מאמר שיטה

דור, טיהור, ואפיון של מיני חלבון DISC1 הסלולריים פולשניים

15.6K צפיות

⸱

DOI:

10.3791/4132

⸱

30 באוגוסט 2012

 ,  ,  ,  , 
1Department of Neuropathology, Medical School Düsseldorf, Germany, 2Center of Behavioral Neuroscience, University of Düsseldorf

במאמר זה

סיכום

פלישת הדור, טיהור ותא של aggresomes התאי, cytoplasmic אורך המלא DISC1 חלבון מתרביות תאים ומתויג בר, multimeric רקומביננטי DISC1 חלבון א coli מתוארים. הפולשנות סלולרית מוצגת לתאי נמען בתרבית תאים ונוירונים In vivo לאחר חיסון המוח stereotactical.

תקציר

צבירת חלבון נתפסה כסימן היכר כללי של תנאי מוח כרוניים, ניווניות כמו, למשל, במחלות ניווניות מחלת אלצהיימר (Aβ, טאו), מחלת פרקינסון (α-סינוקלאין), מחלת הנטינגטון (polyglutamine, huntingtin), ואחרים. צבירת חלבון היא חשבה להתרחש עקב proteostasis המופרע, כלומר חוסר האיזון בין נובע ופירוק חלבוני misfolded. מן ראוי לציין כי את אותם החלבונים נמצאים מצטברים בצורות ספורדיות של מחלות אלו שמוטציה בגרסות נדירות של צורות משפחתיות.

סכיזופרניה היא מחלה כרונית פרוגרסיבית מוח שבמקרים רבים הולכים יחד עם גירעון הקוגניטיבי קבוע ובלתי הפיך. בגישת גן מועמד, אנחנו בדקנו אם 1 שבשנו ב-סכיזופרניה (DISC1), גן משובט במשפחה סקוטית עם הצמדה למחלה כרונית נפשית 1, 2, יכולה להימצא כאגרגטים מסיסים בbrain של מקרים ספוראדיים של סכיזופרניה 3. שימוש CC SMRI, זיהה בכ 20% ממקרים עם CMD אבל לא ביקורת רגילה או חולים עם מחלות ניווניות immunoreactivity DISC1 sarkosyl מסיס לאחר החלוקה ביוכימי. מחקרים מאוחרים יותר במבחנה גילו כי נטיית הצבירה של DISC1 הושפעה פולימורפיזם מחלה הקשורה S704C 4, ושDISC1 aggresomes שנוצר במבחנה היו תא פולשנית 5, בדומה למה שכבר הוכח לAβ 6, 7-9 טאו, α סינוקלאין-10, 11 polyglutamine, או SOD1 אגרגטים 12. ממצאים אלה הניעו אותנו להציע שלפחות משנה של מקרים עם CMD, אלה עם DISC1 המצטבר עלולים להיות הפרעות חלבון קונפורמציה.

כאן אנו מתארים כיצד אנו יוצרים DISC1 aggresomes בתאי יונקים, לטהר אותם בשיפוע סוכרוז ולהשתמש בם לStudi תא הפולשנותes. כמו כן, אנו מתארים כיצד אנחנו מייצרים C-מסוף DISC1 בר, תווית באופן בלעדי multimeric ולטהר אותו ללימודי הפולשנות סלולרית. שימוש בmultimers רקומביננטי של DISC1 להשיג הפולשנות תא דומה כמו לבר סינטטי שכותרת דומה α-סינוקלאין. אנו גם מראים שקטע זה נלקח בvivo כאשר מזריקים stereotactically לתוך המוח של בעלי חיים מושתלים.

פרוטוקול

1. הכנת תאי תורם Aggresome: Transfection של אורך (eGFP)-תויג אנושי מלא (פלורידה) DISC1 חלבון monomeric האדום פלורסנט (mRFP) או חלבון פלואורסצנטי ירוק משופר

  1. זרעי 1.5 x 10 6/10 סנטימטרי צלחת אדם נוירובלסטומה NLF (NLF; בית החולים לילדים של פילדלפיה, פילדלפיה, פנסילבניה) תאים ב10 סנטימטר 10 מנות ולגדול בין הלילה. תאי NLF מתורבתים ב- 1640 RPMI בינוני בתוספת 10% FBS, פניצילין / Strepomycin, L-גלוטמין. למחרת, תאים צריכים להיות ב70-80% confluency.
  2. Transiently transfect כל צלחת 10 סנטימטרים עם 15 מיקרוגרם DNA פלסמיד ומגיב transfection Metafectene (Biontex, Martinsried, גרמניה). בקיצור, למנה בסנטימטר 10, דנ"א 15 מיקרוגרם פלסמיד וMetafectene μl 30 נוספו 750 μl Opti-MEM, מעורבים והודגרו ב RT במשך 20 דקות. 5 מנות היו transfected עם pcDNA3.1 mRFP / eGFP מתויגת-אדם (פלורידה) וDISC1 5 מנות עם eGFP-פלסמיד לבד.

