바이오 매스 생산을 위한 Coppice로 성장 하는 두 개의 포 플 러 품종에 의해 증발

Tree Physiology. Jul, 1999  |  Pubmed ID: 12651539

빠른 성장 트리 클론 바이오 매스 농장에 대 한 선택은 매우 생산적이 고 따라서 대체 농업 작물 보다 더 많은 물을 사용 하는 것. 우리는 두 개의 포 플 라 클론, 프레 (Populus trichocarpa 토 루 하루. & A. 회색 P. deltoides Bartr. ex 습지. x) 및 Dorschkamp (P. nigra L. x P. deltoides), 남부 잉글랜드에서 unirrigated 짧은 회전 coppice로 성장에서 1994 년의 여름을 통해 증발의 필드 측정 보고서. 서 증발 열 균형 방법 줄기의 샘플에서 만든 수액 흐름 측정에서 확장 하 여 계량 했다. 잎 conductances, 리프 지역 개발, 기상 변수 및 토양 물 적자 조사 환경에 대 한 나무의 응답을 측정 했다. 증발의 높은 속도 프레 찾을 수 있었다. 때 흙 물이 풍부, 6 월에서 18 일 동안 평균 (± SD) 증발 속도 7.9 m m day(-1)의 최대에 도달 하는 1.8 m m day(-1) ± 5.0. Dorschkamp에서 증발 속도 낮은 잎 영역 인덱스의 결과로 낮은 됐다. 높은 총 잎 conductances 두 프레 (0.34 0.17 몰 m(-2) s(-1)) 및 Dorschkamp (0.39 0.16 몰 m(-2) s(-1)) + +에 대 한 측정. 리프 전도도 모두 클론에 대기 수증기 압력 적자 증가 함께 약간 거부 하지만 토양 물 적자 증가로 전도도 감소 잎 않았다 프레에만.

Heterologously 표현된 Von Willebrand 인자에 의해 형성 된 분과 립 막 단백질의 선택적이 고 신호 종속 모집

Molecular Biology of the Cell. May, 2002  |  Pubmed ID: 12006654

von Willebrand 인자 (vWF)와 충분히 관여 내 피 세포에 의해 분 비 대형, multimeric 단백질 이다. AtT 20 셀 단위로 vWF Weibel Palade 시체 vWF 규제 분 비 하기 전에 일반적으로 저장 되는 내 피 세포의 모양이 비슷한 시가 모양의 organelles 드 노 보 형성으로 이어집니다. 되 나 pseudogranule, vWF 유도 트는이 막 특징이 있습니다. 우리는 간접적인 반응, 막 단백질을 보충 하는 쇼이 pseudogranules의 능력을 살펴보았다. Coexpression 실험 P selectin Weibel Palade 신체 단백질 및 CD63로 분 트는 막 단백질 기 관련 막 단백질-2와 synaptotagmin 생 포함 하는 adrenocorticotropic 호르몬 분 립 vWF 포함 된 pseudogranules 멀리 우회는 보여준다. 그러나, transferrin 수용 체, lysosomal 관련 막 단백질 1, sialyl 전이 하지 모집 합니다. P selectin 모집 세포질 도메인 내에서 티로신에 기초를 둔 주제에 따라 달라 집니다. 우리의 데이터 표시 vWF pseudogranules 특히 막 단백질의 하위 집합을 채용 하 고 명시적으로 pseudogranule 콘텐츠 (즉, vWF)에 의해 구동 하는 과정에서 하나 이상의 구성 요소 (즉, P selectin) pseudogranule 막의 명 모집 cytosolic 및 따라서 Vwf와 직접 상호 작용할 수 없는 피 selectin의 잔류물에 따라 달라 집니다.

가족성 루 게 릭 병 측면 경화 증의 세포 문화 모델에 Cytosolic 프로테옴의 분석 결과 프로테아좀, 항 산화 방어 체계, 및 산화 질소 합성 경로를 변경

