Name: 저간섭성 홀로토마그래피를 통한 장내 오가노이드의 무표지, 고해상도 3D 이미징 및 머신러닝 분석 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-12T13:15:00.000+00:00
Duration: 10 min 40 s
Description: 배우세요 저간섭성 홀로토마그래피를 활용한 장내 오가노이드의 무표지 고해상도 3D 이미징 및 AI 기반 정량 분석 방법을. 실시간 구조 동태와 약물 반응을 비침습적으로 모니터링하여 질병 모델링과 정밀 의학 연구에 활용할 수 있습니다.

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<ol><li>Kim, J., Koo, B. K., Knoblich, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Human+organoids%3A+model+systems+for+human+biology+and+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Human organoids: model systems for human biology and medicine.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 21 (10), 571-584 (2020).</li>
<li>Schwank, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+repair+of+CFTR+by+CRISPR%2FCas9+in+intestinal+stem+cell+organoids+of+cystic+fibrosis+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+stem+cell%22%5BJournal%5D)">Functional repair of CFTR by CRISPR/Cas9 in intestinal stem cell organoids of cystic fibrosis patients.</a> Cell stem cell. 13 (6), 653-658 (2013).</li>
<li>Arjmand, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advancement+of+organoid+technology+in+regenerative+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Regen+Eng+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Advancement of organoid technology in regenerative medicine.</a> Regen Eng Transl Med. 9 (1), 83-96 (2023).</li>
<li>Zhang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patch+grafting+of+organoids+of+stem%2Fprogenitors+into+solid+organs+can+correct+genetic-based+disease+states%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">Patch grafting of organoids of stem/progenitors into solid organs can correct genetic-based disease states.</a> Biomaterials. 288, 121647(2022).</li>
<li>Hofer, M., Lutolf, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Engineering+organoids%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Mater%22%5BJournal%5D)">Engineering organoids.</a> Nat Rev Mater. 6 (5), 402-420 (2021).</li>
<li>Park, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Artificial+intelligence-enabled+quantitative+phase+imaging+methods+for+life+sciences%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Meth%22%5BJournal%5D)">Artificial intelligence-enabled quantitative phase imaging methods for life sciences.</a> Nat Meth. 20 (11), 1645-1660 (2023).</li>
<li>Fei, K., Zhang, J., Yuan, J., Xiao, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Present+application+and+perspectives+of+organoid+imaging+technology%5BTitle%5D)+AND+%22Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Present application and perspectives of organoid imaging technology.</a> Bioengineering. 9 (3), 121(2022).</li>
<li>Fujii, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+method+for+histopathological+evaluation+of+organoids%5BTitle%5D)+AND+%22J+Toxicol+Pathol%22%5BJournal%5D)">A simple method for histopathological evaluation of organoids.</a> J Toxicol Pathol. 31 (1), 81-85 (2018).</li>
<li>Yoshimoto, S., Taguchi, M., Sumi, S., Oka, K., Okamura, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+of+a+novel+protocol+for+formalin-fixed+paraffin-embedded+organoids+and+spheroids%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Open%22%5BJournal%5D)">Establishment of a novel protocol for formalin-fixed paraffin-embedded organoids and spheroids.</a> Biol Open. 12 (5), bio059882(2023).</li>
<li>Badder, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3D+imaging+of+colorectal+cancer+organoids+identifies+responses+to+Tankyrase+inhibitors%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">3D imaging of colorectal cancer organoids identifies responses to Tankyrase inhibitors.</a> PLoS One. 15 (8), e0235319(2020).</li>
<li>Lacin, M. E., Yildirim, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Applications+of+multiphoton+microscopy+in+imaging+cerebral+and+retinal+organoids%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Applications of multiphoton microscopy in imaging cerebral and retinal organoids.</a> Front Neurosci. 18, 1360482(2024).</li>
<li>Brémond Martin, C., Simon Chane, C., Clouchoux, C., Histace, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+trends+and+perspectives+in+cerebral+organoids+imaging+and+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Fronti+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Recent trends and perspectives in cerebral organoids imaging and analysis.</a> Fronti Neurosci. 15, 629067(2021).</li>
<li>Smits, L. M., Schwamborn, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Midbrain+organoids%3A+a+new+tool+to+investigate+Parkinson%27s+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Midbrain organoids: a new tool to investigate Parkinson's disease.</a> Front Cell Dev Biol. 8, 359(2020).</li>