2. Aggresomeטיהור מתורם בתאי transfected

הפרוטוקול המתואר כאן הוא שילוב של שיטה לטהר Lewy-גופים מרקמת המוח 13 ופרוטוקול לבודד אגרגטים וaggresomes 14 גדולים. מאחר שכבר קיימות שיטות המבוססות על השימוש בחומרי ניקוי, הבידוד של חלבון אבקה נטולה ליישום במבחני תא הפולשנות הוא קריטי.

  1. 48 שעות לאחר transfection, לעקוב אחר הביטוי של eGFP וmRFP/eGFP-DISC1 ולאשר את הקמתה של aggresomes תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי (איור 1).
  2. לשטוף את התאים עם PBS pH 7.4, לגרד עם 400 PBS μl כל, להוסיף קוקטייל מעכב פרוטאז 1X (רוש, אינדיאנפוליס, אינדיאנה) ולשבש את התאים באמצעות Precellys24 homogenizer (טכנולוגיות רטין, צרפת). בקצרה, להוסיף השעית תא 1 מ"ל לצינור 2 מיליליטר תמוגה ולהוסיף 10 חרוזי קרמיקה. Lyse התאים עם 3 60 פולסים x שניות. הכח המכאני של התהליך עלוללהגדיל את הטמפרטורה בתוך המדגם מעל 37 מעלות צלזיוס ולכן יש להקפיד לצנן את המדגם על קרח לאחר הליך תמוגה.
  3. לקרר את התאים על קרח ולהוסיף 10 mM MgCl 2, 40 U / ml DNase ודגירה במשך 60 דקות על 37 מעלות צלזיוס
  4. הכן את פתרונות של 80%, 50%, 20% סוכרוז (w / v) בחומציות PBS 7.4 (10 מ"ל כל אחד).
  5. הכן את שיפוע סוכרוז בצינור 15 מ"ל בז, החל המ"ל סוכרוז 2 80%, ואחריו 50% ו 20%. יוצק את השיפוע לאט ולהיזהר לא להפריע לשכבות כבר זרמו. שכבת lysate מתעכל על גבי השיפוע וצנטריפוגה במשך 15 דקות ב 1000 XG ב 4 ° C.
  6. זהירות לאסוף שלבי ביניים בין 50-80% סוכרוז השכבה עם פיפטה ולערבב עם 5 כרכים של PBS pH 7.4. צנטריפוגה במשך 15 דקות ב 1000 XG ב 4 ° C. חזור על שטיפת פעמים נוספות. בinterphase זה, aggresomes הוא ניאון ויכול להיות חזותי במיקרוסקופ תחת אור UV.
  7. בטל supernatant וresuspend גלול ב pH PBS μl 250-500 7.4. גלולה זו מכילה מטוהרי aggresomes (איור 2).

3. טיפול בתאי נמען SH-SY5Y עם mRFP/eGFP-DISC1 Aggresomes

  1. זרעים 5 x 10 4 תאי neuroblastoma אדם SH-SY5Y נמען constitutively להביע GFP-DISC1 (598-854) בcoverslips זכוכית סטריליים בכל היטב של צלחת גם 24. תא SH-SY5Y מתורבת בDMEM/F-12 בינוני בתוספת חומצות פניצילין / סטרפטומיצין, שאינן חיוניות אמינו (NEAA) ו10% FBS.
  2. 24 שעות מאוחר יותר, להוסיף 10 μl לכל באר ודגירה במשך 48-72 שעות.
  3. לשטוף את תאי 3 X עם PBS pH 7.4 ולהרוות פלואורסצנטי התאי עם 0.04% Trypan הכחול למשך 5 דקות.
  4. לתקן את התאים עם 4% PFA ב PBS pH 7.4 למשך 10 דקות על קרח, לשטוף פעם אחת עם H 2 O סטרילית ולעגן את coverslips על שקופיות זכוכית עם להאריך את הזהב עם DAPI הרכבה בינונית (Invitrogen, ארה"ב).
  5. לאשר את הספיגה /פלישה לaggresomes מיושם exogenously ידי colocalization עם חלבונים שגויסו לידי ביטוי על ידי תאי נמען בתמונות Z-מחסנית.

