Waiting
Traitement de la connexion…

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Immunology and Infection

В Ситу обнаружения бактерий внутри парафин тканей с использованием дигоксина меченных ДНК зонд таргетинга 16S рРНК

Published: May 21, 2015 doi: 10.3791/52836

Introduction

Бактерии играют роль в этиологии различных заболеваний полости рта, такие как периодонтит, пульпит, перикоронит, целлюлит, и остеомиелита. Для того, чтобы понять роль бактерий в патогенезе заболевания и контролировать эффект лечения, локализации бактерий в ткани важно. Наличие бактерий в десневой ткани от пациентов с пародонтитом было показано, используя различные методы, в том числе электронной микроскопии 1,2, иммуногистохимии и иммунофлуоресценции с использованием бактерий специфических антител 3-7, и флуоресцентной гибридизации на месте (FISH) с использованием 8 флуоресцентные- помечены олигонуклеотидный зонд ориентации 16S рРНК. Тем не менее, эти методы не нашли широкого применения из-за технических ограничений или трудностей. По сравнению с антителами, зонды, нацеленные 16S рРНК легко производить и достижения видовой специфичности. РЫБЫ оказалась отличным инструментом для визуализации BactEria в своих природных условиях, таких как бляшки биопленки. Тем не менее, применение FISH образцы тканей ограничено из-за флуоресценции различных тканевых компонентов. Например, сильный флуоресценции красных кровяных клеток часто затрудняет применение флуоресцентной технологии в воспаленных тканях, когда они включают кровотечение 9.

Для того, чтобы локализовать бактерии в воспаленных тканей десны, таким образом, на месте методом гибридизации с использованием дигоксигенина (DIG), меченным зондом ДНК была разработана и успешно применена 10,11. Вот Подробный протокол для локализации бактерий в парафиновых срезах тканей с использованием P. gingivalis -специфические и универсальные эубактериальных зонды был описан. Это, в частности, направлены на стандартизацию метода, так что аналогичные результаты могут быть воспроизведены в других лабораториях. Этот протокол позволяет локализацию бактерий в их гистологического контексте и RESULTS высокой воспроизводимостью. Описанный протокол может быть использован для локализации бактерий либо в видоспецифических или универсальным образом в различных тканях. Универсальный датчик особенно полезен для обнаружения бактерий в Полимикробные заболеваний и изучить потенциальную роль бактерий при заболеваниях, где роль конкретных бактерий, не известно.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. Зонд Подготовка

