Optimisation des protéines synthétiques: Identification des dépendances interposition indicatrice constructivement et / ou les résidus fonctionnellement liées

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14 juillet 2015

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Les séquences de protéines synthétiques basées sur des motifs consensus ignorent généralement les résidus co-évolutifs, qui impliquent des dépendances interpositionnelles (IPD). Les IPD peuvent être essentiels à l’activité, et les conceptions qui ne les tiennent pas compte peuvent entraîner des résultats sous-optimaux. Ce protocole utilise StickWRLD pour identifier les IPD et aider à éclairer la conception rationnelle des protéines, ce qui se traduit par des résultats plus efficaces.

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Alignement de protéines

Chapters in this video

0:05

Titre

1:37

Téléchargement et installation du logiciel et préparation de l'alignement

2:52

Lancement et utilisation de StickWRLD

4:37

Recherche, sélection et enregistrement des dépendances interpositionnelles (IPD)

5:52

Résultats : Visualisation par StickWRLD du domaine couvercle de la protéine adénylate kinase

6:41

Conclusion

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