本方案概述了一种使用连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)的常规方法,SBF-SEM是一种强大的三维成像技术。SBF-SEM的成功应用依赖于适当的固定和组织染色技术,以及对成像参数的仔细设置。本方案涵盖了该过程各个阶段的实用注意事项。
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本方案概述了一种使用连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)的常规方法,SBF-SEM是一种强大的三维成像技术。SBF-SEM的成功应用依赖于适当的固定和组织染色技术,以及对成像参数的仔细设置。本方案涵盖了该过程各个阶段的实用注意事项。
连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)能够采集数百至数千张连续对齐的超微结构图像,为组织微解剖结构提供前所未有的三维视图。尽管近年来SBF-SEM的应用呈指数级增长,但适当的技术细节,如组织样本的制备和成像参数的选择,对该成像技术的成功至关重要。该成像系统具有高度自动化的特点,允许在无人值守的情况下运行显微镜,单日内即可自动采集数百张图像。然而,若组织制备不当,细胞超微结构可能发生改变,从而导致错误或误导性的结论。此外,图像通过扫描树脂包埋生物样本的块面生成,这一过程常带来需要特别考虑的技术挑战。成像过程中电子在样本块内积聚,即所谓的“组织充电”现象,可能导致对比度下降,难以清晰分辨细胞结构。同时,虽然提高电子束强度/电压或降低扫描速度可提升图像分辨率,但这也可能带来不利的副作用,例如损伤树脂块并导致后续图像失真。本文介绍了一种常规的生物组织样本制备方案,旨在保持细胞超微结构完整性并减少组织充电效应。同时,我们还提供了成像参数设置建议,以实现高质量连续图像的快速获取,并最大限度减少对组织块的损伤。
连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)最早由Leighton于1981年提出,其设计是在扫描电子显微镜上加装内置的超薄切片机,能够对包埋在树脂中的组织进行连续切片并成像。然而,由于技术限制,该方法最初仅适用于导电样品,因为非导电样品(如生物组织)会积累严重的电荷(即电子在组织样品内部积聚)1。虽然在每次切片后对块面进行蒸发碳镀膜可减少组织充电,但这显著延长了成像采集时间,同时图像存储也存在问题,因为当时的计算机技术无法有效处理设备生成的大量数据文件。2004年,Denk和Horstmann重新采用SBF-SEM技术,并使用配备可变压力腔室的设备进行改进2。该方法允许向成像腔室内引入水蒸气,从而减少样品内部的电荷积累,使非导电样品的成像成为可能,但图像分辨率有所下降。随着样品制备和成像方法的进一步优化,目前可在高真空条件下进行成像,SBF-SEM已不再依赖水蒸气来消除电荷积累3,4,5,6,7,8,9。尽管近年来SBF-SEM的应用呈指数级增长,但正确的组织样品制备和成像参数设置对于该成像技术的成功实施至关重要。
SBF-SEM 可实现自动采集数千张连续对齐的电子显微图像,平面分辨率可小至 3–5 nm10,11。将用重金属浸渍并包埋在树脂中的组织置于配备有金刚石刀的超薄切片机的扫描电子显微镜(SEM)中。使用金刚石刀切出一个平整表面后,将刀片回缩,再用电子束以光栅扫描方式对样品块表面进行扫描,从而获得组织超微结构的图像。随后,样品块在 z 轴方向上精确抬升一定距离(例如 100 nm),这一过程称为 "z-step",然后切出新的表面,再重复上述过程。通过这种方式,在组织被逐步切去的过程中生成一个三维(3D)图像块。该成像系统还受益于设备的自动化特性,可在无人值守的情况下运行,单日内即可自动采集数百张图像。