The Journal of Biological Chemistry. Feb, 2003  |  Pubmed ID: 12475980

모터 뉴런 돌연변이 Cu, Zn superoxide dismutase (SOD1)와 관련 된 부상-가족성 루 게 릭 병 측면 경화 증 (FALS) 독성 이득-의-함수에서 효소의 결과 관련. SOD1 변경 신경 죽음을 유도 하는 메커니즘 집중적인 연구 노력에도 불구 하 고 불확 실한 남아 있다. 돌연변이 SOD1 존재 표현 차동 세포질 단백질의 분석 새로운 접근 방식을이 독성 이득-의-기능을 추가 조사를 나타냅니다. G93A, 야생 형으로 NSC34 안정적 페 모터 신경 같은 셀 라인을 사용 하 여 또는 G37R 돌연변이 인간 SOD1 우리 돌연변이의 효과 조사 인간의 SOD1 proteomic 방법을 사용 하 여 단백질 표정에. 7 위로 단백질 argininosuccinate synthase, argininosuccinate lyase 신경 nitric 산화물 synthase RNA 의무적인 모티브 단백질 3 peroxiredoxin로 확인 된 나, 프로테아좀 소 단위 베타 5 (X), 그리고 glutathione S-전이 (GST) 알파 2. 7 아래로 단백질 GST 뮤 1, GST 뮤 2, GST 뮤 5, 가상 GST 뮤, GST Pi B, leukotriene B(4) 12-hydroxydehydrogenase, 그리고 프로테아좀 소 단위 beta5i로 확인 되었다 (LMP7). GST 분석 실험 시연 돌연변이 표현 하는 셀의 총 GST 활동에 있는 뜻깊은 감소 인간의 SOD1. 프로테아좀 분석 실험 시연에서 상당한 절감 범용성 같은, 트립 신 같은 게시물 glutamylhydrolase 프로테아좀 활동. 레이저 캡처 기정 인코딩 GST 뮤 1, leukotriene B(4) 12-hydroxydehydrogenase, 및 LMP7 mRNA 수준의 감소 하는 역전사-PCR, 시연과 함께 인간의 FALS 사례에서 척수 운동 신경의. 이러한 결합된 방식을 추가 변경 항 산화 방어 체계, 프로테아좀 기능과 FALS 이상에서 산화 질소 대사에의 참여에 대 한 증거를 제공.

에테르 인지질 및 Glycosylinositolphospholipids 필요 하지 않습니다 Amastigote 독성 또는 대 식 세포 활성화의 저해 Leishmania 주요 여

The Journal of Biological Chemistry. Nov, 2003  |  Pubmed ID: 12944391

에테르 인지질 인간과 Leishmania의 세포 막의 주요 구성 요소입니다. Protozoan 기생충에서 그들은 별도로 발생 또는 분자의 glycosylphosphatidylinositol (GPI) 앵커의 일부로 lipophosphoglycan (LPG), 작은 glycosylinositolphospholipids (GIPLs), GPI 고정 단백질 등 독성에 연루. Leishmania 주요 alkyldihydroxyacetonephosphate synthase (광고), 에테르 지질 합성의 커밋된 첫걸음의 null 돌연변이 생성 되었습니다. 효소 분석과 포괄적인 대량 spectrometric 분석 ads1 노크 아웃 plasmalogens, GIPLs, LPG, 등 모든 에테르 인지질 부족을 보여주었다. Leishmania ads1-따라서를 처음 에테르 지질 합성 진핵생물을 완전히 null 돌연변이 체를 얻을 수 있는 나타냅니다. 현저 하 게 ads1-잘 성장 하 고 지질 뗏목 (세제 방지 막)을 유지 합니다. 독성 테스트에서 LPG 불충분 한 L. 주요 감도 보완 하는 등 생존 macrophage 감염의 초기 단계를 밀접 하 게 닮은. 마찬가지로 호스트 세포 시그널링 억제 능력과 설립 결함을 살아남은 몇 가지 기생충에서 감염 성 amastigotes를 유지 합니다. 이러한 연구 결과 현재 제안 GIPLs 포유류 호스트 또는 그 기생충 lyso-알 킬 amastigote 생존에 필요한 또는 alkylacyl GPI 앵커는 전적으로 대 식 세포 활성화의 저해 카운터.

오는 3 Deoxy D Manno Octulosonic 산 생 합성 페론 Moraxella Catarrhalis 및 KdsA 불충분 한 Isogenic 돌연변이의 분석에서의 식별

Infection and Immunity. Nov, 2003  |  Pubmed ID: 14573664

Lipooligosaccharide (로스), 외부 막의 주된 표면에 노출 된 구성 요소 Moraxella catarrhalis 감염의 병 독성 요인으로 연루 되어 있다. 그러나, 중요 한 단계는 생 합성에 관여 하 고 M. catarrhalis 로스 현재 남아 어셈블리 정의 되지 않은. 이 연구에서는 유전자 순서 pyrG kdsA 이노 오를 3 deoxy D manno octulosonic acid (KDO) 생 합성 페론 M. catarrhalis에 동일시 하 임의 transposon mutagenesis를 사용 했습니다. 지질 A KDO 분자는 다양 한 glycosyl transferases 순차적으로 로스 분자에 대 한 코어 및 분기 올리고 당 확장명을 추가 하는 수락자로 사용 됩니다. KdsA, KDO 8 인산 염 synthase catalyzes KDO 생 합성의 첫 번째 단계 이며 세균 생존 능력의 유지 관리를 위해 장 그람 음성 박테리아에 필수적인 효소. 우리 보고 피로 7169 유전자 교환에 의해 isogenic M. catarrhalis kdsA 돌연변이의 건설. 우리의 데이터 로스 분자 지질 A로만 이루어진 고 KDO glycosylation 부족 한 체 외 M. catarrhalis 생존을 유지 하기 위해 충분 한 나타냅니다. 또한, 성장 및 민감도 비교 분석 실험 부모의 부담에 비해 7169kdsa11의 감도 평가 하기 위해 수행 되었습니다. 이러한 연구의 결과 입증 네이티브 로스 분자 외부 막의 무결성을 유지 하는 중요 한 요소는 로스 M. catarrhalis의 인간의 세라의 살 균 활동을 저항 하는 능력에 관련 된 중요 한 요소는 것이 좋습니다.