עם זאת, ספיגה / פלישה של חלבון אקסוגני אולי לא במהות להתגלות במקביל לגיוס של חלבון תא מארח. בדוגמא שלנו mRFP-תויג DISC1 aggresomes לגייס מסיס GFP-tagged DISC1 (598-854) חלבון מתבטא בתא המארח (ראה איור 3). תמונות צולמו על Zeiss LSM 510 confocal או מיקרוסקופ Zeiss AxioVision Apotome2.

4. הדור של DISC1 רקומביננטי (598-785)

בפרסום קודם נתחנו את היכולת של DISC1 ברי חלבונים שונים לאינטראקציה עצמית מבוסס על הנוכחות של דומיינים עמותה עצמית. בין כל החלבון שברי אדם נבדק DISC1 (598-785) מוצג נטיית multimerization החזקה 4 (איור 4). לכן, האדם DISC1 (598-785) שוכפל לpET15b (איןאגן ונמצא במדיסון, ויסקונסין) המכיל N-מסוף תג 6-היסטידין, המתבטא בE. coli-BL21 (lDE3) רוזטה (Novagen, ארה"ב), ומטוהר בתנאי denaturing באוריאת 8 mol / L כמתואר 4. בקיצור, הפרוטוקול מפורט להלן.

  1. BL21-(IDE3) רוזטה E. coli גודל ב2 x 500 מיליליטר 2YT המכיל עד 5 מ"מ ארגינין-HCl, 5mm MGSO4, 100 מיקרוגרם / המ"ל carbencillin, 35 מיקרוגרם / המ"ל chloramphenicol לOD 600: 0.6-0.8 וDISC1 (598-785) הביטוי היה מושרה עם IPTG 1 מ"מ.
  2. DISC1 (598-785) בא לידי הביטוי במשך 4 שעות על 37 מעלות צלזיוס, הביטוי הופסק על ידי איסוף את החיידקים על ידי צנטריפוגה.
  3. גלולת החיידקים הייתה resuspended ב50 מ"ל TE חיץ (50 mM TRIS-HCl pH 8.0, 5 המ"מ EDTA) בתוספת המ"מ PMSF 2, 1% TX-100, 250 מיקרוגרם / המ"ל Lysozyme, 20 מ"מ U/50 מיליליטר MgCl 2 ו 400 DNase I. כדי להבטיח תמוגה מלאה, תגובת הודגר למשך 30 דקות ב RT עם ערבוב עדין.
  4. הוסף 10 mM β-mercaptoethanol (ME) ו500 המ"מ NaCl ודגירה במשך 30 דקות נוספות.
  5. ספין למטה גופי הכללת חיידקים ב20.000 גרמו למשך 30 דקות ב 4 ° C.
  6. Resuspend גלולה בחיץ חילוץ מ"ל המכיל 50 טריס pH 50mm 8.0, המ"מ imidazole 5, mM NaCl 500, אוריאה וז 8 מ"מ 10 β-ME ולהסיר שאריות ידי צנטריפוגה ב20.000 גרמו למשך 30 דקות ב 4 ° C.
  7. שטוף Ni-נ.ת. ע agarose המטריצה ​​עם חיץ חילוץ. דגירת תמצית resuspended, precleared חלבון עם Ni-נ.ת. ע למטריצת 2 שעות בRT.
  8. שטוף Ni-נ.ת. ע המטריצה ​​עם חיץ מיצוי המכיל 12 המ"מ imidazole.
  9. Elute החלבון לאט עם חיץ elution מ"ל 15 המכיל 50 המ"מ טריס, 500 mM NaCl, 300 המ"מ imidazole, ז 8 אוריאה, 1 המ"מ PMSF, mM EDTA 5 ו 10 מ"מימ β-ME.
  10. דיאליזת חלבון השלבים לPBS pH 7.4 המכיל 10 מ"מ β-ME.

מתרבות 1 ליטר חיידקים מתחילים זה אפשרי לבודד עד 50 מ"ג של DISC1 רקומביננטי (598-785) protעין.

refolding α-סינוקלאין

לניסויים עם α-סינוקלאין, 500 מיקרוגרם של חלבון רקומביננטי (סיגמה אולדריץ, ארה"ב) התפרקו ב PBS בריכוז של 1 מ"ג / מ"ל. כדי להשיג oligomers, מקפל בוצע לילה על 37 מעלות צלזיוס כפי שתואר בפרסום קודם 10.

5. תיוג של DISC1 רקומביננטי (598-785) עם DyLight594

  1. לפני התהליך עוקב התיוג, DISC1 (598-785) החלבון להשתחרר מβ-ME. לכן, חלבון הדיאליזה 3 פעמים לPBS pH 7.4 בדילול של 1:2,000.
  2. תווית 1 מ"ג DISC1 (598-785) עם DyLight 594 maleimide (Thermo Scientific, ארה"ב) על פי הוראות היצרן. בקיצור, לפזר 1 מ"ג / מיליליטר חלבון ב PBS pH 7.4 ולהוסיף TCEP 5 מ"מ להתאושש קבוצות thiol בחינם. הוסף 20 μl של צבע DMF המומס לתגובה והדגירה במשך 2 שעות בRT.
  3. דיאליזת 3 x החלבון לPBS pH7.4 בכל יחס של 1:2000 ל2 שעות כל אחד.

כדי להגביר עוד יותר את הטוהר של החלבון שכותרתו 6-תויג זיקה לטיהור מבוססת על עמודת Ni-נ.ת. ע מתבצעת.

  1. שטוף 1 המ"ל Ni-נ.ת. ע מטריצה ​​(Qiagen, גרמניה) עם 10 המ"ל PBS pH 7.4.
  2. החל החלבון המסומן, הדיאליזה לעמודה ולתת לו לרוץ על העמודה לאט.
  3. שטוף את החלבון עם רמת חומציות 3 x 20 מיליליטר PBS 7.4
  4. Elute חלבון עם PBS pH 7.4, 500 mM imidazole dropwise תוך ניטור הלהקה הצבעונית על עמודת Ni-נ.ת. ע להפחתת נפח eluate.
  5. דיאליזת 3 X eluate עד 10 מ"מימ NaPi pH 7.4 בדילול של 1:2000 ל2 שעות כל אחד.
  6. השתמש במזרק מיקרומטר סטרילי 0.45 מסנן כדי לסנן eluate, aliquot ב5 100 דגימות x μl והקפאת צמד בחנקן נוזלי. הסכום הכולל של חלבון צריך להיות 0.5 - מיקרוגרם 1 / מ"ל ​​בכל aliquot μl 100.

concentr האופציונליצעד ation

  1. לחולדות זריקות stereotactical, החלבון היה מרוכז 10-לקפל ב( מרוכז אפנדורף 5301) מהירות-VAC. מצב החיץ הסופי היה NaPi mM 100.

תיוג α-סינוקלאין

התיוג והטיהור (עמודת Ni-נ.ת. ע) של רקומביננטי α-סינוקלאין בוצע במקביל לDISC1 (598-785). סך הכל החומר ההתחלתי היה 500 מיקרוגרם במקום 1 מ"ג לDISC1 (598-785).

6. טיפול בתאי נמען SH-SY5Y עם DISC1 רקומביננטי שכותרתו (598-785) חלבון

  1. 5x10 4 תאי זרע נמען SH-SY5Y אדם neuroblastoma constitutively להביע GFP-DISC1 (598-854) בcoverslips זכוכית סטריליים בכל היטב של צלחת גם 24.
  2. הוסף חלבון מסומן למדיום תרבית התאים בריכוז של מיקרוגרם / מ"ל ​​5-10 ודגירה במשך 48-72 שעות.
  3. לשטוף את תאי 3 X עם PBS pH 7.4 ולהרוות extracפלואורסצנטי ellular עם 0.04% Trypan כחול למשך 5 דקות.
  4. לתקן את התאים עם 4% PFA ב PBS pH 7.4 למשך 10 דקות על קרח, לשטוף פעם אחת עם H 2 O סטרילית ולעגן את coverslips על שקופיות זכוכית עם להאריך את הזהב עם DAPI הרכבה בינונית (Invitrogen, ארה"ב).
  5. לאשר את הספיגה / פלישה לexogenously מיושמת חלבון רקומביננטי ידי colocalization עם חלבונים שגויסו לידי ביטוי על ידי תאי נמען בתמונות Z-מחסנית שנוצרו על ידי סריקת הליזר מיקרוסקופ confocal. עם זאת, גיוס של חלבון אנדוגני אולי לא במהות להתגלות במקביל לפלישה של חלבון תא מארח, תמונות Z-מחסנית יכולות עדיין לאשר את האופי הפולשני של החלבון.

בדוגמא שלנו rec. DISC1 (598-785) * לפחות בחלק מגויסים המסיסים GFP-tagged DISC1 (598-854) חלבון מתבטא בתא המארח (ראה 5 איור). לרקומביננטי פלישת α-סינוקלאין אבל אין גיוס מוצג (5B איור). תמונות צולמובZeiss LSM 510 confocal או מיקרוסקופ Apotome2 Zeiss AxioVision.

