DNA-barcode-based Multiplex Immunofluorescence Imaging to Analyze FFPE Specimens from Genetically Reprogrammed Murine Melanoma

Sachin  S. Surwase; Xin Ming M. Zhou; Kathryn M. Luly; Qingfeng Zhu; Niki Talebian; Robert A. Anders; Jordan J. Green; Stephany Y. Tzeng; Joel C. Sunshine

doi:10.3791/68124

Genetik Olarak Yeniden Programlanmış Murin Melanomundan FFPE Örneklerini Analiz Etmek için DNA Ba...

JoVE Journal
Cancer Research

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Cancer Research

DNA-barcode-based Multiplex Immunofluorescence Imaging to Analyze FFPE Specimens from Genetically Reprogrammed Murine Melanoma

Genetik Olarak Yeniden Programlanmış Murin Melanomundan FFPE Örneklerini Analiz Etmek için DNA Barkod Tabanlı Multipleks İmmünofloresan Görüntüleme

Full Text

1,129 Views

09:58 min

June 6, 2025

DOI: 10.3791/68124-v

Sachin S. Surwase*^1,2,3, Xin Ming M. Zhou*^3,4, Kathryn M. Luly^1,2,3, Qingfeng Zhu^5,6,7, Niki Talebian⁶, Robert A. Anders^5,6,7,8,9, Jordan J. Green^{1,2,3,5,8,9,10,11,12}, Stephany Y. Tzeng^1,2,3, Joel C. Sunshine^{1,3,4,5,6,8,9}

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Bu protokol, murin FFPE melanom dokularının DNA barkod tabanlı görüntülenmesi için bir multipleks immünofloresan antikor paneli tasarlamak için adım adım bir kılavuz sağlar. Ayrıca, murin melanom tümörü bağışıklık mikro ortamına ilişkin uzamsal proteomik içgörüler oluşturmak için açık kaynaklı araçlar kullanan bir görüntü analizi boru hattını da açıklıyoruz.

Fare FFPE dokularını incelemek için bir multipleks immünofloresan paneli geliştirmek ve doğrulamak için bir protokol sunuyoruz ve plazma DNA'sı sağlayan nanopartiküllerle tedavi edilen bir melanom modelinden alınan örnekleri inceleyerek, tümör mikroçevresini yeniden programlamak için immünolojik sinyalleri kodlayarak faydasını gösteriyoruz. Alanda, fare formaliniyle sabitlenmiş parafine gömülü FFPE dokularıyla uyumlu, titizlikle geliştirilmiş ve doğrulanmış multipleks immünofloresan protokolleri eksikti.

Formalinle sabitlenmiş parafin gömme, doku morfolojisini uzun vadede korur, kullanımı ve saklanması kolaydır ve tek bir slaytta birden fazla numuneyi görüntülemek için doku mikrodizilerinin oluşturulmasını sağlar.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos