Name: Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-Area Imaging(대면적 이미징을 통한 수중 환경의 구조, 구성 및 변화 측정) (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-18T13:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 19 s
Description: 배우세요 대면적 이미징 프로토콜을 통해 산호초 생태계의 구조적 복잡성, 군집 구성 및 인구 통계학적 데이터를 수집하는 방법을. 이 방법은 고품질 영상을 활용하여 생태 변화를 시간에 따라 추적하는 연구자의 능력을 향상시킵니다.

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<table><tbody><tr><td>1 "x 4 1/4"x 3 1/4 "사용자 정의 가공 아세탈</td><td>N / A</td><td>N / A</td><td>1.1 기어 준비; 카메라 슬라이드 및 마운트의 건설을 위해</td></tr><tr><td>1/2" 해양 등급 고밀도 폴리에틸렌</td><td>킹 우현</td><td>N/A</td><td>1.1 기어 준비; 카메라 외부 프레임 및 카메라 장착 패널의 구성용</td></tr><tr><td>18-8 플랫헤드 스테인리스 스틸 필립스 플랫 헤드 나사, 3/8"-16 나사 크기, 1-1/2" Long</td><td>McMaster-Carr</td><td>91771A628</td><td>1.1 기어 준비; 카메라 프레임 조립용</td></tr><tr><td>18-8 스테인레스 스틸 소켓 헤드 나사, 10-24 나사 크기, 1-1/8" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>92196A248</td><td>1.1 기어 준비; 1lb 다이빙 웨이트를 처리하기 위해 마운팅 플레이트를 고정하는 데 사용</td></tr><tr><td></td><td>House of Scuba</td><td>WBELT24 1LB</td><td>1.2 플롯 설정; 참조 플로트</td></tr><tr><td>200DL 수중 하우징 Nikon D780 DSLR 카메라</td><td>Ikelite</td><td>71019</td><td>1.1 기어 준비에 사용됩니다. 디지털 카메라용 수중 하우징</td></tr><tr><td>24mm 고정 렌즈(AF-S NIKKOR 24mm f/1.8G ED)</td><td>Nikkor</td><td>20057</td><td>1.1 기어 준비; 더 중대한 이미지 오버랩을 위한 광각 렌즈</td></tr>: <tr><td>250# 회색, longline, 많은 연약한</td><td>대륙, 서쪽</td><td>503086</td>, <td>1.2 작의 체제; 축척 막대를 만듭니다. 모델 축척</td></tr><tr><td>3lb 드릴링 해머</td><td>Estwing</td><td>B3-3LB</td><td>1.2 플롯 설정을 결정하기 위한 지상 제어 마커; 조사 현장에서 스테인레스 스틸 말뚝을 설치하는 데 사용됩니다</td></tr><tr><td>3/8-16 X 18" THRD ROD W/60 DEGREE POINT 316 S/S</td><td>Ababa Bolt</td><td>37C1800ROD6/60DEG</td><td>1.2 플롯 설정; 측량 사이트를 표시하기 위한 영구 설치용</td></tr><tr><td>316 스테인리스강 나일론 인서트 잠금 너트 초부식 방지, 1/4"-20 나사산 크기</td><td>McMaster-Carr</td><td>90715a125</td><td>1.2 플롯 설정; 축척 막대 및 프레임 조립용.</td></tr><tr><td>316 스테인레스 스틸 나일론 인서트 잠금 너트 슈퍼 부식 방지, 3/8"-16 나사 크기</td><td>McMaster-Carr</td><td>90715A145</td><td>1.2 플롯 설정; 플롯 방향을 위해 왼쪽 스테인리스 스틸 말뚝에 부착</td></tr><tr><td>316 스테인레스 스틸 Phillips 플랫 헤드 나사, 10-32 나사 크기, 3/8" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91500a827</td><td>1.1 기어 준비; </td></tr><tr><td>방수지에 인쇄된 카메라 프레임 어셈블리 4"x4" Agisoft 마커</td><td>Agisoft</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 모서리 타일을 만듭니다. 모델 방향을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>4"x4"x1/4" 스테인리스 스틸 타일</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 모서리 타일을 만듭니다. 모델 방향을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>4"x4"x3/4" 맞춤형 인쇄 플라스틱 agisoft 마커 고밀도 폴리에틸렌 컬러 코어</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 축척 막대를 만듭니다. 