Summary
Este procedimento demonstra in vivo perto IR imagens de fluorescência de atividades de remodelação do colágeno em ratos, bem como ex vivo coloração de colágenos em cortes de tecido usando enjaulados peptídeos de colágeno miméticas que podem ser foto-acionado para cruzar com fios de colágeno desnaturado.
Abstract
O colagénio é um componente estrutural principal da matriz extracelular que suporta a formação e manutenção dos tecidos. Embora a remodelação do colagénio é uma parte integrante da renovação do tecido normal, uma quantidade excessiva de actividade está envolvida na remodelação de tumores, da artrite, e em muitas outras situações patológicas. Durante a remodelação do colagénio, a estrutura helicoidal tripla das moléculas de colagénio é interrompido por proteases no meio ambiente extracelular. Além disso, os colagénios presentes em várias amostras de tecidos histológicos são parcialmente desnaturadas por os processos de fixação e de conservação. Portanto, esses fios de colágeno desnaturado pode servir como alvos eficazes para imagiologia biológica. Nós já desenvolveu um peptídeo mimético colágeno enjaulado (CMP), que pode ser de hibridizar com fios de colágeno desnaturado pela formação de estrutura de tripla hélice, que é exclusivo para colágenos acionada por foto. Os objetivos gerais deste procedimento são: i) a imagem fios de colágeno desnaturado resulting das atividades normais de remodelação in vivo, e ii) para visualizar colágenos em cortes de tecidos ex vivo utilizando as CMPs Caged acionada por fotos. Para conseguir a hibridação eficaz e bem sucedida in vivo e ex vivo de imagens, CMPs Caged fluorescente etiquetado são ou imediatamente antes da injeção intravenosa ativado por foto, ou são directamente accionados em cortes de tecido. Remodelagem do colágeno ósseo normal em camundongos nude e colágenos em cortes de tecido da córnea prefixadas rato são gravadas neste procedimento. O método de imagem baseado na tecnologia de hibridação de CMP-colagénio aqui apresentada poderia levar a uma compreensão mais profunda do processo de remodelação de tecidos, bem como a permitir o desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico para doenças associadas com a actividade de remodelação elevado colagénio.
Introduction
O colagénio, a proteína mais abundante em mamíferos, desempenha um papel crítico no desenvolvimento e regeneração de tecidos, apoiando a proliferação e diferenciação de células. Enquanto colagénios fibrosos (por exemplo, tipo I, II), em tecidos conjuntivos dar resistência mecânica para os tecidos, o colagénio do tipo de rede (tipo IV) formam andaime de base da membrana basal em células de prender e formar tecidos organizados. Remodelação do colágeno envolve tanto a degradação do colágeno (por proteases) e síntese (promovido por fatores de crescimento). Apesar de remodelação do colágeno, por exemplo, em osso, é parte do processo normal de renovação dos tecidos, o excesso de atividade de remodelação, ou sua ocorrência em locais anormais, geralmente indica ferida resposta a uma lesão ou patologias crônicas, como câncer, osteoporose, artrite cura, e fibrose 1-4. A capacidade de colágenos imagem diretamente em remodelação in vivo pode levar a compreensão do progressoião destas doenças, bem como de novos diagnósticos e terapêuticos. Por exemplo, imagens ao vivo pode fornecer informações sobre a gravidade e o local de doenças, e também pode ser utilizado para avaliar a eficácia dos novos agentes terapêuticos. Microscopia de varredura a laser Multiphoton e geração de segundo harmônico foram aplicadas a colágenos fibrilares imagem para monitorar remodelamento da matriz extracelular em tumores em camundongos vivos 5. No entanto, esta técnica requer que os animais a serem montados com as câmaras de dobras cutâneas dorsal transparentes, o que é um procedimento invasivo. Imagem direta e não invasiva da remodelação do colágeno vai beneficiar de uma sonda que visa especificamente o colágeno em remodelação. Essa sonda é difícil de preparar, pois precisa distinguir os colágenos remodelação do colágeno intacta e maduros, que são abundantes em tecidos normais 6.