虽然SBF-SEM成像主要利用背散射电子来形成样品块表面的图像,但在成像过程中也会产生二次电子12。二次电子会与未能逸出样品块的背散射电子和入射电子束电子一起积聚,导致“组织充电”"",从而在样品块表面形成局部静电场。这种电子积聚可能扭曲图像,或导致电子从样品块中被弹出,并被背散射探测器收集而成为信号的一部分,从而降低信噪比13。尽管通过降低电子束电压或强度,或缩短电子束停留时间,可以减轻组织充电程度,但这会导致信噪比下降14。当使用较低电压或强度的电子束,或电子束在每个像素区域停留的时间较短时,从组织中弹出并被电子探测器捕获的背散射电子数量减少,从而导致信号减弱。Denk和Horstmann通过向腔室内引入水蒸气来解决这一问题,从而减少腔室及样品块表面的电荷积累,但代价是图像分辨率降低。当腔室压力为10–100 Pa时,部分电子束会发生散射,增加图像噪声并导致分辨率下降;然而,这也会在样品腔室内产生离子,中和样品块内的电荷2。近年来中和样品块内电荷的方法包括在成像过程中对样品块表面进行局部氮气喷射,或对SBF-SEM载物台施加负电压,以降低探针束着陆能量并提高信号采集效率6,7,15。除了采用载物台偏压、提高腔室压力或局部注入氮气以减少样品块表面电荷积聚外,还可以通过在树脂混合物中添加碳来提高树脂的导电性,从而允许采用更激进的成像参数设置16。以下通用实验方案改编自Deerinck等人于2010年发表的方案,涵盖了我们在组织制备和成像方法方面的改进,这些改进有助于在保持高分辨率图像采集的同时最大限度地减少组织充电现象3,17,18,19。先前的方案主要关注组织处理和重金属浸润步骤,而本方案则重点介绍SBF-SEM研究中固有的成像、数据分析和三维重建工作流程。在我们的实验室中,该方案已成功且可重复地应用于多种组织类型,包括角膜及眼前段结构、眼睑、泪腺和哈德氏腺、视网膜和视神经、心脏、肺和气道、肾脏、肝脏、提睾肌以及大脑皮层/髓质,并适用于多种物种,包括小鼠、大鼠、兔、豚鼠、鱼类、单层和复层细胞培养物、猪、非人灵长类动物以及人类20,21,22,23。尽管针对特定组织和应用可能需要进行微小调整,但该通用方案在我们核心成像设施的应用中已被证明具有高度可重复性和实用性。
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所有动物的处理均遵循《视力与眼科研究协会关于在视力与眼科研究中使用动物的声明》以及休斯顿大学视光学院动物处理指南中所述的规定。所有动物实验程序均已获得相应机构的批准:小鼠、大鼠、兔、豚鼠和非人灵长类动物的实验程序已获休斯顿大学动物护理与使用委员会批准,斑马鱼实验程序已获德堡大学动物护理与使用委员会批准,猪的实验程序已获贝勒医学院动物护理与使用委员会批准。所有人体组织的处理均遵循《赫尔辛基宣言》关于人体组织研究的规定,并已获得相应的机构审查委员会批准。
1. 组织处理
2. 区块制备
注意:该方法取决于样本在包埋块中的方向以及切片的方式。然而,最常见的组织定向方式是将组织置于树脂包埋块尖端的中心位置,并与树脂包埋块的长轴方向垂直。
3. 成像切面的扫描电镜设置
注意:以下成像设置基于作者所用设备生成,该设备列于提供的材料表中。尽管该设备支持可变压力成像,但在高真空条件下获得的结果最佳。
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小鼠角膜
该方案已广泛应用于小鼠角膜研究。通过使用SBF-SEM成像,发现成年小鼠角膜内存在一种无弹性蛋白的微原纤维束网络(EFMBs)。此前人们认为这种网络仅存在于胚胎期和出生后早期发育阶段。SBF-SEM揭示了在整个角膜中广泛分布的EFMB网络,横截面测量显示单根纤维直径为100–200 nm。此外,该EFMB网络呈分层结构排列,纤维与角膜细胞(keratocytes)密切相关,甚至位于角膜细胞表面的浅凹陷内(图5)。成年角膜中EFMB纤维的发现,进一步推动了免疫胶体金标记透射电子显微镜(TEM)、荧光及共聚焦显微技术的研究,以深入理解该网络的性质23。
进一步应用该方案后,发现了一类此前未知的中央角膜神经群体,这类神经在基质-上皮交界处与基底上皮细胞发生细胞融合(图6)。此前人们认为,在此交界处与上皮相互作用的所有神经均会穿透进入角膜上皮层,并发生分支,形成基底下神经丛...
