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DOI: 10.3791/59038-v
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Interações da proteína-proteína são essenciais para sistemas biológicos, e estudos sobre a cinética de ligação fornecem insights sobre a dinâmica e a função dos complexos da proteína. Nós descrevemos um método que quantifica os parâmetros cinéticos de uma proteína complexa usando transferência de energia de ressonância de fluorescência e a técnica de fluxo parou.
Nosso método ajuda a estudar a cinética de uma formação complexa de proteínas. Descreve o quão apertado é um complexo proteico, e se a formação do complexo proteico é interferida por outras proteínas. Essa técnica permite estudar a interação proteína-proteína de forma quantitativa usando fluorescência como repórter, nosso ensaio pode monitorar a associação e a dissociação de um complexo proteico em tempo real.
Para começar, desenhe o ensaio FRET a partir dos dados do complexo COL1 CAND1 do banco de dados de proteínas. Carregue a estrutura em PyMOL e, em seguida, vá para o menu do assistente e use a função de medição para estimar a distância entre o primeiro aminoácido do CAND1 e o último aminoácido de COL1. Em seguida, carregue o visualizador de espectros on-line e visualize os espectros de excitação e emissão de 7-amino-4-metilcoumarina e FlASH simultaneamente.
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