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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
息肉救助是由急性应激引起的一个过程,其中珊瑚息肉消化将它们连接到殖民地的组织并从中分离出来作为个体生活。本方案描述了如何使用高盐碱或无钙海水处理来救助珊瑚微繁殖。
珊瑚是由称为息肉的模块化单元形成的殖民地动物。珊瑚虫在生理上通过组织连接和连接。息肉救助现象是由急性应激引起的一个过程,其中珊瑚虫消化连接它们与殖民地其余部分的组织,并最终从骨骼中分离出来,继续作为单独的个体生活。多年来,珊瑚生物学家已经承认息肉救助的过程,但直到最近,这一过程产生的微繁殖物才被公认为珊瑚生物学研究的典范系统。使用息肉救助可以从单个珊瑚碎片中产生大量的克隆单元。另一个好处是,单个息肉或息肉斑块可以在显微镜下轻松可视化,并在高度标准化的低成本环境中进行维护,例如培养皿,烧瓶和微流体芯片。本方案展示了能够诱导珊瑚微繁殖的可重复方法以及长期维持单个息肉存活的不同方法。这种方法能够在救助后长达8周内成功培育出疣状珊 瑚物种的 息肉,展示了使用单个珊瑚息肉进行珊瑚研究的实用性。
巩膜珊瑚或造礁珊瑚是能够形成碳酸盐骨架,形成珊瑚礁和结构复杂的生态系统的桔梗,可以从深水到浅水环境中找到1。热带珊瑚礁拥有高度的生物多样性,并提供基本的生态系统服务,如海岸保护和渔业维护2.大多数浅水造礁珊瑚依赖于与 共生藻科的藻类的互惠关系,共生藻类提供了珊瑚构建骨骼所需的能量。珊瑚和藻类之间的共生关系可以被环境压力破坏,导致珊瑚白化3,4,5,6。最近的温度异常导致世界各地的珊瑚白化事件,导致大规模珊瑚死亡和永久珊瑚礁退化7,8,9,10,11。由于这种现象是基于热应激后相关细胞机制(如细胞凋亡,自噬和胞吐作用)排出共生体,因此珊瑚白化可以被描述为具有生态系统规模后果5,6,12的细胞过程,这意味着珊瑚细胞或组织的 体外 培养将适用于密切研究这种现象。
由于珊瑚礁的重要性及其面临的主要威胁,特别是在过去二十年中2,珊瑚已成为全球保护和恢复目的的研究重点13.然而,开发可靠,可重复且对环境影响最小的方法和实验系统来研究珊瑚是该领域的主要斗争。
微繁殖被定义为通过在受控容器中培养其生物材料来体 外 增殖生物体的基因型14,15。近几十年来,细胞、组织和器官的培养对植物和动物生物学至关重要。它允许在实验室中大规模繁殖生物体,快速评估不同的治疗方法(如药物和药物),并直接研究细胞功能14,15,16,17。一般而言, 体外 模型对于在更好地控制的物理和化学条件下补充和深化不同生物体的研究是有用的。由于 体外 培养技术的优势,不同的动物细胞和组织培养技术已被开发,优化并用作许多研究领域的重要工具,其中多种细胞系已被研究和商业化用于众多应用16,17,18。
自1882年第一次动物组织培养以来,细胞和组织培养的知识已经取得了许多进步17, 例如使用天然和合成培养基, 已建立的细胞系的发明, 以及开发 3D 培养基以更好的方式培养多种细胞类型16,17,18,19.然而,细胞生物学领域主要集中在一组选定的模式生物上,而许多分类群仍然没有完善的细胞,组织或器官20的体外培养物。例如,在珊瑚研究中,没有永生化的细胞系被广泛用于研究,从而限制了珊瑚细胞研究使用原代细胞培养物。这些培养物的生存能力仅限于21周,没有研究记录所有珊瑚组织中单个细胞的存活时间超过13天,直到2021年初22。将要发表的第一份可持续珊瑚细胞系的报告是具有长达6个月的Acropora tenuis细胞,这些细胞对未来研究的效用仍有待探索23.