O colagénio é constituído por estrutura de proteínas extremamente rara chamada tripla hélice, que éclivada por proteases, tais como metaloproteinases de matriz (MMP), durante a remodelação do colagénio. Os fragmentos de colagénio clivado perdem a sua estrutura de tripla hélice e tornam-se fios desdobradas (gelatina), que são ainda digeridos por proteases não específicas 1. Foi descoberto recentemente que o péptido mimético de colagénio (CMP), que tem a propensão para dobrar na estrutura helicoidal tripla pode visar especificamente cadeias de colagénio que estão dissociados do seu estado de tripla hélice por qualquer desnaturação ou por degradação enzimática de 1,7. A ligação é impulsionada principalmente pelo triple-hélice hibridação entre CMPs monoméricas e os fios de colágeno desnaturado. Porque PGZC auto-montar em hélices triplas homotrimérica à temperatura ambiente com pouca força de condução para a hibridação de colagénio, uma CMP enjaulado [(GPO) 4 NB GPO (GPO) 4, designado como NB (GPO) 9, O: hidroxiprolina], foi desenvolvido , que contém uma nitrobenzilo foto-cliváveisgrupo (NB), fixado no centro de glicina do péptido. O grupo gaiola NB impede estericamente o CMP de dobragem em hélice tripla, ainda, a remoção do grupo gaiola por irradiação UV imediatamente desencadeia a dobragem de tripla hélice do colagénio e de hibridação 1. Quando CMPs monoméricas marcados com infravermelho próximo (NIR) fluoróforos são sistemicamente entregues para modelar ratos, eles podem objetivar especificamente e permitir in vivo de imagens de colágenos desnaturados em tecidos submetidos a normal (por exemplo, no osso e cartilagem) e patológico (por exemplo, em tumores) remodelando 1 .
PGZC marcados com fluorescência também pode ser usado para imagiologia de colagénio em secções de tecido histológico. No estudo histológico, os tecidos colhidos são frequentemente preservados por fixação para manter os componentes celulares e morfologia do tecido geral de deterioração. Os procedimentos de fixação, que incluem o calor, e um tratamento com solventes orgânicos, e trans-linkin químicareagentes de g (por exemplo, paraformaldeído), desnaturar a estrutura helicoidal tripla de colagénio 8. Esta desnaturação gera locais para a CMP hibridação. Tem sido demonstrado que PGZC fluorescentemente marcadas podem ligar-se especificamente ao colagénio em secções de tecido fixado (por exemplo, pele, córnea, e osso) ainda mais eficaz do que o anticorpo anti-colagénio, o que permitiu a identificação fácil de condições patológicas em tecidos do fígado fibróticas 9. A CMP tem como alvo fios de colágeno desnaturado contendo seqüência de aminoácidos de motivos de tripla hélice, que é comum a todos os tipos de colágenos. Portanto CMP pode ser considerado um largo espectro do agente de coloração de colagénio. Aqui, apresentamos os procedimentos experimentais detalhados para i) imagiologia fios de colágeno desnaturado in vivo e ii) visualizando colágenos em cortes de tecidos ex vivo utilizando CMPs Caged fluorescente etiquetado. A tag NIR, IR680, foi conjugada com a CMP enjaulado para geração de imagens ao vivo, while carboxifluoresceína (FC) foi utilizado em tecido de trabalho de coloração para a sua compatibilidade com os microscópios de fluorescência padrão. Este protocolo centra-se na aplicação de imagem de CMPs como relacionados com a remodelação do colágeno. Métodos de síntese CMP pode ser encontrada nos relatórios anteriores 1,7,9-15. Neste relatório, vídeo, imagem tecidos esqueléticos em ratos normais e cortes de tecidos de rato córnea foram escolhidos para fins de demonstração, no entanto os métodos apresentados aqui podem ser facilmente aplicada a muitas patologias e modelos biológicos que envolvem a remodelação do colágeno (por exemplo, tumores, cicatrização de feridas), como bem como para praticamente qualquer amostra de tecido que contém o prefixo colagénios.
Protocol
Todos os estudos com animais foram realizados em conformidade com os regulamentos do Comitê Animal Care e Use a Johns Hopkins.