ההזרקה המרוכזת (4 μl בקירוב של 2.5 מיקרוגרם / μl), שכותרתו DISC1 (598-785) * לתוצאות mPFC בהפצה של החלבון סביב מקום הזריקה שיכול להתגלות גם לאחר טפטוף של בעלי החיים עם 4% PFA ב PBS pH 7.4 עם filterset rhodamine. בדוגמא שלנו DISC1 (598-785) הוא נלקח על ידי מספר ייחודי של תאי עצב ויכול להיות פיקוח עם Z-מחסנית הדמיה (איור 6).

באופן כללי, ההזרקה של חלבונים אחרים ולאחר מכן את אלה המשמשים כאן לא בהכרח תוביל לתא פלישה. אירוע הפלישה הוא למעשה תלוי באופי של החלבון, בכל זאת טיהור נקיה היא תנאי הכרחי לניתוח נוסף.

7. נציג תוצאות

Aggresomes מורכב רקומביננטי פלורידה DISC1-eGFP מטוהרים מתאי NLF פלש הנמען SH-SY5Y ceLLS ביעילות נמוכה (כ 0.3% 5) כפי שניתן לראות על ידי colocalization עם מיקרוסקופיה confocal (איור 3). כפי שדווח בעבר, DISC1 (598-785) הביע ומטוהר מE. coli נוצר multimers 4 היו שווה תא פולשנית ביעילות של כ 20% 5 (האיור 5A) דומים לזו של α-סינוקלאין ששמשה במקביל כביקורת חיובית (5B איור). DISC1 רקומביננטי שכותרתו (598-785) הביע ומטוהר מE. coli היה גם תא פולשנית לנוירונים in vivo כאשר חלבון multimeric הוזרק stereotactically לתוך קליפת מוח הקדם חזיתית המדיאלי של עכברוש (איור 6; pum, בדר, יוסטון, קורט, לא פורסם).

figure-protocol-1
איור 1. תאי neuroblastoma NLF transiently להביע FP-DISC1 (אדום). aggresomes ניאון אדום יכול להיות detected בתוך התאים.

figure-protocol-2
האיור 2. מטוהר mRFP-תויג DISC1 aggresomes לאחר הטיהור בשיפוע סוכרוז.

figure-protocol-3
איור 3. תמונה של פלורסנט aggresomes פלש. flDISC1 aggresomes mRFP מתויג-טוהר ודגר עם תאי neuroblastoma SH-SY5Y overexpressing מסיס GFP-tagged DISC1 (598-854). ספיגה של aggresomes כותרתו היא פיקוח על ידי הדמית Z-מחסנית במיקרוסקופ ליזר סריקה (Zeiss LSM 510).

figure-protocol-4
איור 4. SEC-פרופיל של rec. DISC1 (598-785) המכיל S704 וC704 פולימורפיזמים נוקלאוטיד יחידים (SNP). שני הגרסות להראות שיבוש oligomerization הורה והיווצרות mult משקל המולקולרי הגבוהimers (חץ אדום). תמונה זו היא שונה מפרסום Leliveld et al., ביוכימיה 2009.

figure-protocol-5
איור 5. תמונת Z-מחסנית של פלורסנט DISC1 פולשנית DyLight שכותרת רקומביננטי (598-785). תאי neuroblastoma SH-SY5Y להביע GFP-DISC1 המסיס (598-854) הודגרו עם הכותרת, רקומביננטי חלבון בריכוז של 5 מיקרוגרם / מ"ל. () אגרגטים אדומים מציגים את הפלישה של rec. DISC1 חלבון (598-785) ונקודות צהובות עולים גיוס של ה-GFP-DISC1 המסיס (598-854) לאגרגטים. (ב) רקומביננטי α-סינוקלאין (אדום) פולש לתאים מבלי גיוס בתדירות של כ 20%. לחץ כאן לצפייה בדמות גדולה.

figure-protocol-6
איור 6. תמונה של Immunofluorescent, DISC1 הזריק כותרת רקומביננטי (598-785) החלבון. הדמית Z-מחסנית מאשרת את קיומו של rec. DISC1 (598-785) חלבונים בנוירונים בקליפת מוח חולדה מוכתמת עם נוגדן נגד גרעין עצבי (NeuN, ירוק).

דיון

במחקר זה אנו מתארים טיהור mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes מקו transfected נוירובלסטומה תא, ההכנה ותיוג של DISC1 מיני חלבון רקומביננטי והיישום שלהם בניסויי תא פלישה של תאי נמען במבחנת in vivo.

