Não-invasivo 3D Visualization com Sub-micron Resolução Usando Síncrotron-X-ray-tomografia

Hello.My nome é Michelle Ov, do Bats Lab da University of Tubing, e nesta apresentação quero falar sobre a visualização tridimensional não invasiva da organização interna do micro AHR puts usando tomografia de raios-X síncrotron com resolução submicrônica. O sistema modelo com o qual estamos trabalhando é o ácaro orbital Aus Long osis, uma saída micro COLYER AHR de 800 mícrons a um milímetro de tamanho corporal. Esta é uma foto tirada de todas as culturas de laboratório, onde você pode ver os animais se alimentando de algas.

Para estudar a organização interna do Argos, usamos radiação de raios-x síncrotron para produzir dados tomográficos VOX no SRF e Grable. Aqui você vê uma foto do ESRF com o grande anel de armazenamento e no canto superior direito você vê a sala experimental do ID 19, que está localizada fora do anel Para as medições, as amostras foram criticamente apontadas para a direita e montadas em pinos de plástico usando super cola. Os experimentos foram conduzidos a 20,5 KEV e 1.500 projeções foram feitas para as reconstruções.

Aqui você vê a câmera com um chip CCD co-freelance, faixa dinâmica de 14 bits e quatro megapixels. O simulador mostrado na parte inferior desta imagem traduz os raios-x em luz visível. Este é um close-up no suporte da amostra e na mesa de rotação.

A amostra é montada na cabeça do medidor Goya para permitir uma orientação adequada da amostra no feixe. Uma descrição detalhada da configuração experimental é fornecida em nosso artigo de 2007 no Journal of Microscopy. Nesta apresentação, vou me concentrar em analisadores de dados em relação à visualização tridimensional usando o software Fiji Studio Max.

Primeiro, mostrarei como remover os valores de cinza do plano de fundo para extrair as informações da amostra. No histograma, você vê um grande pico, que pertence principalmente aos valores de cinza do plano de fundo. Depois de remover esse pico do histograma, você pode ver a amostra saindo do cubo cinza.

A seguir, mostrarei como girar o objeto usando o codificador de teclas VG studio. Max tem um conjunto de trajetórias de câmera predefinidas. Aqui eu uso o círculo XY para gerar rotação em torno dos Xs verticais, e esta é a animação final.

A grande estrutura na parte de trás do animal corresponde à superfície da super cola. Agora vou mostrar como definir um plano de corte virtual para poder ter uma visão tridimensional da organização interna da amostra. Existem três orientações em que um plano de corte pode ser definido com zelo real frontal.

Aqui eu uso o plano frontal e encontro uma posição de corte em algum lugar no meio do animal, na região do, esse plano de corte não precisa ser estático. Novamente, usando o codificador, ele pode ser movido ao longo de qualquer eixo. Neste exemplo, eu uso o clipe predefinido Z para mover o plano de corte ao longo de um eixo longitudinal da amostra, e é assim que a animação final fica passo a passo, você pode ver e acompanhar a organização 3D de todas as estruturas internas com uma resolução P de apenas 0,7 mícrons.

Além das trajetórias de câmera predefinidas, também é possível gerar caminhos de câmera específicos do usuário. Para fazer isso, escolha o modo de olhar para a câmera livre e ajuste a câmera e a distância focal da lente virtual para qualquer posição desejada. Passo a passo, novas posições de câmera podem ser definidas para seguir um caminho individual de qualquer complexidade.

A janela 3D no canto superior esquerdo mostra o efeito de todas as configurações da câmera em tempo real. O exemplo final leva você a um voo virtual seguindo o sistema digestivo completo através do animal. Aqui você vê algumas partes do gma, a mina de carvão, o labrum e a rotella.

Estamos nos aproximando e entrando na boca do animal. Aqui você pode ver os PHNs no lado dorsal. Agora estamos passando pelo esôfago para entrar nos ventriculares.

Nossos ácaros rebitados têm dois grandes ker. Estas são estruturas semelhantes com função digestiva. Entramos no seum certo.

Através de sua pequena abertura, você pode ver inúmeras células IDE. Estes desempenham um papel importante na digestão, embora a função e o mecanismo completos ainda não sejam completamente compreendidos. Voltando aos ventriculares, vemos uma estrutura particular, a válvula Isal através da qual realmente entramos nos ventriculares há um minuto, bem na borda dos ventrículos e do cólon.

Você pode ver um touro alimentar, que é compactado e cercado por membrana atrófica. Atrás do bolo alimentar, você vê uma paleta fecal. Estamos voando por esta paleta FE agora.

Depois, passamos o ponto e vírgula curto e entramos no pós-ponto. Aqui você vê o grande e característico microbianamente. Finalmente, você pode ver a superfície interna das placas de animais específicas aqui, assim como uma paleta fe.

Deixamos o sistema digestivo. Agora temos uma breve olhada final no lado ventral externo do animal e vemos as placas de um animal, as placas AAL e as placas genitais.