모델 축척 결정을 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>512GB Extreme PRO SDXC UHS-I 카드 - C10, U3, V30, 4K UHD, SD 카드</td><td>SanDisk</td><td>SDSDXXY-512G-GN4IN</td><td>1.1 기어 준비; 고속, 대용량 저장 카드. 이미지 저장을 위해 카메라당 최대 2개 사용</td></tr><tr>,<td>5TB 요소, 휴대용 외장 하드 드라이브, HDD, USB 3.0</td>, <td>Western Digital</td><td>WDBU6Y0050BBK-WESN</td><td>1.3, 이미지 캡처; 이미지 저장 및 이미지 백업을 위한 대용량 외장 하드 드라이브</td></tr><tr><td>60mm 고정 렌즈(AF-S Micro NIKKOR 60mm F2.8G ED)</td><td>Nikkor</td><td>2177</td><td>1.1 기어 준비; 매크로 줌 렌즈, 듀얼 카메라 설정을 위한 옵션,</td></tr><tr><td>1"x12", 3/8", 16 스레드 지지대용 아세탈 가공 및 탭,</td><td>N/A</td>, <td>N/A</td><td>1.1 기어 준비; 카메라 프레임 지원 열</td></tr><tr><td>AquaMend 에폭시 퍼티 스틱</td><td>JD Industrial Supply</td><td>470550</td><td>1.2 플롯 설정; 측량 현장에 스테인레스 스틸 말뚝을 설치하는 데 사용</td></tr><tr><td>건축 6063 알루미늄 U-채널, 1/8" 벽 두께, 1/2" 높이 x 3/4" 너비</td><td>외부 McMaster-Carr</td><td>9001k46</td><td>1.2 플롯 설정; 축척 막대를 만듭니다. 모델 스케일을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>Black-Oxide 18-8 스테인리스 스틸 팬 헤드 Phillips 나사, 1/4"-20 나사, 1/2" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91249a537</td><td>1.1 기어 준비; 하우징에 ikelite 핸들을 부착하려면</td></tr><tr><td>Black-Oxide 18-8 스테인리스 스틸 팬 헤드 십자 나사, 1/4"-20 나사, 5/8" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91249A539</td><td>1.2 플롯 설정; 축척 막대를 만듭니다. 모델 축척을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>Blue Steel Rope</td><td>Continental Western</td><td>402020</td><td>1.2 플롯 설정; 조사 중 저서에 다이빙 플로트를 고정하는 데 사용</td></tr><tr><td>D780 카메라 본체</td><td>Nikon</td><td>1618</td><td>1.1 기어 준비; 카메라 본체 모델</td></tr><tr><td>DGX Tech Compass w/Bungee Mount and Cord</td><td>Dive Gear Express</td><td>DX-9050x</td><td>1.2 플롯 설정; 플롯 베어링 수집 및 탐색 보조 도구로서의 카메라 프레임에 추가</td></tr> 다이<tr><td>브 컴퓨터 - Suunto Zoop Novo</td><td>Suunto&nbsp;</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 참조 타일에서 깊이를 기록하려면</td></tr><tr><td>다이브 슬레이트</td><td>TexWipe</td><td>TX5835</td><td>1.2 플롯 설정; 타일 깊이 및 코딩된 대상 번호와 같은 플롯 메타데이터를 기록하는 데 사용됩니다</td></tr><tr><td>DL 8인치 돔 포트</td><td>Ikelite</td><td>75340</td><td>1.1 기어 준비; 수중 하우징용 돔 포트</td></tr><tr><td>FLOAT, PVC SPONGE, 5-3/4" DIA. BY 3/4", RUST</td><td>멤피스 네트 & Twine</td><td>SB1</td><td>1.2 플롯 설정; 카메라 오퍼레이터의 플롯 경계와 수영 높이를 결정하기 위한 시각적 참조로 사용됨</td></tr><tr><td>Garmin 78s GPS</td><td>Garmin</td><td>010-00864-01</td><td>1.2 플롯 설정; 측량 현장의 위치를 기록하는 데 사용</td></tr><tr><td>고성능 컴퓨터</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>2.0 모델 구성; 3D 고밀도 포인트 클라우드 처리의 경우 고속 10+ 코어 CPU, 128GB RAM(최소 64GB), 1TB 솔리드 스테이트 드라이브 및 전용 NVIDIA 또는 AMD GPU를 포함하는 권장 사양이 좋습니다.&nbsp;</td></tr><tr><td>팽창식 표면 다이빙 플로트</td><td>Omer</td><td>Atol 6246</td><td>1.2 플롯 설정; 이중 목적 표면 마커 부이 및&nbsp;</td></tr><tr><td>JOHNSON 크로스 체크 레벨: 비자성, 2 1/4 in x 1 7/16 in x 3/16 in, 플라스틱, 교수형 구멍, 1mm/m</td><td>Grainger</td><td>6C225</td><td>1.1 기어 준비; 내비게이션 보조 도구로 카메라 프레임에 선택적으로 추가</td></tr><tr><td>긴 줄자, 1/2 In x 30m, Pumpkin</td><td>Grainger</td><td>3LJW9</td><td>1.2 플롯 설정; 플롯 영역을 설정하는 데 사용됩니다</td></tr><tr><td>만타 릴 SR. 릴</td><td>만타 산업</td><td>N / A</td><td>1.2 플롯 설정; 측량 중 사용을 위해 다이빙 플로트에 부착</td></tr><tr><td>Metashape Professional License</td><td>Agisoft</td><td>N/A</td><td>2.0 모델 구성; 조밀한 포인트 클라우드 처리를 위한 소프트웨어</td></tr><tr><td>눈부심 방지 투명 아크릴</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 모서리 타일을 만듭니다. 모델 방향을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>DL 포트 시스템용 O-링 0132.45, ULTRAcompact 하우징</td><td>Ikelite</td><td>132.45</td><td>1.1 기어 준비; 수중 하우징용 O-링</td></tr><tr><td>DSLR용 O-링 0132.59 및 미러리스 하우징(유형 1)</td><td>Ikelite</td><td>132.59</td><td>1.1 기어 준비; 수중 하우징용 O-링</td></tr><tr><td>Paracord 또는 Dacron Line</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>1.2 플롯 설정; 레퍼렌 플로트를 다이빙 웨이트에 부착하는 데 사용</td></tr><tr><td>패시베이티드 18-8 스테인리스 스틸 필립스 플랫 헤드 나사, 82도 카운터싱크, 1/4"-20 나사, 1" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91771a542</td><td>1.1 기어 준비; 프레임 슬라이더 패널</td></tr><tr><td>패시베이티드 18-8 스테인레스 스틸 필립스 플랫 헤드 나사, 82도 카운터싱크, 1/4"-20 나사, 1-3/4" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91771a548</td><td>1.1 기어 준비; 프레임 슬라이더 패널</td></tr><tr><td>패시베이티드 18-8 스테인레스 스틸 필립스 플랫 헤드 나사, 82도 카운터싱크, 10-32 나사, 3/8" 길이</td><td>McMaster-Carr</td><td>91771A827</td><td>1.2 플롯 설정; 모서리 타일을 만듭니다. 모델 방향을 결정하기 위한 지상 제어 마커</td></tr><tr><td>Pelican 1060 마이크로 케이스</td><td>Pelican</td><td>1060-025-100</td><td>1.2 플롯 설정; 팽창식 다이빙 플로트에 부착된 GPS 장치용 하우징</td></tr><tr><td>플라스틱 헤드 나비 나사 1/4"-20 x 2"</td> <td>McMaster-Carr</td><td>91185A819</td><td>1.1 기어 준비; </td></tr><tr><td>확장 기능이 있는 오른손 퀵 릴리스 핸들</td>에 카메라 하우징을 고정하는 데 사용 <td>Ikelite</td><td>4077.02</td><td>1.1 기어 준비; 수중 하우징 핸들</td></tr><tr><td>R</td><td>N / A</td><td>N / A</td><td>3.0 생태 분석; 구조적 복잡성 스크립트 실행을 위한 소프트웨어</td></tr><tr><td>Taglab</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>3.0 생태 분석; 세분화 분석용 소프트웨어</td></tr><tr><td>셔터 또는 뒤로 버튼 초점용 트리거 확장 v2</td><td>Ikelite</td><td>4077.95</td><td>1.1 기어 준비; 수중 하우징 셔터 버튼 제어를 위한 트리거 확장</td></tr><tr><td>게이지가 있는 진공 펌프</td><td>Ikelite</td><td>47011</td><td>1.1 기어 준비; 수중 카메라 하우징용 O-링 씰의 무결성을 테스트하기 위해</td></tr><tr><td>Viscore</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>2.0 모델 구성;3.0 생태 분석; 생태 분석용 소프트웨어</td></tr></tbody></table>