  1. ПЦР-амплификация зонда
    1. Для P. gingivalis Определённые зонд, амплификации 343 п.н. фрагмента ДНК P. gingivalis 16S рРНК с помощью ПЦР с использованием геномной ДНК из P. gingivalis и следующие праймеры: 5'ТГК AAC ТТГ ССТ TAC АГА GG-3 'и 5'ДЕЙСТВОВАТЬ ВКТ ВКТ УВД GCC ТАТ TC-3' 10. Выполнение амплификации при следующих условиях цикла: 35 циклов при 95 ° С в течение 30 сек, 60 ° С в течение 30 сек и 72 ° С в течение 1 мин 20 сек с последующим расширением 5 мин при 72 ° C 10,11.
    2. Усилить эубактериальный зонд с помощью 70-ВР (фрагмент ДНК, 5'-CAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAG
      TCCCGCAACGAGCGCAACCC-3 ') синтезировали, как олигонуклеотид, и следующих праймеров: 5'-CAG CTG ОТО СМТ GGY-3' и 5'-AGG GTT GTT GCG СТС-3 '11. Выполните уточнения при следующих условиях цикла: 40 цикловв 9 4 ° С в течение 30 сек, 60 ° С в течение 30 сек и 72 ° С в течение 1 мин 20 с последующим расширением 5 мин при 72 ° С 11,12.
    3. Осадок ПЦР-продуктов (≥500 мкл) при добавлении 3 М ацетата натрия (рН 5,2) и 100% этанол (на 10: 1: 2 соотношение) и инкубировали при -20 ° С в течение 2 ч.
    4. Центрифуга смесь при 14000 х г в течение 15 мин, ресуспендируют осадок в 100 мкл ТЕ-буфера, и измеряют концентрацию ДНК по оптической плотности при 260 нм.
  2. DIG-маркировки с помощью маркировки и обнаружения комплект DIG ДНК
    1. Смешайте 3 мкг зонда водой до конечного объема 15 мкл.
    2. Денатурации ДНК при 95 ° С в течение 10 мин и быстро охладить на льду.
    3. Добавьте 2 мкл 10х гексануклеотид смеси 2 мкл дНТФ-маркировки смеси и 1 мкл фермента Кленова до 15 мкл денатурированной ДНК.
    4. Смешайте и инкубируют при 37 ° С в течение 24 ч до 48 ч, а остановить реакцию при нагревании при 65 ° С.
  3. Проверьте чувствительность DIG-меченного зонда, используя маркировки и обнаружения комплект DIG ДНК
    1. Ручная загрузка 1 мкл серийных разведений положительного зонда контроля, предусмотренных в комплекте и 1 нг DIG-меченым зондом на нейлоновую мембрану и сухой в течение 5 мин при комнатной температуре.
    2. Кратко пропитать мембрану в 2Х SSC-буфере (0,3 М NaCl, 30 мМ цитрат натрия, рН 7,0) и инкубируют мембрану при 80 ° С в течение 1 ч, чтобы иммобилизовать ДНК.
    3. Кратко пропитать мембрану в буфере малеиновой кислоты (MAB, 0,1 М малеиновой кислоты, 0,15 М NaCl, рН 7,5) и инкубируют с анти-DIG щелочной фосфатазы (AP) -conjugated антитела разводили (1: 5000) в 6 мл блокирующего раствора при условии в комплект при комнатной температуре в течение 30 мин.
    4. Промыть мембраны с MABT (МАВ, содержащего 1% Твин 20) и применить 40 мкл раствора NBT / BCIP смешивают с 2 мл буфера обнаружения (0,1 М Трис-HCl, 0,1 М NaCl, 0,05 М MgCl 2, рН 9,5) на Мембрана в течение 1 мин. Если чувствительность меченым зондом являетсяне удовлетворяет, повторите шаги с 1.1.3 до 1.3.4.
    5. Измерьте концентрацию ДНК меченого зонда (OD260) и регулировать концентрацию до 100 нг мкл -1.
  4. Проверьте специфику DIG-меченным зондом
    1. Денатурации образцов геномной ДНК (25 нг 3 мкл -1 на каждый образец) из различных видов бактерий, в том числе бактерии мишенью конкретной зонда, при 95 ° С в течение 10 мин и быстро охладить на льду.
    2. Вручную загрузить денатурированной ДНК на нейлоновую мембрану и сушат в течение 20 мин при комнатной температуре.
    3. Кратко пропитать мембрану в 2Х SSC буфера и инкубируют мембрану при 80 ° С в течение 2 ч, чтобы иммобилизовать ДНК.
    4. Блок мембраны с блокирующим раствором при комнатной температуре в течение 1 часа.
    5. Развести зонд на 1 нг мкл -1 в гибридизации буфера, денатурации разводненной зондов, и применять на мембране.
    6. Инкубируйте мембраны при 45 ° С в течение 1 часа.
    7. Вымойте мембраны трираз с 2x SSC буфера.
    8. Кратко замочить мембраны в МАБ.
    9. Инкубируйте с анти-DIG AP-конъюгированного антитела, разбавленного (1: 2000) в 6 мл блокирующего раствора при комнатной температуре в течение 1 часа.
    10. Промыть мембраны с MABT и применить 40 мкл раствора NBT / BCIP смешивают с 2 мл буфера для обнаружения.
    11. Когда зонд не достичь ожидаемого специфичность, повысить температуру гибридизации, пока не наблюдается специфичность.

2. В гибридизация

Примечание: Чтобы избежать пересыхания образцов и реагентов, выполнять все инкубации в увлажненной камере выложены влажных бумажных полотенец.

  1. Де-paraffinization и регидратация срезов
    1. Подготовка разделов толстые ткани 4 мкм от парафин блоков. Формалин, параформальдегид, и на основе цинка фиксатор совместимы с этим протоколом.
    2. Подготовьте все реагенты, используя DEPC обработке воды.
    3. Тепловые скользит в сушильном шкафу при температуре 60 ° С в течение 30 мин и инкубировать слайды при КТ в течение 30 мин.
    4. Погрузитесь слайдов в 100% ксилола в течение 5 мин в три раза; использовать свежий ксилол каждый раз.
      Примечание: У этой процедуры де-воском в химической вытяжкой.
    5. Погружают слайдов в 100% этаноле в течение 5 мин в два раза, с использованием свежих этанола каждый раз, и увлажняет образцов в последовательный 90%, 80% и 70% этанола решения в течение 5 мин каждый.
    6. Погружают слайдов в DEPC-обработанной воде в течение 1 мин и мыть слайдов в DEPC-обработанной PBS (рН 7,4) в течение 6 мин.
  2. Предварительной обработки срезов тканей
    1. Погружают слайды в 0,1 N соляной кислоты в течение 20 мин и мыть слайдов в DEPC-обработанной воды в течение 30 сек.
    2. Нарисуйте гидрофобный барьер, окружающий образцы, используя восковую ручку.
      Примечание: Размер гидрофобного барьера зависит от размера образца. Таким образом, объемы реагентов, используемых в следующих стадий варьируют в зависимости от размера образцов, но должны заполнить HYdrophobic барьер (50 мкл для малых образцов и 400 мкл для больших образцов).
    3. Treat образцов с 50 до 400 мкл протеиназы К (от 1 до 10 мкг мл -1 в DEPC-обработанной PBS) в сушильном шкафу при 37 ° С в течение 30 мин и мыть слайдов в DEPC-обработанной 1x PBS в течение 1 мин.
    4. Замочите слайды в 4% параформальдегида в DEPC обработанной PBS в течение 10 мин, затем промыть слайдов в DEPC обработанной PBS в течение 1 мин.
    5. Замачивание слайды в 0,1 М триэтаноламин-HCl (рН 8,0), содержащего уксусный ангидрид 0,5% в течение 20 мин и мыть слайдов в DEPC-обработанной воды в течение 30 сек.
  3. Гибридизация с зондом и мойки
    1. Погружают слайды в буфере 2Х SSC в течение 20 мин.
    2. Развести зонд на 1 нг мкл -1 в буфере для гибридизации (4x SSC, 50% [объем / объем] формамид, раствор Денхардта 1x, 10% [вес / объем] сульфат декстрана, 0,1% [вес / объем] додецилсульфат натрия, 0,4 мг мл -1 ДНК спермы лосося). Для отрицательных контролей, смешать меченого зонда с10-кратное избыточное количество немеченого зонда.
    3. Денатурации разводненной зонды и применять 50 до 400 мкл на срезах тканей. Поместите покровное на слайде и печать с лаком для ногтей.
    4. Тепловые скользит в ПЦР машины при 90 ° С в течение 10 мин и инкубируют скользит во влажной камере O / N при 45 ° С или оптимальной температуры определяется на этапе 1.4.11.
    5. Охладите слайды при 4 ° С в течение 30 мин, снять крышку скользит, и погрузиться слайды в последовательном SSC буфере, следующие: 4x SSC в течение 10 мин, предварительно нагретой (45 ° C) 2x SSC в течение 20 мин, 2x SSC в течение 10 мин и 0,2 x SSC в течение 10 мин.
  4. Обнаружение анти-DIG AP-конъюгированных антител
    1. Вымойте слайдов в MABT в течение 5 мин.
    2. Блок с 50 до 400 мкл блокирующего раствора с 1% Твин 20 в течение 20 мин.
    3. Добавить 50 до 400 мкл анти-DIG-AP антитело, разведенное в блокирующем растворе (1: 1,000) anld инкубировать при 37 ° С в течение 90 мин.
    4. Вымойте слайдов в MABT в течение 10 мин.
    5. <Li> погружают слайдов в буфер обнаружения, содержащего 1% Твин 20 в течение 5 мин.
    6. Treat с 50 до 400 μ 1 мМ левамизол (в буфере обнаружения, содержащего 1% Твин 20) в течение 5 мин для инактивации эндогенного щелочной фосфатазы.
    7. Распределить 50 до 400 мкл предварительно смешанного раствора NBT / BCIP (разведенного в буфере обнаружения в масштабе 1: 100) на каждого образца и не инкубировать слайды во влажной камере при комнатной температуре в течение 2 до 3 ч до тех пор, разработаны сигнала является удовлетворительным.
    8. Промыть слайды с деионизированной водой, чтобы остановить визуализацию и применить от 50 до 400 мкл 0,05% [вес / объем] метиловым зеленым как счетчик пятно при 37 ° С в течение 10 мин.
    9. Промыть слайды с деионизированной водой, обезвоживают в 100% этанола, и погрузиться в ксилоле.
    10. Применить 80 мкл решение для монтажа на каждом слайде и накрыть покровных стеклах.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Рисунок 1 показывает блоттинг из DIG-меченых зондов по сравнению с положительным зонда контроля, предусмотренных в комплекте, чтобы определить их чувствительность. 343 б.п. П. gingivalis-специфических зонда в 25 раз более чувствителен, чем 70 пар оснований эубактерий зонда. На рисунке 2 показано в гибридизация из тканей десны, полученных от пациентов с хроническим периодонтитом для обнаружения P. gingivalis и эубактерий. Бактериальные сигналы, показанные в фиолетовый, были обнаружены в эпителии, в собственной пластинке слизистой и биопленки, расположенной за пределами ткани. Тем не менее, распределение P. gingivalis и эубактерий в пределах десневой ткани отличается. В большом увеличении (1,000X), различных форм (кокки, стержня, веретеновидные, и волосатой форме) бактерий были видны с помощью зонда эубактериальный, в то время как только стержневых бактерий были обнаружены в P. gingivalis Определённые зонд. Дисперсные формы бактериальных сигналовбыли также отмечены.

