Biology

הערכת יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות למיגור ביופילמים חלביים בגישה המשלבת שיטות סטטיות ודינמיות

Published: December 9, 2022 doi: 10.3791/64619

Coralie Goetz*¹, Nissa Niboucha*¹, Eric Jubinville¹, Julie Jean¹

¹Département des Sciences des Aliments, Institut sur la Nutrition et les Aliments Fonctionnels, Université Laval

* These authors contributed equally

Summary

פרוטוקול זה מתאר גישה המשלבת שיטות סטטיות ודינמיות להערכת יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות למיגור ביופילמים בתעשיית החלב. גישה זו עשויה לשמש גם לבדיקת יעילותן של פורמולציות ביולוגיות או כימיות חדשות לשליטה בביופילמים.

Abstract

נוכחותם של ביופילמים בתעשיית החלב מעוררת דאגה רבה, שכן הם עלולים להוביל לייצור מוצרי חלב לא בטוחים ומשתנים בשל עמידותם הגבוהה לרוב נהלי הניקיון במקום (CIP) המשמשים לעתים קרובות במפעלי עיבוד. לכן, הכרחי לפתח אסטרטגיות חדשות לבקרת ביופילם עבור תעשיית החלב. פרוטוקול זה נועד להעריך את יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות (חומצות פראצטיות, פרפרופיוניות ופרלקטיות וחומר חיטוי מסחרי על בסיס חומצה פראצטית) להשמדת ביופילמים חלביים באמצעות שילוב של שיטות סטטיות ודינמיות. כל חומרי החיטוי נבדקו על החיידקים החזקים ביותר מייצרי ביופילם בביופילם יחיד או מעורב באמצעות בדיקת ריכוז מיגור הביופילם המינימלי (MBEC), שיטת סינון סטטית בעלת תפוקה גבוהה. זמן מגע של 5 דקות עם חומרי החיטוי בריכוזים המומלצים הצליח לחסל הן את הביופילמים הבודדים והן את הביופילמים המעורבים. מחקרים נמשכים כעת כדי לאשר תצפיות אלה באמצעות כור ביופילם של המרכז לבקרת מחלות (CDC), שיטה דינמית לחיקוי תנאים באתרם . סוג זה של ביוריאקטור מאפשר שימוש במשטח נירוסטה, המהווה את רוב הציוד והמשטחים התעשייתיים. נראה כי התוצאות הראשוניות מהכור מאשרות את יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות כנגד ביופילמים. הגישה המשולבת המתוארת במחקר זה עשויה לשמש לפיתוח ובדיקה של פורמולציות ביולוגיות או כימיות חדשות לשליטה בביופילמים ולחיסול מיקרואורגניזמים.

Introduction

תעשיית החלב היא מגזר תעשייתי מרכזי ברחבי העולם, כולל בקנדה, שם יש יותר מ -10,500 רפתות המייצרות כמעט 90 מיליון hL חלב מדי שנה¹. למרות דרישות ההיגיינה המחמירות המוטלות בתעשיית החלב, כולל במפעלי עיבוד, החלב מהווה מדיום תרבית נהדר למיקרואורגניזמים, ולכן מוצרי חלב עשויים להכיל מיקרואורגניזמים, כולל קלקול או מיקרואורגניזמים פתוגניים. פתוגנים אלה יכולים לגרום למחלות שונות; לדוגמה, Salmonella sp. ו Listeria monocytogenes יכול לגרום גסטרואנטריטיס ודלקת קרום המוח, בהתאמה². מיקרואורגניזמים מקולקלים יכולים להשפיע על האיכות והתכונות האורגנולפטיות, של מוצרי חלב על ידי ייצור גזים, אנזימים חוץ-תאיים או חומצות³. המראה והצבע של החלב עשויים גם להשתנות, למשל על ידי Pseudomonas ^spp.4.

חלק מהמיקרואורגניזמים האלה יכולים ליצור ביופילמים על משטחים שונים, כולל נירוסטה. ביופילמים כאלה מאפשרים התמדה וכפל של מיקרואורגניזמים על פני השטח של הציוד, ובכך זיהום של מוצרי חלב⁵. ביופילמים בעייתיים גם בשל יכולתם לעכב מעבר חום ולהאיץ את הקורוזיה של הציוד, מה שמוביל להחלפה מוקדמת של הציוד ובכך להפסדים כלכליים⁶.

נהלי ניקוי במקום (CIP) מאפשרים לתעשיית המזון לשלוט בצמיחת מיקרואורגניזמים. הליכים אלה כוללים שימוש רציף של נתרן הידרוקסידי, חומצה חנקתית, ולפעמים חומרי חיטוי המכילים חומצה היפוכלורית וחומצה פראצטית ^7,8. למרות חומצה hypochlorous יעיל מאוד נגד מיקרואורגניזמים, זה גם מגיב עם חומר אורגני טבעי, גרימת היווצרות של תוצרי לוואי רעילים⁹. חומצה פראצטית אינה מייצרת תוצרי לוואי מזיקים¹⁰; עם זאת, יעילותו נגד ביופילמים בתעשיית המזון משתנה מאוד^10,11. לאחרונה, חומצות פרוקסי אחרות, כולל חומצות פרפרופיוניות ופרלקטיות, נחקרו בזכות הפעילות האנטי-מיקרוביאלית שלהן, ונראה שהן חלופה טובה לשליטה בגדילה מיקרוביאלית בביופילמים^12,13.

לכן, מחקר זה נועד להעריך את יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות (חומצות פראצטיות, פרפרופיוניות ופרלקטיות וחומר חיטוי מבוסס חומצה פראצטית) לחיסול ביופילמים של מוצרי חלב באמצעות גישה המשלבת את בדיקת ריכוז מיגור הביופילם המינימלי (MBEC), שיטת סינון סטטית בתפוקה גבוהה, וכור ביופילם של המרכז לבקרת מחלות (CDC), שיטה דינמית המחקה באתרה תנאים. בדיקת MBEC מכונה להלן "לוחות מיקרוטיטר ביופילם" בפרוטוקול. הפרוטוקול המוצג כאן והתוצאות המייצגות מדגימים את יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות ואת יישומן הפוטנציאלי לשליטה בביופילמים מיקרוביאליים בתעשיית החלב.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

העבודה הכלולה במאמר זה דורשת מעבדה ברמת בטיחות ביולוגית 2 ואושרה בעבר (פרויקט מספר 119689) על ידי ועדת הבטיחות הביולוגית המוסדית של אוניברסיטת לאוואל.

הערה: תרשים הזרימה באיור 1 מייצג סיכום של מתודולוגיה המשלבת גישות סטטיות ודינמיות ששימשה להערכת היעילות של חומצות פרוקסי אורגניות להשמדת ביופילמים.