measuring the structure, composition, and change of underwater environments with large-area imaging(대면적 이미징을 통한 수중 환경의 구조, 구성 및 변화 측정)

Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-area Imaging

현장에서 넓은 영역의 이미지를 성공적으로 수집하면 조사 영역의 전체 하향식 적용 범위를 가진 조밀한 포인트 클라우드 재구성이 생성되어야 하며, 커버리지의 중복성이 부적절하면 포인트 클라우드의 갭 또는 완전한 저하가 발생할 수 있습니다(그림 4). 2016년 하와이 군도 전역에서 실시된 43개의 대형 이미지 조사에서 데이터 세트당 평균 99.6%의 이미지가 정렬되었으며, 이미지 세트의 66%에서 이미지가 100% 성공적으로 정렬되었습니다. 광각 렌즈 카메라에서 수집된 이미지는 평균 GSD가 0.52mm px-1 인 반면 줌 렌즈 카메라의 이미지는 평균 GSD가 0.18mm px-1이었습니다. 이러한 설문 조사는 평균 5억 5,770만 포인트(15GB) 크기의 조밀한 포인트 클라우드를 생성했습니다.
여기에 설명된 생태학적 워크플로우는 산호초 모니터링을 위한 기존 방법론과 유사한 데이터를 생성하도록 설계되었습니다78. 하와이 전역의 LAI 조사에서 추출한 생태학적 데이터는 몇 가지 이상치를 제외하고는 구조적 복잡성 워크플로우에서 비롯된 선형 견고성의 측정값을 보여주며, 이는 현장 전체의 복잡성 측정값과 비교하여 상대적 값과 잘 일치합니다81(그림 5A, B). 주요 저서 작용 그룹의 적용 비율을 측정하기 위한 LAI의 추가 군집 구성 분석은 전통적인 photoquadrat 조사82와 유사한 정렬을 보여줍니다(그림 5C, D). 여기서 Quadrat 샘플링은 고착 무척추 동물의 밀도를 측정하는 데 사용되었으며, 가장 흔한 것은 성게이며, 이는 상대적 풍부도의 범주 형 측정으로 요약되었습니다. LAI 방법은 현장 방법81 (그림 5E, F)에 비해 정기적으로 더 높은 수준의 풍부도를 기록했는데, 이는 신속한 시각적 인구 조사에 비해 주어진 지역 내의 모든 개인을 종합적으로 검색하고 조사할 수 있는 능력 때문일 수 있습니다. 2D orthoprojection을 사용하여 산호 군체를 분할하면 일반적인 산호 분류군의 크기 분포가 in situ 방법83과 유사한 것으로 나타났습니다(그림 5G,H).
LAI 조사의 주요 장점은 밀집된 포인트 클라우드의 공동 정합을 통해 시간에 따른 산호초 지역의 변화를 보관하고 추적할 수 있다는 것입니다. 산호초는 살아있는 기질이며, 이는 LAI 조사의 경우 서로 다른 시점의 조밀한 포인트 클라우드를 안정적으로 공동 정합하는 데 사용할 수 있는 자연 또는 설치의 영구적인 표면을 식별하는 것이 어려울 수 있음을 의미합니다. Millennium Atoll의 예(그림 6)는 높은 성장과 구조적 손실이 모두 있는 예를 보여주며, 시간이 지남에 따라 산호초 표면의 안정성이 거의 또는 전혀 없음에도 불구하고 조밀한 포인트 클라우드 공동 정합에 보조 공동 정합 워크플로우가 사용되었습니다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig01.jpg"> 
그림 1: 조립된 카메라 프레임의 다이어그램. (A,B) 듀얼 및 (C,D) 단일 카메라 프레임 설정의 예시 보기. Ikelite 카메라 하우징은 하우징 핸들에 부착된 슬라이더 플레이트를 사용하여 카메라 장착 패널의 프레임에 부착됩니다. 레벨, 나침반 및 다이빙 컴퓨터와 같은 탐색을 돕기 위한 옵션 도구는 B와 같이 프레임에 부착할 수 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig01large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig02.jpg"> 
그림 2: 100m2 대형 이미지 플롯 설정 다이어그램. 완전히 설정된 대면적 이미지 플롯의 개략도: 100m2 면적. 임시 플롯 표식기에는 6개의 경계 타일 표식기, 4개의 축척 막대 및 4개의 참조 부동 소수점이 포함됩니다. 영구 플롯 마커에는 잠금 너트를 포함하여 육지를 볼 때 왼쪽 말뚝이 있는 두 개의 스테인리스 스틸 말뚝이 포함됩니다. 플롯에 대한 GPS 참조는 왼쪽 중앙 타일 또는 말뚝 위에 있어야 합니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig02large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig03.jpg"> 
그림 3: 다이버 수집 패턴. (A) 버퍼가 포함된 플롯 영역의 충분한 커버리지와 겹침을 보장하기 위한 다이버의 수영 경로 및 (B) 수영 높이에 대한 가이드를 제공하는 기준 플로트가 있는 카메라 시스템과 다이버의 배치. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig03large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig04.jpg"> 
그림 4: 이미지 겹침 감소. 중첩되는 이미지의 수에 따른 밀집된 포인트 클라우드의 저하가 무작위 샘플링을 통해 감소합니다. 각 패널에는 원본 이미지의 (A) 모든 이미지, (B) 1/2, (C) 1/3, (D) 1/5 및 (E) 1/10에서 생성된 밀집된 포인트 클라우드가 표시됩니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig04large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig5v2.jpg"> 
