اعادة تشغيل شوكة الاستنساخ المتوقفة

مع توقف شوكة التضاعف 00:00:03.720 00:00:07.830 يتوقف دى إن إيه بوليميراز من تخليق دى إن إيه ناشىء. لكن الهيليكاز تواصل فك الشريط المزدوج دى إن إيه قبل الإنفصال بفترة قصيرة. بعد ذلك بروتين التضاعف أيه أو آر بى أيه يربط ويحمي هذا الدى إن إيه الزائد أحادى الشريط عند الشوكة المعطلة.دى إن إيه أحادي الشريط المشفر آر بى أيه. يوظف بعد ذلك Rad9-Rad1-Hus1, أو مركب 9-1-1 والذى بدوره تمكّن ربط أيه تى آر. أرتباط أيه تى آر يحفز فسفرة سي إتش كيه 1.سي إتش كيه 1 بدوره يفسفر الفوسفاتيز سي دى سي 25 الفسفرة تعني أن سي دى سي 25 لا يمكنه قبول مزيد من الفوسفات من بروتين سي دى كيه 1 منظم دورة الخلية لذلك يظل سي دى كيه 1 غيرنشط وتتوقفت دورة الخلية بعد ذلك قبل أن يبدأ الإصلاح بروتين التهجين،يسمى آرأيه دى 51 يحل محل آر بى أيه على دى إن أيه أحادي الشريط. بعد ذلك لبدء تشغيل الشوكة عكس الإتجاه أر أيه دى 51 يحمّل إنزيما يسمى إس إم أيه آر سي أيه إل 1 على دى إن إيه والذى يعمل مثل هيليكاز التهجين ليزيح ويلصق 00:01:23.400 00:01:25.710 الشريطين الجديدين مع بعضهم البعض ويشكل مفترق طرق رباعي الإتجاه والذى يشبه قدم الدجاج. هذه العملية تسمى تراجع الشوكة.هناك طريقتان لحل تراجع الشوكة. فى الأول بى آر أيه سي 2 يثبت الخيط النووى آر أيه دى 51 00:01:41.100 00:01:43.170 بين أصابع قدم الدجاج. 00:01:43.170 00:01:47.700 ويحمي الشوكة المعاد تشكيلها من التحلل بواسطة نوكليازات.الآن الشريط الناشىء المتأخر يمكن أن يعمل بمثابة قالب 00:01:50.970 00:01:53.370 لمد الشريط المتقدم وبالتالي تجاوز التلف على شريطى الوالدين أخيرا يعكس إس إم أيه آر سي أيه إل1 شوكة التراجع 00:02:01.130 00:02:03.920 عن طريق إعادة تهجين أشرطة الوالدين. هنا يبقى التلف في شريطة الوالدين لكن تبديل القالب يسمح دى إن إيه المتضاعف بأن يكون سليم الطريقة الثانية لحل تراجع الشوكة يحدث في غياب بى آر سي ايه 2. وهنا رباعية تقاطع قدم الدجاج مشقوق بواسطة الإندونوكلياز محدد التركيب Mus81, معقد مع اندونوكلياز التقاطع،Mms4.يولّد الانقسام كسور ذات شرائط مزدوجة والتي يمكن إصلاحها بواسطة التهجين المتماثل.