1. הכנת חומרים

מבודדים מיקרוביאליים
1. הפעל את ארון הבטיחות הביולוגי (BSC) 15 דקות לפני השימוש ונקה אותו עם תמיסת אלכוהול של 70% (v/v).
2. ברגע שה-BSC סטרילי, הניחו בקבוקון של המבודד המיקרוביאלי לבדיקה (Pseudomonas azotoformans או Brevundimonas vesicularis במחקר זה), לולאה מחסנת, צינור של 15 מ"ל מלא ב-10 מ"ל של מרק סויה טריפטי סטרילי (TSB) ומערבל מערבולת. לפני המיקום BSC, לחטא את כל החומרים עם אלכוהול.
3. מערבול בקבוקון של בידוד מיקרוביאלי כדי הומוגניזציה של התרבית.
4. להעביר 20 μL של בידוד מיקרוביאלי לתוך 10 מ"ל של TSB סטרילי הכלול צינור 15 מ"ל לדגור אותו ב 30 ° C במשך 16-24 שעות עם תסיסה ב 160 סל"ד.
  אזהרה: יש להשתמש ב- B. vesicularis במעבדה ברמת הכלה 2 בהתאם להנחיות הנדרשות לטיפול באורגניזמים פתוגניים. המטפל חייב להיות מאומן כראוי ועליו ללבוש משקפי בטיחות, כפפות ומעיל.
חומרי חיטוי
1. להכנת תמיסת חומצה פרוקסי אורגנית (60 מ"ל), הוסיפו 24 מ"ל מי חמצן ו-36 מ"ל חומצה (חומצה אצטית, פרופיונית או לקטית) לצלוחית ארלנמאייר בנפח 250 מ"ל. לאחר מכן, הוסף נפח מוגדר מראש של 10 M חומצה גופרתית (655 μL עבור חומצה peracetic, 635 μL עבור חומצה perpropionic, או 715 μL עבור חומצה פרלקטית). נערו בעדינות את הבקבוק כדי לערבב, והכניסו את הבקבוק לאמבט מים בטמפרטורה של 30 מעלות צלזיוס בתוך מכסה המנוע הכימי. דוגרים על הבקבוק במשך יומיים, עם ערבוב עדין בכל בוקר.
  הערה: חומר החיטוי המסחרי המבוסס על חומצה פראצטית (ראה טבלת חומרים) סופק ישירות על ידי היצרן.
  אזהרה: יש להשתמש בחומרי החיטוי מתחת למכסה מנוע כימי. יש ללבוש משקפי בטיחות וכפפות למשך הניסוי. לקבלת מידע נוסף על חומרי החיטוי, עיין בגיליון נתוני בטיחות החומרים המתאים.
2. בצע טיטרציה של מי חמצן כמתואר להלן.
  1. הניחו ריקה של 300 מ"ל על איזון אנליטי (ראו טבלת חומרים) וטו את קנה המידה. שוקלים כ-0.23 גרם חומר חיטוי לתוך הכד ומציינים את המשקל המדויק שנוסף. מוסיפים 100 גרם של תמיסת חומצה גופרתית קרה 1 N לתוך הכד, מוסיפים חטיף ערבוב מגנטי לתוך הכד ומניחים אותו על צלחת ערבוב.
  2. תן לפתרון לערבב עד הומוגניזציה מלאה. לאחר מכן, הוסף שלוש טיפות של תמיסת מחוון פרואין (0.1 wt% ב- H₂O) לתוך הכד, וטיטראט עם תמיסת צריום סולפט 0.1 N עד שתמיסה משתנה מצבע ורוד סלמון לצבע תכלת. שים לב לנפח של תמיסת צריום סולפט שנוספה.
  3. חישוב אחוז מי חמצן באמצעות הנוסחה הבאה:
    (1)
    כאשר S הוא נפח תמיסת צריום סולפט שנוספה, N הוא הנורמליות של תמיסת צריום סולפט (0.1 N), W הוא משקל הדגימה (~0.2300 גרם), ו- 0.017 = (1 mol H 2 O 2/2 mol Ce) × (34.0147 גרם H 2 O 2 /1 mol H 2 O)₂× (1ליטר / 1,000 מ"ל)
3. בצע טיטרציה של peroxyacids אורגני כמתואר להלן.
  1. הוסף 20 מ"ל של תמיסת יודיד אשלגן 7.5% (w/v) לתוך כוסית. טיטרט לאט עם תמיסת נתרן תיוסולפט 0.1 N עד שהצבע הכחול של התמיסה מתחיל להפוך לחום/כתום בהיר.
  2. הוסף 2 מ"ל של תמיסת עמילן (1 wt% ב H₂O) לכוס וטיטרט עם תמיסת נתרן תיוסולפט 0.1 N עד שתמיסה משתנה משחור לכתום. שים לב לנפח של תמיסת נתרן thiosulfate בשימוש.
  3. חשב את אחוז peroxyacid אורגני עם הנוסחה הבאה:
    (2)
    כאשר T הוא נפח תמיסת הנתרן תיוסולפט בשימוש, N הוא הנורמליות של תמיסת הנתרן תיוסולפט (0.1 N), W הוא משקל הדגימה (~0.2300g), ו- 0.038 = (1 mol CH 3 COOOH/1 mol I 2) × (1 mol I 2/2 mol S ₂ O 3) × (76.06 גרם/1 מולCH₃ COOOH) × (1 ליטר/1,000 מ"ל)
    הערה: חזור על שלב 1.2.2 ושלב 1.2.3 עם שתי דגימות נוספות כדי לבצע כל בדיקה בשלשה.

