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DOI: 10.3791/58267-v
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This article presents a protocol for generating deletion mutants in E. coli using pre-existing antibiotic resistance-cassette deletion constructs. The method involves mobilizing these deletion mutations into recipient strains via P1 bacteriophage transduction.
Hier präsentieren wir ein Protokoll für die Verwendung von bereits bestehenden antibiotische Resistenz-Kassette Löschung Konstrukte als Grundlage für die Herstellung von Löschung Mutanten in anderen E. Coli -Stämme. Solche Löschung Mutationen können mobilisiert und in den entsprechenden Locus eines Empfängers Stamm mit P1 Bakteriophagen Transduktion eingefügt.
Diese Methode ist nützlich im Bereich der Mikrobiologie, z. B. um die Funktionen bestimmter Gene herauszufinden. Der Hauptvorteil dieser Methode besteht darin, dass sie eine schnelle und zuverlässige Methode zur Erzeugung von Knockout-Mutanten von E.Coli ist. Dieses Verfahren wird von Thomas Trunk, einem Doktoranden aus meinem Labor, demonstriert.
Um einen Spenderstamm zu infizieren, der eine Gendeletion auf der Grundlage einer verbrauchbaren Antibiotikakassette enthält, wachsen die Bakterien zunächst in fünf Millilitern Lysogenbrühe oder LB mit zehn Millimolar Calciumchlorid und optional mit 25 Mikrogramm pro Milliliter Kanamycin auf eine optische Dichte bei 600 Nanometern von etwa 1,0. Es wird eine Verdünnungsserie eines vorhandenen P1-Phagenbestands in dem LB-Medium hergestellt und 200 Mikroliter der Bakteriensuspension mit je 100 Mikrolitern Phagenverdünnung in einzelnen 15-Milliliter-Zentrifugenröhrchen gemischt. Inkubieren Sie die Röhrchen 20 Minuten lang statisch bei 37 Grad Celsius.
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