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3.1:

What are Proteins?

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Molecular Biology
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What are Proteins?

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– [Narrador] Una proteína es una cadena de aminoácidos, que contiene aminoácidos designados como R, unidos a un núcleo de carbono. Los aminoácidos se enlazan a través de enlaces peptídicos covalentes, y la serie repetitiva de átomos a lo largo del núcleo se denomina columna vertebral del polipéptido. La secuencia comienza en el extremo N, con un grupo amino libre, NH3 +, y termina con el extremo C, un grupo carboxilo libre, COO-. Cada proteína es única, dependiendo de la cantidad de aminoácidos y sus cadenas laterales. Por ejemplo, la hormona liberadora de tiroides tiene 234 aminoácidos, mientras que la conectina de la proteína muscular elástica tiene más de 34.000. Además, hay 20 cadenas laterales diferentes, que se dividen en uno de cuatro grupos. Los aminoácidos polares negativos, como los ácidos aspártico y glutámico, tienen cadenas laterales con un grupo carboxilo. Debido a esto, actúan como un ácido a pH neutro. Los aminoácidos polares positivos actúan como bases y tienen un grupo amino en su cadena lateral. Varios aminoácidos son polares pero sin carga. Tienden a ser hidrofílicos, y constituyen la porción externa de una proteína plegada, donde están libres para interactuar con el ambiente acuoso. Por último, un gran grupo de aminoácidos contiene cadenas laterales no polares. Pueden ser simples, como en glicina, o complejos, como la prolina y el triptófano. Las cadenas laterales no polares generalmente hacen que el aminoácido sea hidrófobo, formando el núcleo de muchas proteínas.

3.1:

What are Proteins?

Visión general

Las proteínas son cadenas de aminoácidos que están conectados por enlaces peptídicos y plegados en una estructura tridimensional. Las cadenas laterales de residuos de aminoácidos individuales determinan las interacciones entre los residuos de aminoácidos, y en última instancia el plegado de la proteína. Dependiendo de la longitud y la complejidad estructural, las cadenas de residuos de aminoácidos se clasifican como oligopéptidos, polipéptidos o proteínas.

Los residuos de aminoácidos son los bloques de construcción de las proteínas

Un aminoácido es una molécula que contiene un grupo carboxilo (–COOH) y un grupo amino (–NH2) unido al mismo átomo de carbono, el α-carbono. La identidad del aminoácido está determinada por su cadena lateral o residuo lateral, a menudo llamado el grupo R. El aminoácido más simple es la glicina, donde el residuo es un solo átomo de hidrógeno. Otros aminoácidos llevan cadenas laterales más complejas. La cadena lateral determina las propiedades químicas del aminoácido. Por ejemplo, puede atraer o repeler el agua (hidrófila o hidrófoba), llevar una carga negativa (ácida) o formar enlaces de hidrógeno (polar).

De todos los aminoácidos conocidos, sólo 21 se utilizan para crear proteínas en eucariotas (el código genético codifica sólo 20 de estos). Los aminoácidos se abrevian utilizando un código de tres letras (por ejemplo, Gly, Val, Pro) o un código de letra (por ejemplo, G, V, P). La cadena lineal de residuos de aminoácidos forma la columna vertebral de la proteína. El grupo amino libre en un extremo se llama N-terminal, mientras que el grupo carboxilo libre en el otro extremo constituye el C-terminal. Las propiedades químicas de las cadenas laterales determinan en gran medida la estructura final de la proteína a medida que interactúan entre sí y con moléculas de agua polar.

Para formar un polipéptido, los aminoácidos están unidos entre sí por enlaces peptídicos. Los enlaces peptídicos se forman entre el grupo amino (–grupo NH2) de un aminoácido y el grupo carboxilo (–COOH) del aminoácido adyacente. Las proteínas se forman por síntesis de deshidratación. Cada molécula de agua se forma durante la vinculación de dos aminoácidos. El enlace covalente resultante es un enlace peptídico.

El pH del medio circundante determina la función química de los aminoácidos

Los aminoácidos tienen un grupo básico y un grupo ácido. Por lo tanto, pueden actuar como base (receptor de iones de hidrógeno) o como ácido (donante de iones de hidrógeno). La propiedad química depende del pH del medio circundante. A pH bajo (por ejemplo, pH2) tanto el carboxilo como los grupos amino están protonados (–NH3, –COOH), por lo que el aminoácido actúa como base. En un pH alcalino (por ejemplo, pH13), tanto el carboxilo como los grupos amino están desprotonados (–NH2, –COO) y el aminoácido actuará como un ácido. En un pH neutro (es decir, la mayoría de los entornos fisiológicos, pH7.4), el grupo amino es protonado (–NH3) y el grupo carboxilo es desprotonado (–COO), dando lugar a un zwitterion, una molécula con una carga positiva y negativa. Estas propiedades químicas en el pH fisiológico son esenciales para crear enlaces de hidrógeno, que a su vez contribuyen a la formación de estructuras proteicas más complejas.

La longitud, la complejidad estructural y la funcionalidad distinguen un polipéptido de una proteína

Los polipéptidos son cadenas de aminoácidos. Los polipéptidos con menos de 20 aminoácidos también se conocen como oligopéptidos, o simplemente péptidos. Una cadena de polipéptidos se conoce como proteína cuando se pliega en una estructura tridimensional, lista para realizar su función celular específica.

Las proteínas son bloques de construcción esenciales de la vida

Junto con los carbohidratos, los ácidos nucleicos y los lípidos, las proteínas son los bloques de construcción fundamentales de la vida. Las proteínas exhiben una enorme diversidad en su composición y, por lo tanto, función. Entre otras funciones, proporcionan estructura a una célula (por ejemplo, en forma de colágeno), permiten el movimiento (por ejemplo, actina y miosina en los músculos), catalizan reacciones (enzimas), llevan moléculas a través de la membrana celular y defienden vertebrados contra los invasores (anticuerpos).