2. היווצרות ביופילמים בודדים ומעורבים

לוחות מיקרוטיטר ביופילם
1. מערבול הצינור המכיל את תרבית החיידקים (20 μL של הזן + 10 מ"ל של מדיום TSB, מוכן בשלב 1.1.4). בצע דילול וציפוי סדרתי על אגר סויה טריפטי (TSA) כדי לקבוע את ספירת תאי החיידקים (cfu) של תרבית הלילה. לאחר מכן, להעביר 100 μL של התרבית לתוך 10 מ"ל של מדיום TSB סטרילי (עבור ריכוז סופי של כ 2 x 10⁷ cfu/mL).
  הערה: עבור הבדיקה עם הביוריאקטור, נפח של 100 μL של בידוד מיקרוביאלי מועבר לתוך 100 מ"ל של TSB סטרילי.
2. מערבלים את הצינור. עבור כל חיידק, מעבירים את תרבית החיידקים המדוללת לצלחת מיקרוטיטר הביופילם (150 מיקרוליטר לבאר) בטריפליקט באמצעות פיפטה רב ערוצית. עומס 150 μL של TSB בינוני לתוך שלוש בארות חדשות שישמשו בקרה. יש לדגור על צלחת המיקרוטיטר של הביופילם (ראו טבלת חומרים) בטמפרטורה של 30°C למשך 24 שעות ללא תסיסה.
  הערה: לבדיקות ביופילם מעורבות, הוסף 75 μL מכל תרחיף לקבלת נפח כולל של 150 μL. לוח המיקרוטיטר של הביופילם מכיל יתדות בעפעפיו, שעליהן נוצרים הביופילמים.
ביוריאקטור
1. נקו וייבשו באוויר את חלקי הביוריאקטור (ראו טבלת חומרים) בהתאם להוראות היצרן, והמשיכו להכין את הכור כמתואר להלן.
  1. ראשית, הניחו את הלהב השטוח בתוך זכוכית 1 ליטר (ביוריאקטור), המחוברת למחזיק שלה על ידי מוט מגנטי, ושמרו על המערך במצב זקוף באמצעות מוט הפלסטיק המחובר בצד הפנימי של מכסה הביוריאקטור.
  2. הניחו את הקופונים או המגלשות מפלדת אל-חלד (ראו טבלת חומרים) על מוטות הפוליפרופילן שלהם באמצעות המברג, והכניסו אותם לתוך החורים במכסה, מבלי להכניס את פיני היישור שלהם לחריצים, כדי לאפשר לאדים לברוח במהלך העיקור.
  3. כסו את כל פתחי האוורור של הביוריאקטור ברדיד אלומיניום, ועטפו את שאר הציוד, כלומר את הצינור L/S 18 (ID = 7.9 מ"מ) ואת L/S 16 (ID = 3.1 מ"מ), את שבר זרימת הזכוכית, את מכסי המיכלים, את המברגים, את המלקחיים ואת מסנני 0.2 מיקרומטר, ברדיד אלומיניום.
    הערה: הכנס את צינור הסיליקון (ראה טבלת חומרים) למוט הממוקם על המשטח הפנימי של מכסה המכל הבינוני.
  4. Autoclave הביוריאקטור להגדיר במחזור יבש ב 121 ° C במשך 20 דקות.
2. בצע היווצרות ביופילם בביוריאקטור במצב אצווה (צעד ראשון).
  1. ב- BSC, חבר קצה אחד של הצינור L/S 18 לפיית היציאה של הביוריאקטור, ושמור את הקצה השני עטוף ברדיד אלומיניום כדי לשמור על סטריליות.
  2. הסר קופון אחד או מחזיק שקופיות אחד ממכסה הביוריאקטור והנח אותו בצינור סטרילי של 50 מ"ל. לאחר מכן, מלאו את הכד של הביוריאקטור ב-340 מ"ל של 300 מ"ג/ליטר TSB בינוני דרך החור שנכבש על ידי המוט באמצעות פיפטה סרולוגית של 50 מ"ל.
  3. חסן את מדיום התרבית בביוריאקטור עם 1 מ"ל של התמיסה החיידקית (~ 10⁸ cfu/mL של P. azotoformans) באמצעות פיפטה של 5 מ"ל דרך אותו פתח ששימש קודם לכן, ולאחר מכן החזיר את המוט למקומו המקורי. מקם את המוטות שכבר ממוקמים בחורי המכסה כך שהפינים יתאימו לחריצים המתאימים שלהם.
  4. מניחים מסנן טיהור אוויר חיידקי 0.2 מיקרומטר בקצה הצינור בקוטר הקטן ביותר, הממוקם על מכסה הביוריאקטור. הצינור השני באותו קוטר נשאר מחובר באופן קבוע עם מכסה בורג מתכת או תקע סיליקון שנסגר בחוזקה.
  5. הניחו את הביוריאקטור למשך 24 שעות מעל פלטת החימום בטמפרטורה של 30°C וערבבו ב-130 סל"ד.
    הערה: ליצירת ביופילם רב-מינים, השתמש בנפח שווה של תרביות החיידקים השונות כדי לקבל נפח כולל של 1 מ"ל עבור החיסון.
3. ביצוע היווצרות ביופילם בביוריאקטור במצב זרימה רציפה (שלב שני).
  1. הניחו קרבוי המכיל 18 ליטר מים מזוקקים סטריליים ב-BSC, והוסיפו 2 ליטר של 1,000 מ"ג/ליטר מדיום תרבית TSB לקבלת ריכוז סופי של 100 מ"ג/ליטר.
  2. מכסים את המיכל במכסה הסטרילי שלו, שאליו מחוברים שני צינורות. הראשון הוא צינור סיליקון המקובע על הפן הפנימי של הכובע ומשמש לשאיבת המדיום. הצינור השני (L/S 16) מחובר ליציאה החיצונית כדי לאפשר לנוזל לזרום לכיוון הביוריאקטור. הניחו מסנן של 0.2 מיקרומטר לתוך הצינור השני על מכסה המיכל הבינוני.
  3. חבר צינור שני זה למשאבה הפריסטלטית וחבר את הקצה השני לשבר זרימת הזכוכית, אשר מוכנס לאחר מכן לתוך הצינור הגדול יותר על מכסה הביוריאקטור.
  4. השתמש עוד 20 ליטר carboy כדי לאסוף את השפכים מן bioreactor. חבר את קצה הצינור המחובר לפיית מוצא הביוריאקטור למכסה מיכל הפסולת. הכנס מסנן 0.2 מיקרומטר לתוך הצינור הזמין על מכסה מיכל זה.
  5. הפעל את המשאבה הפריסטלטית בקצב זרימה של 11.3 מ"ל/דקה, והשאר את המערכת פועלת למשך 24 שעות.
    הערה: קצב הזרימה (11.3 מ"ל/דקה) של מדיום התרבית או החלב ששימש במהלך היווצרות הביופילם בביוריאקטור נקבע על ידי חלוקת 340 מ"ל (המתאים לנפח הנוזל בתוך הכור) בזמן מגורים של 30 דקות.
4. לשחזר את הביופילם החיידקי.
  1. כבו את המשאבה הפריסטלטית והפסיקו לערבב ולחמם את הביוריאקטור.
  2. בזהירות להסיר כל מוט מן bioreactor, ולשטוף את הקופונים או שקופיות 3x ב 40 מ"ל של PBS כדי לחסל חיידקים פלנקטוניים. לאחר מכן, שחררו את הקופונים או המגלשות לתוך צינורות חרוטיים סטריליים של 50 מ"ל המכילים 40 מ"ל PBS באמצעות מברג מתאים. סובבו את הצינורות במשך 30 שניות, העבירו אותם למתלה הממוקם באמבט סוניקטור, והפעילו את הצינורות במהירות של 40 קילוהרץ למשך 30 שניות (מה שדורש הספק של 110 וואט). חזור על פעולה זו 3x.
  3. אסוף את מתלי הביופילם של 40 מ"ל בצינורות חרוטיים סטריליים של 50 מ"ל, ולאחר מכן שטוף את הקופונים או המגלשות עם 2 מ"ל של תמיסת PBS סטרילית. לשחזר את נוזל שטיפה זה ולהוסיף אותו השעיה biofilm כבר נאסף.
5. מנה את החיידקים הקיימים בביופילם: עם השעיית הביופילם המתקבלת, בצע דילולים סדרתיים פי 10, ולאחר מכן צלחת 100 μL של דילולים 10-5 ו -^10-6 על TSA במשולש. לדגור את הצלחות ב 30 ° C במשך 24 שעות. ספרו את מספר המושבות הקיימות על לוחות האגר, וחשבו את צפיפות החיידקים על הקופונים והמגלשות (חיידקים סיסליים בני קיימא) על פי ASTM E2562-17¹⁴ באמצעות הנוסחה הבאה:
  (3)
  כאשר X הוא מספר היחידות יוצרות המושבה (CFU), B הוא הנפח המצופה (0.1 מ"ל), V הוא הנפח שבו הביופילם מושהה (תמיסת המלאי), A הוא פני השטח של הקופון או השקף המכוסה על ידי הביופילם, ו-D הוא גורם הדילול.

