При РНК-интерференции, или РНКi, малые РНК привязываются к информационной РНК, мРНК, для предотвращения трансляции белка. Сначала синтезируется двухцепочечная РНК с последовательностью, дополняющей целевой ген. Это может быть короткая интерферирующая РНК имеющая около 22 нуклеотидов в длину, или siRNA-предшественник, такая как малая РНК-шпилька Если используется shРНК, ферменты в клетках, такие как дайсер, расщепляют её до siРНК, которая затем связывается с группой белков, называемой комплексом РНК-индуцированного выключения гена, RISC, и цепи разделяются.Ведущая цепь, та, которая остаётся привязанной к RISC, затем привязывается к её дополнительной последовательности в мРНК. Аргонавт, фермент, который является частью RISC, а затем расщепляет и деградирует мРНК, тем самым выключая целевой ген.