분자 궤도 이론은 원자 사이의 특정 결합으로 국소화하는 대신 분자 전체에 걸쳐 전자의 분포를 설명합니다. 상 내 원자 궤도 사이의 건설적인 간섭은 양전하 핵 사이의 더 큰 전자 밀도에 대응하여 분자를 보다 안정적으로 만듭니다. 이 결합 분자 궤도는 원래 원자 궤도 중 하나 보다 에너지가 낮습니다. 상 외 원자 궤도 사이의 파괴적인 간섭은 핵 사이의 염자 평면에서 낮은 전자 밀도에 해당하여 분자를 덜 안정시합니다. 이 결합 분자 궤도는 원자 궤도보다 에너지가 높으며 별이나 별표로 표시됩니다. 분자 궤도는 원자 궤도가 겹치는 방식에 의해 분류됩니다. 두 개의 궤도 또는 두 개의 종단 p 궤도 사이의 중첩과 같은 핵 축을 따라 원자 궤도의 정면 조합이 시그마 분자 궤도를 초래합니다. 시그마 궤도 전자 밀도는 핵축을 중심으로 한다. 두 개의 p 궤도의 측면 오버랩과 같은 측면 중첩은 pi 분자 궤도를 초래합니다. 여기서 전자 밀도는 핵축의 반대편에 집중된다. 세 가지 다른 p 오비탈의 방향은 일반적으로 한 쌍이 종단간 중첩되고 다른 두 쌍이 옆으로 겹치는 것을 의미한다. 파이 본딩 궤도는 일반적으로 파이 안티본딩 궤도와 마찬가지로 에너지 또는 퇴화와 동일합니다. 분자 궤도 이론은 결합 궤도에서 전자의 수가 2로 나눈 항결합 궤도에서 전자의 수를 뺀 분자의 결합 순서로부터 의 공유 결합의 안정성을 예측한다. 채권 순이 0보다 큰 것은 하나 이상의 공유 채권이 존재할 수 있음을 나타내지만 채권 순서가 0이면 채권이 존재하지 않아야 한다는 것을 의미합니다. 분자 궤도 이론은 벤젠과 같은 다원자 분자에도 유용합니다. 벤젠의 루이스 모델은 그 탈지역화된 전자를 정확하게 나타낼 수 없지만 분자 궤도 이론은 전체 탄소 고리를 덮고 있는 3개의 파이 결합 분자 궤도에 전자를 할당합니다.