3. הערכה כמותית של יעילות חומצות פרוקסי אורגניות למיגור ביופילמים

לוחות מיקרוטיטר ביופילם
1. הוסף 200 μL של מלוחים חוצצי פוספט (1x PBS) לשלוש בארות של מיקרו-צלחת בת 96 בארות.
2. העבירו את המכסה של מיקרו-צלחת הביופילם, עם ביופילמים שנוצרו על היתדות, למיקרו-צלחת בת 96 בארות המכילה PBS למשך 10 שניות על מנת לשטוף את הביופילמים ולחסל חיידקים פלנקטוניים.
3. הכינו את חומרי החיטוי בריכוזים הנדרשים (למשל, 25 חל"מ, 50 חל"מ, 500 חל"מ, 1,000 חל"מ, 5,000 חל"מ, 10,000 חל"מ ו-25,000 חל"מ חומר פעיל).
  הערה: כל הדילולים נעשים באופן אספטי באמצעות מים מזוקקים סטריליים.
4. הוסף 200 μL מכל ריכוז של חומר חיטוי לבארות של צלחת מיקרוטיטר חדשה בת 96 בארות במשולש. מעבירים את מכסה צלחת המיקרוטיטר של הביופילם על צלחת מיקרוטיטר זו בעלת 96 בארות המכילה את חומרי החיטוי, ודגרים על הצלחת בטמפרטורת החדר למשך זמן החשיפה הרצוי.
5. הוסף 200 μL של מרק מנטרל Dey-Engley לבארות של צלחת מיקרוטיטר חדשה של 96 בארות. מעבירים את המכסה של צלחת מיקרוטיטר הביופילם על צלחת מיקרוטיטר 96 בארות המכילה את המרק המנטרל. אטמו את צלחת המיקרוטיטר בפרפילם, והניחו אותה בסוניק האמבטיה במהירות של 40 קילוהרץ למשך 30 דקות.
6. לאחר 30 דקות, להסיר את צלחת microtiter מן sonicator ולהסיר את parafilm. מעבירים 100 μL מהעמודה הראשונה של צלחת 96 בארות המכילה את הביופילמים המנותקים בעקבות סוניקציה לשורה הראשונה של לוח מיקרוטיטר חדש בעל 96 בארות.
7. הוסף 180 μL של PBS סטרילי 1x לבארות של microplate 96 בארות החדש (מוכן בשלב 3.1.6), למעט השורה הראשונה. העברת 20 μL של תמיסת הביופילם מהשורה הראשונה לבארות בשורה השנייה המכילה 180 μL של 1x PBS (שורה 2, דילול: 10⁻¹). לאחר מכן, העבירו 20 μL של הנוזל הכלול בשורה השנייה לבארות בשורה הבאה המכילות 180 μL של 1x PBS (שורה 3, דילול: 10⁻²). חזור על אותו הליך כדי להשיג דילולים בין 10-5 ל-10-7.
8. לחסן 100 μL של דילולים על TSA, ולדגור את הצלחות על פי הפרמטרים הדרושים לצמיחה של כל חיידק.
9. לאחר הדגירה, ספרו את ה-cfus וחשבו את צפיפות log 10 עבור כל יתד ואת הפחתת log₁₀ בכל ריכוז חומר חיטוי בעזרת המשוואות הבאות:
  (4)
  כאשר X הוא היחידות יוצרות המושבה הנספרות במקום, B הוא הנפח המצופה (0.01 מ"ל), V הוא נפח הבאר (0.20 מ"ל), A הוא שטח הפנים של היתד (46.63 מ"מ²) ו-D הוא הדילול.
  ש"ק (5)
10. חזור על כל ניסוי 3 פעמים בימים בלתי תלויים.
  הערה: "הריכוז המינימלי של חומר חיטוי שמחסל את הביופילם", או MBEC, מתאים לריכוז החיטוי הנמוך ביותר שאינו מראה צמיחת חיידקים.
ביוריאקטור
הערה: ההליך של תקן ASTM E2871-19¹⁵ הוא ואחריו לבצע בדיקה זו עם P. azotoformans PFlA1.
1. התחל ביצירת הביופילמים על הקופונים בביוריאקטור, כמתואר בשלב 2.2. לאחר מכן, הסר את המוט המחזיק את הקופונים ושטוף אותו בתוך צינור חרוטי המכיל 30 מ"ל של PBS.
2. זרוק כל קופון לתוך צינור חרוטי סטרילי 50 מ"ל באמצעות מברג, ולאחר מכן הוסף 4 מ"ל של תמיסת peroxyacid אורגנית המתאימה או PBS עבור הבקרה. דוגרים במשך 5 דקות, ולאחר מכן מוסיפים 36 מ"ל של מרק מנטרל Dey-Engli. מערבולת במשך 30 שניות, ולאחר מכן סוניקציה ב 40 קילוהרץ במשך 30 שניות באמצעות אמבט סוניקטור. חזור על התהליך 3x כדי לקבל את השעיית הביופילם.
3. באופן דומה, שוטפים את כל המוטות האחרים ומשחזרים את הביופילמים מהקופונים. בצע דילול סדרתי של השעיית הביופילם והצלחת 0.1 מ"ל על מדיום TSA. לדגור את הצלחות ב 30 ° C במשך 24 שעות.
4. לאחר הדגירה, ספרו את ה-cfus, ולאחר מכן חשבו את צפיפות הביופילם עבור כל קופון (Eq. 6), צפיפות היומן הממוצעת (LD) עבור כל קבוצה של שלושה קופונים מאותו מוט, כולל טיפול ובקרה (Eq. 7), והפחתת היומן עבור חומר החיטוי (Eq. 8) באמצעות המשוואות הבאות:
  (6)
  כאשר X הוא הממוצע של יחידות יוצרות המושבה הנספרות/קופון, B הוא הנפח המצופה (0.1 מ"ל), V הוא נפח חומר החיטוי או PBS בתוספת מנטרל (40 מ"ל), ו-D הוא הדילול.
  (7)
  (8)

4. הערכה איכותית של יעילות חומצות פרוקסי אורגניות לחיסול ביופילמים

הערה: לאחר שטופלו בחומרי החיטוי (שלב 3.1.1 עד שלב 3.1.5), הוכנו ונותחו ונותחו ביופילמים של P. azotoformans שנוצרו על יתדות לוח מיקרוטיטר הביופילם בשיטה הסטטית על ידי תצפית על מיקרוסקופים אלקטרונים וקונפוקליים סורקים.