구조 및 상전이 Trigonal ZrMo2O8 및 HfMo2O8

Acta Crystallographica. Section B, Structural Science. Feb, 2004  |  Pubmed ID: 14734842

이 문서 구조, 열 확장 속성과 ZrMo(2)O(8) 및 Hfmo(2)o(8)의 trigonal 형태의 위상 전환에 설명합니다. 두 단계 실 온에서 P (-) 3m 구조를 채택 하 고 긍정적인 열팽창을 보여줍니다. 또한 두 단계 낮은 열팽창은 높은 대칭 구조를 고온 (487 K에서 ZrMo(2)O(8)) 및 463 K에서 Hfmo(2)o(8)에서 displacive 상전이 받 다. 높은 온도 alpha'-AMo(2)O(8) 폼의 구조 (A = Zr과 Hf) 분말 회절 데이터에서 공간 그룹 P (-) 3 m 1 세련 되었습니다.

2 차원 솔리드 스테이트 17O NMR에 의해 밝혀 Zrw2o8에서 산소 교환 자연

Chemical Communications (Cambridge, England). Feb, 2004  |  Pubmed ID: 14765224

Zrw(2)o(8)에 산소 교류의 성격을 결정 하 17O 마법의 각도 (MAS) NMR 회전 사용 되었습니다. 매우 효과적인 isotopic 라벨 기술을 개발 하 고 1 D NMR 및 2D exchange 분광학 (EXSY) 실험 알파 베타 주문 장애 위상 전환 아래 상당히 온도 에서도 모든 산소 사이트 사이 상호 교환 발생 밝혀.

안전 하 고 흘린 셀 구조 및 관상 동맥 후 Autotransfusion의 효능 무시할 접목: 무작위로 재판을

The Annals of Thoracic Surgery. May, 2004  |  Pubmed ID: 15111142

이 연구의 목표는 셀 구조와 처음 시간 선택 관상 동맥 후 autotransfusion 무시 접목 하는지 여부를 확인 하는 연관 된 동종 혈액, 응고 수술 후 프로필의 임상적으로 중요 한 혼란 또는 수술 후 출혈의 위험을 증가의 사용에 상당한 감소.

3 Glycosyltransferase 효소 Moraxella Catarrhalis Lipooligosaccharide 어셈블리에 대 한 필수의 클러스터의 특성 분석

Journal of Bacteriology. May, 2005  |  Pubmed ID: 15838019

Moraxella catarrhalis epitopes Neisseria Haemophilus 종 비슷한 공유 하는 그들의 표면에 익스프레스 lipooligosaccharide (LOS) 분자를 분리 합니다. 이러한 일반적인 로스 epitopes 다른 유기 체에 대 한 병의 다양 한 단계에 연루 되어. 이 연구에서는 3 로스 glycosyltransferase 유전자 (lgt)의 클러스터 M. catarrhalis 7169, serotype B 로스를 생성 하는 스트레인에에서 확인 되었다. 이 glycosyltransferase 유전자에 돌연변이 건설 되었다 그리고 결과 로스 고기 자르기 야생-타입 로스에 비해 다양 한 각도와 일치 했다. 단일 클론 항 체 (MAb 4G 5) 고도로 보존된 터미널 epitope에도 단일 클론 항 체 (MAb 3F7) 해당 serotype B 로스 사이드 체인 하 여 각 lgt 돌연변이의 로스 구조 검색 더 이상 했다. 두 이러한 lgt 돌연변이 의해 조립 로스 glycoforms의 질량 분석 표시 lgt1 alpha(1-2) glucosyltransferase 인코딩하고 lgt2 beta(1-4) galactosyltransferase를 인코딩합니다. 그러나, 이러한 구조 연구의 수에 함수를 lgt3에 대 한 윤곽을 그리 다 하지. 따라서, M. catarrhalis lgt3 트랜스에 정의 된 beta(1-4) glucosyltransferase Haemophilus ducreyi 35000glu 돌연변이에 도입 된 및 단일 클론 항 체 분석 확인 Lgt3 로스 결함 보완. 이러한 데이터는 lgt3 glucosyltransferase 내부 코어를 beta(1-4) 연결 된 포도 당 이외에 관련 된 인코딩 것이 좋습니다. 또한, 우리는이 효소 단계 M. catarrhalis 7169 여 표현 완전 한 로스 glycoform 어셈블리에 대 한 필수적입니다 결론.

