本文介绍了一种在同一序列中合成具有混合阳离子功能的肽模拟物(赖氨酸型和精氨酸型单体)的方案,并描述了这些化合物对引起皮肤利什曼病的原虫寄生虫Leishmania mexicana的后续测试方法。
本文介绍了一种在同一序列中合成具有混合阳离子功能的肽模拟物(赖氨酸型和精氨酸型单体)的方案,并描述了这些化合物对引起皮肤利什曼病的原虫寄生虫Leishmania mexicana的后续测试方法。
本方案描述了含有两种不同功能化阳离子单体的线性肽拟物的手动固相合成方法。在此过程中,可在同一肽拟物序列中引入氨基功能化的“赖氨酸”和胍基功能化的“精氨酸”肽拟物单体。该方法采用树脂上保护策略,使用N-(1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己基亚乙基))乙基(Dde)保护基,其保护条件与赖氨酸单体的Boc保护正交。随后进行的脱保护步骤可高效地在树脂上进行胍基化反应,从而形成精氨酸残基。该方案与常用的肽拟物亚单体合成法兼容,可使用常规实验室设备和市售试剂制备简单的肽拟物。文中还描述了两种混合肽拟物的代表性合成、纯化与表征过程。此外,介绍了这些化合物在针对Leishmania mexicana的筛选实验中作为潜在抗感染剂的评价方法。L. mexicana是一种原虫寄生虫,是皮肤利什曼病的致病因子,该病为一种被忽视的热带病,全球感染人数高达1200万。
肽拟物(或聚-N取代的甘氨酸)是一类肽模拟物,具有与肽相似的性质,因此在药物和材料应用方面正受到越来越多的关注。在肽中,每个氨基酸的侧链连接在酰胺骨架的α-碳原子上;而在肽拟素(peptoids)中,侧链则连接在骨架氮原子上。这一关键结构差异使肽拟素具有更强的抗蛋白水解能力。
肽模拟物通常采用由Zuckermann首创的亚单体方法进行合成 等人, 其中,肽模拟物单体可通过将连接于固相载体上的氨基进行连续的卤代乙酰化,再用伯胺取代卤素原子而逐步构建。1 我们课题组近期对该亚单体方法进行了改进,首次实现了在同一肽模拟物序列中引入赖氨酸型和精氨酸型肽模拟物残基。2 这种手动固相肽拟物合成方法使用市售试剂和常见的实验室设备,使大多数实验室均可开展。研究表明,肽拟物对多种革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及真菌具有显著的抑制活性,其效果可与多种已知的抗菌肽相媲美。3-9
在我们的研究中,肽模拟物(peptoids)已被用作治疗被忽视的热带病——利什曼病的新型抗感染化合物。5,10 利什曼病在全球80多个国家呈地方性流行,估计全球有超过1200万人受到感染。11 该疾病由原生动物寄生虫引起,通过白蛉叮咬传播。Leishmania 属的寄生虫可导致皮肤利什曼病,这种病症会引起瘢痕形成以及黏膜组织损伤,也可导致危及生命的内脏利什曼病,后者会造成致命的器官损害。目前尚无针对该病的疫苗,现有治疗手段依赖少数几种具有严重副作用的药物。此外,对现有药物的耐药性正成为一个日益严重的问题,因此迫切需要开发新的治疗方法,以有效应对未来的利什曼病治疗需求。12-16
在这些抗菌应用中,通常将肽模拟物设计为具有两亲性,包含阳离子型和疏水性单体的混合物。3,4 这可使肽模拟物对细菌细胞具有一定的选择性,降低对哺乳动物细胞的毒性,并提高其作为分子转运体的活性。17-20 文献中大多数抗感染肽模拟物含有阳离子侧链,这些侧链完全由氨基官能化的赖氨酸型单体或精氨酸型残基组成。此外,还合成了肽-肽模拟物嵌合体,其中阳离子链由氨基酸赖氨酸或精氨酸构成,以研究阳离子基团对活性和毒性的影响。21-25
多聚赖氨酸类肽可利用市售的Boc保护胺通过简便的方法合成。已有报道的多聚精氨酸类肽可通过使用吡唑-1-羧基脒作为胍基化试剂的方法制备18。然而,该方法必须在类肽从树脂上裂解下来且侧链的Boc保护基团被去除后才能进行,因此序列中每一个赖氨酸型残基都会转化为精氨酸残基。为了更精确地调控化合物的化学与生物学性质,我们开发了一种新方法,首次实现了在同一类肽序列中引入双重阳离子功能(例如,NLys 和 NArg)2。
本文描述了两种新型肽模拟物的合成、纯化及表征,这些肽模拟物在同一序列中同时含有赖氨酸型和精氨酸型残基。该方法采用正交的N-Boc和N-Dde树脂保护策略,并以吡唑-1-甲脒作为胍基化试剂。本文还描述了这些肽模拟物在针对引起皮肤利什曼病的病原体——墨西哥利什曼原虫(Leishmania mexicana)的细胞毒性实验中的生物学评价。该方法为获得具有双重阳离子功能的肽模拟物及其生物活性评估提供了实用途径。预计该方法将有助于未来肽模拟物研究领域合成两亲性肽模拟物。
1. 多肽类似物的固相合成
注意:肽拟物通过固相肽拟物合成的亚单体方法手动合成。该方法具有高效的偶联效率和良好的最终产物收率。固相合成还可在每步反应结束后轻松去除过量反应物,本文对该方法进行了改进,以允许使用不同的功能化阳离子单体即, 精氨酸型和赖氨酸型残基)包含在同一序列中。1,2
2. 表征与纯化
注意:可通过使用C18柱的反相高效液相色谱(HPLC)结合电喷雾液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)对肽拟物的合成过程进行监测,并对最终产物进行分析评估。所有用于HPLC及LC-MS的溶剂均应新鲜配制。
3. 针对生物学测试 Leishmania mexicana 寄生虫
注意:合成开始前必须进行安全评估。 Leishmania mexicana 被列为英国的2类危害病原体,在开始检测前必须落实适当的控制措施。所有操作必须在2级微生物安全柜中进行,并根据需要佩戴适当的个人防护装备。即, 腈类手套、护目镜和实验服。
作为代表性结果,将描述两种含有两个赖氨酸型单体和两个精氨酸型单体、各由12个残基组成的肽拟物的合成与表征。同时也展示了细胞毒性实验的后续结果。
两种肽拟物[(NnArgNspeNspe)(NaeNspeNspe)]2 (a) 和 [(NhArgNspeNspe)(NLysNspeNspe)]2 (b) 采用各120 mg Rink Amide树脂(载量 = 0.79 mmol/g)合成。所有乙酰化和取代步骤均按上文所述进行,所用试剂均为商业购买。对于这些残基,取代步骤中使用的胺分别为:Nspe (S)-(-)-α-甲基苄胺,Nae N-(tert-丁氧羰基)-1,2-二氨基乙烷,NLys N-(tert-丁氧羰基)-1,4-二氨基丁烷。对于精氨酸衍生物残基,采用以下未保护的二胺进行偶联:NhArg 1,4-二氨基丁烷或 NnArg 1,2-二氨基乙烷,随后在树脂上用2-乙酰基二甲基酮(Dde-OH)进行保护。整个序列合成完成后,通过肼解脱除Dde保护基,得到游离胺用于胍基化。

图 1. Peptoid 结构 (a) [(NnArgNspeNspe)(NaeNspeNspe)]2 和 (b) [(NhArgNspeNspe)(NLysNspeNspe)]2。 请点击此处查看此图的放大版本。

图 2. 合成混合型精氨酸/赖氨酸肽模拟物的方法。 i. 采用二胺在亚单体法中的标准取代步骤;ii. 加入 Dde-OH,反应 90 分钟以保护游离胺基;iii. 继续采用亚单体法添加单元以延长肽模拟物链;iv. 使用含 2% 肼的 DMF 溶液脱除 Dde 保护基;v. 在树脂上利用吡唑-1-甲脒和 DIPEA 在 DMF 中对游离胺基进行胍基化;vi. 通过酸解从树脂上裂解产物并脱除 Boc 保护基。 请点击此处查看该图的放大版本。