טיהור mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes ילידים פותחה מתוך פרוטוקולים לבודד מבנים לוי גוף דמויים ואגרגטים גדולים 13, 14, אבל שונה כדי להימנע מהשימוש בחומרי ניקוי וכדי למזער את הסיכון של תא פלישה חיובית כוזב שעלולה להתרחש עקב חדירת חומר ניקוי קרום הקל.

שיפור עתיד אפשרי אחד יכול להיות בהמשך להגדיל את הטוהר של aggresomes ידי sonication ללחלוטין קרומים שנותרו נפרדים וcytoskeleton מaggresomes. על ידי טוהר כולל גובר, מספר אירועי פלישה כלל שנרשם לaggresomes ma גדולy להיות מוגבר 5. אם בהגדרה המצומצמת של סוכרוז הציע 3-השלב די לaggresomes של מיני חלבון אחרים יש להיבדק, במובן זה הפרוטוקול המתואר כאן צריך להיחשב כנקודה מוצאת לקידום פרט. את aggresomes המטוהר הוכיח להיות די חזק בידות שלנו, שלבי כביסה נוספים (ללא חומרי ניקוי) לחסל את העקבות של סוכרוז לא להפחית באופן משמעותי את התשואה הכוללת.

בפרסום קודם שתארנו שהרכבת oligomer של DISC1 תלויה בתחומי multimerization נפרדים בתחנה הסופית של C-4 (איור 4). בחרנו קטע זה לביטוי רקומביננטי המסיס בE. coli ושלאחר מכן וטיהור Ni-נ.ת. ע. כדי לפקח multimerization ולהשוות את הפולשנות התא שלה עם חלבון תאר תא פולשנית כמו α-סינוקלאין, אנחנו מתויגים DISC1 (598-785) עם צבע פלואורסצנטי DyLight594, ולעומתהתא הפולשנות עם זה של תווית באופן שווה α-סינוקלאין. תא הפולשנות של DISC1 בר רקומביננטי הייתה גדל באופן דרמטי בהשוואה לזה של ילידי אורך מלא DISC1 aggresomes, כנראה עקב גודל קטן יותר וטוהר גבוה בהרבה. שוב, טוהר נראה לשחק תפקיד מכריע בתא הפולשנות.

בדוגמא שלנו את aggresomes פולשניים גייס חלבון מסיס homologue של קו תא היעד שהתבטא recombinantly בצורה מסיסה, כלומר תא מפוזר-. הביטוי של חלבון פלואורסצנטי (למשל GFP או RFP) בשורת תאי הנמען הוא יתרון שכן הוא מאפשר colocalization של aggresomes פולשניים וחלבונים רקומביננטיים בתוך מגבלת תא הנמען באמצעות הדמית Z-מחסנית.

aggresomes DISC1 תאים פולשניים ושברי multimeric הביעו ומטוהר מE. חיידק יכול להיות תכונה מגדירה של מחלות קונפורמציה חלבון הנוגעים לDISC1, DISC1opathies 15.

צרות קליעה:

תשואה נמוכה aggresome לאחר טיהור שיפוע סוכרוז:

שיפוע סוכרוז הציג בפרוטוקול זה עובד היטב עם aggresomes eGFP/mRFP-DISC1 (פלורידה). Aggresomes המורכב של חלבונים אחרים עשויה להיות מידות משתנות ולכן ריכוזי סוכרוז צריכים להיות מותאמים על ידי משתמשים אחרים.

טיהור בלתי מספקת של חלבון רקומביננטי:

כל זיהום חיידקים בתהליך הטיהור של חלבון רקומביננטי גם להיות מתויג בשלבים מאוחרים יותר של הפרוטוקול. כדי להימנע מזיהומים, להפעיל את החלבון על SDS-PAGE ולוודא כי חלבון רקומביננטי הוא לפחות 95% טהור ע"י השאיר עם Coomassie הכחול. כדי להבטיח איכות ואת התשואה הגבוהה ביותר, בפרוטוקול יש להיות מותאם לכל חלבון בודד.

נמוך התיוג EFficiency של חלבונים רקומביננטיים:

כל זיהומים שמכילים קבוצות SH חופשיות יקטנו תיוג יעיל של החלבון. לכן, דיאליזה נרחבת וטיהור מבוססת Ni-נ.ת. ע הוא חובה.

גילויים

אין ניגודי האינטרסים הכריזו.

