Back to chapter

4.12:

منظمات البروتين المرتبطة تساهميا

JoVE Core
Molecular Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Molecular Biology
Covalently Linked Protein Regulators

Languages

Share

العديد من البروتينات تكون منظّمة من خلال الجزيئات المتبطة تساهميا 00:00:05.650 00:00:09.070 بما في ذلك المجموعات الوظيفية مثل شقوق الميثيل أو الأسيتيل والبروتينات الصغيرة مثل الكيكويتين الروابط التساهمية تحدث على أحماض أمينية محددة في سلسلة عديدة البيبتيدات. على سبيل المثال،مجموعات الفوسفات تكون مرتبطة تساهميا بالسيرين الثيريونين أو التيروزين. مجموعات الميثيل والأسيتيل مرتبطة بالليسين.و اليوبيكويتين يرتبط بالجزيئات المنفردة اللايزين سيستين و سيرين, أو ثيريونين. إنزيم أو زوج من الإنزيمات تحفز تعديلات ما بعد الترجمة بشكل عكسي أسيتيل ترانسزفيراز يمكن ان ينقل الاستيل للبرولين بينما دى اسيتايلاز يمكنه أن يقوم بإزالة المجوعة لاحقا. هذه التعديلات قادرة على القيام بتغيير وظيفة البروتين أو موقعه في الخلية.على سبيل المثال،إضافة الاستيل لبروتينات الهيستون ينظم التعبير الجيني من خلال فتح بُنية دى إن إيه لتنشيط نسخ الجينات. إضافة الميثايل للهيستوون من ناحية أخرى،معروفة بأنها تحد من النسخ من خلال إحكام بنية الدى ان ايه. و مثال آخر هو بى 35 إيه البروتين المتعدد الأساسى المثبط للورم يمر بعدة تعديلات تساهمية استجابة للإجهاد.التعرض إلى العوامل الضارة بالحمض النووي،مثل الأشعة فوق البنفسجية وأشعة جاما يمكن أن يؤدي إلى فسفرة البروتين. الفسفرة تحسن الأستقرار وتنشط 53 بى فتتسبب في ربطه بالحمض النووي الذى حدث له تلف بالإشعاع ويمنع الخلايا التى بها دى إن إيه متحور من الإنقسام إلى الغير موجه. بالإضافة إلى الفسفرة،هناك أنواع مختلفة من التعديلات التي تحدث على جزىء بروتين واحد مثل 53 بى يسمح له بالتحكم بكل دقة فى وظائفه،مثل توقف دورة الخلية, و إصلاح دى إن أيه 00:01:58.540 00:02:02.340 الموت المبرمج للخلية.

4.12:

منظمات البروتين المرتبطة تساهميا

يمكن أن تخضع البروتينات لأنواع عديدة من التعديلات اللاحقة للترجمة، غالباً استجابة للتغيرات في بيئتها. تلعب هذه التعديلات دوراً مهماً في وظيفة واستقرار هذه البروتينات. تشتمل الجزيئات المرتبطة تساهمياً على مجموعات وظيفية، مثل الميثيل، مجموعات الأسيتيل والفوسفات، وكذلك البروتينات الصغيرة، مثل يوبيكويتين. هناك حوالي 200 نوع مختلف من المنظمين التساهمي الذين تم تحديدهم.

تعدل هذه المجموعات أحماض أمينية معينة في البروتين. لا يمكن ربط مجموعات الفوسفات إلا تساهمياً بالأحماض الأمينية سيرين وثريونين وتيروزين، في حين لا يمكن ربط مجموعات الميثيل والأسيتيل إلا بالليسين. &#160؛ تتم إضافة هذه المجموعات إلى البروتين وإزالتها منه بواسطة إنزيم أو زوج من الإنزيمات. &#160؛&#160؛&#160؛ على سبيل المثال، يضيف أسيتيل ترانسفيراز مجموعة أسيتيل إلى بروتين، ويمكن أن يزيلها ديستيلاز. يمكن أن يكون لكل من هذه المعدلات تأثيرات مختلفة على البروتين المرتبط به اعتماداً على عدد التعديلات وموقعها. عندما يرتبط جزيء يوبيكويتين واحد تساهمياً بمستقبل معين على سطح الخلية، فإن هذا البروتين يكون هدفاً للالتقام الخلوي؛ من ناحية أخرى، عندما يتم ربط العديد من اليوبيكويتين معاً بهذا البروتين، يتم تمييزه كهدف للتحلل التحلل للبروتين.

يمكن أن يخضع بروتين واحد لتعديلات متعددة في وقت واحد للتحكم في وظيفته. أحد الأمثلة المعروفة لبروتين منظم بواسطة تعديلات تساهمية متعددة هو بروتين مثبط الورم، p53.&#160؛ يخضع p53 لمجموعة متنوعة من التعديلات استجابة لأنواع مختلفة من الإجهاد، بما في ذلك الإشعاع والمواد المسرطنة. تتضمن بعض التعديلات الفسفرة، والأستلة، والسومويليشن (sumoylation) استجابةً لإشعاعات الأشعة فوق البنفسجية وجاما. يمكن أن تختلف مواقع وأنواع التعديلات اعتماداً على عامل الإجهاد. أظهرت الدراسات أن الأشعة فوق البنفسجية وأشعة جاما يمكن أن تؤدي إلى فسفرة السيرين 33، ولكن يمكن فسفرة السيرين 392 عند تعرضه للأشعة فوق البنفسجية ولكن ليس لأشعة جاما. يمكن أن تؤدي الأنواع الأخرى من الإجهاد، مثل التعرض لنقص الأكسجة ومضادات الأيض والأكتينوميسين D، إلى أستلة p53. يمكن أن تختلف التعديلات أيضاً بين أنواع الخلايا والكائنات المختلفة.

Suggested Reading

  1. 1PDB ID: 1UBQ
    Vijay-Kumar, S., Bugg, C.E., Cook, W.J.(1987) Structure of ubiquitin refined at 1.8 A resolution. J Mol Biol 194: 531-544. DOI: 10.1016/0022-2836(87)90679-6
  2. H.M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, T.N. Bhat, H. Weissig, I.N. Shindyalov, P.E. Bourne. (2000) The Protein Data Bank Nucleic Acids Research, 28: 235-242.
  3. D. Sehnal, A.S. Rose, J. Kovca, S.K. Burley, S. Velankar (2018) Mol*: Towards a common library and tools for web molecular graphics MolVA/EuroVis Proceedings. doi:10.2312/molva.20181103
  4. Alberts et al., 6th edition; pages 157-158, 165-166
  5. Le, D. D., & Fujimori, D. G. (2012). Protein and nucleic acid methylating enzymes: mechanisms and regulation. Current opinion in chemical biology, 16(5-6), 507–515. doi:10.1016/j.cbpa.2012.09.014
  6. Khidekel, N., & Hsieh-Wilson, L. C. (2004). A ‘molecular switchboard’—covalent modifications to proteins and their impact on transcription. Organic & biomolecular chemistry, 2(1), 1-7.
  7. Maclaine, N. J., & Hupp, T. R. (2009). The regulation of p53 by phosphorylation: a model for how distinct signals integrate into the p53 pathway. Aging, 1(5), 490.