1. Infravermelho Próximo (NIR) imagens de fluorescência de Skeletal Colágeno Remodelação In vivo
- Photo-ativação da injeção veia CMP ea cauda enjaulado
- Prepare 110 ml de solução CMP enjaulado para cada rato (20-30 g de peso do rato): 100 ml de solução para a dosagem, com um extra de 10 mL de almofada para a possível perda durante a transferência e injeção. Misturar 11 ul de IR680-Ahx-NB (GPO) solução stock 9 (400 uM) com 11 ul de 100 uM de cisteína em solução de PBS estéril, em seguida, levar o volume total de 110 ul com tampão de PBS 1x. A solução final contém péptido 4 nmol de IR680-Ahx-NB (GPO) 9 e 1 nmol de cisteína em 100 ul de solução de PBS 1x.
- Lentamente withdraw a solução de peptídeo em um 0,5 ml seringa de insulina, com um cano transparente e um pequeno calibre (28-30 G) agulha e, cuidadosamente, remova as bolhas de ar. Ligue a lâmpada UV para permitir que a lâmpada aqueça por 2-5 min.
- Colocar a seringa contendo o péptido directamente sob uma lâmpada de UV (365 nm,> 25 mW / cm 2) durante 5 min para permitir a foto-activação.
- Enquanto isso, posicione o mouse em um limitador sob uma lâmpada aquecida; rotular o mouse com um marcador permanente na cauda ou outros métodos de identificação, tais como etiqueta de orelha ou dedo do pé tatuagem, e desinfectar a cauda com 70% de álcool.
- Imediatamente após a activação de UV, injectar 100 ul de activado por UV IR680-Ahx-NB (GPO) 9 solução na veia da cauda, de preferência, na parte posterior da cauda. Posicione o mouse de volta para a jaula após a injeção.
- NIR imagens de fluorescência de atividade remodelação do colágeno
- Conjuntoa placa de aquecimento do leito de imagem do sensor de imagem de impulso a 37 ° C usando o software 2.0 Pérola impulso.
- Coloque o mouse nu ou raspada para a câmara de indução anestésica contendo 2% de isoflurano em oxigênio. Verifique a profundidade do plano de anestesia por falta de movimento do mouse durante o manuseio e pelo monitoramento da freqüência de respiração (~ 1/seg).
- Depois que o mouse é anestesiado, abrir a gaveta imager Pérola, e coloque o animal na cama de imagem. Remover rapidamente o cone plugue nariz e deslize o focinho do rato dentro do cone do nariz para manter o rato sob anestesia (2% de isoflurano em oxigênio fornecido a 2 L / min através do cone do nariz) durante o processo de geração de imagens. Uma vez que o rato está no lugar, fechar a gaveta.
- Quando o instrumento indica "pronto" no painel de software de imagem, clique no botão "700 canal", "luz branca" e "85 mícron" caixas seguido pelo "botão adquirir imagem". NIR (excitação 685 nm, emissão 720 nm) umd brancas fotos de luz será levado usando o foco automático ea exposição.
- Quando a gravação terminar, abra a gaveta, vire o mouse, e adquirir imagens de um outro ângulo. O mouse pode ser colocado com a sua frente (ventral), costas (dorsal) ou nas laterais de frente para a câmera. Estreitas faixas de fita pode ser usada como restrições para esticar seus membros para obter a melhor vista da região de interesse (por exemplo, caixa torácica, tornozelos e pulsos).
- Um tempo adequado para observar a absorção do esqueleto de IR680-CMP é entre 24-96 horas pós-injecção (hpi), com base na dosagem (~ 4 nmol / murganho). Para adquirir imagens de alta resolução, sacrificar o mouse por deslocamento cervical sob anestesia profunda após 72 hpi, retire a pele (e cabelo), usando uma pinça cirúrgica e tesouras, e da imagem que por NIR fluorescência como descrito acima.
- Analisar as imagens de fluorescência adquiridos NIR.
2. Visualização de colágenos em Ex vivo0; tecido Seções
- Preparação do material
- Prepare 1 ml de 10% (w / v) de solução de BSA em água desionizada. Descongelar 1 ml de soro de cabra em um banho de água à temperatura ambiente. Cortar algumas peças de Parafilm no tamanho de cerca de 2 cm x 5 cm.
- Preparar 10 ml de tampão de bloqueio, através da mistura de 500 mL de soro de cabra, 1 ml de 10x de PBS e 8,5 ml de água desionizada. Prepare 5 ml de tampão de diluição de CMP diluindo 50 ul de 10% (w / v) de BSA com 4,45 ml de água desionizada e 500 ul de PBS 10x.
