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16.1:

Mutagênese in vitro

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Molecular Biology
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JoVE Core Molecular Biology
In vitro Mutagenesis

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Os cientistas podem inativar ou nocautear um gene em animais, geralmente ratos, para aprender mais sobre a função do gene geralmente substituindo-o com um vetor de segmentação, um pedaço de DNA projetado. O vetor de direcionamento tem sequências que são homólogas, idênticas, as sequências antes e depois do gene. Geralmente também tem um marcador de seleção positiva como o gene para resistência à neomicina, NeoR, no meio e um marcador de seleção negativa como o gene para timidina quinase, TK, em uma extremidade.Quando introduzido em células-tronco embrionárias, ele substitui o gene por meio de recombinação homóloga que ocorre naturalmente entre trechos de DNA com sequências semelhantes. As células onde o gene foi corretamente substituído conterão o positivo marcador, mas não o negativo permitindo que sejam identificadas na cultura. Essas células são então inseridas num embrião de rato e implantado no útero de uma fêmea.O rato resultante tem uma combinação de células normais e células com um gene desligado num cromossoma. Esses ratos são então criados para gerar os chamados ratos desativados que são homozigotos para o desligamento em todas as células.

16.1:

Mutagênese in vitro

Para aprender mais sobre a função de um gene, os investigadores podem observar o que acontece quando o gene é inativado ou “knocked out”, criando animais knockout geneticamente modificados. Murganhos knockout têm sido particularmente úteis como modelos para doenças humanas como cancro, doença de Parkinson e diabetes.

O Processo

Genes podem ser aleatoriamente eliminados, ou podem ser alvos específicos. Para realizar o knockout de um gene em particular, uma porção de DNA chamada vector de clonagem é criada e usada para substituir o gene normal, inativando-o dessa forma.

Esses vectores de clonagem têm sequências em cada extremidade idênticas—ou homólogas—às sequências que flanqueiam cada lado do gene de interesse. Essas sequências homólogas permitem que o vector de clonagem substitua o gene através da recombinação homóloga—um processo que ocorre naturalmente entre DNA com sequências semelhantes durante a meiose.

O vetor de clonagem é introduzido em células estaminais embrionárias de murganho em cultura, usando métodos como eletroporação—uso de pulsos elétricos para criar temporariamente poros na membrana celular. Normalmente, para identificar células onde o vector substituiu corretamente o gene, ele é desenhado para incluir um marcador de seleção positivo—como o gene para resistência à neomicina (NeoR)—entre as regiões homólogas; e um marcador de seleção negativo—como o gene da quinase de timidina viral (TK)—após uma das regiões homólogas.

As células são expostas à neomicina, e somente aquelas que incorporaram o vetor no seu DNA irão sobreviver porque têm o gene NeoR. Além disso, as células, onde o vector substituiu o gene alvo através da recombinação homóloga, não terão o gene TK, permitindo-lhes sobreviver na presença do fármaco ganciclovir. Portanto, a exposição ao ganciclovir é usada para eliminar células que têm o vetor aleatoriamente inserido no seu genoma, porque essas células terão o gene TK.

As células com o knockout correto do gene são então inseridas em um embrião de murganho, que é implantado no útero de uma fêmea, onde se desenvolve até o nascimento. O murganho resultantes é uma quimera—o que significa que é composto por uma mistura de células—algumas com DNA normal do embrião, e algumas com o gene eliminado em um cromossoma das células transformadas. Estes murganhos são cruzados, e os descendentes que contêm o gene na sua linha germinativa são ainda mais cruzados entre si para criar uma linha de murganhos onde cada célula é homozigótica para o knockout. Estes murganhos knockout podem ser então usados para estudar a função genética.

Suggested Reading

Hall, Bradford, Advait Limaye, and Ashok B Kulkarni. “Overview: Generation of Gene Knockout Mice.” Current Protocols in Cell Biology / Editorial Board, Juan S. Bonifacino … [et Al.] CHAPTER (September 2009): Unit-19.1217. [Source]