为了克服培养珊瑚细胞培养物的局限性并保持保留珊瑚整体组织组织的实验室培养,最近提出了使用分离的息肉作为珊瑚生物学研究的模型24,25。息肉是珊瑚的解剖学单位,它们中的每一个都有一个位于口腔圆盘中心的嘴,并通过其腹侧区域的coenosarc连接到其他息肉26。活息肉的分离通过息肉纾困过程自然发生,其中急性应激导致息肉之间腹肉的消化,然后可以从蜂群的骨骼中分离25,27,28。据报道,这种现象发生在多种分类群中,包括八角藻29,30,31,黑珊瑚32和巩刹纪珊瑚25,27,28,32,33,并且已经与多种环境压力源有关,例如水中缺钙24,34,酸度增加35,高渗条件25,27,32,36,高温36,37,饥饿33,空气暴露25,30和杀虫剂污染28,38。例如,息肉救助在斑秃珊瑚19中已有报道,这些珊瑚广泛分布在世界各地,通常用作珊瑚研究的模型。属于该组的物种,如达米角虫和西葫芦,从5毫米的25个碎片中产生了大约30-40个微繁殖体。这个数字强调了使用息肉救助作为珊瑚微繁殖方法的优势,因为它创造了从一小块珊瑚中产生许多遗传上相同的个体的可能性。使用分离的息肉进行研究也具有与细胞培养相同的优势,即在受控的实验室环境中培养的可能性,例如烧瓶和培养皿。此外,维持活息肉的微流体平台已经证明,这些微繁殖体可以保持在相对便宜且易于繁殖的环境中,水流,表面和温度受控24,25。这些微流体平台也可用于在显微镜下直接可视化活珊瑚结构24,25。
在本文中,我们总结并演示了已经开发的从其殖民地分离单个珊瑚虫的技术,展示了如何在实验室条件下维持它们以进行长期培养。所讨论的方法包括通过蒸发和泵送高盐度海水的高渗条件以及在无钙海水中孵育来拯救息肉。
在本研究中,SCUBA通过使用锤子和凿子潜水,从Al Fahal礁(22.305118 N; 38.964568 E)中收集了属于疣 状栉珊 瑚物种的殖民地。该殖民地的属在形态学上被鉴定出来,其物种根据先前发表的工作被归类为 疣状芽孢杆菌 ,包括来自红海的 Pocillopora ,表明从遗传学的角度来看,该区域存在的物种是疣 状芽孢杆菌39,40。法哈尔礁不是受保护的环境区域的一部分,收集珊瑚不需要特别许可证。该殖民地在300升的水族箱中保存了一个月,然后被分割并"救出"息肉。水族箱保持在26°C,有两个水族箱加热器,三个泵和两个光源(见 材料表),保持12小时的光周期。通过将两个加热器中的每一个连接到温度控制器来维持水族箱的温度。光发射被编程为从早上6点开始,在下午6点结束,产生一个辐照度曲线,该曲线在下午12点达到峰值,光子为230μmol m−2s−1。
1. 水蒸发后高盐度的息肉救助
注:此方法改编自夏皮罗等人25。如果使用与 疣状孢子虫不同的物种,则在确定要切割的碎片的大小之前,应考虑息肉的大小。
2. 高盐度海水供应的息肉救助
注:该方法改编自庄某等人27。
3. 无钙海水孵化纾息息肉
注:该方法改编自Pang等人24。
4. 培养皿中的息肉维护
5. 培养箱中的息肉维护
通过三种不同的方法,在属于疣螈属物种的单一殖民地的珊瑚碎片中诱导息肉救助(图1)。在培养皿中浸泡珊瑚碎片24小时后,水蒸发后高盐度诱导的脱脱在培养皿中,最初在40 PSU下充满水,然后在过程结束后达到59 PSU的最终盐度(图2A-C,I)。在最初在40 PSU的水中孵育24小时后,盐水供应也达到了救助,该水在12小时后达到52 PSU的盐度,在过程结束时达到59 PSU,24小时后(图2D-F,I)。在这两个实验中,盐度的增加是息肉诱导组织消化的原因。12 h后,高盐度条件导致息肉收缩,同时辅酶肉逐渐变薄,最终导致息肉在24 h后最终脱离。在CaFSW中孵育3h后,然后在20%DMEM培养基中孵育20h后,通过无钙海水孵育的救助诱导完成(图2G-H)。用移液管将其推开后,在所有三种方法中将组织从骨架上分离出来,直到产生个体化的珊瑚息肉(图3A-C)和"组织球"。