מיקרוסקופ אלקטרונים סורק (SEM)
1. הוסף 200 μL של 1x PBS לשלוש בארות של מיקרו-צלחת של 96 בארות. העבירו את המכסה מצלחת מיקרוטיטר הביופילם (שלב 3.1.5) למיקרו-צלחת בעלת 96 בארות המכילה PBS, והשאירו אותו בטמפרטורת החדר למשך 10 שניות כדי לחסל את המרק המנטרל Dey-Engli.
2. הסר את היתדות מצלחת מיקרוטיטר הביופילם באמצעות צבת אף מחט מעוקרת. הכניסו כל יתד לבקבוקון ריק מתחת למכסה מנוע, והוסיפו לכל בקבוקון קיבוע ראשוני (5% גלוטראלדהיד ב-0.1 M Na cacodylate buffer pH 7.5). מכסים כל בקבוקון ודוגרים עליו בטמפרטורה של 4°C למשך 24 שעות.
3. לאחר הדגירה, decant את fixative עם פיפטה, ולהשליך את כל הפסולת הנוזלית במיכל מתאים. הסירו את הפקקים של כל בקבוקון והניחו אותם במכסה מנוע לייבוש באוויר למשך 72 שעות.
4. הרכיבו את הדגימות על גבעולי אלומיניום (ראו טבלת חומרים) על ידי מריחת שרף אפוקסי (ראו טבלת חומרים) על המשטח העליון השטוח של כל גבב. לאחר מכן, הצמידו בזהירות את היתדות לגבעולים בעזרת מלקחיים.
5. מתכת את הדגימות עם מרזב זהב EMS950x + 350s (ראה טבלת חומרים) למשך 4 דקות בלחץ ארגון 2 x 10⁻¹ בר וזרם 20 mA. בצעו הארקה מתאימה על ידי צביעת צד היתד שאינו חשוף לזהב בצבע כסף (ראו טבלת חומרים).
6. קבל תמונות במיקרוסקופ אלקטרונים סורק באמצעות ממשק המשתמש של בקרת SEM גרסה 6.28 (ראה טבלת חומרים). מתח התאוצה ששימש במחקר זה היה 15 קילו וולט, וההגדלות היו פי 300 ופי 2,000.
מיקרוסקופ קונפוקלי
1. הוסף 200 μL של 1x PBS לשלוש בארות של צלחת מיקרוטיטר 96 בארות. העבירו את המכסה מהמיקרו-צלחת של הביופילם לצלחת בעלת 96 בארות המכילה את PBS, והשאירו אותו למשך 10 שניות כדי לחסל את המרק המנטרל של דיי-אנגלי.
2. הכינו תמיסות של כתמים פלואורסצנטיים על ידי הוספת 3 מיקרוליטר של כתם פלואורסצנטי ירוק ו-3 מיקרוליטר של כתם פלואורסצנטי אדום (ראו טבלת חומרים) ל-1 מ"ל מים סטריליים.
3. הוסף 200 μL של תמיסת צביעה לבאר אחת של צלחת microtiter 96 באר. מעבירים את המכסה מצלחת המיקרוטיטר של הביופילם לצלחת בעלת 96 בארות המכילה את תמיסת הצביעה. מכסים את צלחת מיקרוטיטר הביופילם ברדיד אלומיניום, ודגרים על הדגימה במשך 20-30 דקות בטמפרטורת החדר.
4. הוסף 200 μL של מים מעוקרים לתוך בארות של microplate 96 בארות. לאחר מכן, העבירו את המכסה מהמיקרו-צלחת של הביופילם למיקרו-צלחת של 96 בארות המכילה את המים, והשאירו אותה עד לתצפית.
5. דמיינו את הביופילמים שנוצרו על היתדות באמצעות מיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי (ראו טבלת חומרים) עם יעד DIC שמן 63x/1.40. רכוש את התמונות באמצעות התוכנה המשויכת (ראה טבלת חומרים). אורכי הגל של עירור הפלואורסצנטי ששימשו לכתמים הפלואורסצנטיים הירוקים והאדומים היו 482 ננומטר ו-490 ננומטר, בהתאמה.
  הערה: לקבלת התוצאות הטובות ביותר, חותכים ומניחים את היתד בכלי פטרי בקוטר 60 מ"מ וממלאים את הכלי במים סטריליים.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

ניתוח SEM מראה נוכחות של ביופילמים המיוצרים על-ידי P. azotoformans PFl1A על יתדות המיקרו-לוחות של הביופילם (איור 2A). ניתן להבחין במבנה ביופילם תלת מימדי. P. azotoformans PFl1A זוהה בעבר כיצרן ביופילם חזק (A₅₇₀ > 1.5) באמצעות לוחות מיקרוטיטר^{96 בארות 12}.

נוסף על כך, הביופילם P. azotoformans PFl1A שנוצר על שקופית מפלדת אל-חלד באמצעות הביוריאקטור נראה צפוף מאוד והציג את המאפיינים המורפולוגיים של ביופילם בוגר עם מבנה תלת-ממדי (איור 2B). יתר על כן, התוצאות של ספירת החיידקים של הביופילמים שפותחו על-ידי בידוד זה במערכת הדינמית הראו צפיפות תאים משמעותית המתאימה ל-8.74 לוג CFU/cm 2 ו-7.86 לוג CFU/cm² בתרבית TSB בחלב רזה בינוני וסטרילי, בהתאמה (איור 2C).

יתר על כן, התוצאות המוצגות באיור 3 שהתקבלו עם B. vesicularis isolate הראו שלגורמים מסוימים יכולה להיות השפעה חשובה על היווצרות ביופילם בביוריאקטור. על ידי שינוי חלק מהפרמטרים, כגון מהירות הערבוב בתוך הביוריאקטור, קצב הזרימה הבינוני, ריכוז החומרים המזינים הבינוניים ומשך שלב המצב הרציף, ניתן לשפר את חיבור התא, וניתן לצפות בביופילמים צפופים יותר. לדוגמה, העלאת ריכוז החומרים המזינים מ-100 מ"ג/ליטר ל-900 מ"ג/ליטר (מצב A בהשוואה למצב F) הביאה לעלייה בספירת החיידקים של הביופילמים מ-6.11 לוג CFU/ס"מ 2 ל-8.71 לוג CFU/ס"מ². יתר על כן, צמיחה משמעותית של ביופילמים נצפתה כאשר קצב הזרימה הופחת ל -6.0 מ"ל לדקה (במצב C), וכתוצאה מכך זמן שהייה ארוך יותר עקבי עם קצב הגידול של בידוד זה.

התצפיות המיקרוסקופיות של הביופילמים שנוצרו על לוחות המיקרוטיטר של הביופילם או על הטיפול בביוריאקטור לפני ואחרי החיטוי היו משלימות לספירת התאים בת קיימא. איור 4 מראה שאף אחד מהביופילמים לא הכיל תאים ברי קיימא הניתנים לזיהוי בזמן המגע (5 דקות) ובריכוזים (500 ppm עם חומצות פרוקסי אורגניות ו-100,000 ppm עם מי חמצן) של חומרי חיטוי המיושמים בדרך כלל במפעלי חלב. התוצאות האלה אושרו במיקרוסקופ (איור 5). איור 5A מראה את המבנה התלת-ממדי של ביופילם MBEC לא מטופל (בקרה), בעוד שביופילמים של MBEC שטופלו (עם מי חמצן, חומצה פראצטית, חומצה פרלקטית, חומצה פרפרופיונית ותכשירי חיטוי מסחריים) מאבדים את הקונפורמציה התלת-ממדית שלהם, כפי שנקבע על-ידי SEM. עם זאת, למרות שהביופילמים טופלו בחומר חיטוי, נותר מבנה ביופילם לכאורה, במיוחד במי חמצן. אף על פי כן, השימוש בטכניקה חיה/מתה, במקרה זה, מיקרוסקופ קונפוקלי (CM) עם צביעת כדאיות פלואורסצנטית, אישר כי מבנה הביופילם שנותר היה בעיקר חסר חיים לאחר טיפול בחומר חיטוי (איור 5B).