돌연변이 SOD1 모터 신경 Transcriptome 변경: 가족성 루 게 릭 병에 대 한 의미

Brain : a Journal of Neurology. Jul, 2005  |  Pubmed ID: 15872021

가족성 루 게 릭 병 측면 경화 증 (FALS) 발생의 경우, 20 %cu / Zn superoxide dismutase 유전자 (SOD1)에 돌연변이 의해. 모터 신경 부상 발생 독성 이득의 기능을 통해, 비록 정확한 장치를 마더보드에 불분명 남아 있습니다. SOD1 관련 FALS 설립된 NSC34 휴대 전화 모델을 사용 하면, 우리 돌연변이 SOD1 셀 모델링 취약 한 세포 인구 비 신경 세포에 CNS에서 오염 없이 모터 뉴런에 특별히 영향을 조사 했다. 진 식 프로 파일링을 사용 하 여, 268 성적 돌연변이 존재 차동 표현 했다 인간의 G93A SOD1. 이들 중, 그 돌연변이의 존재 SOD1 transcriptional 억압의 표시 정도로 리드 시연 197 감소 했다. 이들의 사이 항 산화 반응 요소 그룹 (는) 유전자 인코딩 단계 II 해독 효소와 항 산화 반응 단백질 (소위 '셀 생활 프로그램' 유전자)를 표현 하는 NRF2 전사 인자에 의해 규제 했다. 우리는 dysregulation nrf2의 증거를 제공 하 고 함께 있다 pentose 인산 경로 활동 감소 NADPH 생성 감소, 중요 한 및 지금까지 돌연변이 SOD1 함수의 독성 증가의 구성 요소를 인식할 수 없는. 다른 관심 크게 변경 SOD1 neurodegeneration에 이전에 내포 된 여러 가지를 포함 하는 돌연변이 존재의 유전자로 유전자 단백질 저하, 면역 반응, 세포 죽음/생존 및 열 충격 응답에 참여. SOD1 관련 모터 신경 질병 사례에서 절연된 모터 뉴런에 대 한 예비 연구 제안 핵심 유전자 인간의 질병도 다르게 표현 됩니다.

Haemophilus 형의 소설 Sialic 산 전송입니다

Infection and Immunity. Sep, 2005  |  Pubmed ID: 16113244

Nontypeable Haemophilus 형 기회 병원 체 및 중이염 어린이 만성 기관지염과 만성 폐쇄성 폐 질환 환자에서 폐 렴의 흔한 원인입니다. Lipooligosaccharides, H. 형의 외부 막의 주요 구성 요소 pathogenicity 미생물 독성에 중요 한 역할을 한다. 터미널 nonreducing 설탕으로는 lipooligosaccharides N Acetylneuraminic 산 (sialic 산)를 통합할 수 있습니다. Sialic 산 없이 lipooligosaccharides에 통로의 대부분은 이해 하지만 전송 산 통풍 관 N acetylneuraminic 헤 형에 대 한 책임은 아직 특징 수 있다 한다. 이 논문에서이 전송 노사 정 ATP 독립적인 periplasmic 운송업 자 가족의 소설 설탕 전송기는 보여 줍니다. 이 전송의 부재, H. 형 인간의 혈 청에 노출 되 면 살아남을 수 없는 유기 체를 만드는 그것의 lipooligosaccharides에 sialic 산을 통합할 수 없습니다 및 biofilm 성장에서 생존 능력을 감소를 일으키는.

다리의 다중 계층 폐쇄 대 단층 긴 Saphenous 정 맥 수확 후 상처: 잠재는 무작위로 재판

The Annals of Thoracic Surgery. Dec, 2005  |  Pubmed ID: 16305864

전통적인 기법에 의해가 걷이 긴 saphenous 정 맥은 관상동맥 바이패스 접목 (관상)에 대 한 중요 한 도관 이다. 이 연구의 목적은 만약 드레인을 통해 단일 레이어 폐쇄 상처 치유 수확 후 전통적인 2 층 폐쇄에 비해 개선 확인 했다.

장래 무작위로 Medtronic 모자이크와 Carpentier-에드워즈-SAV 대동맥 위치에 비교: 중간 보고서

The Journal of Heart Valve Disease. May, 2006  |  Pubmed ID: 16784086

연구 목표는 비교 prospectively 임상 성능 및 장기 내구성 있는 Medtronic 모자이크와 Carpentier-에드워즈 돼지 (CE SAV) bioprostheses 대동맥 위치에서의 10 년 동안 했다.

