Name: Het meten van de structuur, samenstelling en verandering van onderwateromgevingen met beeldvorming van grote gebieden (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-18T13:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 19 s
Description: Leer een vierstaps beeldvormingsprotocol voor ecologische dataverzameling van koraalriffen. Deze methode analyseert structurele complexiteit, gemeenschapssamenstelling en demografie in mariene ecosystemen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<table><tbody><tr><td>1" x 4 1/4" x 3 1/4" custom machined acetal</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.1 Gear Preparation; For construction of camera slides and mounts</td></tr><tr><td>1/2" marine grade high density polyethylene</td><td>King Starboard</td><td>N/A</td><td>1.1 Gear Preparation; For construction of camera outer frame and camera mounting panels</td></tr><tr><td>18-8 Flathead Stainless Steel Phillips Flat Head Screws, 3/8"-16 Thread Size, 1-1/2" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>91771A628</td><td>1.1 Gear Preparation; For camera frame assembly</td></tr><tr><td>18-8 Stainless Steel Socket Head Screw, 10-24 Thread Size, 1-1/8" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>92196A248</td><td>1.1 Gear Preparation; Used to secure mounting plate to handles</td></tr><tr><td>1 lb dive weights</td><td>House of Scuba</td><td>WBELT24 1LB</td><td>1.2 Plot Setup; Used for reference floats</td></tr><tr><td>200DL Underwater Housing for Nikon D780 DSLR Camera</td><td>Ikelite</td><td>71019</td><td>1.1 Gear Preparation; Underwater housing for digital camera</td></tr><tr><td>24mm fixed lens (AF-S NIKKOR 24mm f/1.8G ED)</td><td>Nikkor</td><td>20057</td><td>1.1 Gear Preparation; Wide-angle lens for greater image overlap</td></tr><tr><td>250# gray longline poly soft</td><td>Continental Western</td><td>503086</td><td>1.2 Plot Setup; To build scale bars. Ground control markers for determining model scale</td></tr><tr><td>3 lb drilling hammer</td><td>Estwing</td><td>B3-3LB</td><td>1.2 Plot Setup; Used to install stainless steel stakes at survey site</td></tr><tr><td>3/8-16 X 18" THRD ROD W/60 DEGREE POINT 316 S/S</td><td>Ababa Bolt</td><td>37C1800ROD6/60DEG</td><td>1.2 Plot Setup; For permanent installation to mark survey site</td></tr><tr><td>316 Stainless Steel Nylon-Insert Locknut Super-Corrosion-Resistant, 1/4"-20 Thread Size</td><td>McMaster-Carr</td><td>90715a125</td><td>1.2 Plot Setup; For scale bars and frame assembly.</td></tr><tr><td>316 Stainless Steel Nylon-Insert Locknut Super-Corrosion-Resistant, 3/8"-16 Thread Size</td><td>McMaster-Carr</td><td>90715A145</td><td>1.2 Plot Setup; Affixed to left stainless steel stake for orientation of the plot</td></tr><tr><td>316 Stainless Steel Phillips Flat Head Screws, 10-32 Thread Size, 3/8" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>91500a827</td><td>1.1 Gear Preparation; For camera frame assembly</td></tr><tr><td>4"x4" Agisoft marker printed on waterproof paper</td><td>Agisoft</td><td>N/A</td><td>1.2 Plot Setup; To build corner tiles. Ground control markers for determining model orientation</td></tr><tr><td>4"x4"x1/4" Stainless steel tile</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 Plot Setup; To build corner tiles. Ground control markers for determining model orientation</td></tr><tr><td>4"x4"x3/4" custom printed plastic agisoft marker high density polyethylene color core</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 Plot Setup; To build scale bars. Ground control markers for determining model scale</td></tr><tr><td>512 GB Extreme PRO SDXC UHS-I Card - C10, U3, V30, 4K UHD, SD Card</td><td>SanDisk</td><td>SDSDXXY-512G-GN4IN</td><td>1.1 Gear Preparation; High speed, large capacity storage card. Up to 2 used per camera for