-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
استخدام مكتبات رؤية الكمبيوتر لتبسيط القياس الكمي للنوى
استخدام مكتبات رؤية الكمبيوتر لتبسيط القياس الكمي للنوى
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Using Computer Vision Libraries to Streamline Nuclei Quantification

استخدام مكتبات رؤية الكمبيوتر لتبسيط القياس الكمي للنوى

Full Text
678 Views
06:25 min
June 6, 2025

DOI: 10.3791/67945-v

Danielle E. Levitt1, Alexandra L. Khartabil1, Rylea E. Hall1, Matthew R. DiLeo1, Connor J. Mills1, Ashley K. Williams1, Casey R. Appell2, Ronald G. Budnar, Jr.1, Hui-Ying Luk2

1Metabolic Health & Muscle Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University, 2Applied Exercise Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a method for automating the quantification of nuclei in images, which aids in normalizing metabolic data in skeletal muscle research. The automated program, validated across varying cell densities, addresses challenges inherent to manual counting, such as bias and variability.

Key Study Components

Research Area

  • Cell biology
  • Metabolic health
  • Heat therapy effects on muscle

Background

  • Manual quantification of nuclei is time-consuming and biased.
  • Automated methods can improve accuracy and efficiency.
  • Understanding the effects of heat therapy on muscle adaptations is crucial for metabolic health.

Methods Used

  • Automated nuclei counting using an open-source program
  • Cell line models for skeletal muscle research
  • Image processing and analysis

Main Results

  • The automated program showed excellent reliability with an intra-class correlation coefficient of 0.993.
  • Quantification accuracy was high across varying cell densities.
  • Problems with clustering nuclei and artifacts were identified for further improvement.

Conclusions

  • The study demonstrates an objective approach to nuclei quantification that enhances experimental normalization.
  • This method is relevant for advancing research in metabolic health and muscle adaptations.

Frequently Asked Questions

What is the significance of nuclei quantification in this study?
Nuclei quantification is essential for normalizing metabolic data in skeletal muscle research.
How does the automated program compare to manual counting?
The automated program significantly reduces observer bias and variability, showing high reliability against manual counts.
What challenges does manual nuclei counting present?
Manual counting is prone to biases and inconsistencies, making it less reliable than automated methods.
What improvements can be made to the automated method?
Further enhancements can focus on better handling of clustered nuclei and image artifacts.
Is the program user-friendly for those with limited technical skills?
Yes, the program is designed to be accessible for scientists with varying levels of coding experience.
What was the primary validation for the automated program?
The program was validated with high intra-class correlation coefficients across all tested cell densities.
How does this research relate to metabolic health?
It aims to uncover mechanisms of heat therapy in improving muscle and mitochondrial health, particularly in pre-diabetic individuals.

توضح هذه المقالة طرقا خطوة بخطوة لأتمتة القياس الكمي للنوى المستندة إلى الصور باستخدام برنامج قابل للتنفيذ مفتوح المصدر تم التحقق من صحته عبر مجموعة من كثافات الخلايا. يوفر هذا البرنامج بديلا يعالج الحواجز المتعلقة بالتكلفة ، وإمكانية الوصول للمستخدمين ذوي المهارات التكنولوجية المحدودة ، والتحقق من الصحة الخاصة بالتطبيق التي قد تحد من فائدة التقنيات الحالية.

لقد طورنا هذه الطريقة لتطبيع البيانات الأيضية من نماذج الخلايا للمساعدة في تحديد الآليات ، والتأكيد على تكيفات العضلات الهيكلية الناجمة عن العلاج الحراري ، وفي النهاية ، تحسين صحة التمثيل الغذائي بين الأشخاص المصابين بمقدمات السكري.

يجب أن نحسب النوى للتطبيع التجريبي. يمثل القياس الكمي اليدوي للنوى تحديات بما في ذلك تحيز المراقب والوقت والتباين في العثور على عينات أو ظروف مختلفة.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

علم الأحياء العدد 220

Related Videos

سير العمل عالية المحتوى، الكمي خلية فردية من نيون علامات من المجاهر البيانات العالمي، بدعم من برمجيات المصدر المفتوح

09:57

سير العمل عالية المحتوى، الكمي خلية فردية من نيون علامات من المجاهر البيانات العالمي، بدعم من برمجيات المصدر المفتوح

Related Videos

13.6K Views

الكميات التعبير البروتين والتعاون التعريب عن طريق تعدد المناعية النسيجية تلطيخ والمتعددة الأطياف التصوير

08:40

الكميات التعبير البروتين والتعاون التعريب عن طريق تعدد المناعية النسيجية تلطيخ والمتعددة الأطياف التصوير

Related Videos

13.4K Views

استغلال التصوير الحي إلى نويات المسار خلال ميوبلاست التمايز والانصهار

09:03

استغلال التصوير الحي إلى نويات المسار خلال ميوبلاست التمايز والانصهار

Related Videos

8.7K Views

رسم خرائط التنظيم المكاني الناشئ للخلايا الثديية باستخدام الأنماط الدقيقة والتصوير الكمي

09:56

رسم خرائط التنظيم المكاني الناشئ للخلايا الثديية باستخدام الأنماط الدقيقة والتصوير الكمي

Related Videos

7K Views

محلل البنية الفرعية: سير عمل سهل الاستخدام للاستكشاف السريع والتحليل الدقيق للأجسام الخلوية في صور المجهر الفلوري

14:28

محلل البنية الفرعية: سير عمل سهل الاستخدام للاستكشاف السريع والتحليل الدقيق للأجسام الخلوية في صور المجهر الفلوري

Related Videos

8.4K Views

عالية المحتوى فحص التمايز وتحليل النضج من الجنين والكبار الخلايا الجذعية العصبية المشتقة من ثقافات الخلايا السليفة Oligodendrocyte

09:36

عالية المحتوى فحص التمايز وتحليل النضج من الجنين والكبار الخلايا الجذعية العصبية المشتقة من ثقافات الخلايا السليفة Oligodendrocyte

Related Videos

3.3K Views

التصوير والتحليل الآليان لتحديد كمية الماكروبينوسومات الموسومة بالفلورسنت

11:01

التصوير والتحليل الآليان لتحديد كمية الماكروبينوسومات الموسومة بالفلورسنت

Related Videos

3.4K Views

خط أنابيب متعدد الاستخدامات لتحليل التغيرات الديناميكية في الأجسام النووية في مجموعة متنوعة من أنواع الخلايا

06:33

خط أنابيب متعدد الاستخدامات لتحليل التغيرات الديناميكية في الأجسام النووية في مجموعة متنوعة من أنواع الخلايا

Related Videos

917 Views

SCAnED - ماكرو تجزئة الجلد مفتوح المصدر للكشف شبه الآلي عن الخلايا والنوى في مقصورات البشرة والجلد

06:34

SCAnED - ماكرو تجزئة الجلد مفتوح المصدر للكشف شبه الآلي عن الخلايا والنوى في مقصورات البشرة والجلد

Related Videos

591 Views

تحليل بيانات الفحص المجهري متعدد الأبعاد باستخدام Cell-ACDC

06:17

تحليل بيانات الفحص المجهري متعدد الأبعاد باستخدام Cell-ACDC

Related Videos

558 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code