<li>Huisken, J., Swoger, J., Del Bene, F., Wittbrodt, J., Stelzer, E. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+sectioning+deep+inside+live+embryos+by+selective+plane+illumination+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Optical sectioning deep inside live embryos by selective plane illumination microscopy.</a> Science. 305 (5686), 1007-1009 (2004).</li>
<li>Delgado-Rodriguez, P., Brooks, C. J., Vaquero, J. J., Munoz-Barrutia, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innovations+in+ex+vivo+light+sheet+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Prog+Biophys+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Innovations in ex vivo light sheet fluorescence microscopy.</a> Prog Biophys Mol Biol. 168, 37-51 (2022).</li>
<li>Masson, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-resolution+in-depth+imaging+of+optically+cleared+thick+samples+using+an+adaptive+SPIM%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">High-resolution in-depth imaging of optically cleared thick samples using an adaptive SPIM.</a> Sci Rep. 5 (1), 16898(2015).</li>
<li>Kopper, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+organoid+platform+for+ovarian+cancer+captures+intra-and+interpatient+heterogeneity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Med%22%5BJournal%5D)">An organoid platform for ovarian cancer captures intra-and interpatient heterogeneity.</a> Nat Med. 25 (5), 838-849 (2019).</li>
<li>Renner, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fully+automated+high-throughput+workflow+for+3D-based+chemical+screening+in+human+midbrain+organoids%5BTitle%5D)+AND+%22elife%22%5BJournal%5D)">A fully automated high-throughput workflow for 3D-based chemical screening in human midbrain organoids.</a> elife. 9, e52904(2020).</li>
<li>Laperrousaz, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+transfection+of+clonal+organoids+in+Matrigel+microbeads%3A+a+promising+approach+toward+organoid-based+genetic+screens%5BTitle%5D)+AND+%22Nucl+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Direct transfection of clonal organoids in Matrigel microbeads: a promising approach toward organoid-based genetic screens.</a> Nucl Acids Res. 46 (12), e70-e70 (2018).</li>
<li>Susaki, E., Takasato, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Perspective%3A+Extending+the+Utility+of+Three-Dimensional+Organoids+by+Tissue+Clearing+Technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Perspective: Extending the Utility of Three-Dimensional Organoids by Tissue Clearing Technologies.</a> Front Cell Dev Biol. 9, 1-12 (2021).</li>
<li>Park, Y., Depeursinge, C., Popescu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+phase+imaging+in+biomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Photon%22%5BJournal%5D)">Quantitative phase imaging in biomedicine.</a> Nat Photon. 12 (10), 578-589 (2018).</li>
<li>Kim, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Holotomography%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Meth+Primers%22%5BJournal%5D)">Holotomography.</a> Nat Rev Meth Primers. 4 (1), 51(2024).</li>
<li>Wolf, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+structure+determination+of+semi-transparent+objects+from+holographic+data%5BTitle%5D)+AND+%22Optics+Comm%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional structure determination of semi-transparent objects from holographic data.</a> Optics Comm. 1 (4), 153-156 (1969).</li>
<li>Kim, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+holotomography+and+deep+learning+for+rapid+detection+of+NPM1+mutations+in+AML%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Integrating holotomography and deep learning for rapid detection of NPM1 mutations in AML.</a> Sci Rep. 14 (1), 23780(2024).</li>
<li>Kim, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+imaging+and+evaluation+of+characteristic+properties+of+asthma-derived+eosinophils+using+optical+diffraction+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+BiophysRes+Comm%22%5BJournal%5D)">Label-free imaging and evaluation of characteristic properties of asthma-derived eosinophils using optical diffraction tomography.</a> Biochem BiophysRes Comm. 587, 42-48 (2022).</li>
<li>Kim, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA-mediated+demixing+transition+of+low-density+condensates%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Comm%22%5BJournal%5D)">RNA-mediated demixing transition of low-density condensates.</a> Nat Comm. 14 (1), 2425(2023).</li>