תודות

עבודה זו מומנה על ידי NEURON-Eranet גלה (BMBF 01EW1003) לCK וJPH, DFG (Ko 1679/3-1; GRK1033) לCKVB נתמך על ידי מענק של Forschungskommission של הפקולטה לרפואה באוניברסיטת דיסלדורף.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
שם מגיב חברה מספר קטלוגים תגובות
RPMI 1640 Invitrogen 11875-093 בינוני תלוי בקו התא המארח. שורת תאי הנמען האופטימלית צריכה להיקבע על ידי המשתמש.
DMEM/F-12 Invitrogen 11320-033 בינוני תלוי בקו תא הנמען. שורת תאי הנמען האופטימלית צריכה להיקבע על ידי המשתמש.
PBS Invitrogen 14190-250
Metafectene Biontex T020-1.0 ריאגנטים transfection אחרים יכולים לעבוד גם כן, אבל לא נבדקו בפרוטוקול שלנו.
Ni-נ.ת. ע agarose Qiagen 30210 הניסויים נעשו עם Ni_NTA agarose מQiagen, ספקים אחרים צריכים לעבוד גם כן.
אני DNase רוש 04716728001 אין צורך בRNase החופשי DNase בתהליך של טיהור aggresomes.
סוכרוז סיגמה אולדריץ S0389
Opti-ממ Invitrogen 31985-062 מדיום סרום ללא עובד כמו גם
פניצילין / סטרפטומיצין Invitrogen 15140122 תוספת לSH-SY5Y וNLF הבינוני
שאינן חיונית, חומצות אמינו (NEAA) סיגמה אולדריץ M7145 תוספת למדיום SH-SY5Y
Trypan הכחול 0.4% סיגמה אולדריץ T8154 ריאגנט רעיל
DyLight 594 מאleimide תרם פישר סיינטיפיק 46608 הקטין לצבוע תגובתי ציסטאין ליצור קשרי thioether יציבים. זמין גם בצבעים אחרים.
להאריך את הזהב עם DAPI Invitrogen P36935 mountant הנוזל antifade זה נתן תוצאות טובות יותר בידות שלנו.
קוקטייל מעכב פרוטאז רוש 11873580001 ממס טבלה 1 מתוך 500 H 2 O μl לפתרון 100X.
סינטטי-סינוקלאין סיגמא S7820 לקפל כפי שמתואר בטקסט.
טבלה של חומרים כימיים ספציפי.
24 Precellys טכנולוגיות רטין 03119.200.RD000 אנחנו עדיין לא נבחנו homoge מכאני אחרnizers אחר מזה. שיטת homogenization חופשיה אחרת דטרגנט יכול לעבוד גם כן, אבל לא נבדקה לפרוטוקול זה.
5301 מרוכזים (speedvac) אפנדורף 5301 000.210 הכרחי רק אם חלבון צריך להיות מרוכז.
LSM 510 וAxioVision Apotome2 Zeiss ראה קטלוג יצרנים שני מיקרוסקופי נמל היכולת לבצע הדמית Z-מחסנית. זו היא תנאי הכרחית להערכה מוצקה ורצינית של אירועי פלישה.
חומר פלסטי תרבית תאים Nunc 10 מנות סנטימטר # 172958, צלחות 24 # 142475 גם השימוש בחומר פלסטי אחר עשוי להשפיע על האינטראקציה של חלבונים רקומביננטיים או aggresomes ואת משטחי הפלסטיק. אנחנו עדיין לא נבחנו חומרים אחרים מאלו שתוארו כאן.
טבלה של חומרים וציוד ספציפיים.
מספר שם מאגר תוכן תגובות
1. מדיום גידול חיידקים 16 ג'/ ליטר Bacto Tryptone, תמצית 10 גרם / ליטר Bacto שמרים, 5 גרם / ליטר NaCl, 5 מ"מ ארגינין-HCl, MGSO4 5mm, 100 מיקרוגרם / המ"ל carbencillin, 35 מיקרוגרם / המ"ל chloramphenicol לגדול חיידקים לOD 600: 0.6-0.8 לגרום ביטוי עם IPTG 1 מ"מ.
2. חיץ resuspension קטריאלי 50 המ"מ TRIS-HCl pH 8.0, 5 המ"מ EDTA, 2 המ"מ PMSF, 1% TX-100, 250 מיקרוגרם / המ"ל Lysozyme, 20 מ"מ MgCl 2 ו 400 המ"ל DNase U/50 Resupend גלולת חיידקים מ1 הליטר oveתרבות rnight במאגר resuspension מ"ל 50.
3. חיץ מיצוי חלבון 50 mM טריס pH 8.0, 5 המ"מ imidazole, 500 המ"מ NaCl, אוריאת ז 8 ו 10 מ"מ ב-ME
4. חיץ לשטוף עמודת Ni-נ.ת. ע 50 mM טריס pH 8.0, 5 המ"מ imidazole, 500 המ"מ NaCl, אוריאת ז 8 ו 10 מ"מ ב-ME, 12 המ"מ imidazole חיץ חילוץ שונה עם 12 המ"מ imidazole הוסיף.
5. חיץ elution עמודת Ni-נ.ת. ע 50 mM טריס, 500 mM NaCl, 300 המ"מ imidazole, ז 8 אוריאה, 1 המ"מ PMSF, 5 מ"מ ו10 mM EDTA ב-ME חיץ elution מכיל 10 mM ב-ME, הדיאליזה בהמשך.
6. PBS 8 גרם / הליטר NaCl, 0.2 גר '/ ליטר KCl, 1.44 גר' / ליטר Na 2 HPO 4, 0.24 ג'/ ליטר KH 2 PO 4, להסתגל לpH 7.4
7. תיוג חיץ PBS המכיל TCEP 5 מ"מ
טבלה של מתכונים.