איור 1: תרשים זרימה המייצג גישה סטטית ודינמית משולבת להערכת היעילות של חומצות פרוקסי אורגניות להשמדת ביופילמים. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: ניתוח היווצרות ביופילם על-ידי Pseudomonas azotoformans PFl1A. (A) סריקת מיקרוגרפים אלקטרונים (300x ו-2,000x) של ביופילם P. azotoformans PFl1A שנוצר על יתדות של לוח מיקרוטיטר הביופילם. נתון זה שונה מ- Goetz et ^al.12 באישור (Copyright 2022 American Society for Microbiology. כל הזכויות שמורות.). מוטות קנה מידה = 50 מיקרומטר (300x), 100 מיקרומטר (2,000x). (B) סריקת מיקרוגרפים אלקטרונים (2,000x) של (1) שקופית מפלדת אל-חלד המכילה ביופילם P. azotoformans PFl1A שגדל בביוריאקטור ו-(2) שקופית נטולת ביופילם (בקרה שלילית). סרגל קנה מידה = 10 מיקרומטר. נתון זה שונה מ- Niboucha et ^al.16 באישור. (ג) צפיפות חיידקים של ביופילמים מסוג P. azotoformans PFl1A שנוצרו בביוריאקטור בתרבית TSB בחלב רזה בינוני וסטרילי ונקבעה לאחר הסרתם על ידי אולטרסוניקציה ממגלשות הנירוסטה. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD (n = 3). הבדל משמעותי (p < 0.05) מבוסס על מבחן t של התלמיד. נתון זה שונה מ- Niboucha et ^al.16 באישור. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: צפיפות חיידקים של ביופילמים Brevundimonas vesicularis שהתפתחו באמצעות הביוריאקטור בתנאים משתנים של ערבוב, קצב זרימה, זמן במצב רציף ומדיה תרבותית (TSB). תנאי א': מהירות ערבוב של 130 סל"ד, קצב זרימה של 11.8 מ"ל/דקה, מצב רציף של 24 שעות בתווך TSB של 100 מ"ג/ליטר (בהתאם לפרוטוקול הבינלאומי של ASTM E2562-17¹⁴ להיווצרות ביופילמים על ידי Pseudomonas aeruginosa); מצב ב': מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 11.8 מ"ל/דקה, מצב רציף של 24 שעות ב-100 מ"ג/ליטר TSB בינוני; תנאי C: מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 6.0 מ"ל/דקה, מצב רציף של 24 שעות ב-100 מ"ג/ליטר TSB בינוני; מצב D: מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 6.0 מ"ל/דקה, מצב רציף של 48 שעות ב-100 מ"ג/ליטר TSB בינוני; תנאי E: מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 6.0 מ"ל/דקה, מצב רציף של 48 שעות ב-300 מ"ג/ליטר TSB בינוני; מצב F: מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 6.0 מ"ל/דקה, מצב רציף של 48 שעות ב-900 מ"ג/ליטר TSB בינוני; מצב G: מהירות ערבוב של 60 סל"ד, קצב זרימה של 6.0 מ"ל/דקה, מצב אצווה של 24 שעות ב-TSB של 2.7 גרם/ליטר ומצב רציף של 48 שעות במצב בינוני של 900 מ"ג/ליטר TSB. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD (n = 3). הבדלים משמעותיים (אותיות שונות, עמ' < 0.05) מבוססים על מבחן ההשוואה החד-כיווני של ANOVA ו-Tukey. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: ספירת תאים בת-קיימא בביופילמים Pseudomonas azotoformans PFl1A לפני ואחרי טיפול במי חמצן, חומצה פרלקטית, חומצה פרפרופיונית, חומצה פראצטית או חומר חיטוי מסחרי. כל נקודה מייצגת את ממוצע הספירה המשולשת המתקבלת בשלושה ימים עצמאיים עבור כל בידוד. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD (n = 3). נתון זה שונה מ- Goetz et ^al.12 באישור (Copyright 2022 American Society for Microbiology. כל הזכויות שמורות.). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: תצפית מיקרוסקופית על מבנה הביופילם ועל הכדאיות שלו. (A) סריקת מיקרוגרפים אלקטרונים (300x ו-2,000x) של ביופילם Pseudomonas azotoformans PFl1A שנוצר על יתדות לוח המיקרוטיטר של הביופילם לפני (בקרה) ואחרי הטיפול במי חמצן, חומצה פראצטית, חומצה פרלקטית, חומצה פרפרופיונית וחומר חיטוי מסחרי בריכוזי מיגור הביופילם המינימליים שלהם (MBEC). סרגל קנה מידה = 10 מיקרומטר. נתון זה שונה מ- Goetz et ^al.12 באישור (Copyright 2022 American Society for Microbiology. כל הזכויות שמורות.). (B) כדאיות של ביופילם שנוצר על ידי P. azotoformans PFl1A באמצעות צביעת כדאיות תאים פלואורסצנטיים על יתד מיקרו-צלחת הביופילם לפני (משמאל) ואחרי (מימין) טיפול בחומצה פראצטית (500 ppm), המודגם על ידי מיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי (63x/1.40 שמן דיפרנציאלי interference מטרת ניגודיות). התאים החיים מוכתמים בירוק, והתאים המתים מוכתמים באדום. סרגל קנה מידה = 20 מיקרומטר. נתון זה שונה Goetz et ^al.12 באישור (Copyright 2022 American Society for Microbiology. כל הזכויות שמורות.). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

בדיקת MBEC (בדיקת מיקרו-צלחות ביופילם) הייתה השיטה הראשונה שהוכרה כבדיקת ביעור ביופילם סטנדרטית על ידי ASTM¹⁷. המחקר שלנו ואחרים הראו כי ישנם שני שלבים קריטיים בעת שימוש בבדיקה זו: שלב הסוניקציה (זמן ועוצמה) וזמן הטיפול בחומר חיטוי¹⁸. סטיוארט ופרקר הציעו גם פרמטרים אחרים שיכולים להשפיע על תוצאות הבדיקה, כגון מיני מיקרוביאליים, גיל הביופילם, יחס שטח פנים / נפח וכו '. ¹⁹. לבסוף, חשוב לציין כי היווצרות ביופילמים סביב היתדות על מכסי המיקרו-צלחות עשויה להיות הטרוגנית ותשתנה בהתאם לחיידקים בהם נעשה שימוש.

ניתן להשתמש בשיטת MBEC עם סוגים שונים של חומרי חיטוי. השימוש בטכניקות מיקרוסקופיות, כגון SEM ומיקרוסקופ קונפוקלי, משלימים ושימושיים ביותר לחקר המבנים התלת-ממדיים ומצב הכדאיות (ערכות צביעת כדאיות תאים פלואורסצנטיים, ראו טבלת חומרים) של ביופילמים לפני ואחרי טיפול בחומרי חיטוי, בהתאמה¹². היכולת של חיידקים ליצור ביופילמים נחקרה בעיקר עם לוחות microtiter בשל הקלות והמהירות של ביצוע. עם זאת, לשימוש במערכת סגורה זו ללא כוחות גזירה, כפי שנצפה ברוב המצבים, יש מגבלות. לכן, מומלץ מאוד להשתמש בשיטת היווצרות ביופילם דינמית, כגון הביוריאקטור של CDC, כדי לאשר את התצפיות שנעשו באמצעות בדיקת מיקרופלייט ביופילם.

על פי השיטה המתוקננת של ASTM^14,15 ומחקרים שפורסמו^20,21^, הביוריאקטור נמצא בשימוש נרחב לגידול ביופילמים ולהערכת יעילותם של חומרי חיטוי. התקן זה מחקה תנאים סביבתיים מסוימים של היווצרות ביופילם, כגון במונחים של כוח גזירה גבוה, חומרי מזון ספציפיים ומתחדשים, וחומרים על פני השטח. במחקר זה, ביופילמים בוגרים של זן P. azotoformans PFlA1 התקבלו על שקופיות נירוסטה באמצעות מערכת דינמית זו. הפרוטוקול המוצג כאן התבסס על פרוטוקול תקן ASTM באמצעות Pseudomonas aeruginosa. עם זאת, שיטת ביופילם סטנדרטית זו אינה יכולה להיות מיושמת על כל המיקרואורגניזמים, גם אם הוכח שהם יצרני ביופילם חזקים המשתמשים בטכניקות אחרות. זה היה המקרה של B. vesicularis, שעבורו היה צורך לייעל את הפרוטוקול כדי להגיע לצפיפות ביופילם גבוהה יותר.