<li>Kim, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+species+identification+of+pathogenic+bacteria+from+a+minute+quantity+exploiting+three-dimensional+quantitative+phase+imaging+and+artificial+neural+network%5BTitle%5D)+AND+%22Light+Sci+Appl%22%5BJournal%5D)">Rapid species identification of pathogenic bacteria from a minute quantity exploiting three-dimensional quantitative phase imaging and artificial neural network.</a> Light Sci Appl. 11 (1), 190(2022).</li>
<li>Hugonnet, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiscale+label-free+volumetric+holographic+histopathology+of+thick-tissue+slides+with+subcellular+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Photon%22%5BJournal%5D)">Multiscale label-free volumetric holographic histopathology of thick-tissue slides with subcellular resolution.</a> Adv Photon. 3 (2), 026004-026004 (2021).</li>
<li>Lee, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-term+three-dimensional+high-resolution+imaging+of+live+unlabeled+small+intestinal+organoids+via+low-coherence+holotomography%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">Long-term three-dimensional high-resolution imaging of live unlabeled small intestinal organoids via low-coherence holotomography.</a> Exp Mol Med. 56 (10), 2162-2170 (2024).</li>
<li>Wang, D., Lippard, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cellular+processing+of+platinum+anticancer+drugs%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Cellular processing of platinum anticancer drugs.</a> Nat Rev Drug Discov. 4 (4), 307-320 (2005).</li>
<li>Berg, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ilastik%3A+interactive+machine+learning+for+%28bio%29+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Meth%22%5BJournal%5D)">Ilastik: interactive machine learning for (bio) image analysis.</a> Nat Meth. 16 (12), 1226-1232 (2019).</li>
<li>Sbrana, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+three-dimensional+imaging+and+quantitative+analysis+of+living+fibroblasts+and+myofibroblasts+by+holotomographic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Microscopy+Res+Tech%22%5BJournal%5D)">Label-free three-dimensional imaging and quantitative analysis of living fibroblasts and myofibroblasts by holotomographic microscopy.</a> Microscopy Res Tech. 87 (11), 2757-2773 (2024).</li>
<li>Zhao, H., Brown, P. H., Schuck, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((On+the+distribution+of+protein+refractive+index+increments%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">On the distribution of protein refractive index increments.</a> Biophys J. 100 (9), 2309-2317 (2011).</li>
<li>Wallaeys, C., Garcia-Gonzalez, N., Libert, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Paneth+cells+as+the+cornerstones+of+intestinal+and+organismal+health%3A+a+primer%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">Paneth cells as the cornerstones of intestinal and organismal health: a primer.</a> EMBO Mol Med. 15 (2), e16427(2023).</li>
<li>Hooper, L. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epithelial+cell+contributions+to+intestinal+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Immunol%22%5BJournal%5D)">Epithelial cell contributions to intestinal immunity.</a> Adv Immunol. 126, 129-172 (2015).</li>
<li>Atanga, R., Singh, V., In, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intestinal+enteroendocrine+cells%3A+present+and+future+druggable+targets%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Intestinal enteroendocrine cells: present and future druggable targets.</a> Int J Mol Sci. 24 (10), 8836(2023).</li>
<li>Dicarlo, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quercetin+exposure+suppresses+the+inflammatory+pathway+in+intestinal+organoids+from+winnie+mice%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Quercetin exposure suppresses the inflammatory pathway in intestinal organoids from winnie mice.</a> Int J Mol Sci. 20 (22), 5771(2019).</li>
<li>Miura, S., Suzuki, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+mouse+and+human+organoid-forming+intestinal+progenitor+cells+by+direct+lineage+reprogramming%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Stem+Cell%22%5BJournal%5D)">Generation of mouse and human organoid-forming intestinal progenitor cells by direct lineage reprogramming.</a> Cell Stem Cell. 21 (4), 456-471.e5 (2017).</li>
<li>Barer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+dry+mass%2C+thickness%2C+solid+and+water+concentration+in+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Determination of dry mass, thickness, solid and water concentration in living cells.</a> Nature. 172 (4389), 1097-1098 (1953).</li>
<li>Popescu, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+imaging+of+cell+mass+and+growth+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Physiol+Cell+Physiol%22%5BJournal%5D)">Optical imaging of cell mass and growth dynamics.</a> Am J Physiol Cell Physiol. 295 (2), C538-C544 (2008).</li>