허 혈 성 마비 없이 심폐 바이패스: 긴급 한 관상이 필요한 고 위험 환자에 대 한 심근 보호 전략을 합니다

Journal of Cardiac Surgery. Sep-Oct, 2006  |  Pubmed ID: 16948769

긴급 관상 동맥 revascularization이 필요한 환자에 대 한 사망률 높은 남아 있다. 주된 이유 중 하나는 허 혈 성 마비 후 심근의 가난한 기능 및 대사 회복 이다. 하이브리드가 고 위험 그룹에 대 한 관상 revascularization 중 허 혈 성 체포를 피하기 위해 오프 펌프와 펌프에 기술 설명 합니다.

Nontypeable Haemophilus 형 스트레인 R2866 인간의 혈 청의 저항에서 Lgtc의 역할

Infection and Immunity. Nov, 2006  |  Pubmed ID: 16966407

우리 nontypeable Haemophilus 형 (NTHI) 스트레인, R2866, 수 막 염으로 아이 게 서 격리를 조사 하 고 있습니다. R2866는 정상적인 인간의 혈 청에 의해 살인에 비정상적으로 강하다. 혈 청 50% 억제 농도 (IC50)이이 긴장에 대 한 18%, 캡슐화 8. 형의 접근 이다. R3392는 인간의 혈 청 (IC50, 1.5%)에 대 한 민감도 증가 발견 된 r2866의 파생 값입니다. Lipooligosaccharide (LOS) 두 종자의 생 합성 유전자 내의 tetrameric 반복 영역의 분석 표시 glycosyltransferase 유전자 lgtC ("off") 프레임의 밖으로 r3392의 대부분의 식민지에 있지만 부모 대부분의 식민지에 ("에") 그것의 시작 codon 프레임. 우리 로스 구조 수정에 대 한 항 원 및 생 화 확 적인 증거를 찾았다. 전체 셀 효소 연결 된 immunosorbent 분석 실험 스트레인 R3392 표시 Galalpha1, 4 Gal 관련 단일 클론 항 체 4C 4 바인딩 감소. 스트레인 r2866에서 로스의 질량 분석 분석 기본 올리고 당 glycoform 포함 r3392의 4 개의 heptose 및 3 hexose 잔류물을 포함 하는 동안 4 개의 heptose 및 4 개의 hexose 잔류물을 표시 합니다. 우리 R2866 lgtC 유전자는 galactosyltransferase 인코딩합니다 결론 4C 4의 합성에 관여 다른 종자와 그 표현의 lgtC epitope이이 긴장에 대 한 관찰 되었습니다 높은 수준의 혈 청 저항과 연결 됩니다. NTHI, 높은 수준의 혈 청 저항의 유전적으로 완전 한 게놈 시퀀스 결정 되었습니다 NTHI 스트레인에 로스 컴포지션의 첫 번째 설명의 첫 번째 설명입니다.

모터 신경 SOD1 관련 상해 및 Ebselen에 의해 개량에 미토 콘 드리 아 피부 방어의 장애

Brain : a Journal of Neurology. Jul, 2006  |  Pubmed ID: 16702190

이제 알은 강력한 모터 신경 질병 (국방부), 미토 콘 드 리아 기능 장애의 증거 하지만 이러한 종양의 분자 기준입니다. 그것도 분명 여부 관찰 된 미토 콘 드 리아 기능 장애 질환 병 인에서 중심 역할을 하 고 있다면, 여부는 개량 치료 기회를 제공할 수 있습니다. 우리 후보 세대를 (SOD1) superoxide dismutase 1의 well-validated 세포 배양 모델에서 미토 콘 드리 아 단백질 식이의 변화에 대 한 proteomics 화면을 사용 하 여 접근 관련 가족 국방부 (fMND)를 채택 했다. 변경 된 단백질 매트릭스 보조 레이저 탈 착/이온화 비행 시간 (TOF MALDI) 질량 분광학에 의해 확인 되었다. 단백질 후보 apoptotic 레 귤 레이 터, 안티-oxidants 전자 수송 체인의 구성 요소를 포함. 확실 한 서양 blotting 수행 했다 및 검증 단백질 발현 변화 조사 추가 되었다. Peroxiredoxin 3 (Prx3), 미토 콘 드리 아 thioredoxin 종속 hydroperoxidase downregulated 돌연변이 SOD1 모두 우리의 세포 배양 모델 및 돌연변이 SOD1 유전자 변형 생쥐의 척수 미토 콘 드리 아의 존재 이다. 우리 기술에 의해 마우스와 인간 척추 운동 뉴런의 미토 콘 드리 아 내에서 prx3의 식을 확인합니다. 실시간 양이 많은 PCR (Q-PCR)를 사용 하 여, 우리 prx3은 downregulated 산발적 (sMND)과 fMND SOD1 관련 환자에서 척수 운동 신경에도 보여줍니다. 산화 스트레스에 의해 특징입니다 질병,이 미토 콘 드 리아 피부 방어에 잠재적으로 중요 한 적자를 나타냅니다. 최근의 증거에서 탈 선 구리 화학 산화 스트레스 SOD1 관련 Fmnd의 병 인에 중요 역할을 할 하지 않을 수 있습니다 제안 합니다. 이 연구의 결과에서 우리는 돌연변이 SOD1 모터 신경 세포 내에서 산화 스트레스를 생성할 수 있습니다 그것에 의하여 다른 메커니즘으로 미토 콘 드 리아 피부 방어의 붕괴를 제안 합니다. 또한 ebselen, 이미 안전 하 게 인간의 연구에 사용 되는 피부 약물 역할 Prx 모방을, 우리의 세포 배양 모델에서 돌연변이 SOD1 독성 개량 수 보여 줍니다. 우리 피부 응답 요소 (있다)의 전사를 유도 할 수 있는 ebselen을 보여주는 결론과 그 ebselen transcriptional upregulation 피부 단백질, 그리고 직접 자신의 오른쪽에 있는 노화 방지 제에 의해 둘 다 행동 수 있습니다 공준.