- Dilui-se as soluções de reserva de marcado-carboxifluoresceína enjaulado CMP, CF NB (GPO) 9 (480 uM), a 5 uM, utilizando o tampão de diluição de CMP. CMP concentração óptima varia 2,5-30 uM, dependendo do tipo de tecidos e a natureza de amostras de tecido. Um volume de 100 uL é recomendado para coloração de uma secção de tecido deslizante. Guarde o solut CMP formuladoíons no escuro.
- Deixe o mouse lâminas de tecido da córnea atinjam a temperatura ambiente. Incubar as lâminas em tampão PBS 1x por 5 min. Os tecidos da córnea de ratinho usados nesta demonstração foram prefixados com paraformaldeído a 4% em solução de PBS, durante 1 hora, criopreservadas em Tissue-Tek outubro médio, cryosectioned a 8 espessura mM, e montadas em lâminas de vidro carregadas.
- Coloração de tecidos e de imagem
- Colocar as lâminas em câmara úmida. Para cada lâmina, aplicar 0,5 ml de solução de bloqueio e incubar as lâminas durante 30 minutos à temperatura ambiente. Remover a solução de bloqueio por secagem das lâminas sobre uma toalha de papel.
- Aplicar a cerca de 100 ul de CF NB (GPO) 9 soluções para cobrir as secções de tecido de cada lâmina. Incubar as lâminas durante 2 min para permitir que a solução de CMP para permear tecidos.
- Ligue a lâmpada UV. Quando a lâmpada é aquecido, expor o tecido CMP-se cobertoCÇÕES à luz UV durante 6 min (365 nm, ~ 8 mW / cm 2) para desproteger os PGZC gaiolas. Após a exposição à radiação UV, cobrir as secções de tecido de cada lâmina com um pedaço de Parafilm para evitar a secagem. Colocar as lâminas na câmara húmida e incubar a 4 ° C durante 2 horas.
- Prepara-se uma diluição de 1:3.000 de solução DAPI em PBS 1x. Após a coloração CMP, retire delicadamente o Parafilm com uma pinça, e secar os slides em um papel toalha para remover o excesso de solução CMP. Aplicar a cerca de 100 ul de soluções diluídas DAPI para cada lâmina de tecido e incubar durante 1 minuto à temperatura ambiente.
- Após a coloração, mergulhe as lâminas em tampão PBS 1x em uma tina de coloração por 5 min. Repita este 3x em fresco 1x PBS para lavar os agentes de coloração não ligados.
- Adicionar uma gota de meio de montagem na secção de tecido e cubra com uma lamela de vidro, evitando bolhas de interceptação. Coloque os slides em uma bandeja deslizante de papelão para protegê-los da luz.
- Imagem os fios de colágeno (canal FITC) e núcleo das células (canal DAPI) nas lâminas de tecido, utilizando um microscópio de fluorescência.
Representative Results
A Figura 1 mostra um resultado típico de como IR680-Ahx-(GPO) acionada por foto 9 distribui em um SKH1 fêmea rato nu saudável após 24-96 horas pós injeção. Ele mostra acumulação CMP aparente no esqueleto após 24 hpi, altura em que a maioria dos peptídeos não ligados foram em grande parte esvaziados. O processo de hibridação de CMP com os fios de colágeno remodelação parece ser relativamente lento, especialmente em contraste com outras sondas de imagem (por exemplo, péptido RGD 16). Isso provavelmente é por causa da taxa de dobramento lento da tripla hélice de colágeno 17,18. No entanto, uma vez hibridados, as cadeias CMP estão fortemente ligados aos tecidos colagenosos, com apenas uma ligeira redução do sinal é observada após 24 hpi (Figura 1). Em 96 hpi, a imagem de fluorescência de NIR o rato após a remoção da pele demonstra claramente a absorção do esqueleto de IR680-Ahx-(GPO) 9 na coluna vertebral e as costelas, bem como dentro dos joelhos, os tornozelos,pulsos e mandíbulas inferiores (Figura 2A).
Em ex vivo coloração de tecidos, desencadeada foto-fluorescente-rotulados CMPs Caged hibridizar especificamente para fios de colágeno desnaturado em cortes de tecido. Na Figura 3, a coloração de CMP revela claramente as finas fibras de colagénio paralelas no estroma da córnea, o que demonstra a sua utilização como um agente de coloração específica de colagénio.