מחקרים קודמים הראו כי חלק מהתנאים התפעוליים (או הפרמטרים) הם קריטיים בתהליך התפתחות הביופילם ויש להתאים אותם לכל אחד מהחיידקים שנבדקו^22,23,24. לדוגמה, יש להתאים את הדרישות התזונתיות לכל חיידק מבחינת העדפה וריכוז²⁵. יתר על כן, הוכח כי הביופילמים עבים יותר ויש להם ביומסה משמעותית יותר בתנאי אספקת חומרים מזינים רציפים בביוריאקטור מאשר כאשר הם גדלים במצב אצווה, הנחשב לסביבה מוגבלת בחומרים מזינים²⁶. היבט חשוב נוסף הוא זמן השהייה, אשר נשלט על ידי קצב הזרימה ויש לכוונן אותו על מנת שיהיה קצר יותר מזמן ההכפלה של החיידקים. בנוסף, יש להתאים את הטמפרטורה וערבוב הגזירה של הנוזל לכל חיידק על מנת לספק תנאי גידול אופטימליים²⁷. לחץ הגזירה הגבוה שנוצר על ידי תנועת הבלבל מקדם את התפתחות הביופילם וממלא תפקיד בשליטה על מבנהו ועובי²⁸. עם זאת, אם מהירות הערבוב מוגברת יותר מדי, זה יכול לגרום לשחיקה או החלקה של פני השטח של הביופילם, מה שמוביל לירידה בצפיפות החיידקים^29,30.

לשימוש בביוריאקטור יש כמה מגבלות, כגון היותו יקר וגוזל זמן בנוסף לשימוש בכמות גדולה של נוזלים כמדיום התזונתי. אף על פי כן, היא נותרה שיטה מאוד חוזרת וניתנת לשחזור ליצירת ביופילמים ולמחקרם. השימוש בביוריאקטור מאפשר גם שימוש בו זמנית במספר קופונים העשויים מחומרים שונים. הביוריאקטור נועד לנטר את תנאי הניסוי במהלך גידול הביופילם, כגון הטמפרטורה, מהירות הערבוב וקצב הזרימה, והוא מאפשר התאוששות של ביופילמים הומוגניים ומייצגים לניתוח עוקב. באופן כללי, שיטות סטטיות ודינמיות משלימות זו את זו לבחינת יעילותם של חומרי חיטוי נגד ביופילמים שבודדו ממגזרי המזון והסביבה.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי עניינים.

Acknowledgments

מחקר זה נתמך על ידי Consortium de Recherche et Innovations en Bioprocédés Industriels au Québec (CRIBIQ) (2016-049-C22), Agropur, Groupe Sani Marc ומועצת המחקר למדעי הטבע וההנדסה של קנדה (NSERC) (RDCPJ516460-17). אנו מודים לתרזה פניקוני על הביקורת על כתב היד.

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
0.2 µm filters	Corning	09-754-28	diameter: 50 mm, PTFE- Membrane
316 stainless-steel disc coupon	Biosurface Technologies Corporation	RD128-316
316 stainless-steel slide coupon	Biosurface Technologies Corporation	CBR 2128-316
96-microtiter plate	Corning	07-200-89	cell Culture-Treated, flat-Bottom Microplate
Acetic acid	Sigma Aldrich	27225	store at RT
Aluminium stubs	Electron Microscopy Science	75830-10	32x5mm
Aqueous glutaraldehyde EM Grade 25%	Electron Microscopy Sciences	16220	store at -20 °C
AB204-S/FACT Analytical balance	Mettler Toledo	AB204-S
Bacterial Vent Filter (0.45 µm)	Biosurface Technologies Corporation	BST 02915
BioDestroy	Groupe Sani Marc	09-10215	commercial peracetic acid-based disinfectant, store at RT
Carboy LDPE 20 L	Cole Parmer	06031-52
CDC biofilm reactor	Biosurface Technologies Corporation	CRB 90	bioreactor
Cerium (IV) sulphate	Thermo Scientific	35650-K2	store at RT
Confocal laser scanning microscope LSM 700	Zeiss	LSM 700
Dey-Engley neutralizing broth	Millipore	D3435-500G	store at 4 °C
EMS950x + 350s gold sputter	Electron Microscopy Sciences
Epoxy resin	Electron Microscopy Sciences	14121	with BDMA
Ethyl alcohol 95%, USP	Greenfield global	P016EA95	store at RT
Ferroin indicator solution	Sigma Aldrich	318922-100ML	store at RT
Filling/venting cap	Cole Parmer	RK-06258-00
FilmTracer LIVE/DEAD Biofilm Viability Kit	Invitrogen	L10316	fluorescent cell viability kit (SYTO 9: green fluorescent stain, Propidium iodide: red fluorescent stain), store at - 20 °C
Glass flow break	Biosurface Technologies Corporation	FB 50
Gold with silver paint	Electron Microscopy Sciences	12684-15
Heating plate set	Biosurface Technologies Corporation	110V Stir Plate
Hex screwdriver	Biosurface Technologies Corporation	CBR 5497
Hydrogen peroxide	Sigma	216763	store at 4 °C
Inoculating loops	VWR	12000-812	sterile, 10 µl
Lactic acid	Laboratoire MAT	LU-0200	store at RT
MASTERFLEX L/S 7557-04 W/ 7557-02 with EASY-LOAD II peristaltic pump and 77200-50 Head	Cole Parmer	77200-60
MBEC (Minimum Biofilm Eradication Concentration) assay biofilm inoculator with a 96-well base	Innovotech	19111	Biofilm microtiter plate
Oxford agar base	Thermo Scientific	OXCM0856B	store at 4 °C
Plastic coupon holder	Biosurface Technologies Corporation	CBR 2203
Plastic slide holder rod	Biosurface Technologies Corporation	CBR 2203-GL
Potassium iodide	Fisher Chemical	P410-500	store at RT
Precision slotted screwdriver (1.5 mm x 40 mm)	Wiha	26015
Propionic acid	Laboratoire MAT	PF-0221	store at RT
Sartorius BCE822-1S Entris® II Basic Essential Toploading Balance	Cole Parmer	UZ-11976-3
Scanning electron microscope JSM-6360LV model	JEOL	JSM-6360LV	SEM and user control interface
Screw cap tube, 15 mL	Sarstedt	62.554.205	(LxØ): 120 x 17 mm, material: PP, conical base, transparent, HD-PE
Screw cap tube, 50 mL	Sarstedt	62.547.205	(LxØ): 114 x 28 mm, material: PP, conical base, transparent, HD-PE
Sodium Cacodylate Trihydrate	Electron Microscopy Sciences	12300	store at -20 °C
Sodium thiosulfate	Thermo Scientific	AC124270010	store at RT
Sonication bath	Fisher	15-336-122	5,7 L
Starch solution	Anachemia	AC8615	store at RT
Sulfuric acid	Sigma Aldrich	258105-500ML	store at RT
Tryptic soy agar	BD Bacto	DF0369-17-6	store at RT
Tryptic soy broth	BD Bacto	DF0370-17-3	store at RT
Tubing Masterflex L/S 16 25'	Cole Parmer	MFX0642416
Tubing Masterflex L/S 18 25'	Cole Parmer	MFX0642418
Tygon SPT-3350 silicon tubing	Saint-Gobain	ABW18NSF	IDx OD: 1/4 in.x 7/16 in.
Vortex	Cole Parmer	UZ-04724-00
Water bath	VWR	89202-970
Zen software	Zeiss