빈곤 감소는 기후 변화를 악화 하지 해야 합니다

Nature. Mar, 2007  |  Pubmed ID: 17377562

Sialic 산 교통과 Haemophilus 형에서 풀어 규정

Molecular Microbiology. Oct, 2007  |  Pubmed ID: 17880422

Nontypeable Haemophilus 형 (NTHi)의 독성 sialic 산 lipooligosaccharide의 훈장에 따라 달라 집니다. 이 설탕으로 NTHi sialic 아미노산을 합성할 수 없다는 호스트에서 파생 되어야 합니다. NTHi 또한 탄소 소스로 sialic 산을 사용할 수 있습니다. Sialic 산 전송 인코딩 유전자와 유전자 인코딩 catabolic 활동 각각 2 베낀된 divergently operons, siaPT 오 페론을 앤 오 페론 지역화 됩니다. 이 연구에서는 SiaR sialic 산 교통과 Nthi에서 풀어의 진압으로 파악. Siar의 비활성화에 모두 operons 유전자의 관계가 없는 식 귀착되 었 다. SiaR 돌연변이에 sialic 산의 관계가 없는 풀어 혈 청 감도 표면 sialylation 및 증가의 감소에 있는 결과. SiaR 중재 억압, 이외에 CRP, 캠프 수용 체 단백질 식 siaPT 오 페론만 아니라 할머니 오 페론의 활성화를 표시 했다. 우리 Siar과 CRP 세포내 sialic 산 레벨을 조절 하기 위해 노력 하는 모델을 설명 합니다. 우리의 결과 표면 sialylation의 요구와 세포내 sialic 산의 독성 축적을 균형 규정 SiaR 중재의 중요성을 보여 줍니다.

수용 Extracytoplasmic 용 질 체의 (SiaP) Nontypeable Haemophilus 형 스트레인 2019의 N-아 세 틸-5-neuraminic 산 바인딩 사이트의 특성

The Journal of Biological Chemistry. Jan, 2008  |  Pubmed ID: 17947229

Nontypeable Haemophilus 형 어린이 만성 기관지염과 만성 폐쇄성 폐 질환 환자에서 폐 렴에 중이염을 일으키는 기회주의적 인간 병원 체 이다. Nontypeable 헤 형의 외부 막은 lipooligosaccharides (로스)는 많은 통합 터미널 nonreducing 설탕으로 sialic 산에 의해 주도하 고 있다. Sialic 산 호스트 환경 내에서 박테리아의 생존에 중요 한 요소가 될 입증 되었습니다. 8. 형 sialic 산 합성 능력이 고 호스트 환경에서 무료 sialic 산 청소에 따라 달라 집니다. 이를 위해 헤 형 노사 정 ATP 독립적인 periplasmic 전송기를 이용 한다. 이 연구에서 우리는 nontypeable 헤 형 스트레인 2019에서 바인딩 사이트 extracytoplasmic 용 질 수용 체 (SiaP)의 특징. N-아 세 틸-5-neuraminic 산 (Neu5Ac)의 결정 구조-바운드 SiaP 1.4 a 결정 했다 해상도. Neu5Ac 바인딩의 열역학적 특성 enthalpically 구동 상당한 불리 한 기여와 엔트로피에서이 상호 작용을 보여 줍니다. 이 때문에 수많은 수소 결합에 의해 중재 및 몇 가지 매장된 물 분자는 neu5ac에 SiaP 바인딩을 전망 이다. 특정 아미노산을 대상으로 하는 점 돌연변이 putative 바인딩 사이트에 도입 되었다. 돌연변이 siaP 구문 보완성 결과 전체, 부분, 또는 특정 잔류물의 역할에 따라 아무 보완성에. R127K 점 돌연변이의 O deacylated 로스의 질량 분석 분석 확인 neu5ac의 감소 없이 로스에의 관찰. 가져오려는 sialic 산 헤 형의 감소 능력 보완-중재 살인 및 시험관, 박테리아 sialic 산 교통의 중요성을 확인 biofilms의 생존 능력에 부정적인 영향을 했다.