image storage</td></tr><tr><td>5TB Elements Portable External Hard Drive HDD, USB 3.0</td><td>Western Digital</td><td>WDBU6Y0050BBK-WESN</td><td>1.3 Image Capture; Large volume external hard drive for image storage and image backup</td></tr><tr><td>60 mm fixed lens (AF-S Micro NIKKOR 60mm F2.8G ED)</td><td>Nikkor</td><td>2177</td><td>1.1 Gear Preparation; Macro zoom lens, optional for dual-camera setup</td></tr><tr><td>Acetal machined and tapped for 1"x12" 3/8" 16 thread support braces</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.1 Gear Preparation; Camera frame support columns</td></tr><tr><td>AquaMend Epoxy Putty Stick</td><td>JD Industrial Supply</td><td>470550</td><td>1.2 Plot Setup; Used to install stainless steel stakes at survey site</td></tr><tr><td>Architectural 6063 Aluminum U-Channel, 1/8" Wall Thickness, 1/2" High x 3/4" Wide Outside</td><td>McMaster-Carr</td><td>9001k46</td><td>1.2 Plot Setup; To build scale bars. Ground control markers for determining model scale</td></tr><tr><td>Black-Oxide 18-8 Stainless Steel Pan Head Phillips Screws, 1/4"-20 Thread, 1/2" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>91249a537</td><td>1.1 Gear Preparation; To attach ikelite handle to housing</td></tr><tr><td>Black-Oxide 18-8 Stainless Steel Pan Head Phillips Screws, 1/4"-20 Thread, 5/8" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>91249A539</td><td>1.2 Plot Setup; To build scale bars. Ground control markers for determining model scale</td></tr><tr><td>Blue Steel Rope</td><td>Continental Western</td><td>402020</td><td>1.2 Plot Setup; Used to secure dive float to the benthos during surveys</td></tr><tr><td>D780 camera body</td><td>Nikon</td><td>1618</td><td>1.1 Gear Preparation; Camera body model</td></tr><tr><td>DGX Tech Compass w/Bungee Mount and Cord</td><td>Dive Gear Express</td><td>DX-9050x</td><td>1.2 Plot Setup; For collection of plot bearings and as an addition to the camera frame as a navigational aid</td></tr><tr><td>Dive computer - Suunto Zoop Novo</td><td>Suunto&nbsp;</td><td>N/A</td><td>1.2 Plot Setup; To record depth at reference tiles</td></tr><tr><td>Dive slate</td><td>TexWipe</td><td>TX5835</td><td>1.2 Plot Setup; Used to record plot metadata such as tile depth, and coded target numbers</td></tr><tr><td>DL 8 inch Dome Port</td><td>Ikelite</td><td>75340</td><td>1.1 Gear Preparation; Dome port for underwater housing</td></tr><tr><td>FLOAT, PVC SPONGE, 5-3/4" DIA. BY 3/4", RUST</td><td>Memphis Net &amp; Twine</td><td>SB1</td><td>1.2 Plot Setup; Used as a visual reference to determine plot boundaries and swim height of camera operator</td></tr><tr><td>Garmin 78s GPS</td><td>Garmin</td><td>010-00864-01</td><td>1.2 Plot Setup; Used to record location of survey site</td></tr><tr><td>High performance computer</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>2.0 Model Construction; For 3D dense point cloud processing, recommended specifications to include a high speed 10+ core CPU, 128GB RAM (64 GB minimum), 1TB solid state drive, and a dedicated NVIDIA or AMD GPU.&nbsp;</td></tr><tr><td>Inflatable surface dive float</td><td>Omer</td><td>Atol 6246</td><td>1.2 Plot Setup; Dual purpose surface marker buoy and&nbsp;</td></tr><tr><td>JOHNSON Cross Check Level: Nonmagnetic, 2 1/4 in x 1 7/16 in x 3/16 in, Plastic, Hanging Hole, 1mm/m</td><td>Grainger</td><td>6C225</td><td>1.1 Gear Preparation; Optional addition to the camera frame as a navigational aid</td></tr><tr><td>Long Tape Measure,1/2 In x 30m,Pumpkin</td><td>Grainger</td><td>3LJW9</td><td>1.2 Plot Setup; Used to set up plot area</td></tr><tr><td>Manta reel SR. Reel</td><td>Manta Industries</td><td>N/A</td><td>1.2 Plot Setup; Attached to dive float for use during surveys</td></tr><tr><td>Metashape Professional License</td><td>Agisoft</td><td>N/A</td><td>2

het meten van de structuur, samenstelling en verandering van onderwateromgevingen met beeldvorming van grote gebieden

Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-area Imaging

Het meten van de structuur, samenstelling en verandering van onderwateromgevingen met beeldvorming van grote gebieden

Digital imaging and processing technology have evolved to facilitate the expansion of large-area imaging surveys, which increase our capacity to study the ...

measuring-structure-composition-change-underwater-environments-with

Research

JoVE Journal

Environment

Milieu

Dit protocol bevat instructies over hoe je een self-contained onder water velocimetry apparaten (SCUVA), die is ontworpen voor de kwantificering van de in situ dieren gegenereerde stroom te gebruiken. Daarnaast, dit protocol adressen uitdagingen van de veldomstandigheden, en omvat operator beweging, voorspellen positie van het dier, en oriëntatie van SCUVA.

Kwantitatief meten In situ Stromen met behulp van een self-contained Underwater Velocimetry Apparatus (SCUVA)

Een geïntegreerde suite van beeldvormende technieken is toegepast op poliep morfologie en weefselstructuur in het Caribisch gebied koralen Montastraea annularis en M. te bepalen faveolata. Fluorescentie, serieblok gezicht, en twee-foton confocale laser scanning microscopie hebben lobbige structuur, poliep muren, en de geschatte chromatophore en zoöxanthellen dichtheid en uitkeringen geïdentificeerd.

Multimodale optische microscopie methoden Reveal Poliep Tissue morfologie en structuur in het Caribisch gebied Reef Building Koralen

Beschrijven we een nieuwe methode voor het tellen van de vissen, en het schatten van de relatieve overvloed (MaxN) en de dichtheid van de vissen met behulp van roterende stereo-video camerasystemen. We laten ook zien hoe met camera (Z afstand) afstand schatten soortspecifieke detecteerbaarheid.

Ontwikkeling van nieuwe methoden voor het kwantificeren van de dichtheid van de vissen met behulp van onderwater Stereo-video Tools

Beeld gebaseerde landmeten is een steeds meer praktische, niet-invasieve methode om te proeven van het mariene milieu. Wij presenteren het protocol van een daling van de camera enquête die schat van de overvloed en verdeling van de Atlantische zee mantel (Placopecten magellanicus). We bespreken hoe dit protocol kan worden gegeneraliseerd voor toepassing op andere benthische macroinvertebrates.

Methoden voor beeld-gebaseerde enquêtes van benthische Macroinvertebrates en hun leefgebied wordt geïllustreerd door de Drop Camera enquête voor de Atlantische zee mantel

We bieden een gedetailleerd protocol voor het uitvoeren van fotogrammetrie-onderzoeken van de onderwaterstructuur uit beweging om 3D-modellen en orthomosaics te genereren.

Een veldprimer voor het monitoren van benthische ecosystemen met behulp van structuur-uit-beweging fotogrammetrie

Hier wordt een protocol gepresenteerd voor het verzamelen en verwerken van onderwaterfotogrammetriegegevens, inclusief een aanzienlijk vereenvoudigde en volledig geautomatiseerde beeldverwerkingspijplijn die resulteert in gegeorefereerde en op tijdreeksen afgestemde outputs die klaar zijn voor ecologische gegevensextractie, analyse en toepassing.

Reefshape: een systeem voor het efficiënt verzamelen en geautomatiseerd verwerken van tijdreeksen onderwaterfotogrammetriegegevens voor het monitoren van benthische habitats

Werkwijze voor de bepaling van vetzuren en samenstelling microalgen gebaseerd op mechanische celdisruptie, oplosmiddelhoudende vetextractie, verestering en kwantificatie en identificatie van vetzuren met gaschromatografie wordt beschreven. Een tripentadecanoin interne standaard wordt gebruikt ter compensatie van eventuele verliezen bij de winning en onvolledige omestering.

Analyse van vetzuurgehalte en Compositie in Microalgen

Meer dan de helft van de eiwitten zijn kleine eiwitten (moleculaire massa &lt;200 kDa) die zijn uitdagend voor zowel de elektronenmicroscoop beeldvorming en driedimensionale reconstructies. Geoptimaliseerde negatieve kleuring is een robuuste en high-throughput protocol hoog contrast en relatief hoge resolutie (~ 1 nm) beelden van kleine asymmetrische eiwitten of complexen onder verschillende fysiologische omstandigheden te verkrijgen.

Geoptimaliseerd Negatieve kleuring: een High-throughput protocol voor de behandeling Kleine en Asymmetric Protein Structure door Electron Microscopy

In planta meting van nutriënten en toxische stroom is essentieel voor de studie van plantenvoeding en toxiciteit. Hier bespreken we protocollen met radiotracers voor de bepaling van influx en efflux in intacte plantenwortels, met behulp van kalium (K+) en ammoniak/ammonium (NH3/NH4+) stromen als voorbeelden. De voordelen en beperkingen van dergelijke technieken worden besproken.

Het meten van stromen van minerale nutriënten en toxische stoffen in planten met radioactieve tracers

Aquafaba is een viskeuze SAP uit blik kikkererwten die, wanneer krachtig geroerd, produceert een relatief stabiele wit schuim of schuim. Het primaire onderzoek doel is om identificatie van de bestanddelen van aquafaba die bijdragen viscosifying/verdikking eigenschappen met behulp van nucleaire magnetische resonantie (NMR), ultrafiltratie, elektroforese en peptide massa vingerafdrukken.

Samenstelling en eigenschappen van Aquafaba: Water verhaald commercieel blik kikkererwten

Leer een vierstaps beeldvormingsprotocol voor ecologische dataverzameling van koraalriffen. Deze methode analyseert structurele complexiteit, gemeenschapssamenstelling en demografie in mariene ecosystemen.

Het meten van de structuur, samenstelling en verandering van onderwateromgevingen met beeldvorming van grote gebieden

Meer video's verkennen