Автоматизированный анализ Шолл оцифрованных нейронов морфологии в различных масштабах

33.8K просмотров

Цитируется: 62

11:41 мин.

14 ноября 2010 г.

10.3791/2354-v

14 ноября 2010 г.

33.8K просмотров
 ,  ,  ,  , 

* These authors contributed equally

Мы разработали компьютерную программу для анализа нейронной морфологии. В сочетании с двумя существующими открытыми инструменты анализа источников, наша программа выполняет Шолл анализа и определяет количество невриты, точек ветвления и аксонов советы. Анализы выполняются так, что локальные изменения в морфологии аксонов можно наблюдать.

Больше видео

Анализ дендритов

Chapters in this video

0:00

Название

0:20

Введение

1:20

Подготовка к автоматизированному Шолль-анализу

2:14

Трассировка нейронов в NeuronJ

4:52

Использование Bonfire для создания предварительных .swc-файлов на основе данных NeuronJ

6:27

Использование NeuronStudio для окончательного формирования .swc-файлов

7:57

Использование 'bonfire' для извлечения морфологических данных и 'bonfire_results' для просмотра данных

9:06

Использование 'bonfire_export' для экспорта данных в Excel

11:21

Заключение

Related Videos