다중 사이트 평가 정밀도 및 플라즈마에 단백질의 여러 반응 모니터링 기반 측정의 재현성

Nature Biotechnology. Jul, 2009  |  Pubmed ID: 19561596

후보 바이오 마커의 확인 대상 단백질의 선택적인 검출을 위한 최적화 된 특정, 양적 분석 실험에 의존 하 고 점점 발견에 중요 한 단계 파이프라인 전 임상 유효성 검사를 그 다리 편견된 biomarker 발견으로 볼. 비록 여러 반응 모니터링 (MRM) 동위 원소 희석 질량 분석으로 결합 된 개별 실험실 입증 후보 단백질 바이오 마커의 플라즈마, 재현성 및 연구소 간의 이러한 분석 실험의 양도 증명 되지 계량 수 있습니다. 재현성, 복구, 선형 동적 범위와 감지의 한계를 평가 하기 위해 multilaboratory 연구를 설명 하 고 정량화의 다중화, MRM 기반 분석 실험, NCI CPTAC에 의해 실시. 일반 자료 및 표준화 된 프로토콜을 사용 하 여 보여 줍니다 이러한 분석 실험 실험실 및 악기 플랫폼에 걸쳐 높은 재현 될 수 있으며 unfractionated 플라즈마 낮은 낯 짝/ml 단백질 농도에 민감합니다. 데이터 및 벤치 마크는 개별 실험실 수 그들의 성능을 비교 하 고 플라즈마의 biomarker 검증에 대 한 새로운 기술을 평가 하 게 해 드립니다.

산 성 촉매 산소-18 펩 티 드의 라벨

Analytical Chemistry. Apr, 2009  |  Pubmed ID: 19243188

효소 (18) O 라벨링 전략 양적 proteomics에 대 한, 낮은 Ph에서 carboxyl oxygens 교환은 일반적으로, 바람직하지 않은 측면 반응입니다. 우리는 다시 exchange 산 촉매 반응 자체는 펩 티 드에 (18) O 라벨을 도입 하기 위한 방법으로 사용 하는 수 있는 여부와 정량에 방해 수 물었다. 여러 가지 합성 펩 티 드 50% (v/v) H(2) (18) O 포함 하는 희석 염 산에 녹아 있는 고 실 온에서 incubated. Aliquots 3 주 기간 동안 제거 하 고 텐 덤 질량 분석 (MS/MS)에 의해 분석 되었다. (18)O 법인 비율 허용 여러 안정 동위 원소 합자에 대 한 선형 회귀 분석에 의해 결정 했다. 낮은 Ph에서 펩 티 드 수성 용 매와 carboxyl 산소 원자를 들을 교환 했다. 그들은 약 11 일 후 예상된 이항 분포 평형에 도달할 때까지 동위 원소 패턴은 점차적으로 높은 대 중에 게 이동. 반응 속도 잔류물 및 시퀀스 관련 됐다. 그것의 느린 특성상 산 성 촉매 다시 exchange 최소한 방해 효소 (18) O 라벨 연구는 낮은 pH 노출 시간을 최소화 하는 스토리지 및 분석 조건 예정 이다. 자체에서 양적 proteomics에 사용 된 산 성 촉매 화학, 신진 대사, 대신 일반 태그 지정 전략입니다 (18) O 라벨 및 현재 계획 효소 동위 원소 라벨.

도전을 극복: 여호와 최소한의 과학기술처 순환 사용 증인 겪고 심장 수술

The Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery. Jun, 2010  |  Pubmed ID: 19931094