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

Canada's dairy industry at a glance. Canadian Dairy Information Centre. , Available from: https://agriculture.canada.ca/en/canadas-agriculture-sectors/animal-industry/canadian-dairy-information-centre/canadas-dairy-industry-glance (2017).
Oliver, S. P., Jayarao, B. M., Almeida, R. A. Foodborne pathogens in milk and the dairy farm environment: food safety and public health implications. Foodborne Pathogens and Disease. 2 (2), 115-129 (2005).
Fondation de technologie laitière du Québec. Science et technologie du lait. 3rd edn. , Les Presses de l'Université Laval. Quebec. (2018).
Evanowski, R., et al. Short communication: Pseudomonas azotoformans causes gray discoloration in HTST fluid milk. Journal of dairy science. 100, 7906-7909 (2017).
Bower, C. K., McGuire, J., Daeschel, M. A. The adhesion and detachment of bacteria and spores on food-contact surfaces. Trends in Food Science & Technology. 7 (5), 152-157 (1996).
Gupta, S., Anand, S. Induction of pitting corrosion on stainless steel (grades 304 and 316) used in dairy industry by biofilms of common sporeformers. International Journal of Dairy Technology. 71 (2), 519-531 (2018).
Marchand, S., et al. Biofilm formation in milk production and processing environments; Influence on milk quality and safety. Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety. 11 (2), 133-147 (2012).
Silva, H. O., et al. Efficiency of different disinfectants on Bacillus cereus sensu stricto biofilms on stainless-steel surfaces in contact with milk. Frontiers in Microbiology. 9, 2934 (2018).
Sedlak, D. L., von Gunten, U. Chemistry. The chlorine dilemma. Science. 331 (6013), 42-43 (2011).
vander Veen, S., Abee, T. Mixed species biofilms of Listeria monocytogenes and Lactobacillus plantarum show enhanced resistance to benzalkonium chloride and peracetic acid. International Journal of Food Microbiology. 144 (3), 421-431 (2011).
Saa Ibusquiza, P., Herrera, J. J., Cabo, M. L. Resistance to benzalkonium chloride, peracetic acid and nisin during formation of mature biofilms by Listeria monocytogenes. Food Microbiology. 28 (3), 418-425 (2011).
Goetz, C., Larouche, J., Velez Aristizabal, M., Niboucha, N., Jean, J. Efficacy of organic peroxyacids for eliminating biofilm preformed by microorganisms isolated from dairy processing plants. Applied and Environmental Microbiology. 88 (4), 0188921 (2022).
Vimont, A., Fliss, I., Jean, J. Study of the virucidal potential of organic peroxyacids against norovirus on food-contact surfaces. Food and Environmental Virology. 7 (1), 49-57 (2015).
ASTM International. ASTM E2562-17. Standard Test Method for Quantification of Pseudomonas aeruginosa Biofilm Grown with High Shear and Continuous Flow using CDC Biofilm Reactor. ASTM International. , West Conshohocken, PA. Available from: https://www.astm.org/e2562-17.html (2017).
ASTM International. ASTM E2871-19. Standard Test Method for Evaluating Disinfectant Efficacy Against Pseudomonas aeruginosa Biofilm Grown in CDC Biofilm Reactor Using Single Tube Method. ASTM International. , West Conshohocken, PA. Available from: https://www.astm.org/e2871-19.html (2019).
Niboucha, N., et al. Comparative study of different sampling methods of biofilm formed on stainless-steel surfaces in a CDC biofilm reactor. Frontiers in Microbiology. 13, 892181 (2022).
ASTM International. ASTM E2799-17. Standard Test Method for Testing Disinfectant Efficacy against Pseudomonas aeruginosa Biofilm using the MBEC Assay. ASTM International. , West Conshohocken, PA. Available from: https://www.astm.org/e2799-17.html (2022).
Parker, A. E., et al. Ruggedness and reproducibility of the MBEC biofilm disinfectant efficacy test. Journal of Microbiological Methods. 102, 55-64 (2014).
Stewart, P. S., Parker, A. E. Measuring antimicrobial efficacy against biofilms: A meta-analysis. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63 (5), 00020 (2019).
Lindsay, D. K., Fouhy, K., Loh, M., Malakar, P. The CDC biofilm bioreactor is a suitable method to grow biofilms, and test their sanitiser susceptibilities, in the dairy context. International Dairy Journal. 126, 105264 (2022).
Buckingham-Meyer, K., Goeres, D. M., Hamilton, M. A. Comparative evaluation of biofilm disinfectant efficacy tests. Journal of Microbiological Methods. 70 (2), 236-244 (2007).
Goeres, D. M., et al. Statistical assessment of a laboratory method for growing biofilms. Microbiology (Reading). 151, 757-762 (2005).
Williams, D. L., Woodbury, K. L., Haymond, B. S., Parker, A. E., Bloebaum, R. D. A modified CDC biofilm reactor to produce mature biofilms on the surface of peek membranes for an in vivo animal model application. Current Microbiology. 62 (6), 1657-1663 (2011).
Pieranski, M. K., Rychlowski, M., Grinholc, M. Optimization of Streptococcus agalactiae biofilm culture in a continuous flow system for photoinactivation studies. Pathogens. 10 (9), 1212 (2021).
Mendez, E., Walker, D. K., Vipham, J., Trinetta, V. The use of a CDC biofilm reactor to grow multi-strain Listeria monocytogenes biofilm. Food Microbiology. 92, 103592 (2020).
Salgar-Chaparro, S. J., Lepkova, K., Pojtanabuntoeng, T., Darwin, A., Machuca, L. L. Nutrient level determines biofilm characteristics and subsequent impact on microbial corrosion and biocide effectiveness. Applied and Environmental Microbiology. 86 (7), 02885 (2020).
Goeres, D. M., et al. Design and Fabrication of Biofilm Reactors. Recent Trends in Biofilm Science and Technology. Simoes, M., Borges, A., Chaves Simoes, L. , Academic Press. Cambridge, MA. 71-88 (2020).
Fjeld, C. S., Schüller, R. B. Biofilm formation during hexadecane degradation and the effects of flow field and shear stresses. Annual Transactions - The Nordic Rheology Society. 21, 341-346 (2013).
Gilmore, B. F., Hamill, T. M., Jones, D. S., Gorman, S. P. Validation of the CDC biofilm reactor as a dynamic model for assessment of encrustation formation on urological device materials. Journal of Biomedical Materials Research Part B: Applied Biomaterials. 93 (1), 128-140 (2010).
Picioreanu, C., van Loosdrecht, M. C., Heijnen, J. J. Two-dimensional model of biofilm detachment caused by internal stress from liquid flow. Biotechnology and Bioengineering. 72 (2), 205-218 (2001).

Biology

הערכת יעילותן של חומצות פרוקסי אורגניות למיגור ביופילמים חלביים בגישה המשלבת שיטות סטטיות ודינמיות

Summary

Abstract

Introduction

Protocol

Representative Results

Discussion

Disclosures

Acknowledgments

Materials

References

Tags

Cite this Article

Summary

Abstract

Introduction

Protocol

Representative Results

Discussion

Disclosures

Acknowledgments

Materials

References

Tags

Cite this Article

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.