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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
우리는 전반사 형광 현미경을 사용하여 살아있는 대식세포에서 전례 없는 고해상도 phagosome formation 및 close를 3차원으로 시각화하는 실험 설정을 설명합니다. 이를 통해 phagocytic cup의 기저부, 확장된 pseudopods, phagosome scission의 정확한 위치를 모니터링할
수 있습니다.Phagocytosis는 미생물이나 세포 파편을 내재화하고 제거하기 위해 특수 세포가 사용하는 메커니즘입니다. 그것은 입자 주위의 원형질막 확장의 원동력인 액틴 세포골격(actin cytoskeleton)의 심오한 재배열에 의존합니다. 또한, 큰 물질의 효율적인 삼킴은 세포 내 구획의 국소 외세포작용에 의존합니다. 이 과정은 매우 역동적이며 수많은 분자 플레이어가 식세포컵 형성 중에 역할을 하는 것으로 설명되었습니다. 그러나 이러한 모든 분자의 시공간 내 정확한 조절은 여전히 파악하기 어렵습니다. 또한, phagosome closure의 마지막 단계는 RNA 간섭 또는 우성 음성 돌연변이에 의한 억제가 종종 phagocytic cup 형성을 지연시키기 때문에 관찰하기가 매우 어려웠습니다.
우리는 전반사 형광 현미경(TIRFM)과 에피형광을 사용하여 커버슬립에 느슨하게 결합된 입자 주위에서 자라는 식체에서 유사 포드의 확장과 그 끝을 단계별로 모니터링하기 위한 전용 실험 접근 방식을 설정했습니다. 이 방법을 사용하면 두 개의 서로 다른 형광 태그가 지정된 단백질에 대해 살아있는 세포에서 식체가 닫히는 동안 pseudopods의 끝과 융합을 고해상도로 관찰할 수 있습니다.
식균 작용은 인식을하고 섭취 재료의 국제화 및 저하로 연결하는 수용체를 표면 재료의 결합을 시작하는 중요한 세포 기능이다. 이러한 금형 Dictyostelium의 discoideum 및 아메바 같은 단세포 진핵 생물은 박테리아에 공급하는 식균 작용을 사용하는 반면, 고등 생물 전문 세포로 진화했다. 대 식세포 또는 수지상 세포는 다양한 조직과 기관의 병원균에 대한 방어의 첫 번째 라인이며, 항원 제시 및 사이토 카인 생산 1-4을 통해 적응 면역 체계를 활성화 할 중요하다. 특정 상황에서 식균 작용은 비전문가 탐식 세포, 예컨대, 내피 세포 및 상피 세포에 의해 수행 될 수있다. 이 과정은 개발 과정과 정상 조직의 매출과 리모델링에 대한 성인의 항상성을 유지하는 것이 중요하다. 이러한 고환 또는 망막의 세르 톨리 (Sertoli) 세포와 같은 마지막으로, 전문 식세포색소 상피 세포는 매우 강력한 식세포 5입니다.
phagosome의 형성은 어디 미생물이나 세포 파편의 저하는 탐식 세포의 표면에 식세포 수용체의 클러스터링 시작을 발생합니다. 이러한 Fc 수용체 FCR () 또는 보완 수용체 (CR을) 등의 옵 소닌 수용체의 클러스터링을 다음과 같은 다운 스트림 신호 이벤트가 아니라 특징으로하고있다. 그러나, 수신자 같은 수용체 (TLR에), 렉틴, 만노스 수용체와 스 캐빈 저 수용체 등 다양한 비 옵 소닌 수용체도 있습니다. 이들 수용체는 만노스 또는 푸 코스 잔기, 포스파티딜 세린, 및 리포 폴리 사카 라이드 1,6-9로서 입자 표면에 결정을 인식한다.