Figura 1. Imagens de fluorescência NIR serial de um rato nu administrado por via intravenosa com foto-decaged IR680-Ahx-(GPO) 9 mostrando a absorção óssea ao longo de quatro dias. Clique aqui para ver imagem ampliada.
Figura 2. NIR imagens de fluorescência de camundongos administrados com foto-decaged IR680-Ahx-(GPO) 9 (A), enjaulado IR680-Ahx-NB (GPO) 9 sem exposição aos raios UV (B), pré-dobrados triple-helicoidal [IR680-Ahx-(GPO ) 9] 3 (C), ou dissociado ao calor única vertente IR680-Ahx-(GPO) 9 (D) em 96 hpi após a remoção da pele. segmentação Skeletal pela CMP só pode ser observado em A e D. Sinais de fluorescência NIR são mostrados na escala do arco-íris. Clique aqui para ver imagem ampliada.
Figura 3. Micrografias de fluorescência de uma co ratosecção de tecido rneal prefixado em paraformaldeído, e corados com DAPI e CF acionada por foto (GPO) 9 usando Protocolo 2, exibindo estroma colágeno denso (manchada pela CMP, em verde), bem como epitélio celular e endotélio (manchado por DAPI, em azul ) (barra de escala: 100 mm).
Discussion
Como pode ser visto neste protocolo, a entrega do CMP é simples já que o UV-ativação das CMPs enjaulados é o único passo adicional para a cauda comum protocolos de injeção veia 19. A chave é injetar as sondas de peptídeos em um estado de um único fio uncaged e metaestável. O grupo gaiola impede CMP de auto-montagem e ligação para colagénios (Figura 2B), até que seja removido por luz de UV a que o ponto de CMP começa a dobrar-se em hélice tripla. A formulação injectável contém cisteína, que pode reagir rapidamente com o grupo gaiola clivada durante a irradiação de UV para minimizar a toxicidade. Inúmeros ratos com diferentes estirpes (por exemplo SKH-1 e DR-1) foram testados utilizando esta formulação, e não detectamos quaisquer defeitos de saúde comportamental ou outros nesses camundongos até seis meses. Se a injecção não se segue imediatamente após a exposição UV, as CMPs vai dobrar em hélices triplas homotrimérica, que não têm capacidade de hibridização. Figura 2C mostra um caso extremo, onde antes da injeção das CMPs foram totalmente remontada em hélices triplas por tempo de atraso longo (> 2 dias). Para contornar este problema, solução CMP deve ser preparado em concentração relativamente baixa (por exemplo, ~ 40 mM), e injectado nos ratinhos imediatamente após UV-decaging. Devido à lenta taxa de hélice tripla dobragem das CMP em condições diluídas (metade do tempo de re-enrolamento:> 50 min) e a exposição à radiação UV e curto tempo de injecção (5 ~ 7 total min), a maioria dos PGZC entram na corrente sanguínea em única vertente formulário quando este protocolo é seguido. Uma vez injectados, PGZC devem permanecer como cadeias simples, como a concentração é reduzida por um factor de 20 numa acumulação de sangue, levando a uma redução dramática na taxa de remontagem 18. Se a injeção é adiada (por exemplo, devido ao manuseio de animais) e é suspeito de redobramento homotrimérica, os peptídeos parcialmente montados pode ser reativado por aquecimento acima de 7076; C dissociar as CMPs para-cadeias simples, seguido de imediato resfriamento e injeção. Embora menos conveniente, tais CMPs dissociado ao calor também mostram resultados in vivo de segmentação (Figura 2D) esperado.
Na presente demonstração, os ratinhos nus foram utilizadas para imagens de fluorescência de NIR porque até 50% do sinal de NIR pode ser bloqueada pelo cabelo. Quando se trabalha com modelos de ratos de cabelos (especialmente os com pêlos pretos), recomendamos raspar o mouse na região de interesse antes da imagem usando um barbeador elétrico ou removedor de pêlos. Na Figura 1, existem sinais de falsos positivos a partir da região abdominal do animal, o qual é causado por auto-fluorescência da clorofila na dieta dos animais. Tais sinais de fundo pode ser significativamente reduzida, passando o mouse para dietas purificadas cerca de 4 dias antes da imagem. Como pode ser visto nas Figuras 1 e 2A, existem fortes absorções CMP no piruetae. Portanto, para evitar artefactos resultantes injecções na veia da cauda imperfeitos, recomendamos a injecção na parte posterior da cauda de modo que o local da injecção não é capturada na imagem de fluorescência.