Hajishengallis др. продемонстрировали существенную роль синантропных бактерий в развитии P. gingivalis -индуцированных экспериментальный пародонтит у мышей 14. Применение декстрана сульфата натрия (DSS) плотные контакты (TJ) -disrupting химической, на слизистую оболочку десны, индуцированной пародонтита и альвеолярного потери костной массы у мышей 13. Эубактерий зонд успешно обнаружен бактерии в тканях десны из группы DSS, которые не были обнаружены в P. gingivalis -специфический зонд (рис 3).

Эубактерий зонд является полезным для изучения возможности участия бактерий в других заболеваний. С Международным агентством по изучению рака назначенного Helicobacter Pylori в классе я канцерогеном для рака желудка 15, потенциальное участие бактерий в развитии других видов рака широко изучается. При себеctions биопсии легких с диагнозом плоскоклеточный рак были на месте гибридизации с зондом эубактерий, бактерии были обнаружены как в опухолевых клетках и между окружающей стромы / проникновение клеток (фиг.4). В гибридизация с использованием эубактериальный зонд был также применен к исследовать наличие бактерий в поражениях полости рта красном плоском лишае, воспалительного заболевания иммунной с неизвестной этиологии. Интересно, что бактериальные сигналы были обнаружены не только в эпителии, но и в собственной пластинке, где наблюдалась полоса-подобный инфильтрации. При большом увеличении, бактериальные сигналы были обнаружены в ядрах многих клеток (рисунок 5).

