1. Gram Staining
2. Staining capsule
3. Staining Endospore (méthode Schaeffer-Fulton)
Source: Rhiannon M. LeVeque1, Natalia Martin1, Andrew J. Van Alst1, et Victor J. DiRita1
1 Department of Microbiology and Molecular Genetics, Michigan State University, East Lansing, Michigan, États-Unis d'Amérique
Les bactéries sont diverses micro-organismes que l'on trouve presque partout sur Terre. De nombreuses propriétés aident à les distinguer les unes des autres, y compris, mais sans s'y limiter, le type, la forme et l'arrangement de Gram, la production de capsules et la formation de spores. Pour observer ces propriétés, on peut utiliser la microscopie légère; cependant, certaines caractéristiques bactériennes (par exemple la taille, le manque de coloration et les propriétés réfractives) font qu'il est difficile de distinguer les bactéries uniquement avec un microscope léger (1, 2). La coloration des bactéries est nécessaire pour distinguer les types bactériens par microscopie légère. Les deux principaux types de microscopes légers sont simples et composés. La principale différence entre eux est le nombre de lentilles utilisées pour amplifier l'objet. Les microscopes simples (par exemple une loupe) n'ont qu'une lentille pour grossir un objet, tandis que les microscopes composés ont plusieurs lentilles pour améliorer le grossissement (figure 1). Les microscopes composés ont une lentille objective près de l'objet qui recueille la lumière pour créer une image de l'objet. Ceci est ensuite amplifié par l'oculaire (lentille oculaire) qui agrandit l'image. La combinaison de la lentille objective et de l'oculaire permet un grossissement plus élevé que l'utilisation d'une seule lentille. Typiquement, les microscopes composés ont plusieurs lentilles objectives de différents pouvoirs pour permettre un grossissement différent (1, 2). Ici, nous discuterons de la visualisation des bactéries avec des taches Gram, taches Capsule, et les taches Endospore.

Figure 1 : Microscope composé typique. Les parties les plus importantes du microscope sont étiquetées.
La tache Gram, développée en 1884 par le bactériologiste danois Hans Christian Gram (1), différencie les bactéries en fonction de la composition de la paroi cellulaire (1, 2, 3, 4). En bref, un frottis bactérien est placé sur une lame de microscope, puis fixé à la chaleur pour adhérer les cellules à la diapositive et les rendre plus facilement accepter des taches (1). L'échantillon fixé à la chaleur est taché de Violet de Cristal, transformant les cellules pourpres. La glissière est rincée avec une solution d'iode, qui fixe le Violet de Cristal à la paroi cellulaire, suivie d'un décoloreur (un alcool) pour laver toute violet de cristal non fixe. Dans la dernière étape, une contre-tache, Safranin, est ajoutée aux cellules de couleur rouge (figure 2). Les bactéries Gram-positives tachent le pourpre en raison de la couche épaisse de peptidoglycan qui n'est pas facilement pénétrée par le décoloreur ; Les bactéries Gram-négatives, avec leur couche peptidoglycan plus mince et leur teneur en lipides plus élevée, se décolorent avec le décolorant et sont contre-tachées en rouge lors de l'ajout de Safranin (figure 3). La coloration Gram est utilisée pour différencier les cellules en deux types (Gram-positif et Gram-négatif) et est également utile pour distinguer la forme cellulaire (sphères ou cocci, tiges, tiges courbes et spirales) et l'arrangement (cellules simples, paires, chaînes, groupes et clusters) (1, 3) .

Figure 2 : Schéma du protocole de coloration de gram. La colonne de gauche montre comment les bactéries Gram-négatives réagissent à chaque étape du protocole. La colonne de droite montre comment les bactéries Gram-positives réagissent. On y voit également deux formes de cellules bactériennes typiques : les bacilles (ou tiges) et les cocci (ou sphères).

Figure 3 : Résultats de la coloration de Gram. Une tache de Gram d'un mélange de Staphylococcus aureus (Cocci pourpre Gram-positif) et Escherichia coli (gram-négatifs tiges rouges).
