Back to chapter

5.17:

Kromatin Yapıların Kalıtımı

JoVE Core
Molecular Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Molecular Biology
Inheritance of Chromatin Structures

Languages

Share

Tüm somatik hücreler aynı genetik bilgiyi içerse de, karaciğer hücreleri bölündüğünde yalnızca karaciğer hücreleri oluşur ve deri hücreleri bölündüğünde yalnızca deri hücreleri oluşur. Her doku tipindeki spesifik kromatin paketlemesi ve histon modifikasyonları, farklı gen ekspresyonu modelleriyle sonuçlanır. Sentromer, heterokromatin ve ökromatin bölgeleri gibi kromatinin bu yapısal özellikleri, epigenetik olarak kalıtsaldır;yani genetik materyalin yanı sıra özellikleri de anneden yavru hücreye geçer.Bu, karaciğer veya derinin veya diğer özelleşmiş hücrelerin dokuya-özel fenotiplerinin, genetik materyalde değişiklik olmasına gerek kalmadan hücre bölünmesinin her turunda aktarıldığı anlamına gelir. Yeni sentezlenen DNA üzerindeki yeni sentromer oluşumu, sentromere özgü nükleozomları oluşturmak için histon H3 varyantı CENP-A’nın AT-zengini uydu DNA’ya bağlanmasıyla başlar. Bir kez başlatıldığında, birlikte hareket eden yapı, seçici bir şekilde yakınına daha fazla CENP-A histonu alır.DNA replikasyonu sırasında, replikasyon çatalının önündeki histon oktameri, iki H2A/H2B dimerine ve H3/H4 tetramerine bölünür. İki H2A/H2B dimeri oktamerden tamamen çıkarılırken, H3/H4 tetramerleri DNA’ya gevşek bir şekilde bağlanır ve rastgele olarak yavru zincirlere dağıtılır. Yeni sentezlenen H3/H4 tetramerleri daha sonra, boşlukları doldurmak için her iki zincire de eklenir.Bunu, oktameri tamamlamak için yarısı orijinal moleküller ve diğer yarısı yenilerden olan, iki H2A/H2B dimerinin eklenmesi izler. Mayada, DNA replikasyonunu takiben, yeni sentezlenen zincirdeki histon H3’ün asetilasyonu, ökromatini işaretler;histon H3’ün deasetilasyonu ise kompakt kromatin alanlarının veya heterokromatinin konumunu belirler. Histon H3 metilasyonu, kromatinin yoğunlaşmasına neden olur.DNA replikasyonundan sonra, metillenmiş histonlar, yavru zincirlere rastgele dağıtılır;bunlar da yeni sentezlenen oktomerler üzerindeki histon H3’ü metile etmek için, enzim histon metiltransferaz ile birleşir. X-kromozomu inaktivasyonu, kromatin yapısının kalıtımının başka bir örneğidir. Dişi memeliler iki adet X kromozomu alırken erkekler yalnızca bir tane alır.Dişilerde, X kromozomlarından biri, dozaj telafisi adı verilen bir olay ile inaktive edilir Burada, uzun, kodlamayan bir RNA olan XIST, embriyonik aşamada bir X-kromozomunun tamamına bağlanarak X-inaktivasyonunu başlatır. Daha sonra, kromozom, tüm somatik hücrelerde gerçekleşen takip eden hücre bölünmelerinde bu inaktif modda tutulur.

5.17:

Kromatin Yapıların Kalıtımı

Epigenetik, DNA dizilerini değiştirmeden bir hücrenin fenotipindeki kalıtsal değişikliklerin incelenmesidir. Hücre soyunu, pozisyon etkili değişkenliği, dozaj telafisini ve telomerler ve sentromeres gibi kromatin yapılarının bakımını sağlamak için diferansiyel gen ekspresyon deseni için bir bellek formu sağlar. Örneğin, sentromerin kromozomlar üzerindeki yapısı ve yeri epigenetik olarak kalıtsaldır. İşlevselliği, altta yatan DNA dizisi tarafından değil, kromatin organizasyonu ve histon varyantları tarafından belirlenir veya sağlanır. Kurulduktan sonra, sentromere organizasyonu ve işlevleri birkaç hücre bölümü aracılığıyla sabit bir şekilde kalıtsal kalır.

Histonlar epigenetik mirasın merkezidir

Nükleozomda, hem DNA hem de histonlar kimyasal olarak modifiye edilir. DNA, sitozin kalıntılarında metillenir ve histonlar metillenmiş, asetillenmiş veya fosforile edilmiştir. Bu değişikliklerin her biri histon kodu adı verilen bir sinyal oluşturur. Son gelişmeler, iyi niyetli bir epigenetik işaret olarak metilasyonu ve epigenetik izlerin birincil taşıyıcısı olarak kromatin karmaşıklığını vurgulamaktadır. Histon varyantlarının belirli konumlarda ve zamanda bulunması kromatin organizasyonunun karmaşıklığını arttırır.Örneğin, HİSTON H3 varyantı CENP-A, DNA sentezinden bağımsız bir şekilde bir nükleozom içine dahil edilir ve alışılmadık derecede kararlı bir nükleozom ile sonuçlanır.

Histonların kalıtımı

DNA metilasyonu, HİSTONLARIN DNA iplikçikleri üzerinde birikmesi ve histonların veya histon kodunun translasyon sonrası modifikasyonları replikasyon makinelerine bağlanır. Bir DNA işlem faktörü olan PCNA, DNA replikasyonunu epigenetik işaretlerin kalıtımı ile bağlayan hayati bir proteindir. Çoğaltma çatalında, nükleozomlar, h2a-H2B dimerleri çoğaltma çatalından tamamen çıkarılacak şekilde yer değiştirir. Ebeveyn H3-H4 tetramerleri daha sonra yavru iplikçiklerine dağıtılır ve ardından nükleozomları tamamlamak için yeni sentezlenmiş histon alt birimlerinin ebeveyn histonları üzerine yerleştirilmesi sağlanır.

Suggested Reading

  1. Molecular Biology of Cell, Alberts, 6th edition, Pages 204-205
  2. Margueron, Raphaël, and Danny Reinberg. "Chromatin structure and the inheritance of epigenetic information." Nature Reviews Genetics 11, no. 4 (2010): 285-296.
  3. Reinberg, Danny, and Lynne D. Vales. "Chromatin domains rich in inheritance." Science 361, no. 6397 (2018): 33-34.