Фигура 1
Рисунок 1. Чувствительность теста из DIG-меченых зондов. Серийно разбавленные на заказ меченых зондов и положительный контрол зонд в комплекте предоставляется были уничтожены точка с анти-DIG-AP-конъюгированных антител. После добавления субстрата, блот с P. gingivalis Определённые зонд был разработан в течение 30 сек, в то время как клякса с эубактериального зонда был разработан в течение 1 мин. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 2
Рисунок 2. Обнаружение бактерий внутри тканей десны, полученных от пациентов с хроническими периодонтита. Разделы десны биопсии от здоровых сайта (A) и больном месте (B) пациента с периодонтитом подвергали гематоксилин-эозином (Н & Е) окрашивания или гибридизация либо с P. gingivalis -специфический зонд или зонд эубактерий. Negativе управление гибридизовали с зондом, смешанного с 10-кратным избытком немеченого зонда. Увеличенная площадь обозначается квадратной коробке. Представительства позитивные сигналы, показанные в фиолетовый, отмечены тонким стрелками. Толстые стрелки указывают налета биопленки за пределами ткани. Доска биопленки рассмотрены на 1,000X увеличения показаны на вставках. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 3
Рисунок 3. Обнаружение бактерий полости рта синантропных внутри десневой ткани мыши. Экспериментальный периодонтит индуцировали в линии BALB / C мышей при пероральном инокуляции P. gingivalis (PG) или применение DSS на слизистую оболочку десны. Десневого срезы мышей подвергали H & E окрашивания или гибридизация с любой < EM> Р. gingivalis -специфический зонд или зонд эубактерий. Представительства позитивные сигналы, показанные в фиолетовый, отмечены стрелками. Оригинальный увеличение является X400. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 4
Рисунок 4. Обнаружение бактерий в пределах рака поражения. Разделы легких биопсии у пациентов с диагнозом плоскоклеточный рак окрашивали H & E или в месте гибридизованной либо универсального эубактериального зонда или отрицательного контрольного датчика. Увеличенная площадь обозначается квадратной коробке. Представительства позитивные сигналы, показанные в фиолетовый, отмечены стрелками. Граница опухолевых клеток, обозначены пунктирными линиями.Arget = "_ пустое"> Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Рисунок 5
Рисунок 5. Обнаружение бактерий в пределах поражений полости рта красном плоском лишае. Разделы биопсии из слизистой оболочки щеки диагноз как устные красный плоский лишай окрашивали H & E или в месте гибридизованной либо универсального эубактериального зонда или отрицательного контрольного датчика. Увеличенной площади указаны с квадратной коробке. Представительства позитивные сигналы, показанные в фиолетовый, отмечены стрелками. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Вот протокол локализовать бактерии внутри парафиновых срезах тканей с использованием DIG-меченой ДНК, был описан. Зонд цели ДНК или РНК молекулы бактериального гена 16S рРНК и 16S-рРНК-нацеленные зонды могут быть выполнены в виде либо конкретных видов или универсальное. Специфической гибридизации с P. gingivalis Определённые зонд P. gingivalis, но не в других бактерий полости рта Ранее было показано, 10. В противоположность этому, эубактерий зонд гибридизуют всех испытанных бактериальных геномной ДНК (17 разновидностей), хотя эффективность гибридизации варьировать 12. Количество Т-нуклеотидов внутри зонда определяет эффективность DIG-маркировки. Изготовление DIG-меченым зондом с высокой чувствительностью является наиболее важным шагом для успешной реализации описанного протокола. Лечение образцов с соляной кислотой улучшает отношение сигнал-шум по добыче белков и частичной hydrolysiх последовательностей-мишеней. Увеличение концентрации протеиназы К увеличивает целевую доступности зондов, но снижает сохранение тканей. Поэтому, рекомендуется, чтобы проверить несколько концентрации протеиназы К, в зависимости от типов ткани. Стадию ацетилирования уменьшается фон связывания отрицательно заряженного зонда к белкам ткани ацетилирование положительно заряженных аминогрупп. После серии этих подготовительных шагов, секции ткани слезу легко, таким образом, должны быть обработаны с осторожностью. Фон является минимальным по сравнению с рыбой. Тем не менее, сигналы от тканей с высокой эндогенной активности щелочной фосфатазы, такие как кости и слизистые железы следует критически интерпретировать.

ПЦР-амплифицированные ДНК-зонды легко производить и стабильным по сравнению с РНК-зондов. Иммуногистохимический обнаружения гибридизированных зондов позволяет идентифицировать гистологических структур путем сравнения с Н & Е, окрашенных секциях: эпителии,соединительной ткани, воспалительные инфильтраты, и кровеносные сосуды хорошо различимы. Одно из ограничений описанного протокола является невозможность применить несколько зондов одновременно. Кроме того, исключение из сигналов от бактериальных загрязнений на поверхности секций ограничено.

Этот протокол может быть адаптирован для обнаружения других бактериальных транскриптов в срезах ткани 16. Кроме того, этот протокол может быть расширен, чтобы удвоить иммуногистохимического окрашивания обнаружения маркера клеток-хозяев.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Авторы не имеют ничего раскрывать.

Acknowledgments

Это исследование было поддержано грантом (2013R1A1A3005669) из Национального исследовательского фонда Кореи и гранта (HI13C0016) корейского технологий здравоохранения R & D проекта, Министерство здравоохранения и социального обеспечения.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Acetic anhydride Sigma 6404
50% Dextran sulfate solution Millipore S4030
50X Denhardt’s solution Sigma D2532
DEPC Sigma P159220
DIG DNA labeling and detection kit Roche 11 093 657 910
Formamide Sigma F9037
ImmEdge™ Pen Dako H-400
Levamisole Vector SP-5000
Magnesium chloride Sigma 246964
Maleic acid Sigma M0375
Methyl green Sigma M6776
Paraformaldehyde Sigma P1648
Permount Fisher SP15-500
Salmon sperm DNA solution Invitrogen #15632-011
Sodium chloride Sigma S9625
Sodium citrate Duksan D1420
Sodium dodecyl sulfate Amresco 227
Triethanolamine-HCl Sigma 90279
Tris-HCl Research organics 3098T