<li>Shin, S., Kim, D., Kim, K., Park, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+three-dimensional+fluorescence+and+optical+diffraction+tomography+of+live+cells+using+structured+illumination+generated+by+a+digital+micromirror+device%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Super-resolution three-dimensional fluorescence and optical diffraction tomography of live cells using structured illumination generated by a digital micromirror device.</a> Sci Rep. 8 (1), 9183(2018).</li>
<li>Kim, Y. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combining+three-dimensional+quantitative+phase+imaging+and+fluorescence+microscopy+for+the+study+of+cell+pathophysiology%5BTitle%5D)+AND+%22Yale+Biol+Med%22%5BJournal%5D)">Combining three-dimensional quantitative phase imaging and fluorescence microscopy for the study of cell pathophysiology.</a> Yale Biol Med. 91 (3), 267(2018).</li>
<li>Liu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+dual-contrast+three-dimensional+imaging+in+live+cells+via+optical+diffraction+tomography+and+fluorescence%5BTitle%5D)+AND+%22Photonics+Res%22%5BJournal%5D)">Simultaneous dual-contrast three-dimensional imaging in live cells via optical diffraction tomography and fluorescence.</a> Photonics Res. 7 (9), 1042-1050 (2019).</li>
<li>Schlüßler, R., et al. Combined fluorescence, optical diffraction tomography and Brillouin microscopy. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSchl%C3%BC%C3%9Fler%2C+R+%22bioRvix%22">bioRvix</a>. , (2020).</li>
<li>Chowdhury, S., Eldridge, W. J., Wax, A., Izatt, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structured+illumination+multimodal+3D-resolved+quantitative+phase+and+fluorescence+sub-diffraction+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Optics+Exp%22%5BJournal%5D)">Structured illumination multimodal 3D-resolved quantitative phase and fluorescence sub-diffraction microscopy.</a> Biomed Optics Exp. 8 (5), 2496-2518 (2017).</li>
<li>Jo, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+multiplexed+microtomography+of+endogenous+subcellular+dynamics+using+generalizable+deep+learning%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Label-free multiplexed microtomography of endogenous subcellular dynamics using generalizable deep learning.</a> Nat Cell Biol. 23 (12), 1329-1337 (2021).</li>
<li>Oh, C., Hugonnet, H., Lee, M., Park, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Digital+aberration+correction+for+enhanced+thick+tissue+imaging+exploiting+aberration+matrix+and+tilt-tilt+correlation+from+the+optical+memory+effect%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Comm%22%5BJournal%5D)">Digital aberration correction for enhanced thick tissue imaging exploiting aberration matrix and tilt-tilt correlation from the optical memory effect.</a> Nat Comm. 16 (1), 1685(2025).</li>
<li>Yasuhiko, O., Takeuchi, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In-silico+clearing+approach+for+deep+refractive+index+tomography+by+partial+reconstruction+and+wave-backpropagation%5BTitle%5D)+AND+%22Light+Sci+Appl%22%5BJournal%5D)">In-silico clearing approach for deep refractive index tomography by partial reconstruction and wave-backpropagation.</a> Light Sci Appl. 12 (1), 101(2023).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>48웰 플레이트&nbsp;</td><td>코 닝</td><td>3548</td><td>배양 요리</td></tr><tr><td>세포 회수 솔루션&nbsp;</td><td>코 닝</td><td>354253</td><td>마트리겔 분해&nbsp;</td></tr><tr><td>시스플라틴</td><td>수펠코</td><td>PHR1624</td><td>해당 사항 없음</td></tr><tr><td>디메틸 설폭사이드(DMSO)</td><td>시그마-알드리치</td><td>D2650</td><td>차</td></tr><tr><td>Eppendorf 튜브</td><td>코 닝</td><td>MCT-175-CS</td><td>해당 사항 없음</td></tr><tr><td>HTX 처리 서버</td><td>Tomocube Inc., 한국</td><td>해당 사항 없음</td><td>데이터 처리 서버</td></tr><tr><td>HT-X1 시리즈</td><td>Tomocube Inc., 한국</td><td>해당 사항 없음</td><td>운영 소프트웨어</td></tr><tr><td>일라스틱</td><td>해당 사항 없음</td><td>해당 사항 없음</td><td>기계 학습 기반 세분화 툴킷</td></tr><tr><td>이미징 접시 용기 홀더&nbsp;</td><td>Tomocube Inc., 한국</td><td>해당 사항 없음</td><td>이미징 접시 홀더</td></tr><tr><td>IntestiCult 오가노이드 성장 배지 (마우스)</td><td>STEMCELL 기술</td><td>#06005</td><td>시중에서 판매되는 미리 만들어진 배양 배지&nbsp;</td></tr><tr><td>매트랩</td><td>매스웍스</td><td>매트랩 2024a</td><td>이미지 처리용 소프트웨어</td></tr><tr><td>마트리겔</td><td>코 닝</td><td>356231</td><td>3D 오가노이드용 ECM</td></tr><tr><td>밀리포어&nbsp; 스테리톱&nbsp; 진공 병 상단 필터</td><td>머 크</td><td>S2GPT05RE</td><td>0.22 &무; M 중간 살균용 필터 유닛</td></tr><tr><td>마우스 장 오가노이드</td><td>STEMCELL 기술</td><td>#70931</td><td>해당 사항 없음</td></tr><tr><td>굴절 계</td><td>애타고</td><td>R-5000</td><td>굴절률 계산기</td></tr><tr><td>토모디쉬</td><td>Tomocube Inc., 한국</td><td>901002-02</td><td>#1.5 커버슬립 바닥 이미징 접시</td></tr><tr><td>토모스튜디오 X</td><td>Tomocube Inc., 한국</td><td>해당 사항 없음</td><td>이미징 소프트웨어</td></tr><tr><td>트립레</td><td>깁코</td><td>12604</td><td>단일 세포 해리</td></tr></tbody></table>

