회 반복의 ± SEM을 나타냅니다. 1028에서 1038 사이 (2010, 188 란타에서 42 K + 분석 새로운 피톨을) 및 COSKUN 등 용량 및 칼륨 채널과의 가소성 높은 :... (COSKUN 등 규제 및 보리 뿌리에서 칼륨 방출 메커니즘에서 재현. 보리와 애기 장대. 공장 Physiol. 162, 496-511 (2013)의 뿌리 친 화성 수송.)
저자는 공개할 것이 없습니다.
식물에서 영양소 및 독성 플럭스의 측정은 식물 영양 및 독성 연구에 필수적입니다. 여기에서는 칼륨(K+) 및 암모니아/암모늄(NH3/NH4+) 플럭스를 예로 사용하여 온전한 식물 뿌리의 유입 및 유출 측정을 위한 방사성 추적자 프로토콜을 다룹니다. 이러한 기술의 장점과 한계에 대해 설명합니다.
이 작업은 캐나다 자연과학 및 공학 위원회(NSERC), 캐나다 연구 의장(CRC) 프로그램 및 캐나다 혁신 재단(CFI)의 지원을 받았습니다.
| 감마 카운터 | Perkin Elmer | 모델: Wallac 1480 Wizard 3" | |
| Geiger-Mü ller 카운터 | Ludlum Measurements Inc. | 모델 3 측량 미터 | |
| 400ml 유리 비커 | VWR | 89000-206 | 사전 흡수, 흡수 및 탈착 용액용 |
| 유리 깔때기 | VWR | 89000-466 | 유출 깔때기용 |
| 대형 튜빙 | VWR | 529297 | 유출 깔때기용 |
| 중간 튜빙 | VWR | 684783 | 번들링용 |
| 소형 튜빙 | VWR | 63013-541 | 폭기용 |
| 폭기 매니폴드 | Penn Plax Air Tech | vat 5.5 | 가압 공기를 용액으로 제어/분배하기 위해 |
| 유리 섬광 바이알 | VWR | 66022-128 | 감마 계수용 |
| 유리 원심분리기 튜브 | VWR | 47729-576 | 스핀 건조 루트 샘플용 |
| Kimwipes | VWR | 470173-504 | 스핀 건조 루트 샘플용 |
| 해부 가위 | VWR | 470001-828 | |
| 겸자 | VWR | 470005-496 | |
| 저속 임상 원심 분리기 | International Equipment Co. | 76466M-4 | 스핀 건조 루트 샘플용 |
| ml 피펫 | Gilson | F144493 | |
| 10 ml 피펫 | Gilson | F144494 | |
| 1 ml 피펫 팁 | VWR | 89079-470 | |
| 10 ml 피펫 팁 | VWR | 89087-532 | |
| 분석 저울 | Mettler toledo | PB403-S/FACT |