Certaines bactéries produisent une couche externe visqueuse extracellulaire appelée capsule (3, 5). Les capsules sont des structures protectrices avec diverses fonctions, y compris mais sans s'y limiter à l'adhérence aux surfaces et à d'autres bactéries, à la protection contre la dessiccation et à la protection contre la phagocytose. Les capsules sont généralement composées de polysaccharides contenant plus de 95 % d'eau, mais certaines peuvent contenir des polyalcools et des polyamines (5). En raison de leur composition la plupart du temps non-ionique et de la tendance à repousser des taches, les méthodes simples de coloration ne fonctionnent pas avec la capsule ; au lieu de cela, la coloration de capsule utilise une technique négative de coloration qui tache les cellules et l'arrière-plan, laissant la capsule comme halo clair autour des cellules (1, 3) (figure 4). La coloration de capsule implique le barbouillage d'un échantillon bactérien dans une tache acide sur une glissière de microscope. Contrairement à la coloration Gram, le frottis bactérien n'est pas fixé à la chaleur lors d'une tache capsule. La fixation de la chaleur peut perturber ou déshydrater la capsule, ce qui entraîne de faux négatifs (5). En outre, la fixation de la chaleur peut rétrécir les cellules résultant en une compensation autour de la cellule qui peut être confondue comme une capsule, conduisant à de faux positifs (3). La tache acide colore le fond de diapositive ; tout en faisant un suivi avec une tache de base, Crystal Violet, colore les cellules bactériennes elles-mêmes, laissant la capsule intacte et apparaissant comme un halo clair entre les cellules et le fond de diapositive (figure 5). Traditionnellement, l'encre de L'Inde a été utilisée comme tache acide parce que ces particules ne peuvent pas pénétrer dans la capsule. Par conséquent, ni la capsule ni la cellule n'est souillée par l'encre de l'Inde; au lieu de cela, l'arrière-plan est taché. Congo Rouge, Nigrosin, ou Eosin peut être utilisé à la place de l'encre de l'Inde. La coloration des capsules peut aider les médecins à diagnostiquer les infections bactériennes lorsqu'ils examinent les cultures à partir d'échantillons de patients et à orienter le traitement approprié des patients. Les maladies courantes causées par les bactéries encapsulées comprennent la pneumonie, la méningite et la salmonellose.

Figure 4 : Schéma du protocole de coloration des capsules. Le panneau supérieur affiche le frottis de diapositive avant toute application de tache. Le panneau du milieu montre comment la diapositive et les bactéries s'occupent de la tache primaire, Congo Red. Le panneau final montre comment la diapositive et les bactéries s'occupent de la contre-tache, Crystal Violet.

Figure 5 : Résultats de la coloration des capsules. Coloration capsule d'Acinetobacter baumannii encapsulé (dénoté avec des flèches noires) et d'Escherichia coli non encapsulé (dénoté avec des flèches blanches). Notez que l'arrière-plan est sombre et que les cellules A. baumannii sont tachées de pourpre. La capsule autour des cellules A. baumannii est évidente comme un halo, tandis que E. coli n'a pas de halo.
Dans des conditions défavorables (par exemple limitation des nutriments, températures extrêmes ou déshydratation), certaines bactéries produisent des endospores, des structures métaboliquement inactives qui résistent aux dommages physiques et chimiques (1, 2, 8, 9). Les endospores permettent à la bactérie de survivre à des conditions difficiles en protégeant le matériel génétique des cellules; une fois que les conditions sont favorables à la croissance, les spores germent et la croissance bactérienne continue. Les endospores sont difficiles à tacher avec des techniques de coloration standard parce qu'elles sont imperméables aux colorants généralement utilisés pour la coloration (1, 9). La technique couramment utilisée pour tacher les endospores est la méthode Schaeffer-Fulton (figure 6), qui utilise la tache primaire Malachite Green, une tache soluble dans l'eau qui se lie relativement faiblement au matériel cellulaire, et la chaleur, pour permettre à la tache de se briser à travers le cortex de la spore (figure 7). Ces étapes colorent les cellules de plus en plus (appelées cellules végétatives dans le contexte de la biologie de l'endospore), ainsi que les endospores et les spores libres (celles qui ne se trouvent plus dans l'ancienne enveloppe cellulaire). Les cellules végétatives sont lavées à l'eau pour enlever Malachite Green; les endospores conservent la tache due au chauffage du vert de Malachite dans la spore. Enfin, les cellules végétatives sont contre-tachées avec Safranin pour visualiser (figure 8). La coloration des endospores aide à différencier les bactéries en anciens spores et en anciens non-spore, ainsi qu'à déterminer si les spores sont présentes dans un échantillon qui, s'il est présent, pourrait entraîner une contamination bactérienne lors de la germination.

Figure 6 : Schéma du Protocole de coloration endospore. La colonne de gauche montre comment les bactéries formant des spores réagissent à chaque étape du protocole. La colonne de droite montre comment les bactéries qui ne forment pas les spores réagissent.

Figure 7 : Diagramme de la structure d'Endospore. Cellule bactérienne contenant un endospore avec les diverses structures de spores étiquetées.

Figure 8 : Résultats de la coloration des endospores. Une coloration typique des endospores de Bacillus subtilis. Les cellules végétatives (démarquées par les flèches blanches) sont tachées de rouge, tandis que les endospores (dénotées avec les flèches noires) sont teintées de vert.
1. Gram Staining
2. Staining capsule
3. Staining Endospore (méthode Schaeffer-Fulton)
Les bactéries sont des organismes vivants microscopiques qui ont de nombreuses caractéristiques distinctives telles que la forme, la disposition des cellules, la production ou non de capsules et la formation de spores. Ces caractéristiques peuvent toutes être visualisées par coloration et aident à l’identification et à la classification de différentes espèces bactériennes.
Pour examiner les deux premières caractéristiques de la forme et de l’arrangement des cellules, nous pouvons utiliser une technique simple appelée coloration de Gram. Ici, le violet cristallin est appliqué sur des bactéries, qui ont été fixées thermiquement sur une lame. Ensuite, la solution d’iode de Gram est ajoutée à la lame, ce qui entraîne la formation d’un complexe insoluble entre le violet cristallin et la solution d’iode de Gram. Un décolorant est ensuite appliqué et toute bactérie avec une épaisse couche de peptidoglycane se tachera en violet, car cette couche n’est pas facilement pénétrée par le décolorant. Ces bactéries sont appelées Gram positif.
Les bactéries à Gram négatif ont une couche de peptidoglycane plus mince et décolorent le décolorant, perdant la couleur violette. Cependant, ils se colorent en rose rougeâtre lorsqu’une contre-coloration à la safranine est ajoutée, qui se lie à une couche de lipopolysaccharides à l’extérieur. Une fois colorées, la morphologie, la taille et l’arrangement des cellules peuvent être observées, par exemple en chaînes ou en grappes, ce qui facilite davantage la classification et l’identification.
Une autre technique utile dans la boîte à outils du microbiologiste est la coloration des capsules, utilisée pour visualiser les capsules externes qui entourent certains types de cellules bactériennes. En raison de la composition non ionique de la capsule et de sa tendance à repousser les taches, des méthodes de coloration simples ne fonctionneront pas. Au lieu de cela, une technique de coloration négative est utilisée, qui colore d’abord le fond avec un colorant acide, tel que le rouge Congo, avant que les cellules bactériennes ne soient colorées avec du violet cristallin. Cela laisse toute capsule présente sous la forme d’un halo clair autour des cellules.
La dernière technique de coloration majeure abordée ici peut aider à déterminer si les bactéries étudiées forment des spores. Dans des conditions défavorables, certaines bactéries produisent des endospores, des structures dormantes, dures et non reproductrices dont la fonction principale est d’assurer la survie des bactéries pendant les périodes de stress environnemental, comme les températures extrêmes ou la déshydratation. Cependant, toutes les espèces bactériennes ne fabriquent pas d’endospores, et elles sont difficiles à colorer avec des techniques standard car elles sont imperméables à de nombreux colorants. La méthode Schaeffer-Fulton utilise une coloration verte à la malachite, qui est appliquée sur les bactéries fixées sur une lame. La lame est ensuite lavée à l’eau avant d’être contre-teintée avec de la safranine. Les cellules végétatives apparaîtront rouge rosâtre, tandis que les endospores présentes apparaîtront vertes. Dans cette vidéo, vous apprendrez à effectuer ces techniques courantes de coloration bactérienne, puis à examiner les échantillons de coloration à l’aide de la microscopie optique.