저간섭성 홀로토마그래피를 통한 장내 오가노이드의 무표지, 고해상도 3d 이미징 및 머신러닝 분석

Label-free, High-Resolution 3D Imaging and Machine Learning Analysis of Intestinal Organoids via Low-Coherence Holotomography

그림 1은 sIO의 4D 이미징 및 정량 분석을 위한 개략적인 워크플로를 보여줍니다. 이 프로토콜은 배양, 4D 이미징, 이미지 처리 및 정량 분석의 4단계 프로세스를 통해 지속적인 라이브 이미징 및 sIO의 포괄적인 평가를 가능하게 합니다(그림 1D).
5일의 배양기 후, 성숙한 sIO를 저간섭 홀로단층촬영(HT)을 사용하여 시각화하기 위해 커버슬립 바닥 이미징 접시로 옮겼습니다(그림 1A). 이 이미징 기술은 디콘볼루션 알고리즘(그림 1B)을 통해 RI 단층 촬영을 재구성하여 살아있는 오가노이드의 고해상도, 무표지 이미징을 가능하게 합니다.
이후 기계 학습 지원 분할 접근 방식을 사용하여 이미지 처리가 수행되어 정확...

저간섭성 홀로토마그래피를 통한 장내 오가노이드의 무표지, 고해상도 3D 이미징 및 머신러닝 분석

Accurate, label-free imaging of intestinal organoids is crucial for studying their morphology, growth dynamics, and responses to environmental stimuli. ...

label-free-high-resolution-3d-imaging-machine-learning-analysis

Research

연구

JoVE Journal

Biology

생물학

Lensfree 광학 tomography은 &lt;1 μm의의 공간적 해상도를 제공하는 입체 현미경 기법이다 × &lt;1 μm의 × 15~1백밀리미터의 큰 이미지 볼륨여 각각 X, Y 및 Z 크기에서 &lt;3...

멀티 앵글 조명 및 픽셀 슈퍼 해상도를 채용 Lensfree 온칩 단층 현미경

광학 일관성 단층 촬영 (10 월), 3 차원 영상 기술, 모니터링 하 고 다세포 종양 spheroids의 성장 활동 특성 사용 되었다. 접근, 및 내장 광 감쇠 대비에 따라 spheroids에서 레이블 없는 죽은 조직 검출 복을 사용 하 여 종양 spheroids의 정확한 체적 정량화 시연 했다.

경도 형태 및 생리 적인 광학 일관성 단층 촬영을 사용 하 여 3 차원 종양 Spheroids의 모니터링

장기의 전체 3D 구조 및 세포 함량뿐만 아니라 원래 조직과 의학적 유사성은 여기에 설명된 단세포 분해능 3D 이미징 프로토콜을 사용하여 포획될 수 있다. 이 프로토콜은 원기, 크기 및 모양이 다양한 광범위한 오르가노이드에 적용할 수 있습니다.

단세포 분해능 3차원 알래기 알코노이드

우리는 스캐닝 전자 현미경의 자동화 된 이미징 절차와 함께 배열 단층 촬영 샘플로 사용하기 위해 대형 전송 지원에 직렬 섹션의 리본과 컬렉션의 준비를 설명합니다. 이 프로토콜을 통해 로컬, 희귀 한 이벤트의 스크리닝, 검색 및 표적 이미징및 대량 데이터 볼륨을 수집 할 수 있습니다.

스캐닝 전자 현미경 을 사용하여 대량 정보의 표적 수집을위한 배열 단층 학워크

여기에서 자사는 100μm에서 수 밀리미터 범위의 고정 3차원 세포 배양 모델의 염색 및 세포내 분해능 이미징을 수행하기 위한 상세하고 강력하며 보완적인 프로토콜을 제공하여 형태, 세포 유형 구성 및 상호 작용을 시각화할 수 있습니다.

3차원 오가노이드 및 스페로이드 모델의 염색 및 고해상도 이미징

이 논문은mm2당 수백 개의 마이크로컨테이너를 사용하는 새로운 유형의 배양 기질에 대한 제조 프로토콜을 제시하며, 이 배양에서 오가노이드는 고해상도 현미경을 사용하여 배양 및 관찰할 수 있습니다. 세포 파종 및 면역 염색 프로토콜도 자세히 설명되어 있습니다.

오가노이드의 배양 및 3D 이미징을 위한 고처리량 플랫폼

이 프로토콜은 종양 내 이질성을 포착하기 위해 다중 매개변수, 단일 오가노이드 약물 반응을 정량화하고 시각화하기 위한 중간 및 고처리량 오가노이드 약물 스크리닝 및 현미경에 구애받지 않는 자동 이미지 분석 소프트웨어를 위한 반자동 방법을 설명합니다.

벌크 및 단일 오가노이드 분석을 위한 광시야 라이브 셀 이미징을 사용한 다중 파라미터 종양 오가노이드 약물 스크리닝

여기에서는 감염 중 병원성 박테리아를 장기 전체에서 검출하고 형광 리포터 활동을 정량화할 수 있는 절차에 대해 설명합니다.

고분해능 3차원 전장기 단층촬영(High-resolution three-dimensional whole-organ tomography of microbial infections)

이 프로토콜은 광학 투명화(optical clearing)와 면역 라벨링(immunolabeling)을 결합하여 전체 마운트 망막 오가노이드의 전체 볼륨 컨포칼 이미징을 제공합니다. 3D 구조를 보존하여 주요 신경 경로를 자세히 시각화할 수 있으며, 망막 성숙, 공간 조직, 질병 모델링 및 개인 맞춤형 의학에서의 잠재적 응용에 대한 연구를 개선합니다.

Whole-mount Retinal Organoid Visualization with Cellular Resolution

공촛점 래맨 현미경에 따라 방법은 레이블이없는 식물 세포 벽에 리그닌의 시각화 및 다른 조직, 표본 또는 수종의 lignification의 비교를 내실수 것을 제공됩니다.

라벨 - 무료 현장에서</em식물 세포 벽 Lignification의> 이미징

배우세요 저간섭성 홀로토마그래피를 활용한 장내 오가노이드의 무표지 고해상도 3D 이미징 및 AI 기반 정량 분석 방법을. 실시간 구조 동태와 약물 반응을 비침습적으로 모니터링하여 질병 모델링과 정밀 의학 연구에 활용할 수 있습니다.

저간섭성 홀로토마그래피를 통한 장내 오가노이드의 무표지, 고해상도 3D 이미징 및 머신러닝 분석

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