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Takarada, H., Cattoni, M., Sugimoto, A., Rose, G. G. Ultrastructural studies of human gingiva. II. The lower part of the pocket epithelium in chronic periodontitis. J. Periodontol. 45 (3), 155-169 (1974).
  2. Allenspach-Petrzilka, G. E., Guggenheim, B. Bacterial invasion of the periodontium; an important factor in the pathogenesis of periodontitis. J. Clin. Periodontol. 10 (6), 609-617 (1983).
  3. Saglie, F. R., et al. The presence of bacteria in the oral epithelium in periodontal disease. II. Immunohistochemical identification of bacteria. J. Periodontol. 57 (8), 492-500 (1986).
  4. Christersson, L. A., Albini, B., Zambon, J. J., Wikesjö, U. M., Genco, R. J. Tissue localization of Actinobacillus actinomycetemcomitans. in human periodontitis. I. Light, immunofluorescence and electron microscopic studies. J. Periodontol. 58 (8), 529-539 (1987).
  5. Saglie, F. R., Pertuiset, J., Rezende, M. T., Nestor, M., Marfany, A., Cheng, J. In situ. correlative immuno-identification of mononuclear infiltrates and invasive bacteria in diseased gingiva. J. Periodontol. 59 (10), 688-696 (1988).
  6. Rautemaa, R., et al. Intracellular localization of Porphyromonas gingivalis. thiol proteinase in periodontal tissues of chronic periodontitis patients. Oral Dis. 10 (5), 298-305 (2004).
  7. Marttila, E., et al. Intracellular localization of Treponema denticola. chymotrypsin-like proteinase in chronic periodontitis. J. Oral Microbiol. 6, (2014).
  8. Colombo, A. V., da Silva, C. M., Haffajee, A., Colombo, A. P. Identification of intracellular oral species within human crevicular epithelial cells from subjects with chronic periodontitis by fluorescence in situ. hybridization. J. Periodontal Res. 42 (3), 236-243 (2007).
  9. Abrams, K., Caton, J., Polson, A. Histologic comparisons of interproximal gingival tissues related to the presence or absence of bleeding. J. Periodontol. 55 (11), 629-632 (1984).
  10. Kim, Y. C., et al. Presence of Porphyromonas gingivalis. and plasma cell dominance in gingival tissues with periodontitis. Oral Dis. 16 (4), 375-381 (2010).
  11. Choi, Y. S., et al. Porphyromonas gingivalis. and dextran sodium sulfate induce periodontitis through the disruption of physical barriers. Eur. J. Inflammation. 10, 419-431 (2013).
  12. Choi, Y. S., Kim, Y. C., Ji, S., Choi, Y. Increased bacterial invasion and differential expression of tight junction proteins, growth factors, and growth factor receptors in periodontal lesions. J. Periodontol. 85 (8), e313-e322 (2014).
  13. Baker, G. C., Smith, J. J., Cowan, D. A. Review and re-analysis of domain-specific 16S primers. J. Microbiol. Methods. 55 (3), 541-555 (2003).
  14. Hajishengallis, G., et al. A Low-abundance biofilm species orchestrates inflammatory periodontal disease through the commensal microbiota and the complement. Cell Host Microbe. 10 (5), 497-506 (2011).
  15. Axon, A. Gastric cancer and Helicobacter pylori. Aliment. Pharmacol. Ther. 16 (suppl. 4), 83-88 (2002).
  16. Fenhalls, G., et al. In situ. detection of Mycobacterium tuberculosis transcripts in human lung granulomas reveals differential gene expression in necrotic lesions. Infect. Immun. 70 (11), 6330-6338 (2002).

Tags

Иммунологии выпуск 99 пародонтологии оральный микробиологии, 16S рРНК бактерии парафин тканей видовым универсальный
<em>В Ситу</em> обнаружения бактерий внутри парафин тканей с использованием дигоксина меченных ДНК зонд таргетинга 16S рРНК
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Choi, Y. S., Kim, Y. C., Baek, K.More

Choi, Y. S., Kim, Y. C., Baek, K. J., Choi, Y. In Situ Detection of Bacteria within Paraffin-embedded Tissues Using a Digoxin-labeled DNA Probe Targeting 16S rRNA. J. Vis. Exp. (99), e52836, doi:10.3791/52836 (2015).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter