Method Article

Przygotowanie próbki MALDI: metoda ultra cienkowarstwowa

DOI:

10.3791/192

April 29th, 2007

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ten film demonstruje przygotowanie ultracienkiej warstwy matrycy/analitu do analizy peptydów i białek za pomocą spektrometrii mas z desorpcją laserową wspomaganą desorpcją i desorpcją laserową (MALDI-MS).

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ten film demonstruje przygotowanie ultracienkiej warstwy matrycy/analitu do analizy peptydów i białek za pomocą spektrometrii mas z desorpcją laserową wspomaganą matrycą (MALDI-MS) 1,2. Metoda ultracienkowarstwowa polega na wytworzeniu warstwy substratu z kryształów matrycy (kwas alfa-cyjano-4-hydroksycynamonowy) na płytce próbki, która służy jako podłoże do późniejszej krystalizacji mieszaniny matrycy/analitu. Zaletą metody ultracienkiej warstwy w porównaniu z innymi metodami osadzania próbek (np. wysuszonymi kroplami) jest to, że zapewnia ona (i) większą tolerancję na zanieczyszczenia, takie jak sole i detergenty, (ii) lepszą rozdzielczość oraz (iii) wyższą jednorodność przestrzenną. Metoda ta jest szczególnie przydatna do dokładnego oznaczania masy białek. Protokół został początkowo opracowany i zoptymalizowany do analizy białek błonowych i wykorzystany do skutecznej analizy kanałów jonowych, transporterów metabolitów i receptorów, zawierających od 2 do 12 domen transbłonowych 2. Od czasu pierwotnej publikacji okazało się również, że jest równie przydatny do analizy rozpuszczalnych białek. Rzeczywiście, wykorzystaliśmy go do wielu białek o szerokim zakresie właściwości, w tym tych o masach cząsteczkowych sięgających 380 kDa 3. Jest to obecnie nasza metoda z wyboru do analizy masy cząsteczkowej wszystkich białek. Opisana procedura niezmiennie zapewnia wysokiej jakości widma, jest czuła, solidna i łatwa do wdrożenia.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bardzo ważne jest, aby podczas przygotowywania cienkiej warstwy nosić rękawice bezpudrowe.

Czyszczenie płytki próbki

  1. Użyj płytki próbnej MALDI ze stali nierdzewnej lub złota.
  2. Umyj MeOH i delikatnie przetrzyj chusteczką Kimwipe. Nie pocieraj ani nie szoruj powierzchni za pomocą Kimwipe, aby zapobiec zarysowaniu powierzchni.
  3. Umyć za pomocąH2Oi delikatnie przetrzeć chusteczką Kimwipe.
  4. Umyj MeOH i delikatnie przetrzyj chusteczką Kimwipe.
  5. W razie potrzeby powtórz cykl czyszczenia MeOH/H2O/MeOH, zawsze kończąc się MeOH.
  6. Upewnij się, że na talerzu nie pozostały żadne p....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Xiang, F., Beavis, R. C. A Method to Increase Contaminant Tolerance in Protein Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization by the Fabrication of Thin Protein-Doped Polycrystalline Films. Rapid Communications in Mass Spectrometry. 8, 199-204 (1994).
  2. Cadene, M., Chait, B. T.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

MALDI Sample PreparationUltra Thin Layer MethodMatrix Assisted Laser Desorption IonizationProtein Mass AnalysisMembrane Protein AnalysisSoluble Protein AnalysisPlate Cleaning ProtocolThin Layer SubstrateVacuum Aspirator UseContaminant Removal

Related Articles