1. رد الفعل الأنزيمية -- يوم 1 (1 ساعة بعد الظهر)
- الخطوة الأولى هي إعداد 10-20 التفاعلات الإنزيمية المستقلة التي IP 6 K1 أو تحويل الملكية الفكرية VIP1 6 إلى الأشكال الإسوية pyrophosphorylated.
- نحن نستخدم له 6 - IP K1 والانزيمات GST - Vip1 تنقيته من E. القولونية وفقا لبروتوكول 17،18 الموصوفة سابقا.
- تجهيز 50 ميكرولتر تحتوي على ردود فعل رد فعل 1X العازلة (Hepes 30 ملم 6.8 درجة الحموضة ، و 50 ملي مول كلوريد الصوديوم ، 6 مم MgSO 4 ، 1 ملم DTT) ، 6 فسفوكرياتين ملم (PCR) ، و 25 يو / مل CreatinePhosphoKinase (CPK) ، 5 مم ATP (ملغ الملح) ، 0.3 ملي IP6 ، 0،05-0،1 ميكروغرام صاحب IP - 6 K1 أو ضريبة السلع والخدمات Vip1. ضبط مستوى الصوت مع 2 MiliQ O. DDH
- تدور لفترة وجيزة في رد الفعل واحتضان 37 درجة مئوية خلال الليل مع التناوب.
2. بولي أكريلاميد صب جل والتحميل -- يوم 2 (4 ساعات بعد الظهر)
- يتم تحضير هلام بولي أكريلاميد باستخدام 24 سم ، 18 سم لوحات زجاجية واسعة والفواصل واسعة 1.5 مم. وعادة ما يتم استخدام ممر 16 أو مشط التحضيرية حارة واحدة.
- تحضير مزيج (50 مل / جل) يحتوي على ما يلي : 35.5 ٪ (W / V) الأكريلاميد : مكرر الأكريلاميد 19:01 ، 1X بيرسلفات الأمونيوم تريس / البورات / EDTA (TBE) ، 0.05 ٪ (W / V) (وكالة الأنباء الجزائرية ) ، Temed 0.05 ٪ (W / V). صب مزيج بين لوحات ما قبل محمل الزجاج ، وادخال المشط والسماح للتبلمر 30-60 دقيقة في RT.
- مرة واحدة في هلام وبلمرة ، ونقل الجهاز إلى غرفة باردة وقبل تشغيله في TBE 1X لحوالي 30-60 دقيقة على 200-300 فولت.
- إضافة 1X صبغة OrangeG (10 ملي تريس - pH7.0 حمض الهيدروكلوريك ، 1 ملم EDTA ، الجلسرين 30 ٪ ، 0.1 ٪ OrangeG) إلى كل التفاعل. تحضير عينة تحتوي على 2 nmol الملكية الفكرية 6 الى تحميل كعنصر تحكم القياسية.
- يغسل جيدا جيدا مع كل تشغيل العازلة باستخدام المحاقن والإبر 21G لإزالة أي يعجل ، ثم تحميل الجل. تجنب التحميل على الآبار الجانبية.
- تشغيل هلام بين عشية وضحاها على 450-550 فولت (7 mAmp / هلام) ، حتى الفرقة صبغ OrangeG ضمن مشاركة 10 سم من الجزء السفلي من هلام.
3. بمعزل عن الملكية الفكرية 7 -- يوم 3 (4 ساعات) ، ويوم 4 (6-7 عملية التجفيف SpeedVac ساعة)
- تفكيك جهاز هلام بعناية وإزالة إحدى الصفائح الزجاجية ترك الجل على الآخر. قطع جزء صغير من الجل من فوق الشريط صبغ OrangeG إلى القاع الذي يحتوي على 6 من IP القياسية ومسار واحد العينة ، كما هو مبين في الشكل 1.
- وصمة عار على قطع جزء من هلام مع الأزرق طولويدين (0.1 ٪ (W / V) طولويدين الزرقاء ، و 20 ٪ (W / V) والميثانول ، 2 ٪ (W / V) الجلسرين) لبضع دقائق (1-3 دقائق) أو حتى الفرقة بيروفوسفات اينوزيتول تظهر. وضع لوحة من الزجاج الخلفي إزالة سابقا على رأس لمنع هلام هلام غير ملوثين من التجفيف.