Lectin 선호도 워크플로 인간의 플라즈마 트립 신 소화에서 Glycosite 관련, 암 관련 탄수화물 구조를 대상으로 합니다

Analytical Biochemistry. Jan, 2011  |  Pubmed ID: 20705048

Glycans는 발달 하는 동안 변조 셀 유형별, posttranslational 단백질 수정 및 질병 프로세스. 이와 같이, glycoproteins는 매력적인 biomarker 후보. 여기, 우리가 특정 glycan 구조를 전달 하는 단백질을 풍부 하 게 lectin 친화성 크로마토그래피 통합 질량 분석 기반 워크플로 설명 합니다. Sialylation 및 fucosylation의 증가 암 관련 수정 중 눈에 띄는, 우리 Sambucus nigra agglutinin (SNA) 및 Aleuria (AAL) aurantia lectin sialic 산 고 fucose 포함 된 구조를 각각 바인딩할 lectins에 초점을 맞춘. 인간의 lactoferrin 긍정적인 컨트롤 및 효 모 당화 부정적인 컨트롤 역임에서 높은 스 구조에서에서 Fucosylated 및 sialylated glycopeptides. 표준 건강 한 기증자 로부터 여러 선호도 제거 시스템 (화성) 14 고갈, 트립 신 소화 인간의 플라즈마로 아군 했다. 샘플 lectin 열에 로드 된 HPLC에 의해 구분 하는 흐름을 통해 하 고 바운드 분수에 및 펩 티 드로 치료: N glycosidase F glycans N 연결을 제거 합니다. Deglycosylated 펩 티 드 분수 ESI HPLC-MS/MS에 의해 심문을 했다. 우리 총 122 인간의 플라즈마 glycoproteins 247 고유한 glycosites를 포함 하는 확인. 중요 한 것은, 관찰 된 glycoproteins (예를 들어, cadherin 5와 호 gelatinase 연결 lipocalin)의 몇 가지 일반적으로 밀리 레벨 당 낮은 나노 그램에서 플라즈마에서 순환. 함께, 이러한 결과 암 biomarker 검색 파이프라인으로 lectin 분리 플랫폼을 통합의 유틸리티의 질량 분석 기반 증거를 제공 합니다.

원래의 장소에 Fluorometers의 보정을 위한 형광 표준의 검토: 연안에서 적용 하는 권장 사항 및 프로그램을 확인 하는 바다

Optics Express. Dec, 2011  |  Pubmed ID: 22274260

Fluorometers는 엽록소 등 CDOM 농도, 지구 물리학 매개 변수를 유추로 유기 화합물에서 형광 신호를 모니터링 하 생태계 관찰에 널리 사용 되지만 측정은 미생물 파울 링, 악기 디자인, 센서 드리프트, 운영 환경 및 교정 사후 경직으로 인 한 변형에 취약. 고품질 데이터를 수집 하려면 같은 센서 자주 확인 하 고 일반 캘리브레이션 필요. 이 연구에서는 다양 한 액체와 고체 형광 물질 trialed 원래의 장소에 fluorometers의 성능 평가 대 한 참조 표준 서의 적합성을 평가 했다. 사용 기준을 평가 하는 기준이 포함 형광 센서를 기준으로 대상된 바다 속성, 농도, 안정성과 일관성, 가용성 및 비용으로 사용의 용이성을 증가 함께 fluorometer의 광 응답의 선형성을 물질의 스펙트럼 여기/방출 응답. 연구 결과 일련의 센서 해안 현장에서의 다양 한 해양 센서 구성에 맞게 고정 및 모바일 플랫폼에 배포를 위한 권장된 참조 표준으로 요약 됩니다. 권장된 액체 표준 Fluorescein를 사용 하 여 엽록소 규모 계수 반복된 결정 2.5%의 정확도 달성. 권장된 고체 표준, 유리 야 Satinice ® 매 4 H 01 DC (polymethylmethacrylate), 18 일 동안 변화 평균 값에서 엽록소 센서의 1.0%와 3.3 %cdom 센서에 의해 측정을 반복 합니다.

Lectin 크로마토그래피/질량 분석 검색 워크플로 공격적인 유방암의 상 Biomarkers를 식별합니다

Journal of Proteome Research. Feb, 2012  |  Pubmed ID: 22309216

화면 조절 lectin 크로마토그래피/MS 기반 접근을 사용 하는 우리 (덜 공격적) luminal 패널에서 매체와 트리플 음수 (공격적인) 유 방 암 세포 라인 (n = 5/하위 형식). 샘플은 fractionated lectins Aleuria aurantia (AAL) 그리고 Sambucus nigra agglutinin (SNA)를 사용 하 여 각각 fucose와 sialic 산을 인식 하는. 바운드 분수 enzymatically N deglycosylated 되었고, LC-MS/MS로 분석 했다. 총에서 533 glycoproteins ~ 90%는 했다 셀의 구성 요소 식별 표면 또는 세포 외 매트릭스. 1011 독특한 glycosites는 100 ≥3 트리플 부정적인 라인에서 발견 된 전적으로 관찰 합니다. 통계 분석 이러한 glycosites 수 트리플 부정 관련 하 고 따라서이 종양 하위 형식에 대 한 잠재적인 바이오 마커의 했다 제안 했다. RNAseq 데이터의 분석 약 트리플 luminal 셀 라인, 대 음수에 upregulated 있 었 절반 잠재적인 biomarker glycosites 운반 단백질 건설 기계 임대 인코딩 mRNAs 인코딩 fucosyl 또는 sialyltransferases 유전자의 수 변경 glycosylation 후보 식별을 구동할 수 있습니다 제안 하는 두 하위 사이 차동 표현 했다 밝혔다. 특히, 이러한 상 biomarker 후보 파생 된 glycoproteins 암 관련 프로세스에 관련 된. 따라서, 그들은이 공격적인 종양 하위에 대 한 새로운 치료 목표를 나타낼 수 있습니다.