RNA Polimeraz II Aksesuar Proteinleri

Ökaryotik hücrelerde, transkripsiyonun başlatılması karmaşık bir süreçtir ve belirli DNA elemanları ve protein bileşenleri arasında titiz bir koordinasyon gerektirir. Transkripsiyonun başlatılması sırasında, RNA polimeraz 2 ve transkripsiyon faktörlerinin yanı sıra diğer düzenleyici faktörler de gen ekspresyonu regülasyonunda rol oynar. Hızlandırıcı dizileri, bu transkripsiyonel kontrol elemanlarından biridir ve başlatıcıdan uzaklıklarından bağımsız olarak etkilerini gösterirler.Bunlar, yaklaşık 50 ila 200 baz çiftinden oluşan düzenleyici DNA segmentleridir ve transkripsiyon aktivatörleri olarak da bilinen gen düzenleyici proteinler için birçok bağlanma yeri içerirler. Transkripsiyonel aktivatörler, iki bölgeden oluşan modüler proteinlerdir:bir DNA bağlanma bölgesi ve bir aktivasyon bölgesi. DNA bağlanma bölgesi, proteini, spesifik bir hızlandırıcı dizisine tuttururken, aktivasyon bölgesi, transkripsiyon mekanizmasının farklı elemanları ile etkileşime girerek transkripsiyonu tetikler.Bununla birlikte, aktivatör ve transkripsiyonel mekanizma arasındaki bu etkileşim, aracı adı verilen ve çok sayıda alt birim içeren bir kompleksin varlığını gerektirir. Aracıdaki yapısal olarak esnek protein ağı, aktivatörden RNA polimeraz 2’ye ve transkripsiyonel faktörlere sinyaller gönderir;bu da normalde sadece bazal seviyede transkribe edilecek olan bağlantılı bir genin transkripsiyon miktarının artışıyla sonuçlanır. Aktivatörlerin aksine, baskılayıcılar transkripsiyonu inhibe ederek gen ekspresyonunu regüle eder.Aktif baskılayıcılarda bulunan işlevsel bölgeler, genel transkripsiyon faktörleriyle etkileşime girerek DNA’ya bağlanmalarına müdahale eder. Başka bir baskılayıcı tipi, transkripsiyon başlangıç yerinin yakınına bağlanarak, RNA polimerazın ve genel transkripsiyon faktörlerinin başlatıcı ile etkileşimini bloke eder. Üçüncü tip baskılayıcı, hızlandırıcılara bağlanmada aktivatörlere rakip olur.Genel olarak, birçok farklı transkripsiyonel düzenleyici proteinin hareketlerinin toplamı, embriyonik gelişim ve hücre farklılaşması sırasında gen ekspresyonunun kontrolünden sorumludur.