ينبغي أن الفرقة الملكية الفكرية 7 تكون مرئية منذ تشغيله بشكل أبطأ قليلا من مستوى 6 IP. وينبغي للاعبي التنس المحترفين ، والذي يعمل بشكل أسرع من 6 الملكية الفكرية ، وأيضا أن تكون مرئية (الشكل 1). نقل الجزء الملون من هلام في التوصل إلى حل لإزالة البقع (20 ٪ (W / V) الميثانول) لبضع دقائق ، يغسل أي فائض في الزرقاء وإعادة طولويدين الجل مع الجل غير ملوثين.
إذا كان مطلوبا التصور العالي الأشكال الإسوية اينوزيتول pyrophosphorylated (IP IP 8 و 9) ، وصمة عار الجل مع الحل طولويدين تلطيخ الأزرق لمدة 20 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. بعد ذلك ، يغسل الأزرق طولويدين مع الحل دي تلطيخ لحوالي 15 دقيقة.
- مع خفض شفرة حلاقة الملكية الفكرية 7 الفرقة على الجزء غير ملوثين من هلام به كمرجع للملكية الفكرية موقف ترحيل 7 العزم مع الجل الملون (الشكل 1).
- وضع الملكية الفكرية 7 الفرقة التي قطعت من الجل على أنبوب 15 مل و 10 مل من إضافة 2 MilliQ O. DDH وضع الأنابيب في التناوب لمدة 10 دقيقة في درجة حرارة الغرفة. رفض السائل لإزالة الفائض من جزيئات الأكريلاميد TBE والمجهرية.
- بعد ذلك ، نفذ two - جفاف الماء دورات. إضافة 5 مل من 50 ٪ (W / V) الميثانول إلى أنبوب مع هلام يحتوي على 7 الملكية الفكرية وتدوير في درجة حرارة الغرفة لمدة 2 ساعة. نقل شريحة هلام لأنبوب جديد 15 مل تحتوي على 5 مل من 2 MilliQ O DDH وتدوير في درجة حرارة الغرفة لمدة 2 ساعة. لا يتخلص من الميثانول وMilliQ H O 2 من الأنابيب. تكرار الجفاف دورة الماء مرة أخرى ، من خلال إعادة نقل هلام بولي أكريلاميد في 15 مل من الأنابيب المستخدمة سابقا. لا يمكن أن يؤديها واحد من يغسل طوال الليل.
- لتركيز IP eluted 7 ، جفاف 10 مل معا (5 مل MilliQddH 2 O و 5 مل 50 ٪ الميثانول (ث / ت)) باستخدام SpeedVac ساخنة عند 60 درجة مئوية.
- مرة واحدة على عينات جافة تقريبا ، ونقل السائل المتبقي (300-600 ميكرولتر) لa1.5 مل أنبوب الطرد المركزي وتدور لمدة 2 دقيقة في 5000 دورة في الدقيقة.
- طاف جمع ونقل الى الطازجة 1.5 مل أنبوب الطرد المركزي ؛ مغادرةأسفل 20-30 ميكرولتر أنها قد تحتوي على جزيئات الأكريلاميد.
- إذا كان ذلك ضروريا الاستمرار في عملية التجفيف باستخدام SpeedVac غير مدفأة. وخفضت بشكل كبير في انتعاش IP 7 إذا العينات يجف تماما ، ثم إنهاء عملية التجفيف عندما تصل عينات حجم 100-300 ميكرولتر.
4. تحديد تركيز 7 الملكية الفكرية والنقاء.
- استخدام 2-5 ميكرولتر من العينة تعافى 7 IP لتشغيل على هلام PAGE ، على غرار الأقسام 2،2-2،5. تحميل العديد من التخفيفات IP 6 (أي 0.5 ، 1 ، 2 ، 4 nmol) وفقا لمعايير وتركيز 4 nmol من بولي - P علامة. بعد تشغيل هلام ، تصور الأشكال الإسوية بيروفوسفات اينوزيتول بواسطة تلطيخ واجتثاث تلطيخ الجل كامل مع حل طولويدين الأزرق ، وبعد الإجراء الموضح في القسم 3.2 (الشكل 2A).
