Back to chapter

10.7:

المنطقة المحفزة فى حقيقية النواة

JoVE Core
Molecular Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Molecular Biology
The Eukaryotic Promoter Region

Languages

Share

المحفّز هو منظم كبير للتعبير الجيني وهو يحتوي على مواقع ربط آر إن أيه بوليميراز،الإنزيم المسؤول عن النسخ،وعوامل النسخ التي تسهل أو تمنع ربط آر إن أيه بوليميراز. منطقة المحفّز تقع في الغالب عكس الإتجاه من الجين الذى تنظّمه. وهي تتمتع بتميزها بالخصائص الهيكلية, مثل التركيب المنحني مع القدرة على الثني عندما المنظمات النسخية ترتبط بها و تقلل الإتزان الحركى الحرارى بسبب وجود مناطق غنية-أيه تى.فى حقيقيات النوى, منطقة تحكم النسخ هذه تكون أكثر تعقيدًا من بدائيات النوى. إضافة إلى المحفز الأساسي،جينات حقيقيات النوى بها كثير من تسلسلات منظم سيز إضافية. التى يمكن أن يرتبط بها عوامل النسخ.آر إن أيه-بوليميراز فى بدائيات النوى تتطلب عامل سيجما ليرتبط بالمحفّز،في حين آر إن أيه بوليميراز فى حقيقيات النواة يتطلب العديد من هذه المنظمات. بالإضافة إلى ذلك،فإن الثلاث آر إن أيه بوليميرازيس المختلفة في حقيقيات النوى التى ترتبط بالمحفزين المتميزين تتطلب منظمات نسخية مختلفة. محفّز حقيقية النواة الأساسي يحتوي العديد من الزخارف التسلسلية التى تعمل معا في مجموعات متوافقة مختلفة لتسمح ل آر إن أيه بوليميراز أن يرتبط.صندوق تاتا محفوظ بدرجة كبيرة عبر الكائنات الحية. عادة ما يكون صندوق Tata موجود في الجينات التي تظهر مستويات عالية من تعبيرات تخصصية بالخلية،مثل البروتينات المشتركة في تمايز الخلايا. عناصرالبادىء والمحفّز الهابط يتكون من تسلسلات

10.7:

المنطقة المحفزة فى حقيقية النواة

تكون منطقة محفز حقيقيات النوى عبارة عن جزء من الحمض النووي يقع في الجزء العلوي من الجين. ويحتوي على موقع ربط بوليميراز RNA، وموقع بدء النسخ، والعديد من المتواليات cis التنظيمية. & #160؛ تقع منطقة المحفز الأقرب بالقرب من الجين ولديها متواليات تنظيمية cis والمحفز الأساسي. إن المحفز الأساسي هو موقع الربط لبوليميراز RNA ويقع عادةً بين -35 و +35 نيوكليوتيد من موقع بدء النسخ. مناطق المحفز البعيدة هي متواليات تنظيمية cis ، وآلاف الأزواج الأساسية بعيدة عن الجين. يمكن أن يختلف طول منطقة المحفز بشكل كبير من جين إلى آخر.

يحتوي المحفز الأساسي على أشكال مميزة حيث يمكن لعوامل النسخ العامة أن تربط وتوظف بوليميراز الحمض النووي الريبي. &#160؛ يكون صندوق TATA عبارة عن نموذج يقع من 25 إلى 30 زوجًا أساسيًا في الجزء العلوي من موقع بدء النسخ. إنه أكثر مرونة وأقل استقرارًا من الناحية الديناميكية الحرارية من أشكال المحفز الأخرى نظرًا لمحتواه العالي من A-T، مما يسمح بالربط الفعال لآلة النسخ. يوجد في الجينات التي تتطلب مستويات عالية من التعبير في ظل ظروف معينة، مثل تلك الجينات المشاركة في تمايز الخلايا. غالبًا ما يكون صندوق TATA محاطًا بمجموعة من الأشكال النوكليوتيدية القصيرة، والمعروفة باسم عناصر التعرف على B. & # 160 ؛ عامل النسخ الثاني ب ، & # 160 ؛ عنصر مهم يشارك في تجميع آلات النسخ في صندوق TATA ، يرتبط بهذه العناصر B.

يحتوي ال عنصر البادئ ، المكون من التسلسل المنحل YYANWYY * ، على موقع بدء النسخ. &#160؛ المصب الخاص بعنصر البادئ هو عنصر مميز آخر ، يُعرف باسم عنصر المروج النهائي (DPE)، ويتكون من التسلسل المنحل RGWYVT. ينظم صندوق TATA و DPE أنواعًا متشابهة من الجينات ، ويمكن أن يحتوي محفز حقيقي النواة إما على صندوق TATA أو DPE. يمكن أن يعمل عنصر البادئ بشكل تآزري إما مع صندوق TATA أو DPE لتنظيم النسخ.

تعد جزر CpG نوعًا آخر من أشكال المروّجات الأساسية التي تنظم التعبير عن الأنواع الأخرى من الجينات ، & # 160 ؛ مثل جينات التدبير المنزلي، التي تتطلب تعبيرًا ثابتًا بكميات صغيرة. يطلق عليها جزر CpG لأنها تحتوي على تسلسلات عالية في السيتوزين تليها الجوانين. و # 8220 ؛ & # 8221 ؛ تمثل P رابطة الفوسفوديستر التي تربط C بـ G. CpG ومن المعروف أيضًا حدوثها في مناطق المحفز البعيدة.

* رموز R لأي من A أو G ؛ رموز W لأي من A أو T ؛ رموز Y لـ C أو T ؛ رموز V لـ A أو G أو C ؛ & # 160 ؛ ورموز N لأي من القواعد الأربع.

Suggested Reading

  1. Alberts, Bruce, et al. Molecular Biology of the Cell. 6th ed. Garland Science, 2017. pp: 384-385
  2. Lodish, Harvey, et al. Molecular Cell Biology. 8th ed. W.H. Freeman and Company, 2016. pp: 371-372.
  3. Kiran, K., Ansari, S. A., Srivastava, R., Lodhi, N., Chaturvedi, C. P., Sawant, S. V., & Tuli, R. (2006). The TATA-box sequence in the basal promoter contributes to determining light-dependent gene expression in plants. Plant physiology, 142(1), 364–376. https://doi.org/10.1104/pp.106.084319
  4. Kanhere, A., & Bansal, M. (2005). Structural properties of promoters: similarities and differences between prokaryotes and eukaryotes. Nucleic acids research, 33(10), 3165–3175. https://doi.org/10.1093/nar/gki627
  5. Kutach, A. K., & Kadonaga, J. T. (2000). The downstream promoter element DPE appears to be as widely used as the TATA box in Drosophila core promoters. Molecular and cellular biology, 20(13), 4754–4764. https://doi.org/10.1128/mcb.20.13.4754-4764.2000
  6. Yella, V. R., & Bansal, M. (2017). DNA structural features of eukaryotic TATA-containing and TATA-less promoters. FEBS open bio, 7(3), 324–334. https://doi.org/10.1002/2211-5463.12166