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8.3:

RNA Stability

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Molecular Biology
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RNA Stability

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– [ Instructor] El ARN es una molécula móvil de relativa corta vida, que es mucho menos estable, estructural y químicamente, comparada con el ADN. En el ARN, la ribosa de cinco carbonos tiene un grupo hidróxido en el segundo carbono, mientras que la deoxiribosa tiene un solo hidrógeno. El hidrógeno del grupo hidróxido es susceptible de ser removido en soluciones básicas. Cuando esto ocurre, el oxígeno remanente, con carga negativa puede descomponer la columna vertebral del azúcar fosfatado. Además, el ARN generalmente es de una sola cadena, lo que hace que sea menos estable estructuralmente que la doble hélice del ADN. Las moléculas del ARN también son más cortas que las del ADN y son más vulnerables a la degeneración en los extremos. Factores externos pueden afectar la estabilidad del ARN. Por ejemplo, ciertas exonucleasas en el citoplasma llamadas Rnase descomponen los ARN que no están siendo traducidas activamente. Otras proteínas, conocidas como proteínas de enlace del ARN, producen estabilidad, reconociendo y enlazando secuencias nucleotídicas específicas del ARN. Las transcripciones mARN, con elementos ricos en AU, generalmente repeticiones AUUUA, en sus regiones primarias no traducidas, o las UTR, atraen diferentes tipos de proteínas de enlace ARN con roles opuestos. Algunas de estas proteínas mejoran la estabilidad del mARN y aumentan la traducción de la proteína limitada al UTR, mientras que otras desestabilizan la transcripción, de manera que se degrada más rápido. Así, la cantidad de tiempo que una molécula ARN está disponible para ser traducida, es variable y depende de múltiples factores.

8.3:

RNA Stability

En los fósiles se pueden encontrar hebras de ADN intactas, mientras que los científicos a veces luchan por mantener el ARN intacto en condiciones de laboratorio. Las variaciones estructurales entre el ARN y el ADN subyacen a las diferencias en su estabilidad y longevidad. Debido a que el ADN es de doble cadena, es inherentemente más estable. La estructura monocatenaria del ARN es menos estable, pero también más flexible y puede formar enlaces internos débiles. Además, la mayoría de los ARN en la célula son relativamente cortos, mientras que el ADN puede tener hasta 250 millones de nucleótidos de largo. El ARN tiene un grupo hidroxilo en el segundo carbono del azúcar ribosa, aumentando la probabilidad de rotura de la columna vertebral del azúcar-fosfato.

La célula puede explotar la inestabilidad del ARN, regulando tanto su longevidad como su disponibilidad. Los ARNm más estables estarán disponibles para su traducción durante un período de tiempo más largo que las transcripciones de ARNm menos estables. Las proteínas de unión al ARN (RBP) en las células desempeñan un papel clave en la regulación de la estabilidad del ARN. Las RBP pueden enlazarse a una secuencia específica (AUUUA) en la región 3’ no traducida (UTR) de los ARNm. Curiosamente, el número de repeticiones de AUUUA parece reclutar a las RBP de una manera específica: menos repeticiones reclutan a las RBP estabilizadoras. Varias repeticiones superpuestas dan como resultado la unión de las RBP desestabilizadoras. Todas las células tienen enzimas llamadas RNasas que descomponen los ARN. Normalmente, la tapa 5’ y la cola poliA protegen el ARNm eucariótico de la degradación hasta que la célula ya no necesita la transcripción.

La investigación emergente sobre epitranscriptómica tiene como objetivo definir las modificaciones regulatorias del ARNm. Recientemente, los científicos han descubierto un papel importante de la metilación en la estabilidad del ARNm. La metilación de residuos de adenosina (m6A) parece aumentar la traducción y degradación del ARNm. m6A también tiene funciones en las respuestas al estrés, la exportación nuclear y la maduración del ARNm. La presencia de un residuo uracilo modificado, la pseudouridina, también parece desempeñar un papel importante en la regulación del ARN.

Suggested Reading

Zhao, Boxuan Simen, Ian A. Roundtree, and Chuan He. “Post-Transcriptional Gene Regulation by MRNA Modifications.” Nature Reviews. Molecular Cell Biology 18, no. 1 (January 2017): 31–42. [Source]

Agris, Paul F. “The Importance of Being Modified: An Unrealized Code to RNA Structure and Function.” RNA 21, no. 4 (April 2015): 552–54. [Source]