- بعد تلطيخ طولويدين ، يمكن تحديد التركيزات عن طريق مسح الجل ومقارنة الاختلافات في كثافة تتراوح بين 6 الملكية الفكرية والملكية الفكرية 7 ، وذلك باستخدام برامج التصوير مثل J - الصور ، كما هو مبين في الشكل 2B.
5. ممثل النتائج :
ويمكن تحويل التحضيرية الأنزيمية للملكية الفكرية من 6 إلى 7 باستخدام IP IP 6 K1 وVIP1 الانزيمات حلها بسهولة باستخدام التحليل PAGE (الشكل 1). التحميل من 6 الملكية الفكرية باعتبارها التحكم في حجم جنبا إلى جنب مع تلوين طولويدين الجل الأزرق يتيح التعرف على المشتقات pyrophosphorylated ، حيث أنها تعمل بشكل أبطأ اعتمادا على عدد من المجموعات الفوسفات الموجودة على الحلبة اينوزيتول. الإجراء المذكورة أعلاه يسمح للتنقية سهلة من 7 IP. وكشف تحليل لبيروفوسفات اينوزيتول يطهر PAGE نقاء الملكية الفكرية لدينا 7 (الشكل 2A). ومن المثير للاهتمام ، و1/3PP-IP 5 ايزومير من الناتج 7 IP من VIP1 يهاجر أبطأ قليلا من أيزومر 5 5PP - IP من 7 IP التي تم إنشاؤها بواسطة K1 6 IP. 6 استخدام معايير الملكية الفكرية تسمح الكمي سهلة للتركيز IP المنقى 7 (الشكل 2B). 7 قبل استخدام الملكية الفكرية لمزيد من التجارب ، يمكن تقييم نشاطها البيولوجي
(الشكل 3). 5PP - IP هو المحتضنة 5 مع VIP1 ومع الفوسفاتيز 7 IP DDP1 (diphosphoinositol phosphohydrolase متعددة الفوسفات). بشكل روتيني ، يتم تحويل الملكية الفكرية تنقيته من 7 إلى 8 من VIP1 الملكية الفكرية والملكية الفكرية التي DDP1 6 (الشكل 3).

الشكل 1 : من تلطيخ طولويدين PAGE والعزلة من الفرقة الملكية الفكرية 7 قطع جزء من الجل الذي يحتوي على معيار (IP 6) والملون باستخدام حل طولويدين الأزرق. الفرق الثلاثة تمثل (من أعلى إلى أسفل) 7 IP ، IP 6 و ATP. ثم كان متحالفا الجزء الملون من هلام مع ما تبقى من هلام. هذا يسمح للتوطين جزء من هلام يحتوي على 7 الملكية الفكرية ، والتي يمكن بعد ذلك قص وتنقيته (مربع متقطع).

الشكل 2 : تحليل PAGE الملكية الفكرية منتجات التفاعل 6 K1 وVIP1. أ) تم استخدام تحليل IP 6 (4 ، 2 ، 1 ، 0.5 nmol) عن طريق تلوين طولويدين الأزرق من أجل تحديد IP 7 تركيز تنقيتها من كل 6 IP K1 (IP - 5PP 5) وVIP1 (1/3PP-IP 5) ردود الفعل. B) مبعثر تحليل مؤامرة لتحديد تركيز الملكية الفكرية المنقى 7. وتم تحديد التركيزات وفقا لكثافة الموجات ، محسوبة باستخدام البرمجيات imageJ ، مقارنة كميات محددة مسبقا من 6 IP. والمحور السيني يمثل شدة ، ويمثل المحور Y - تركيزات التي أعرب عنها في nmol.

الشكل 3 : تحليل النشاط 7 IP البيولوجي لتحديد نوعية الملكية الفكرية المنقى 7 المحتضنة نحن 5PP 5 - IP (IP 6 K1 IP ولدت 7) مع VIP1 أو مع الفوسفاتيز 7 DDP1 IP وحلها ثم رد الفعل على الصفحة. كشفت وتلطيخ دابي طولويدين الإنتاج المتوقع من 8 VIP1 الملكية الفكرية وتحويل الملكية الفكرية من 7 إلى 6 من DDP1 IP.