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7.1:

Aperçu de la réparation de l’ADN

JoVE Core
Molecular Biology
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JoVE Core Molecular Biology
Overview of DNA Repair

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As the repository of all genetic information, DNA is highly stable.  However, like any organic molecule, it is susceptible to a variety of changes that alter its base chemistry including heat, radiation, and oxidation by free radicals produced during cellular respiration. Also present abundantly in the cell is water, and this can cause hydrolytic damage. There are two types of hydrolytic reactions that spontaneously damage DNA bases under physiological conditions.  The first, deamination, affects pyrimidine bases such as cytosine, and is defined by the loss of an amino group in the presence of water that converts the base into Uracil. The second is depurination, which is the loss of purine bases due to the cleavage of the bond between the base and deoxyribose – leaving an apurinic site in the DNA. These different types of damage lead to random mutations, which can be very harmful, causing genome instability, cell death, or cancers, amongst other conditions. Thankfully, only a few of these mutations are retained during DNA replication due to the cell’s highly efficient repair mechanisms. The double-stranded structure of DNA itself is particularly suitable for repair because it contains two separate copies of the genetic information in its two strands. This means that, when one strand is damaged, the complementary strand can be used as a template to restore the correct nucleotide sequence. There are three common DNA repair mechanisms. The first, base excision repair, focuses on fixing endogenous DNA damage, such as the hydrolytic damage resulting in deamination or depurination. Nucleotide excision repair can fix damage caused by ultraviolet light or certain chemical carcinogens, and finally, mismatch repair fixes faulty base incorporation by DNA polymerase during replication which leads to incorrect base-pairing.

7.1:

Aperçu de la réparation de l’ADN

Pour être transmis de génération en génération, l’ADN génomique doit être intact et exempt d’erreurs. Cependant, chaque jour, l’ADN d’une cellule subit plusieurs milliers à un million d’événements dommageables dus à des causes naturelles et à des facteurs externes. Les rayonnements ionisants tels que les rayons UV, les radicaux libres produits pendant la respiration cellulaire et les dommages hydrolytiques dus aux réactions métaboliques peuvent altérer la structure de l’ADN. Les dommages causés comprennent l’altération d’une seule base, la dimérisation des bases, les ruptures de chaîne et la réticulation.

L’ADN génomique modifié chimiquement peut provoquer des erreurs lors de la transcription et de la traduction en protéines. Si l’ADN endommagé n’est pas réparé avant la division cellulaire, les mutations génomiques peuvent être transférées aux prochaines générations de cellules. Certaines de ces mutations peuvent entraîner une croissance cellulaire incontrôlée qui se développe en cancer.

La cellule a développé des systèmes robustes pour détecter et réparer les dommages à l’ADN. Ces derniers peuvent être réparés par des enzymes qui peuvent directement inverser le changement chimique en une seule réaction. Par exemple, l’enzyme photolyase utilise le rayonnement UV pour diviser les dimères de thymine en ouvrant la fraction cyclobutane qui maintient le dimère de thymine ensemble.

D’autres formes de réparation suivent un processus en plusieurs étapes dans lequel

  1. Des modifications chimiques dans l’ADN sont détectées
  2. La base ou la région endommagée est supprimée
  3. Un nouvel ADN est synthétisé

Si les dommages sont irréparables, la cellule peut soit devenir sénescente, soit subir une apoptose. La sénescence est un état dans lequel la cellule devient irréversiblement dormante, c’est-à-dire qu’elle ne peut plus subir de division cellulaire et que son cycle cellulaire est interrompu indéfiniment. L’apoptose fait référence à la mort cellulaire programmée, où des protéines appelées caspases dégradent les composants cellulaires nécessaires à la survie des cellules. Ceci est suivi par la digestion de l’ADN par les DNases, ce qui entraîne une diminution de la taille de la cellule et la transmission de signaux à un groupe de globules blancs appelés macrophages, qui engloutissent et éliminent les débris cellulaires.

Suggested Reading

  1. Cooper, G. M. The Cell: A Molecular Approach. 2nd edition. Sunderland (MA): Sinauer Associates; 2000. DNA Repair.