מקורות

  1. Millar, J. K. Disruption of two novel genes by a translocation co-segregating with schizophrenia. Hum. Mol. Genet. 9, 1415-1423 (2000).
  2. St Clair, D. Association within a family of a balanced autosomal translocation with major mental illness. Lancet. 336, 13-16 (1990).
  3. Leliveld, S. R. Insolubility of disrupted-in-schizophrenia 1 disrupts oligomer-dependent interactions with nuclear distribution element 1 and is associated with sporadic mental disease. J. Neurosci. 28, 3839-3845 (2008).
  4. Leliveld, S. R. Oligomer assembly of the C-terminal DISC1 domain (640-854) is controlled by self-association motifs and disease-associated polymorphism S704C. Biochemistry. 48, 7746-7755 (2009).
  5. Ottis, P. Convergence of two independent mental disease genes on the protein level: recruitment of dysbindin to cell-invasive disrupted-in-schizophrenia 1 aggresomes. Biol. Psychiatry. 70, 604-610 (2011).
  6. Meyer-Luehmann, M. Exogenous induction of cerebral beta-amyloidogenesis is governed by agent and host. Science. 313, 1781-1784 (2006).
  7. Frost, B., Jacks, R. L., Diamond, M. I. Propagation of tau misfolding from the outside to the inside of a cell. J. Biol. Chem. 284, 12845-12852 (2009).
  8. Frost, B., Ollesch, J., Wille, H., Diamond, M. I. Conformational diversity of wild-type Tau fibrils specified by templated conformation change. J. Biol. Chem. 284, 3546-3551 (2009).
  9. Clavaguera, F. Transmission and spreading of tauopathy in transgenic mouse brain. Nat. Cell Biol. 11, 909-913 (2009).
  10. Desplats, P. Inclusion formation and neuronal cell death through neuron-to-neuron transmission of alpha-synuclein. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106, 13010-13015 (2009).
  11. Ren, P. H. Cytoplasmic penetration and persistent infection of mammalian cells by polyglutamine aggregates. Nat. Cell Biol. 11, 219-225 (2009).
  12. Munch, C., O'Brien, J., Bertolotti, A. Prion-like propagation of mutant superoxide dismutase-1 misfolding in neuronal cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 3548-3553 (2011).
  13. Iwatsubo, T. Purification and characterization of Lewy bodies from the brains of patients with diffuse Lewy body disease. Am. J. Pathol. 148, 1517-1529 (1996).
  14. Meriin, A. B., Wang, Y., Sherman, M. Y. Isolation of aggresomes and other large aggregates. Curr. Protoc. Cell Biol. Chapter 3, 1-9 (2010).
  15. Korth, C. DISCopathies: brain disorders related to dysfunctional DISC1. Rev. Neurosci. 20, 321-330 (2009).

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות

צבירי חלבון DISC1בדיקת פלישה תאיתטיהור במדרג סוכרוזדימוי במיקרוסקופיה קונפוקליתפרגמנט DISC1 רקומביננטיהיווצרות אגרסוםשורות תאי נוירובלסטומהסימון בחלבון פלואורסצנטימחקרי אגרגציה של חלבוניםניתוח פלשנות תאית
דור, טיהור, ואפיון של מיני חלבון DISC1 הסלולריים פולשניים
צרו קשר
המליצו לספרייה

פרטיות

תנאי שימוש

מדיניות

זכויות יוצרים © 2026 MyJoVE Corporation. כל הזכויות שמורות.