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5.12:

Modification des histones

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Molecular Biology
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JoVE Core Molecular Biology
Histone Modification

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Un nucléosome contient un ensemble de protéine qui est composé de quatre histones de base-H2A, H2B, H3 et H4.En plus de ces quatre histones de base standard, les eucaryotes possèdent également quelques variants de chaque histone, à l’exception de H4.Les queues amino-terminales des histones du cœur standard et variant dépassent des nucléosomes et sont non structurées et très mobiles. Ces queues, composées d’environ 30 acides aminés, sont soumises à plusieurs formes de modifications covalentes, telles que l’acétylation des lysines, la phosphorylation des sérines et la mono, di ou triméthylation des lysines. Les réactions qui conduisent à ces modifications sont catalysées par différentes enzymes, telles que les méthyltransférases, les acétylases et les kinases.Ces groupes d’enzymes sont collectivement appelés les writers. Les réactions qui catalysent l’élimination de ces groupes chimiques sont catalysées par des enzymes telles que les déméthylases, les déacétylases et les phosphatases. Ces enzymes sont collectivement appelées les erasers.Parmi les nombreuses combinaisons possibles de différents variants d’histone et de modifications finales amino-terminales, seulement certains ensembles coordonnés sont connus. Certains de ces ensembles combinés de modifications encodent un signal spécifique pour la cellule. Par exemple, un ensemble de modifications signale des dommages de l’ADN et le besoin de réparation.Un autre signale l’expression des gènes, tandis que d’autres signalent l’inhibition ou la modification de la chromatine, comme l’établissement et la propagation de l’hétérochromatine. Ce système de codage est appelé code des histones. Les signaux codés dans ces modifications sont décodés par des protéines régulatrices spécifiques appelées readers.Ces protéines et complexes multiprotéiques contiennent divers petits domaines, chacun reconnaissant une marque d’histone particulière. Ils se lient étroitement à une région de chromatine qui contient plusieurs marques d’histone différentes et attirent des complexes protéiques supplémentaires avec des activités catalytiques. Cela conduit à des fonctions biologiques spécifiques, telles que la modification de la chromatine, l’expression des gènes et la neutralisation des gènes.

5.12:

Modification des histones

Les protéines d’histone ont une queue N-terminale flexible s’étendant à partir du nucléosome. Ces queues d’histone sont souvent soumises à des modifications post-traductionnelles telles que l’acétylation, la méthylation, la phosphorylation et l’ubiquitination. Des combinaisons particulières de ces modifications forment les &# 8220;codes d’histone” qui influencent le repliement de la chromatine et l’expression des gènes spécifiques aux tissus.

Acétylation

L’enzyme histone acétyltransférase ajoute un groupe acétyle aux histones. Une autre enzyme, l’histone désacétylase, élimine le groupe acétyle des histones acétylées. Les acides aminés de la lysine aux positions 4 et 9 de la queue d’histone N-terminale sont souvent acétylés et désacétylés. L’acétylation augmente la charge négative des histones. Cela affaiblit l’interaction ADN-histone entraînant un relâchement de la chromatine et un accès accru à l’ADN. Par exemple, dans les cellules érythroïdes, le gène de la bêta-globine est associé à des histones acétylées qui augmentent son expression. Dans les cellules non érythroïdes où le gène est inactif, il est associé à des histones non acétylées.

Méthylation

Les queues d’histone à la position lysine 9 de l’histone H3 peuvent être di- ou tri-méthylées par l’enzyme histone méthyltransférase. Cette méthylation peut initier la liaison des protéines non histones et augmenter la compaction de la chromatine. La méthylation augmente la charge positive sur les histones, entraînant une affinité accrue entre l’ADN et les histones chargés négativement et un compactage plus élevé de la chromatine. La chromatine réprimée, également connue sous le nom d’hétérochromatine, est hautement méthylée.

Tableau récapitulatif des modifications des histones et de leur effet sur l’expression des gènes

Modification des histones Effet sur l’expression des gènes
Lysine acétylée Activation
Lysine hypoacétylée Répression
Sérine/thréonine phosphorylée Activation
Arginine méthylée Activation
Lysine méthylée Répression
Lysine ubiquitinylée Activation/Répression

Les codes ou modifications des histones sont hérités de manière épigénétique, ce qui signifie que ces modifications ne sont pas codées génétiquement. Par conséquent, ces modifications sont fidèlement transmises à la cellule suivante lors de chaque division cellulaire en tant que mémoire épigénétique.

Suggested Reading

  1. Margueron, Raphaël, and Danny Reinberg. "Chromatin structure and the inheritance of epigenetic information." Nature Reviews Genetics 11, no. 4 (2010): 285-296.
  2. Molecular Cell Biology, Lodish, 8th edition, Pages 330-333, 405-406.