병원체 또는 세포 파편 인식에 다음 강렬하고 과도 굴지 리모델링으로 이어질 식세포 수용체의 여러 종류의 클러스터링 바인딩을 포함한다. 세포 내 compartmen의 병렬, 초점 세포 외 유출에TS는 막 긴장의 방출에 기여하고, 큰 입자의 효과적인 식세포 작용에 중요하다. 액틴 중합 막 변형을 유도하는 신호 이벤트는 하나의 식세포 수용체를 유발 실험 모델에서 해부했다. FcRγ 쇄 매개 식균 작용하는 동안, 작은 GTP 아제 (RAC, Cdc42)에 의해 조절된다 강렬한 액틴의 중합이있다. 자신의 다운 스트림 이펙터 중, 비스 코트 - 올드리치 증후군 단백질 (WASP)은 액틴 필라멘트 1,2,4,10를 핵이 액틴 관련 단백질 복합체 2/3 (Arp2 / 3)의 활성화로 연결됩니다. 포스파티딜 이노시톨 -4,5- 비스 포스페이트 (PI (4,5) P (2))의 로컬 생산 pseudopod 형성 초기 구동 액틴 중합 중요하다. PI (3,4,5) P (3) 그 변환은 pseudopod 확장 및 phagosome 폐쇄 (11)가 필요합니다. 여러 경로는 PI (4,5) P (2)의 실종에 기여한다. 포스파티딜 이노시톨 인산염 키나의 첫째 분리phagosome 체포의 PI (4,5) P (2) 합성에서 SES (PIPKIs). 둘째, 인산화 될 수 있고, 내가 키나제 (PI3K)를 PI3K 클래스에 의해 소비 PI (3,4,5) P (3) (12)에 변환됩니다. 포스와 포스 포에 대한 역할은 포유 동물 세포 및 Dictyostelium (13, 14)에 식균 작용 동안 PI (4,5) P (2) 가수 분해 및 F - 굴지 제거 암시하고있다. 포스 포 리파제 C (PLC) δ는 디아 실 글리세롤 및 이노시톨 1,4,5- 트리스 포스페이트에 PI (4,5) P (2)를 가수 분해한다. 된 PI (4,5) P (2)와 PI (3,4,5) P (3) 인산 OCRL은 (로우의 로우 증후군)도 phagosome 형성에 관여하고있다. F - 굴지 및 해중합의 정확한 지역의 형성이 밀접하게 공간과 시간에 규제되고 우리가 세포 내 구획의 모집을 보인 것은 따라서 식세포 컵의 바닥에 지역 굴지의 해중합에 기여하고, 로컬 OCRL 포스 파타 아제를 제공하는 것이 중요하다 phagosome 폐쇄 및 막 절단에 필요한기구 및 분자 선수는 가난 때문에 시각화 및 phagosome 폐쇄의 사이트를 모니터링의 어려움 정의 된 상태로 유지됩니다. 최근까지, 식균 작용은 어려운 phagosome 폐쇄의 사이트의 적시 시각화하고, 자신의 등쪽면에 또는면에 입자를 내면화 고정 또는 살아있는 세포에서 관찰되었다. 또한, 고정 방법은 세포막과 바이어스 pseudopodia 확장 및 폐쇄에 결과의 철회의 원인이 될 수 있습니다. 대조적으로, 우리가 설정하고 여기에 기술 한 분석은 우리가 pseudopod 확장 및 총 내부 반사 현미경 (TIRFM) (16)에 기초하여 살아있는 세포 (13)의 탐식의 폐쇄 단계를 시각화 할 수 있습니다. 이 기술은 광학 투명의 계면에 얇은 영역에서 형광체를 여기하기 위해 소멸 파를 사용하므로뚜껑 (커버 슬립) 및 액체 (세포 배양 배지). 여진 깊이의 두께는 세포막에 가까운 분자 이벤트의 시각화를 허용 고체 표면에서 약 100 ㎚이다. TIRFM 높은 신호 대 바탕 비율을 허용 의한 세포의 조명에 수집 포커스 아웃 형광 세포 독성을 제한한다. TIRFM을 활용, 우리는 커버 슬립이의 IgG-옵 소닌 적혈구 (IgG를-SRBCs)로 코팅 한 후 폴리 리신으로 활성화되는 "phagosome 폐쇄 분석"을 개발했다. 