לפעמים, חומרים, כגון יונים טעונים, נדחים על-ידי השכבה ההידרופובית של הקרום, ובכך עוצרים דיפוזיה בתהליך העברה תוך סיוע, או דיפוזיה מסתייעת, מולקולות יכולות לנוע מעבר לקרום באמצעות חלבוני תעלה או חלבוני נשא המאפשרים פעפוע ללא צריכת אנרגיה נוספת. הסוג הראשון, חלבוני תעלה, יוצרים נקבובית הידרופילית שדרכה המולקולות הטעונות יכולות לעבור, ובכך להמנע מהשכבה ההידרופובית של הקרום. תעלות אלה או פתוחות תמיד או מבוקרות על-ידי מנגנון כלשהו לשליטה על זרימה.הקטגוריה השנייה, חלבוני נשא, קושרים חומרים מסוימים, וגורמים לשינוי קונפורמטיבי של התעלה, מה שמאפשר תנועה במורד המפל. מסיבה זו, קצב ההעברה אינו תלוי במפל הריכוזים, אלא במספר חלבוני הנשא הזמינים. למרות היותה מורכבת יותר מדיפוזיה פשוטה, העברה תוך סיוע מאפשרת דיפוזיה המתרחשת בקצב מדהים, שבה חלבוני תעלה מעבירים עשרות מיליונים של מולקולות בשנייה, בעוד חלבוני נשא מעבירים אלף עד מיליון מולקולות בשנייה.