Pour commencer la procédure, attachez les cheveux longs et mettez l’équipement de protection individuelle approprié, y compris une blouse de laboratoire et des gants.
Ensuite, nettoyez une lame de microscope fraîche avec une lingette de laboratoire. Ensuite, pipetez 10 microlitres de solution saline tamponnée au phosphate 1X sur la première lame. Ensuite, à l’aide d’une pointe de pipette stérile, sélectionnez une seule colonie bactérienne dans la plaque de gélose LB. Étalez la colonie bactérienne dans le liquide pour produire une couche mince et uniforme. Placez la glissière sur la paillasse et laissez-la sécher complètement à l’air.
Une fois séché, allumez un bec Bunsen pour fixer thermiquement les bactéries. À l’aide de pinces, passez la lame plusieurs fois dans la flamme du brûleur, côté bactérie vers le haut, en prenant soin de ne pas maintenir la lame trop longtemps dans la flamme, ce qui pourrait déformer les cellules.
Maintenant, en travaillant au-dessus de l’évier, tenez le niveau de la diapositive et appliquez plusieurs gouttes de violet de cristal de Gram pour couvrir complètement la tache bactérienne, puis placez la diapositive sur le banc pour qu’elle repose pendant 45 secondes. Ensuite, tenez la lame en biais et versez doucement un jet d’eau sur le dessus de la lame, en prenant soin de ne pas projeter directement la tache bactérienne. Maintenant, en maintenant à nouveau le niveau de la lame, appliquez la solution d’iode de Gram pour couvrir complètement les bactéries tachées, puis laissez-la reposer pendant 45 secondes supplémentaires. Ensuite, rincez soigneusement l’iode de la lame, comme indiqué précédemment. Tout en tenant la lame en biais, ajoutez quelques gouttes de décolorant de Gram à la lame, en lui permettant de couler sur les bactéries tachées, jusqu’à ce que le ruissellement soit clair, pendant environ 5 secondes. Rincez immédiatement à l’eau comme indiqué précédemment. Cela limitera la décoloration excessive du frottis. Ensuite, en maintenant à nouveau le niveau de la diapositive, appliquez la contre-coloration à la safranine de Gram pour couvrir complètement les bactéries tachées. Après 45 secondes, rincez doucement le Safranin de la lame avec de l’eau, comme indiqué précédemment, puis séchez avec des serviettes en papier.
Enfin, ajoutez une goutte d’huile d’immersion directement sur la lame, puis examinez la lame à l’aide d’un microscope optique avec un objectif à huile 100X.
Pour commencer ce protocole de coloration, mettez d’abord l’équipement de protection individuelle approprié, puis assurez-vous que les lames de verre qui seront utilisées sont propres.
Ensuite, préparez les solutions. Pour préparer une solution de violet cristallin à 1 %, mélangez 0,25 gramme de poudre de violet cristallin avec 25 millilitres d’eau distillée et vortex jusqu’à dissolution. Ensuite, préparez une solution de rouge du Congo à 1 % en mélangeant 0,25 gramme de poudre de rouge du Congo avec 25 millilitres d’eau distillée et agitez jusqu’à dissolution. Maintenant, pipetez 10 microlitres de la solution rouge du Congo sur la lame. À l’aide d’une pointe de pipette propre et stérile, sélectionnez une seule colonie bactérienne dans la plaque de gélose LB. Ensuite, étalez la colonie bactérienne dans le colorant pour produire une couche mince et uniforme. Faites sécher complètement la lame bactérienne à l’air libre pendant 5 à 7 minutes. Une fois que la lame est sèche, inondez le frottis avec suffisamment de violet cristallin à 1 % pour couvrir le frottis et laissez-le reposer pendant 1 minute. Maintenant, tenez la lame en biais et versez doucement un jet d’eau sur le dessus de la lame, en prenant soin de ne pas gicler directement les bactéries. Continuez à tenir la lame à un angle de 45 degrés jusqu’à ce qu’elle soit complètement sèche à l’air. Enfin, ajoutez une goutte d’huile d’immersion directement sur la lame, puis examinez la lame à l’aide d’un microscope optique avec un objectif à huile 100X.