分离后,收集所有三种方法的息肉并使其在海水中恢复,然后分配到覆盖有网或细胞瓶的培养皿中。从蒸发和供水方法中获得的息肉在水族箱内的培养皿中保持,并分别存活6周和8周(图3D 和 图3F)。这些微繁殖体保留了息肉的通常解剖结构,呈现触手,基底盘和口腔1。通过在无钙海水中孵育获得的息肉寿命短,存活长达1天,之后其组织解离。从海水蒸发方法获得的息肉保存在培养箱内的细胞培养瓶中,存活长达3周,而不会使组织解离(图3F)。在所有情况下,即使息肉不能附着在基质上,它们也是视觉健康的并保持其颜色,虫黄藻细胞在其组织内仍然可见1。

图1:三种不同测试的息肉救助诱导方法的示意图(左图),然后是在实验室条件下维持获得性息肉的两种方法的图示(右) (A)通过水蒸发来拯救息肉的方法的表示。(B) 通过高盐度海水供应拯救息肉的方法的表述。(C) 无钙海水孵化蚌除息肉的方法说明。 请点击此处查看此图的大图。

图2:使用珊瑚物种疣螈的碎片,通过三种不同的方法诱导息肉救助过程的图像。 (自动对照)分别在培养皿中使用水蒸发法在培养皿中孵育后0h,12h和24h的珊瑚碎片。(D-F)珊瑚碎片分别在孵育后0 h、12 h和24 h,采用高盐度海水供应法。(G,H)珊瑚碎片分别暴露于无钙海水孵育方法之前和之后。(I)在无钙人工海水中孵育3 h,在20%DMEM中孵育21 h.(I)在水蒸发过程中海水PSU中盐度值的图形表示和高盐度海水供应救助诱导方法。请点击此处查看此图的大图。

图3:从三个演示的救助诱导程序中获得的疣状疱疹息肉的图像(A-C)分别从蒸发,盐水供应和无钙海水方法获得的息肉的图像在从骨骼上分离后立即捕获。(D)在培养皿中存活6周后从蒸发方法获得的珊瑚息肉的图像。(E)在培养皿中存活8周后从盐水供应方法获得的珊瑚息肉的图像。(F)在细胞培养瓶中存活3周后从蒸发方法获得的珊瑚息肉的图像。请点击此处查看此图的大图。
作者没有什么可透露的。
息肉救助是由急性应激引起的一个过程,其中珊瑚息肉消化将它们连接到殖民地的组织并从中分离出来作为个体生活。本方案描述了如何使用高盐碱或无钙海水处理来救助珊瑚微繁殖。
我们感谢亚当·巴尔诺和弗朗西斯卡·加西亚对珊瑚虫实验和监测的支持。我们也感谢KAUST沿海和海洋资源核心实验室在水族馆维护和基础设施方面的帮助。该研究由KAUST拨款编号BAS / 1 / 1095-01-01资助。
| 5560 电导率/温度探头 | YSI | 5560 | 电导率探头与 ProQuatro 多参数测量仪 |
| Ace 5 in.合金钢斜口钳 | Ace Hardware | 2004083 | 用于切割珊瑚碎片 |
| 氨苄青霉素钠盐 | Sigma-Aldrich | A9518 | 用于 DMEM 培养基。 |
| DMEM (1x) Dulbecco 改良 Eagle 培养基 | Gibco | 41965-039 | 用于在无钙息肉保释法中孵育珊瑚碎片 |
| Fisherbrand 培养皿,可堆叠盖 60 mm x 15 mm 无菌聚苯乙烯 | Thermo Fisher Scientific | FB0875713A | 培养皿,用于通过蒸发保释和将息肉保持在水族箱内。 |