관심 일시적으로 찬란 태그 단백질을 발현하는 대 식세포는 다음의 IgG-SRBCs을 삼켜 할 수 있습니다. 세포 비공유 유리 표면에 바인딩 대상 입자를 분리하는 동안, pseudopods의 선단 관찰하고 TIRF 모드에서 기록 될 수있다. TIRF 인수는 마주 할 수있는 위의 3 단계 μm의를 이동 한 후, 표면 형광 모드에서 인수와 결합탐식 컵베이스의 ualization. 이러한 과정 액틴 또는 dynamin 억제 것과 약리학 약물의 첨가는 상기 분자 수준의 처리를 절개하는 것이 가능하다. 여기에 상세히 설명 된 프로토콜은 RAW264.7 쥐의 대식 세포주 및 옵 소닌 입자이지만, 사실상, 이것은 다른 포식 세포와 같은 비드와 같은 다른 표적에 적용될 수있다. 이 방법은 시간과 다양한 식세포 과정에서 pseudopod 확장 및 phagosome 폐쇄에 관여하는 분자 선수의 공간에서 규제의 더 나은 특성을 수 있습니다.
참고 : Lifeact-mCherry 사용되는 플라스미드 (17) 후에 생성 박사 기욤 Montagnac, 연구소 퀴리, 파리, 일종의 선물이다.
1. 세포와 형질
참고 RAW264.7 식세포가 완전 배지에서 서브 컨 플루 (RPMI (로스웰 파크 메모리얼 연구소) 1640 배지, 10 mM의 HEPES, 1 mM 피루브산 나트륨, 50 μM의 β 머 캅토 에탄올로 성장 2 mM의 글루타민 및 10 % FCS ( 100 밀리미터 접시에 소 태아 혈청)). 그들은 전기에 의해 찬란 태그 단백질을 코딩하는 플라스미드로 형질된다. 정기적으로 약 5 - 6 10 6 세포는 각각 각 형질 전환 또는 공동 형질 전환 용 플라스미드의 20 μg의 10 μg의 형질된다 X. 리포 펙션 또는 전기 천공에 기초하여 형질 전환의 다른 방법은 다른 방식으로 사용될 수 있습니다.
적혈구 2. 옵 소닌
주 : 대 식세포 입자 대상의 모델로서, 양 적혈구 (SRBCs)가 사용된다. 일반적으로 35mm 유리 바닥 접시 당 약 7 × 10 6 SRBCs이 사용됩니다.
Coverslips는 3. 폴리 라이신 코팅
유리 바닥 요리에 SRBCs 4. 비 공유 고정
5. 탐식 TIRFM에 의해 가시화
이 논문에 설명 된 실험 시스템은 개략적으로도 1에 표시된다. 형광 태그에 융합 관심의 단백질을 발현하는 트랜 RAW264.7 식세포는 비공유 수정 된 IgG를 - 옵 소닌 양 적혈구 (SRBCs)에 접촉 배치 커버 슬립에. 대 식세포는 그것을 삼켜하기 위해 커버 슬립에서 SRBC를 분리 할 수 있습니다. 사용 TIRF 현미경이 3 μm 이상의 Z 시프트 후의 표면 형광 모드 pseudopods 및 신호의 선단에 대응하는 TIRF 영역으로부터 신호를 수반 취득 할 수있다.
이는도 2이 플라즈마 막 아래의 100 nm의 영역에서 깨끗한 TIRF 신호 보장에 기재된 3도. 전반사 형광 대한 임계각을 결정하는 것이 필수적이다 acquisiti의 발전을 나타낸다"프로토콜 편집기"라는 모듈을 통해 매개 변수를 라이브 수집 소프트웨어에 포함되어 있습니다. 이 모듈은 사용자가 생성하고이 프로세스를 실행 현미경에 보내기 전에 워크 플로우를 관리 할 수 있습니다. 인수의 끝에서, 사용자는 TIFF 스트림을 수집한다.