그림 5: 생태학적 데이터 추출. 각 생태학적 워크플로우에 대한 대면적 이미징에서 추출된 후보 데이터는 확립된 현장 데이터 수집 방법과 비교하여 표시됩니다. 여기에는 (A,B) 구조적 복잡성, (C,D) 군집 구성(오차 막대는 표준 오류를 나타냄), (E,F) 무척추 동물 밀도 및 (G,H) 크기 구조 인구 통계가 포함됩니다. 약어: LAI = large-area imaging. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig5v2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67700/67700fig06.jpg"> 
그림 6: 밀집된 포인트 클라우드 정합. 시간적으로 공맞춰진 두 개의 밀집된 포인트 클라우드의 시각적 비교 예제입니다. 너울로 인한 손상으로 인한 구조적 손실 영역은 자홍색 화살표로 표시된 것처럼 시각적으로 빨간색으로 코드화되어 있습니다. 일반적으로 산호 군체의 성장에 기인하는 구조적 추가 영역은 노란색 화살표로 표시된 것처럼 시각적으로 파란색으로 코드화되어 있습니다. 여기에 설명된 공동 정합 워크플로우는 여기에서 볼 수 있는 것처럼 영구적으로 설치된 지상 제어점(GCP)이 과잉 성장 또는 이탈로 인해 신뢰할 수 없는 역동적인 암초 지역에 계속 사용할 수 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/67700fig06large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>카메라 기능</td>
			<td>권장 설정</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>초점</td>
			<td>자동</td>
		</tr>
		<tr>
			<td rowspan="2">촬영 모드</td>
			<td>P (Programmed Auto) : 광각 렌즈</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>A(조리개 우선 모드), 매크로 렌즈의 경우 조리개 F8로 설정</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>릴리스 모드</td>
			<td>S (셔터 우선)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>자동 초점 설정</td>
			<td>자동 초점 중심(AF-C), 단일 중앙 포인트(S)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ISO 감도 자동 제어</td>
			<td>에</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>최대 ISO 감도</td>
			<td>3200</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>최소 셔터 속도</td>
			<td>1/320</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>이미지 품질</td>
			<td>원시 + JPEG</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>인터벌 타이머</td>
			<td>1들</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>화이트 밸런스</td>
			<td>관습</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
표 1: 권장 카메라 설정. 다음은 이미지 품질을 최적화하는 데 사용되는 주요 카메라 설정 목록입니다. 이러한 설정은 수중 조명 조건에서 움직이는 작업자가 캡처한 초점이 맞는 이미지를 캡처하는 데 우선 순위를 둡니다.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td colspan="2">사진 정렬</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>정밀</td>
			<td>높다</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>일반 사전 선택</td>
			<td>아니요</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>키 포인트 제한</td>
			<td>5000</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>타이 포인트 제한</td>
			<td>0</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>가이드 이미지 매칭</td>
			<td>아니요</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>적응형 카메라 모델 피팅</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="2">Dense Cloud 구축</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>질</td>
			<td>높다</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>깊이 필터링</td>
			<td>심하지 않음</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>포인트 색상 계산</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>포인트 신뢰도 계산</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="2">포인트 내보내기</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>파일 형식</td>
			<td>스탠포드 플라이</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>좌표계</td>
			<td>로컬 좌표 (m)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>소스 데이터</td>
