21 марта 2025 г.
В данной работе мы представляем систематический метод, описывающий квазиобратимую самосборку покрытых бета-амилоидом 1-40 (Aβ 1-40) золотых агрегатов размером 20 нм. Наноразмер-зависимая квазиобратимая сеть между пептидами коррелировала с конкретными аминокислотами или участками мономера Aβ 1-40.
Основное внимание в моем исследовании уделяется получению критически важной подтверждающей информации о бета-амилоиде 1-40, когда он поглощается поверхностью наночастиц золота и происходит обратимый процесс агрегации. Задача, стоящая перед нами в этой области исследований, заключается в получении тепловой, химической и динамической информации о процессе обратной агрегации. Важным открытием этого проекта является то, что мы можем идентифицировать конкретное движение или режим вибрации, способствующий свернутому или развернутому подтверждению бета-амилоида 1-40, когда они поглощаются на поверхности наночастиц золота.
Большим преимуществом использования SERS, спектроскопии комбинационного рассеяния с поверхностным усилением, является обнаружение очень малых, слабых сигналов рассеяния для определения моды, которая имеет решающее значение для возникновения сворачивания и развертывания. В то же время мы можем точно определить морфологию агрегатов. Результаты, которые мы можем получить в результате этого проекта, являются ключевым взаимодействием белок-белкового взаимодействия, которое будет иметь важное значение для возникновения олигомера и которое приведет к фиброгенезу.
Для начала с помощью микропипетки добавьте один миллилитр дистиллированной деионизированной воды к одному миллиграму бета-лиофилизированного амилоида, или бета-амилоида А 1-40. Перемешайте раствор с помощью вихревого миксера в течение примерно 30 секунд. Убедитесь, что в растворе не осталось твердых частиц при комнатной температуре, примерно 20 градусов Цельсия.
Далее приготовьте пептидные стоковые растворы с использованием деионизированной и дистиллированной воды. Определите концентрацию пептида путем спектроскопического измерения поглощения тирозина на глубине 275 нанометров. Храните стоковые растворы A beta 1-40 при температуре минус 80 градусов Цельсия.
Разморозьте пептидный исходный раствор примерно за пять минут до сбора данных. В 15-миллилитровой центрифужной пробирке смешайте восемь микролитров раствора пептида с 800 микролитрами коллоидных частиц золота. Добавьте 4,2 миллилитра деионизированной дистиллированной воды, затем сделайте образец вихревым в течение 10 секунд.
Зафиксировать концентрацию пептидов A beta 1-40 на уровне 1,8 наномоляра и отрегулировать соотношение пептидов к коллоидным частицам золота в определенном диапазоне. С помощью блока контроля температуры УФ-видимого спектрофотометра установите температуру раствора при комнатной температуре, примерно 22 градуса Цельсия. Контролируйте начальный pH раствора образца с помощью pH-метра и отрегулируйте его до уровня чуть ниже pH 7.
Собирайте спектр поглощения в диапазоне от 400 до 800 нанометров. Затем отрегулируйте pH образца примерно до pH четыре, добавив 1,0 микролитра молярной соляной кислоты. Собирайте спектр поглощения в том же диапазоне от 400 до 800 нанометров.
Затем отрегулируйте pH образца примерно до pH 10, добавив примерно 1,5 микролитра 1,0 молярного гидроксида натрия. Сбор спектра поглощения в том же диапазоне длин волн от 400 до 800 нанометров. После этого измените pH от pH 4 до pH 10 10 раз, добавив либо соляную кислоту, либо гидроксид натрия.
Непрерывно собирайте спектр поглощения при температуре 25 градусов Цельсия. Получение набора данных ASCII о длинах волн в зависимости от поглощения. Используйте программу PeakFit для извлечения средних положений вершин полосы.
Используя функцию графика, постройте график набора данных, чтобы визуализировать оптическую плотность в зависимости от длины волны. Определите и отметьте начальные пиковые длины волн, лямбду 1 и лямбду 2, выбрав их приблизительное положение на построенных графиках. Подгонка данных осуществляется с помощью функции пиковой аппроксимации исходной программы.
Получите график, отображающий центральные положения пиков для каждой лямбды, обозначенной как XCI, вместе с соответствующими областями канала, обозначенными как AI. Экспортируйте извлеченные положения вершин и соответствующие области в программу для анализа электронных таблиц. Рассчитайте весовой коэффициент, AI, для каждого центра пика, сравнив площадь полосы с общей площадью всех полос по отображаемой формуле. Затем извлеките среднее положение пика с помощью уравнения, отображаемого на экране.
Чтобы построить график обратимости, сведите в таблицу средние положения пиков в зависимости от номера операции N. Присвойте номер операции N, как указано на экране. Проанализируем положение пика в точке N с помощью выведенной формулы. Перенесите рассчитанный набор данных в исходное программное обеспечение и постройте его на график.
Выберите нелинейную аппроксимацию кривой анализа, введите начальные значения для A, B, C, D и E и нажмите кнопку "Выполнить", чтобы завершить процесс аппроксимации кривой. Для выполнения комбинационной визуализации для каждого образца под номером операции N необходимо поместить 100 микролитров раствора на слюдяной диск диаметром один сантиметр. Перед измерением дайте образцам высохнуть в течение ночи.
Затем соберите изображения в белом свете для каждой операции под номером N. Подготовьте отдельный образец на новом слюдяном диске, так как pH постоянно изменяется в диапазоне от 4 до 10. Соберем рамановское изображение для каждого номера операции, причем с использованием упомянутых спецификаций лазера с длиной волны 633 нанометра. Захватывайте изображения в сетке 100 на 100 пикселей с определенным временем интегрирования, фокусируясь на нужной области спектра.
Постройте репрезентативный спектр для каждой операции с числом N, выровненный как функция N.Постройте трехмерную спектроскопию комбинационного рассеяния света с усиленной поверхностью, или спектр SERS, как функцию N для 20-нанометрового золота с покрытием A beta 1-40. Используйте вид спектра сверху в качестве контурной карты для выделения конкретных мод, связанных с определенным состоянием pH. Идентификация спектральных особенностей с улучшением только при четных или нечетных числах операций.
Полоса SPR наночастиц золота с покрытием A beta 1-40 сместилась с 530 нанометров до примерно 650 нанометров, когда раствор стал более кислым. Это соответствовало образованию коллоидных агрегатов золота с развернутыми мономерами бета-1-40 А, наблюдаемым методом ПЭМ. Также было очевидно pH-зависимое изменение цвета золота с покрытием A beta 1-40.
Обратимый pH-зависимый сдвиг средней полосы достиг пика между более короткой и длинной длиной волны, а чередование дисперсной и агрегатной морфологии, наблюдаемое в ПЭМ, подтвердило квазиобратимый характер процесса. Визуализация в белом свете показала четкую обратимую картину агрегации, соответствующую сдвигам pH, в то время как спектры SERS показали тонкие pH-зависимые изменения в области отпечатков пальцев.
Это исследование представляет систематический метод квазиобратимого самосбора аминобето-1-40 (Aβ 1-40) покрытых золотыми наночастицами. Исследование направлено на понимание процесса агрегации Aβ 1-40 при абсорбции на золотых поверхностях, раскрывая критические взаимодействия, которые влияют на складывание белков.
Precise characterization of pH-dependent reversible self-assembly of amyloid beta 1-40 on gold colloids enables mechanistic de-risking in early-stage neurodegeneration research. Quantitative SPR and SERS outputs provide predictive confidence for target validation and aggregation pathway interrogation. This workflow supports portfolio triage by clarifying aggregation mechanisms relevant to Alzheimer's disease models.
This method integrates into the discovery-to-preclinical continuum by enabling hypothesis-driven aggregation studies, quantitative assay development, and translational biomarker alignment.