A CMP rotulado permite segmentação e imagens de locais específicos de remodelação do colágeno in vivo que são difíceis de detectar por outros métodos. Por exemplo, o sangue e urina, ensaios baseados em ELISA são sensíveis para os fragmentos de colagénio telopéptido clivados, mas o método não pode localizar a fonte do turnover do colagénio, uma vez que tem como alvo antigénios solúveis. As principais limitações da técnica de imagem in vivo utilizando NIR rotulado CMPs são atenuação da profundidade de penetração e têmpera por proximais agrupados células vermelhas como hemoglobina é um supressor endógeno de 680/710 nm corantes NIR. As aplicações futuras da CMP em imagem in vivo incluem SPECT ou PET imagem usando CMPs marcados com radionuclídeos emissores de radiação gama, diretos ou com pósitrons emitters, para diagnóstico de estados de doença que envolvem a remodelação do colagénio (por exemplo, osteoporose, artrite, aterosclerose, e fibrose). Estes análogos CMP radiomarcados irá eliminar as limitações de perda de sinal, devido à profundidade de tecido quanto à presença de glóbulos vermelhos combinados, e irá permitir que as medições quantitativas de tecidos doentes. Além disso, o tempo de imagem relativamente tarde (por exemplo, 48-96 hpi) resultante da liberação de ligação e lenta de CMPs poderia tornar difícil acompanhar as mudanças rápidas na remodelação do colágeno. Essa limitação pode ser superada por mais engenharia da cinética de ligação e afinidade dos agentes de imagem CMP. Desde CMP liga a colágenos desnaturados que têm pouca estrutura, a imagem de colágeno baseado em CMP é complementar ao segundo microscopia geração harmônica que só pode imagem fibras de colágeno 5.
Quando coloração cortes de tecidos com fluorescente etiquetado CMPs, descobrimos que é benéfico para incubar aAs amostras das soluções de péptido activado por UV, a 4 ° C, porque a hibridação de tripla hélice é facilitada a temperatura mais baixa de 1,20. Constatou-se também que a imersão das lâminas em tampão PBS fresco em uma tina de coloração é a maneira mais eficaz para lavar CMPs não ligados, o que funciona muito melhor do que simplesmente pipetagem tampões de lavagem sobre as amostras. A hibridização vertente CMP-colágeno é muito específico e robusto, por isso o protocolo de coloração simples apresentadas neste vídeo pode ser facilmente modificado para costaining biomarcadores adicionais, e para a identificação de colágenos degradadas em cortes de tecido não corrigidos. Isto é uma alternativa eficaz e conveniente para o uso de anticorpos anti-colagénio para a detecção de colagénios fibrosos em várias amostras histológicas.
Disclosures
Os autores declaram não haver interesses financeiros concorrentes.
Acknowledgments
Os autores agradecem Gilbert Verde para assistência técnica. Este trabalho foi apoiado por subsídios da NIAMS / NIH (R01-AR060484) e DOD (W81XWH-12-1-0555) atribuído a SMY e do NIH (CA92871 U24 U54 e CA151838) concedidos a MGP
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| IRdye 680RD Maleimide (IR680) | LI-COR | 929-71050 | Used for CMP labeling, protocol presented elsewhere1. |
| 5(6)-Carboxyfluorescein | Sigma | 21877-5G-F | Used for CMP labeling, protocol presented elsewhere12. |
| Cysteine | Advanced Chemtech | YC2200 | |
| Isoflurane | Butler Veterinary Supply | 4/4/5260 | |
| Goat Serum | Sigma | G9023-10ML | |
| Albumin from bovine serum (BSA) | Sigma | A9647 | |
| DAPI | Roche Applied Science | 10236276001 | |
| Fluoroshield mounting medium | Sigma | F6182-20ML | |
| Syringes | BD | 329461 | |
| UV lamp | McMaster-Carr | 1447T17 | |
| Pearl impulse imager | LI-COR | 9400 | |
| Surgical forceps and scissors | |||
| EasyDip slide staining system | Light Labs | M900-12B | |
| 20-place cardboard microscope slide tray | Light Labs | ||
| Cover glasses | Fisher | 12-545-c | |
| Fluorescence Microscope | Nikon | Eclipse TE2000-E |
References
- Li, Y., et al. Targeting collagen strands by photo-triggered triple-helix hybridization. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109, 14767-14772 (2012).