그림 4는, 예를 들어, Lifeact-mCherry 박사 기욤 Montagnac, 연구소 퀴리, 파리의 일종 선물이 후 생성 된 플라스미드 (형질 RAW264.7의 대 식세포에 "phagosome 폐쇄 분석"의 대표 라이브 셀 TIRFM 영화 17) 액틴의 중합을 수행합니다. 대 식세포는 일시적으로 발현하는 플라스미드는 coverslip에 바인딩의 IgG-SRBCs를 침몰시켰다. pseudopods의 팁 하나 SRBC 주위에 유리 커버 슬립에 나란히 놓이는 된 바와 같이, F - 굴지 링은 TIRF 영역에 폐쇄 될 때까지 점진적으로 축소 (상단 패널)를 검출되었다. 병행, 흐린 F - 굴지탐식 컵의 바닥에 해중합에 맞습니다 (아래 패널) 위의 3 단계 μm의 이동 후 표면 형광 검출 신호를 출력한다. 투과광 (오른쪽 패널)로 확인 된 인수의 3 분 후, SRBC 완전히, 내면화되었다.
따라서,이 방법은 적절히 pseudopods의 맨 끝과 식세포 컵의베이스에서 발생하는 분자 수준에서 일어나는 분자 이벤트를 구별하는데 사용될 수있다.

그림 TIRFM에 의해 분석은 "Phagosome 폐쇄 분석"의 도식 표현. phagosome 폐쇄 분석은 일시적으로 하나 또는 두 개의 형광 태그로 단백질을 발현하는 대 식세포를 사용하여 수행된다. 대 식세포는 비공유 폴리 리신 COA에 고정-IgG의 옵 소닌 SRBCs에 퇴적테드가 된 커버. 이미지는 식세포 컵의 바닥을 감지 phagosome의 폐쇄 및 표면 형광 모드에서 사이트를 감지 할 TIRF 모드에 기록됩니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2 : TIRFM에 대한 중요 각도의 결정. (A) "라이브 인수"를 사용하여, 형광 태그로 단백질을 발현하는 세포가 (적색 영역 (1)) 필드의 중앙에 배치된다. TIRF 스택 옵션을 선택하면 이미지가 다른 각도는 0.01 ° (빨간색 영역 2)의 증가와 함께, 5 °까지 0 °에서 시작하는, 하나의 여기 파장에서 획득 하였다. (B) 이미지의 순서가 ImageJ에를 사용하여 열 컬러 프로파일 소프트웨어 및 AR의 평균 형광 강도관심 egion (ROI)는 "스택"과 "PlotZ 축 프로파일"(빨간색 영역 1)을 이용하여 X 축에 대한 각도의 함수로 도시된다. (C)의 플롯 형광 피크의 x 위치에 대응 임계각 : 1.98 ° (검은 점선). 이 각도 후의 상관 값을 사용할 수있다. 예를 들어, 2.00 °가 (빨간 선) 선택 될 수있다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

라이브 획득 모듈을 사용하여 그림 3. 워크 플로 프로세스 "프로토콜 편집기". (A)은 "편집기 프로토콜"윈도우에서, 워크 플로 캔버스가 생성된다. (B)이 프로토콜은 현미경 결정 횟수를 반복 할 것이다 조치 "루프"를 포함사용자가. 예로서, 750 (1). 한 루프 포함 : TIRF 모드에 대한 관심의 형광 단백질의 레이저 여기에 "멀티 채널"취득. 예로서 : 레이저 491 nm의 강도의 50 % -TIRF 각도 2.00 (2); 목적의 "Z 이동"3 μm의 (3); 표면 형광 모드에서 "멀티 채널"수집 (4); 다시 TIRF 영역 (5)과 투과광 (6)에 "스냅 샷"에 목적의 "Z 이동". 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4. F - 굴지는 일시적으로 플라스미드 Lifeact-mCherry (박사 기욤 모 일종의 선물을 표현 RAW264.7의 대 식세포를 사용하여 수행 하였다 Phagosome 폐쇄. Phagosome 폐쇄 분석의 사이트에서 포인트로 누적됩니다ntagnac, 17 일 후에 생성 연구소 퀴리, 파리,). 플라스미드 신호는 TIRF 영역 (위)와 표면 형광 모드 (아래)에 인수되었다. 빨간색 화살표는 TIRF 지역에서 굴지의 축적을 나타냅니다. 3 분의 투과광 이미지는 내면화 SRBC를 나타내는 표시됩니다. 스케일 바, 10 μm의. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