从树脂上裂解并冻干后,粗产物为白色粉末:(a) 154 mg,(b) 163 mg。采用反相高效液相色谱(RP-HPLC)纯化产物,使用配备紫外-可见检测器(λ = 250 nm)的液相色谱泵,在分析柱(250 mm × 10 mm,5 µm)上进行,进样量不超过 50 mg,流速为 2 ml/min。收集对应目标分子量的组分,合并后得到白色粉末:(a) 54 mg,(b) 65 mg,最终收率约为 30%,产物纯度 >90%。
纯化后最终化合物的身份通过配备超高效液相色谱(UPLC)和光电二极管阵列检测器的三重四极杆质谱仪进行 LC-MS 分析确认(见图 3)。采用同一台质谱仪对 [M+2H]2+ 离子进行精确质量测定。测得以下计算值与实测值高度一致(图 4):(a) 计算值 = 896.0026 amu,实测值 = 896.0038 amu;(b) 计算值 = 952.0691 amu,实测值 = 952.0730 amu。

图3. 纯化肽模拟物的液相色谱-质谱分析。 (a)m/z = 1,792 和 (b)m/z = 1,903。其中上方为总离子流图(TIC),中间为液相色谱-质谱图,下方为220 nm处的紫外色谱图。 请点击此处查看该图的高清版本。

图 4. peptoid 的精确质谱数据(a)和(b)。 请点击此处查看此图的放大版本。
采用分析型反相高效液相色谱(RP-HPLC)评估产物纯度(使用分析柱 4.6 mm × 100 mm,3.5 µm,配备带紫外-可见光检测器的液相色谱泵;流速 = 1 ml/min),在220 nm处检测,该波长对应酰胺键骨架的吸光度。图5a 和 5b 显示化合物具有均一性。

图 5. 纯化后的肽模拟物 (a) 和 (b) 的分析型高效液相色谱。 采用 0–100% 流动相 B 的梯度洗脱,持续 30 分钟,柱温箱温度为 40 °C(流动相 A = 95% H2O, 5% MeCN, 0.05% TFA;流动相 B = 95% MeCN, 5% H2O, 0.03% TFA)。请点击此处查看该图的放大版本。
纯化的肽模拟物(a)和(b)在针对L. mexicana 无菌培养的无鞭毛体的细胞毒性实验中进行了测试。L. mexicana 的冻存菌种经解冻后,转化为适合实验的无鞭毛体阶段。解冻后72小时,寄生虫应处于对数生长期的昆虫阶段前鞭毛体,呈分裂循环形式,含有大量分裂中的细胞。此时可通过调节pH和温度转变条件,将寄生虫转化为无鞭毛体阶段27。转化第9天时,寄生虫将进入非复制性的感染性后鞭毛体阶段。最终在第14天,寄生虫应达到致病性无鞭毛体阶段,此时寄生虫失去前鞭毛体所具有的典型鞭毛结构28。
将化合物用细胞培养级 DMSO 配制成 5 mM 的储备液,并在至少两个独立实验中进行三次重复测试,以确保获得可靠的数据集。一个典型的 96 孔板设计如图 6所示。在实验结束时,向每个孔中加入细胞活力检测试剂,并按所述方法测定荧光值,以计算各测试浓度下寄生虫的存活率(见图 7)。计算得到的 ED50 值分别为:peptoid (a) >100 µM,peptoid (b) 37 µM。误差线表示孔间变异的标准差,可见大多数误差线的范围是合理的。

图6. 针对两种肽模拟物溶液(包含阳性和阴性对照)进行细胞毒性检测的代表性96孔板设计。 med+ = 培养基(Schneider's昆虫培养基,pH 5.5,含20% FBS,1% P/S)。L. mex. = 在med+中浓度为8 × 106/ml的寄生虫培养液。AmphoB = DMSO中5 mM溶液。Peptoid = DMSO中5 mM储备液。空孔应加入无菌水。请点击此处查看该图的放大版本。

图7. 针对细胞毒性的检测结果 L. mexicana 使用肽模拟物(a)和(b)培养无菌无鞭毛体寄生虫。 可以看出,肽模拟物(b)在降低可存活寄生虫百分比方面比肽模拟物(a)更有效,且两种化合物均呈现剂量依赖性效应。误差线表示各孔之间的变异,以标准差形式展示。 请点击此处以查看此图的放大版本。
在化学生物学和药物化学领域,肽拟物(peptoids)正受到越来越多的关注,其应用包括新型治疗剂3-5、细胞递送载体18,20以及诊断工具29。通常,这些序列带有正电荷,以实现对病原体相对于哺乳动物细胞的选择性识别、穿透细胞膜的能力,并有助于在水相体系中的溶解性。文献中已有大量仅含有模拟赖氨酸或精氨酸残基的阳离子型肽拟物实例。然而迄今为止,由于缺乏合适的合成方法,同时在同一序列中包含这两种阳离子残基的肽拟物的合成一直受到阻碍。本文所述的方案可高效地合成混合阳离子型肽拟物,具有很高的应用价值,因为它为调控两亲性肽拟物的生物学和化学性质提供了可行途径。
我们的方法对常用的亚单体肽模拟物合成法进行了改进,可在同一序列中引入赖氨酸型和精氨酸型单体。该方法在室温下进行偶联反应,并采用成熟的保护基化学策略,因此预期可适用于大多数研究团队。为实现对精氨酸型残基的正交保护,首先在标准取代条件下加入未保护的二胺,随后使用Dde-OH在60分钟内完成保护。可选用多种不同链长的二胺,从而引入侧链长度为2至6个碳原子的取代基。 即, 1,2-乙二胺至1,6-己二胺。Dde-OH保护基在DMF中溶解性良好,是一种高效且选择性优异的伯胺保护基。Dde保护基对仲胺无影响, 例如未受保护的肽模拟物链N端。30 一个局限性在于所有合成步骤均为手动完成;然而,预计所开发的偶联条件将使该方法适用于自动肽/拟肽合成仪。
树脂上Dde保护基的脱保护使用2%肼的DMF溶液进行,以释放游离胺基,随后在树脂上利用吡唑-1-羧基脒对游离胺基进行胍基化反应。每摩尔树脂上的游离胺基使用6当量吡唑-1-羧基脒和6当量DIPEA。即,每种六个当量 NArg类型单体的偶联)。该反应效率同样较高,且吡唑-1-羧基脒试剂在DMF中具有良好的溶解性。室温反应60分钟后,通常可通过LC-MS检测确认反应完成。
由于亚单体法具有较高的通用性,在取代步骤中可使用多种多样的伯胺,因此可能需要优化条件以提高偶联效率、产物总收率或纯度。31 对于上述讨论的序列,无需特殊条件即可实现成功的偶联反应。然而,对于较难进行的取代反应,可采用更长的取代时间或更高的胺浓度。即,对于亲核性较差或空间位阻较大的胺类)。某些胺在DMF中可能无法完全溶解,此时建议将其溶解于 NN-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)或其他适用于固相反应的适当溶剂,如先前报道的亚单体合成肽拟态物的综合方法中所述。32 为了引入侧链中含有未保护杂原子的单体,其他研究团队已证实使用氯乙酸进行乙酰化是有效的。33 此外,该方法还可使用其他树脂,以获得具有不同C端官能团的肽拟物。王氏树脂和2-氯三苯甲基氯树脂在肽拟物的单体亚单元合成中被常规使用。例如,本课题组已成功将该方法应用于2-氯三苯甲基氯树脂。2 不同的固体载体需要采用与本文所述Rink Amide不同的负载方法(取决于所用的特定树脂),因此在合成前应查阅相关文献予以确认。
与多肽合成类似,从树脂上最终裂解peptoid的条件也可根据特定序列进行优化。本方案中使用了TFA裂解混合液(以三异丙基硅烷和水作为捕获剂)。本文所述peptoid仅含有Boc保护基团,该基团具有适度的酸不稳定性。为确保含有较多保护残基或酸不稳定性较低的保护基团的序列能够完全去保护,可能需要更长的裂解时间(即,对于含有Pbf或叔丁酯保护基团的序列,建议裂解时间超过2小时。对于具有特殊侧链的肽,也可使用其他替代性清除剂(例如,对于含有半胱氨酸或甲硫氨酸等含硫侧链的肽,常使用乙二硫醇或2-巯基乙醇)。
本实验所采用的生物学检测方法是一种标准的细胞毒性试验,可根据不同细胞系进行调整。需要注意的是,每块96孔板都应包含足够的对照,以确保所得结果的可靠性。在本实验中,两性霉素B作为阳性对照,因为它是治疗该疾病的已知药物;而DMSO作为阴性对照,因为它是用于配制化合物储备液的溶剂。如果使用其他细胞系,则应在使用前获取并验证合适的替代对照。将利什曼原虫(L. mexicana)与浓度范围为100至2 µM的拟肽(peptoid)共同孵育1小时,然后将寄生虫与拟肽的混合溶液稀释10倍,进行过夜孵育(即,最初含有100 µM拟肽储备液的孔,稀释后浓度为10 µM)。
在实验结束时,向每个孔中加入细胞活力试剂(占孔总体积的10%)。活力寄生虫孔(粉红色)、无活力寄生虫的对照孔(蓝色)以及活力寄生虫数量介于两者之间的孔之间,可观察到明显的颜色变化。荧光强度与活细胞数量成正比,反映细胞的代谢活性;在代谢活跃的细胞中,非荧光性的刃天青染料(resazurin)通过还原反应转化为荧光性的试卤灵(resorufin)34。本实验中,细胞活力试剂的孵育时间已针对L. mexicana进行了优化。当接种不同细胞浓度或不同细胞系(例如,该方法也可用于哺乳动物细胞)的孔板时,活力试剂的孵育时间可能有所不同。根据所使用的具体酶标仪型号,在进行荧光检测前需进行相应考虑。应去除孔中的任何气泡,以确保读数准确。某些酶标仪从孔板底部读数,此时应使用平底96孔板;其他仪器可能从孔板上方读数,因此在检测前应移除孔板盖。
未来,本方案可能适用于能够并行合成多条序列的自动化合成仪。此外,利用该方法也可实现环状肽拟物的合成。本方案为研究人员提供了一种实用的合成步骤,可用于构建含有赖氨酸型和精氨酸型单体的新型肽拟物骨架,在材料科学或药物研发等多个领域具有潜在应用价值。
作者无任何利益冲突需要披露。
感谢工程与物理科学研究委员会(EPSRC)提供的经费支持(HLB)。同时感谢Sridévi Maalika Ramanoudjame在本实验操作拍摄过程中提供的协助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 聚丙烯固相萃取小柱(带两个筛板) | Crawford Scientific | 12131017 和 12131015 | 本制备中使用的 20 ml 和 6 ml 羧酸酯柱 |
| 三氟乙酸 | 东京化工产业(欧洲) | T0431-100g | >98%;注意:可引起严重灼伤和呼吸道刺激 |
| N,N'二异丙基碳二亚胺 | Sigma Aldrich | 38370-100ML | >98%;注意:对眼睛、皮肤和呼吸道吸入有害,可能引起过敏反应 |
| 二甲基甲酰胺 | Fischer Scientific | 10346180 | HPLC 级;注意:疑似致畸物 |
| 乙腈 | Fischer Scientific | 10407440 | 高效液相色谱级 |
| 二氯甲烷 | Fischer Scientific | 10354263 | 99.8%;注意:疑似致癌物 |
| 溴乙酸 | Sigma Aldrich | 17000-100G | >99%;注意:可引起灼伤,对皮肤、眼睛和呼吸道有害 |
| (S)-(-)-α-甲基苄胺 | Sigma Aldrich | 115568-100G | 98%;注意:吞食有害,与皮肤接触有毒,可引起严重皮肤灼伤和眼睛损伤,用于合成 Nspe 单体 |
| N-Boc 1,4-二氨基丁烷 | 东京化学工业(欧洲) | A1373-25g | >98%;注意:可引起严重皮肤灼伤和眼损伤,用于合成 NLys 单体 |
| N-Boc 1,2-二氨基乙烷 | 东京化学工业(欧洲) | A1371-25g | >97%;警告:可引起严重皮肤灼伤和眼睛损伤,用于合成 Nae 单体 |
| 1,2-二氨基丁烷 | Sigma Aldrich | D13208-100G | 99%;警告:易燃液体和蒸气,吞咽或吸入有害,皮肤接触有毒,可引起严重皮肤灼伤和眼损伤,用于NhArg单体的合成 |
| 1,4-二氨基乙烷 | Sigma Aldrich | 03550-250ML | >99.5%;警告:易燃液体和蒸气,吞咽或吸入有害,皮肤接触有毒,可引起严重皮肤灼伤和眼损伤,用于NnArg单体的合成 |
| 1H-吡唑-1-甲脒盐酸盐 | Sigma Aldrich | 402516-10G | 以盐酸盐形式;注意:吞食有害,可能引起过敏性皮肤反应,造成严重眼损伤 |
| 一水合肼 | Sigma Aldrich | 207942-5G | 试剂级;注意:疑似致癌物,吸入致命,对皮肤和眼睛可造成严重灼伤 |
| 2-乙酰基二甲酮 | Novabiochem | 8510150005 | Dde-OH |
| Rink Amide 树脂 | Novabiochem | 8551190005 | 100-200 目,高载量 |
| 哌啶 | Sigma Aldrich | 411027-1L | >99.5%,属于管制物质,购买前必须获得适当许可;注意:高度易燃液体和蒸气,吞食有害,与皮肤接触或吸入有毒,可引起严重皮肤灼伤和眼睛损伤,对水生生物有害并具有长期持续影响 |
| 三异丙基硅烷 | Sigma Aldrich | 233781-50G | 98%;警告:易燃液体和蒸气,可引起皮肤刺激和严重眼刺激 |
| alamarBlue | ThermoFischer | DAL1025 | 未被归类为危险品 |
| 施奈德昆虫培养基 | Sigma Aldrich | S9895-1L | 粉末状培养基需按照生产商说明书在使用前配制;用于生物学实验前,需使其升温至室温 |
| 96 孔板 | VWR | 734-1793 | 平底(便于从底部进行荧光检测)、组织培养处理 |
| 溶剂储液罐 | VWR | 613-1182 | 使用多通道移液器 |
| 多通道移液器 | Eppendorf | 3122000043 | |
| 移液器吸头 | Starlab 集团 | S1111-3810,S1113-1810,S1111-6810 | 移液器枪头的体积取决于所使用的移液器。10 µl,10 - 200 µl 和 1,000 µl 建议用于检测 |
| 25 cm3 细胞培养瓶 | VWR | 734-2312 | |
| 50 ml 离心管 | VWR | 525-0791 | |
| 二甲基亚砜(分子生物学级) | Sigma Aldrich | D8418-50ML | 未被归类为危险品 |
| 热灭活胎牛血清 | ThermoFischer | 10082139-100mL | Gibco |
| 青霉素/链霉素 | ThermoFischer | 15140148-20mL | 缩写:P/S |
| 两性霉素B | Sigma Aldrich | 46006-100mg | 两性霉素B三水合物,VetranalTM 分析标准品 |