			<td>짙은 구름</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>포인트 색상 저장</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>세이브 포인트 노멀</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>포인트 신뢰도 확보</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>세이브 포인트 클래스</td>
			<td>아니요</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>색상을 8비트 RGB로 변환</td>
			<td>예</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>바이너리 인코딩</td>
			<td>예</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
표 2: 3D 밀집 포인트 클라우드 구성 설정. Agisoft Metashape 에서 고품질의 밀집된 포인트 클라우드 재구성을 만들고 내보내는 데 사용되는 설정 목록입니다.
보충 파일 1: 로드맵. 재조사할 플롯 영역을 찾는 데 도움이 되도록 플롯 기능과 깊이로 표시된 정사모자이크 이미지의 예. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%201%20Roadmap.pdf" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 2: Extract_meta.py. Agisoft Metashape 에서 스크립트를 실행하여 Viscore 에서 사용할 카메라 포즈 및 파일 디렉토리 정보를 내보내 원본 이미지를 쿼리합니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%202%20extract_meta.py" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 3: Viscore 가이드. Viscore용 소프트웨어 가이드에는 모델 시각화, 공동 정합 및 생태 분석을 위한 워크플로우가 포함되어 있습니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental_3_Guide_to_Viscore_Final.pdf" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 4: Rugosity_Functions.Rmd. Viscore에서 추출한 rugosity 데이터를 처리하는 함수를 포함하는 R에서 사용되는 스크립트 입니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%204%20Rugosity_Functions.Rmd" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 5: Rugosity_Analysis.Rmd. rugosity 메트릭을 계산하기 위해 R에서 사용되는 스크립트입니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%205%20Rugosity_Analysis.Rmd" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 6: Quadrat_sampling.rpl.json. 사분면 밀도 분석 워크플로우를 위해 Viscore 에서 사용되는 스크립트. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%206%20Quadrat_sampling.repl.json" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 7: Density_taxo_lookup.json. 분류 그룹별로 사분면 샘플링 데이터를 집계하기 위해 사분면 샘플링 스크립트를 실행하기 위한 버튼 조회 파일입니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%207%20Density_taxo_lookup.json" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 8: Density_Analysis.R 설문 조사 수준에서 분류 그룹별로 밀도를 계산하는 2 차 샘플링 데이터를 집계하는 R에서 사용되는 스크립트입니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%208%20Density_Analysis.R" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 9: README.txt 이미지 캡처 방법론을 설명하는 데이터 보관을 위해 원본 이미지에 포함될 예시 텍스트 파일입니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%209%20README.txt" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>
보충 파일 10: METADATA_KAH_2016-07_03.txt LAI 설문조사에 대한 메타데이터 필드를 포함하는 데이터 보관을 위해 원본 이미지에 포함될 예시 텍스트 파일입니다. 여기에는 참조를 위한 설문조사 축척 및 깊이 데이터 내에 대한 필드와 지리적 컨텍스트에 대한 전체 사이트 메타데이터가 포함됩니다. 약어: LAI = large-area imaging. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67700/Supplemental%2010%20METADATA_KAH_2016-07_03.txt" target="_blank">이 파일을 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.</a>

Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-Area Imaging(대면적 이미징을 통한 수중 환경의 구조, 구성 및 변화 측정)

Digital imaging and processing technology have evolved to facilitate the expansion of large-area imaging surveys, which increase our capacity to study the ...

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Research

연구

JoVE Journal

Environment

환경

이 프로토콜은 원위치 동물 생성 흐름에의 부량 위해 설계 자체에 포함된 수중 velocimetry 장치 (SCUVA)를 사용하는 방법에 대한 지침을 제공합니다. 또한,이 프로토콜은 현장 조건으로 인한 문제를 해결하고, 운영 모션, 동물의 예측 위치, 그리고 SCUVA의 방향을 포함하고 있습니다.

양적 측정 현장에서</em독립적인 수중 Velocimetry 장치 (SCUVA)을 사용하여> 흐름

영상 기술의 통합 제품군은 카리브해 산호 Montastraea의 annularis와 M.에서 용종의 형태와 조직 구조를 결정하기 위해 적용되었습니다 faveolata. 형광, 직렬 블록 얼​​굴, 및이 광자 공 초점 레이저 주사 현미경 lobate 구조 용종 벽 및 예상 chromatophore 및 주산 셀러 밀도 및 분포를 확인했다.

복합 광학 현미경 방법 카리브 암초 건물 산호의 폴립 조직 형태와 구조를 밝히기

물고기, 계산 그리고 관계 되는 풍부 (MaxN) 및 생선 밀도 회전 스테레오 비디오 카메라 시스템을 사용 하 여 예측에 대 한 새로운 방법을 설명 합니다. 우리는 또한 종의 검출 추정 카메라 (Z 거리)에서 거리를 사용 하는 방법을 보여 줍니다.

수 중 스테레오 비디오 도구를 사용 하 여 물고기 밀도 측정을 위한 새로운 방법의 개발

이미지 기반 조사 해양 환경을 점점 더 실용적이 고 비-침략 적 방법입니다. 선물이 드롭 카메라 조사는 풍부의 프로토콜 및 대서양 해 가리비 (Placopecten magellanicus)의 유통. 우리는 어떻게이 프로토콜 다른 생물이 macroinvertebrates 응용 프로그램에 대 한 일반화 될 수 있다 설명.