영화 1 :.이 일시적으로 플라스미드를 표현 RAW264.7의 대 식세포를 사용하여 수행 된 식세포 컵 Phagosome 폐쇄 분석의 자료에서 해제되는 동안 F - 굴지가의 Pseudopods의 팁과 Phagosome 폐쇄의 사이트에 축적된다. TIRFM를 사용하여 플라스미드 TIRF 영역 (상부)의 표면 형광 이미징 모드 (하단)의 대안 실시 하였다LY 37 ° C에서 3 분 동안 매 50 밀리 초. 이 비디오를 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개할 것이 없습니다.
우리는 전반사 형광 현미경을 사용하여 살아있는 대식세포에서 전례 없는 고해상도 phagosome formation 및 close를 3차원으로 시각화하는 실험 설정을 설명합니다. 이를 통해 phagocytic cup의 기저부, 확장된 pseudopods, phagosome scission의 정확한 위치를 모니터링할
수 있습니다.실험적 접근법에 대한 초기 논의를 해주신 Alexandre Benmerah 박사(프랑스 파리의 Institut Imagine Necker)와 원고를 읽어주신 Jamil Jubrail 박사에게 감사드립니다. Nadège Kambou와 Susanna Borreill은 우리 실험실에서 이 방법으로 실험을 수행한 것으로 인정받고 있습니다. 이 연구는 CNRS(ATIP 프로그램), Ville de Paris 및 Agence Nationale de la Recherche(2011 BSV3 025 02), Fondation pour la Recherche Médicale(FRM INE20041102865, FRM DEQ20130326518 FMA 박사 펠로우십 포함)의 보조금, JM의 박사 펠로우십을 포함한 Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales"(ANRS)의 보조금으로 지원되었습니다.
| 안티 양 적혈구 IgG | MP Biomedicals | 55806 | |
| 소 혈청 알부민 열 쇼크 분율, pH 7, ≥ 98% | Sigma | A7906 | |
| Cell lifter | Corning | 3008 | |
| 큐벳 4 mm | Cell project | EP104 | |
| DPBS, 칼슘 없음, 마그네슘 없음 | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | 실온 |
| 전기버퍼 키트 | Cell project | EB110 | |
| 100 mm TC 처리된 세포 배양 접시 | Corning | 353003 | |
| Gene X-cell pulser | Biorad | 165-2661 | |
| 겐타마이신 용액 | Sigma | G1397 | |
| 유리 바닥 접시 35mm 코팅되지 않은 1.5 | MatTek corporation | P35G-1.5-14-C Case | |
| iMIC | TILL Photonics | Oil-immersion objective (N 100X, NA1.49), CO2가 있는 가열 챔버, 카메라 단일 광자 검출 EMCCD(Electron Multiplying Charge Coupled Device) 및 1.5X 렌즈 | |
| Poly-L-Lysine 용액 0.1% | Sigma | P8920-100ml | 물에 0.01% 희석 |
| RPMI 1640 중간 GLUTAMAX 보충 | Life technologies | 61870-010 | |
| RPMI 1640 매체, 페놀 레드 없음 (10 x 500 ml) | Life technologies | 11835-105 | Warm in 37 ° C 사용 전 수조 |
| 양 적혈구 (SRBC) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | 4 °에서 Alsever 버퍼에 보존; C 사용하기 전에 |