Pour effectuer la coloration de l’endospore, préparez d’abord une solution de vert de malachite à 0,5 % en mélangeant 0. 125 grammes de poudre verte de malachite avec 25 millilitres d’eau distillée, puis tourbillonnez la solution jusqu’à ce qu’elle soit dissoute. Ensuite, pipetez 10 microlitres de 1X PBS au centre de la lame. Ensuite, à l’aide d’une pointe de pipette stérile, sélectionnez une seule colonie bactérienne dans la plaque de gélose LB. Étalez les bactéries dans le liquide pour produire une couche mince et uniforme. Maintenant, placez la glissière sur la paillasse et laissez-la sécher complètement à l’air. Une fois séché, allumez un bec Bunsen pour fixer thermiquement les bactéries. Passez la diapositive plusieurs fois dans la flamme du brûleur bleu, avec le côté des bactéries vers le haut. Ensuite, une fois la diapositive refroidie, placez un morceau de papier prédécoupé sur le frottis fixé à chaud. Ensuite, allumez une plaque chauffante au réglage le plus élevé et portez un bécher d’eau à ébullition.
Saturez le papier de lentille avec la solution de vert de malachite et, à l’aide de pinces, placez la lame sur le bécher d’eau bouillante pour cuire à la vapeur pendant 5 minutes. Gardez le papier de l’objectif humide en ajoutant plus de colorant, une goutte à la fois, au besoin. Ensuite, toujours à l’aide de pinces, ramassez la lame du bécher et retirez et jetez le papier de l’objectif. Laissez la diapositive refroidir pendant 2 minutes. En travaillant au-dessus de l’évier, tenez le toboggan en biais et versez doucement un jet d’eau sur le dessus du toboggan. Maintenant, maintenez le niveau de la diapositive et appliquez du Safranin pour couvrir complètement la diapositive. Ensuite, laissez-le reposer pendant 1 minute. Ensuite, tenez la diapositive en biais et rincez comme indiqué précédemment. Laissez la diapositive sécher à l’air libre sur la paillasse. Enfin, ajoutez une goutte d’huile d’immersion directement sur la lame, puis examinez la lame avec un microscope optique, avec un objectif à huile 100X.
Dans le protocole de coloration de Gram, deux taches de couleurs différentes peuvent en résulter. La coloration violet foncé indique que les bactéries sont à Gram positif et qu’elles ont conservé la tache violette cristalline. En revanche, la coloration rose rougeâtre est une caractéristique des bactéries à Gram négatif, qui seront plutôt colorées par la contre-coloration à la safranine. De plus, différentes formes et arrangements de bactéries peuvent être visualisés après la coloration de Gram. Par exemple, il est possible de différencier les Cocci, ou bactéries rondes, des Bacillus en forme de bâtonnet, ou d’identifier les bactéries, qui forment des brins, par rapport à celles qui s’agrègent généralement en touffes ou se produisent individuellement.
Dans une image au microscope colorée par capsule, les cellules bactériennes seront généralement colorées en violet et le fond de la lame doit être coloré en noir. Sur ce fond sombre, les capsules de la bactérie, si elles sont présentes, apparaîtront comme un halo clair autour des cellules.
Enfin, dans la coloration des endospores, les cellules végétatives seront colorées en rouge par la contre-coloration de la safranine. Si des endospores sont présentes dans l’échantillon, celles-ci conserveront la coloration vert malachite et apparaîtront de couleur vert bleuâtre.
Les bactéries ont des caractéristiques distinctives qui peuvent faciliter leur identification. Certaines de ces caractéristiques peuvent être observées par la coloration et la microscopie légère. Trois techniques de coloration utiles pour observer ces caractéristiques sont Gram coloration, coloration Capsule, et Endospore coloration. Chaque technique identifie différentes caractéristiques des bactéries et peut être utilisée pour aider les médecins à recommander des traitements pour les patients, à identifier les contamin...
Chapters in this video
0:01
Concepts
3:12
Gram Staining
5:48
Capsule Staining
7:31
Endospore Staining - Schaeffer-Fulton Method
9:48
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