| Heizer Titanrohr Heizstab SW MW 600 瓦 | Schego | 548 | 水族馆中使用的加热器 |
| 徕卡应用套件 4.2 | 版 徕卡显微系统 | NA | 软件,用于演示结果中的图像捕捉 |
| 徕卡 IC80 HD | 徕卡显微系统 | 12730216 | 用于拍摄演示结果照片的相机 |
| 徕卡 MDG33 | 徕卡显微系统 | 10 450 123 | 立体镜架 用于拍摄演示结果图片 |
| Leica Z6 APO | Leica Microsystems | NA | 用于拍摄演示结果图片的宏观镜 |
| 氯化镁 | Thermo Fisher Scientific | 7487-88-9 | 用于制备无钙人工海水。 |
| 无水硫酸镁 | Sigma-Aldrich | 7791-18-6 | 用于制备无钙人工海水。 |
| 用于精密软管的 Masterflex I/P Easy-Load 泵头,白色 PPS 外壳,SS 转子 | Masterflex | HV-77602-10 | 蠕动泵头。 |
| 带台式控制器的 Masterflex L/S 精密模块化驱动器 | Masterflex | EW-07557-00 | 蠕动泵驱动器,用于泵送高盐度海水。可以替代任何能够保持协议中所述水流的蠕动泵。 |
| Masterflex L/S 精密泵管,铂金固化硅胶,L/S 16;25 英尺 | Masterflex | HV-96410-16 | 蠕动泵管。 |
| Millex 33 mm PVDF 0.22 µm 无菌 RUO | Sigma-Aldrich | SLGVR33RS | 用于过滤人工海水。 |
| Nunc EasYFlask 75 cm2 Nunclon Delta Surface | Thermo Fisher Scientific | 156499 | 培养瓶通常用于细胞培养,用于息肉培养。 |
| 轨道摇床,Advanced 5000,VWR | VWR | 444-2916 | 摇床,用于培养箱内。 |
| Percival 培养箱 - I-22VL | Percival | NA | 培养箱,用于维持保存在细胞培养瓶中的珊瑚。 |
| 浮游生物网 200 & 微型;m 网孔尺寸 | KC Denmark | NA | 用于覆盖含有珊瑚虫的培养皿。 |
| 氯化钾 | VWR 化学品 | 7447-40-7 | 用于制备无钙人工海水。 |
| ProQuatro 多参数计 | YSI | 606950 | 用于测量整个协议的盐度 |
| RADION XR15 G5 PRO | Ecotech | NA | 用于水族箱的灯 |
| 红海盐 优质、中等碱度 | 的红海 | NA | 用于制备 40 PSU 人工海水。 |
| 碳酸氢钠 | Sigma-Aldrich | 144-55-8 | 用于制备无钙人工海水。 |
| 氯化钠 | Sigma-Aldrich | S3014 | 用于制备无钙人工海水。 |
| 硫酸钠 无水 | VWR 化学品 | 7757-82-6 | 用于制备无钙人工海水。 |
| TRD 112 恒温器 | Schego | NA | 用于水族馆的恒温器 |
| Turbelle Nanostream 6025 | Tunze | 6025 000 | 用于水族馆的泵 |