생물이 Macroinvertebrates 그리고 대서양 바다 가리비에 대 한 드롭 카메라 조사에 의해 Exemplified 그들의 서식 지의 이미지 기반 설문 조사 방법

우리는 3D 모델과 정사모자이크를 생성하기 위해 수중 움직임 사진 측량 조사를 수행하기 위한 자세한 프로토콜을 제공합니다.

Structure-from-Motion Photogrammetry를 사용하여 저서 생태계를 모니터링하기 위한 현장 입문서

여기에 제시된 프로토콜은 수중 사진 측량 데이터를 수집하고 처리하기 위한 프로토콜로, 생태 데이터 추출, 분석 및 적용을 위해 준비된 지리 참조 및 시계열 정렬 출력을 생성하는 크게 단순화되고 완전히 자동화된 이미지 처리 파이프라인을 포함합니다.

Reefshape: 저서 서식지 모니터링을 위한 시계열 수중 사진 측량 데이터의 효율적인 수집 및 자동 처리를 위한 시스템

기계적 세포 파괴, 용매 기반 지질 추출, 에스테르 교환 반응 및 정량 가스 크로마토 그래피를 사용하여 지방산의 식별에 기초하여 미세 조류의 지방산 함량 및 조성의 결정을위한 방법을 설명한다. tripentadecanoin 내부 표준 물질은 추출과 불완전 에스테르 교환시 가능한 손실을 보상하기 위해 사용된다.

미세 조류의 지방산 콘텐츠 및 조성 분석

더 많은 단백질의 절반 이상이 전자 현미경 영상과 3 차원 재구성 모두 도전하고 작은 단백질 (분자량 &lt;200 kDa의)이다. 최적화 네거티브 염색 고 대비 및 비교적 높은 해상도 (~ 1 nm의) 다른 생리적 조건 하에서 작은 비대칭 또는 단백질 복합체의 이미지를 얻기 위해 견고하고 높은 처리량 프로토콜이다.

최적화 된 음의 염색 : 전자 현미경으로 작은 비대칭 단백질 구조 검사를위한 높은 처리량 프로토콜

식물에서 영양소 및 독성 플럭스의 측정은 식물 영양 및 독성 연구에 필수적입니다. 여기에서는 칼륨(K+) 및 암모니아/암모늄(NH3/NH4+) 플럭스를 예로 사용하여 온전한 식물 뿌리의 유입 및 유출 측정을 위한 방사성 추적자 프로토콜을 다룹니다. 이러한 기술의 장점과 한계에 대해 설명합니다.

방사성 트레이서와 식물에 미네랄 영양 성분 및 독성 물질의 플럭스를 측정

Aquafaba은 통조림된 chickpea에서 점성 주스, 적극적으로 흔들 때 상대적으로 안정적인 백색 거품 또는 거품 생성. 주요 연구 목표는 핵 자기 공명 (NMR), 외, 전기, 및 펩 티 드를 사용 하 여 viscosifying/두껍게 속성을 기여 하는 aquafaba의 구성 요소를 식별 하는 대량 지문.

구성 및 Aquafaba의 속성: 상업적으로 통조림된 Chickpeas에서 물 발견

배우세요 대면적 이미징 프로토콜을 통해 산호초 생태계의 구조적 복잡성, 군집 구성 및 인구 통계학적 데이터를 수집하는 방법을. 이 방법은 고품질 영상을 활용하여 생태 변화를 시간에 따라 추적하는 연구자의 능력을 향상시킵니다.

Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-Area Imaging(대면적 이미징을 통한 수중 환경의 구조, 구성 및 변화 측정) (동영상) | JoVE Journal

Measuring the Structure, Composition, and Change of Underwater Environments with Large-Area Imaging(대면적 이미징을 통한 수중 환경의 구조, 구성 및 변화 측정)

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