- Wynn, T. A., Ramalingam, T. R. Mechanisms of fibrosis: therapeutic translation for fibrotic disease. Nat. Med. 18, 1028-1040 (2012).
- Kessenbrock, K., Plaks, V., Werb, Z. Matrix metalloproteinases: regulators of the tumor microenvironment. Cell. 141, 52-67 (2010).
- Costa, A. G., Cusano, N. E., Silva, B. C., Cremers, S., Bilezikian, J. P. Cathepsin K: its skeletal actions and role as a therapeutic target in osteoporosis. Nat. Rev. Rheumatol. 7, 447-456 (2011).
- Perentes, J. Y., et al. et al. In vivo imaging of extracellular matrix remodeling by tumor-associated fibroblasts. Nat. Methods. 6, 143-145 (2009).
- Breurken, M., Lempens, E. H. M., Meijer, E. W., Merkx, M. Semi-synthesis of a protease-activatable collagen targeting probe. Chem. Commun. 47, 7998-8000 (2011).
- Wang, A. Y., et al. Spatio-temporal modification of collagen scaffolds mediated by triple helical propensity. Biomacromolecules. 9, 1755-1763 (2008).
- Bächinger, H. P., Morris, N. P. Analysis of the thermal stability of type II collagen in various solvents used for reversed-phase high performance chromatography. Matrix. 10, 331-338 (1990).
- Li, Y., et al. Direct detection of collagenous proteins by fluorescently labeled collagen mimetic peptides. Bioconjugate Chem. 24, 9-16 (2013).
- Li, Y., Mo, X., Kim, D., Yu, S. M. Template-tethered collagen mimetic peptides for studying heterotrimeric triple-helical interactions. Biopolymers. 95, 94-104 (2011).
- Stahl, P. J., Cruz, J. C., Li, Y., Yu, S. M., Hristova, K. On-the-resin N-terminal modification of long synthetic peptides. Anal. Biochem. 424, 137-139 (2012).
- Wang, A. Y., Mo, X., Chen, C. S., Yu, S. M. Facile modification of collagen directed by collagen mimetic peptides. J. Am. Chem. Soc. 127, 4130-4131 (2005).
- Wang, A. Y., et al. Immobilization of growth factors on collagen scaffolds mediated by polyanionic collagen mimetic peptides and its effect on endothelial cell morphogenesis. Biomacromolecules. 9, 2929-2936 (2008).
- Mo, X., An, Y. J., Yun, C. S., Yu, S. M. Nanoparticle-assisted visualization of binding interactions between collagen mimetic peptide and collagen fibers. Angew. Chem. Int. Ed. 45, 2267-2270 (2006).
- Chan, T. R., Stahl, P. J., Yu, S. M. Matrix-bound VEGF mimetic peptides: design and endothelial cell activation in collagen scaffolds. Adv. Funct. Mater. 21, 4252-4262 (2011).
- van Hagen, P. M., et al. Evaluation of a radiolabelled cyclic DTPA-RGD analogue for tumour imaging and radionuclide therapy. Int. J. Cancer. 90, 186-198 (2000).
- Boudko, S., et al. Nucleation and propagation of the collagen triple helix in single-chain and trimerized peptides: transition from third to first order kinetics. J. Mol. Biol. 317, 459-470 (2002).
- Ackerman, M. S., et al. Sequence dependence of the folding of collagen-like peptides. J. Biol. Chem. 274, 7668-7673 (1999).
- Machholz, E., Mulder, G., Ruiz, C., Corning, B. F., Pritchett-Corning, K. R. Manual restraint and common compound administration routes in mice and rats. J. Vis. Exp. (67), (2012).
- Brodsky, B., Persikov, A. V. Molecular structure of the collagen triple helix. Adv. Prot. Chem. 70, 301-339 (2005).