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本文方法学论文的目的是重点介绍使我们实验室能够稳定获取高分辨率连续电子显微镜图像的组织制备与成像技术,并指出实现该结果的关键步骤以及在进行SBF-SEM成像过程中可能出现的潜在问题。成功应用本实验方案需要对组织进行适当的固定、将重金属充分渗透入样品、对包埋树脂进行改良以减少电荷积聚,以及充分理解所用显微镜及其成像参数设置。常言道, "质量输入,质量输出" 是进行SBF-SEM成像的合适原则。由于SBF-SEM的目标通常是观察或量化超微结构细节,因此必须格外重视固定策略,以确保组织不发生形变。若在样品制备过程中的任何阶段出现组织形变(例如发生肿胀、收缩或细胞形态破坏),则组织重建与定量分析将无法获得准确数据。此外,若使用不正确的成像参数,可能导致数据丢失,而由于SBF-SEM成像具有破坏性,丢失的数据无法重新获取。同时,在装载组织样品时也需格外小心,因为操作不当或样品制备仓促可能损伤精密的金刚石刀刃,导致刀刃出现缺口或断裂,进而在图像中留下明显的划痕痕迹图10C金刚石刀也可能因钙化结构、硬质颗粒或意外嵌入的玻璃(例如来自试剂安瓿瓶的玻璃)而受损。
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作者无任何利益冲突需要披露。
我们感谢 Sam Hanlon 博士、Evelyn Brown 和 Margaret Gondo 提供出色的技术支持。本研究部分由美国国立卫生研究院(NIH)R01 EY-018239 和 P30 EY007551(国家眼科研究所)、部分由 Lions 视力基金会、部分由 NIH 1R15 HD084262-01(国家儿童健康与人类发展研究所)资助。 & 人类发展)
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 1/16 x 3/8 铝制铆钉 | Industrial Rivet & Fastener Co. | 6N37RFLAP/1100 | 用作样品针。 |
| 2.5 mm 平头螺丝刀 | Wiha Quality Tools | 27225 | |
| 丙酮 | Electron Microscopy Sciences | RT 10000 | 用于稀释导电银漆。 |
| 天冬氨酸 | Sigma-Aldrich | A8949 | |
| 氯化钙 | FisherScientific | C79-500 | |
| 导电银漆 | Ted Pella | 16062 | |
| 配备标准金箔靶材的 Denton Desk-II 真空溅射仪 | Denton Vacuum | N/A | 这是作者使用的喷金设备,其他替代设备也可接受。 |
| 双刃剃刀片 | Fisher Scientific | 50-949-411 | |
| Embed 812 包埋剂 | Electron Microscopy Sciences | 14120 | |
| 安装在 Tescan Mira3 场发射扫描电镜中的 Gatan 3View2 系统 | Gatan & Tescan | N/A | 这是作者使用的 SBF-SEM 设备,其他替代设备也可接受。 |
| 玻璃壳小瓶,0.5 dram(1.8 ml) | Electron Microscopy Sciences | 72630-05 | |
| 戊二醛 | Electron Microscopy Sciences | 16320 | |
| 强力胶(Gorilla Super Glue - Impact Tough) | NA | NA | 文中称为氰基丙烯酸酯胶。 |
| Ketjen Black | HM Royal | EC-600JD | 文中称为炭黑。 |
| KOH | FisherScientific | 18-605-593 | |
| 硝酸铅 | Fisher Scientific | L62-100 | |
| 微波炉 | Pelco | BioWave Pro | 这是作者使用的微波设备,其他替代设备也可接受。 |
| 四氧化锇 | Sigma-Aldrich | 201030 | |
| 亚铁氰化钾 | Sigma-Aldrich | P9387 | |
| 硅胶包埋模具 | Ted Pella | 10504 | |
| 二甲胂酸钠三水合物 | Electron Microscopy Sciences | 12300 | |
| Samco 移液管 | ThermoFisher Scientific | 202 | 用于制作样品针储存管。 |
| 瑞士式针锉 | Electron Microscopy Sciences | 62115 | |
| 硫代碳酰肼 | Sigma-Aldrich | 223220 | |
| 醋酸铀酰 | Polysciences, Inc. | 21447-25 | |
| 重建软件 | |||
| Amira 软件 | Thermo Scientific | N/A | 用于生成图 5–7 和图 9 中的重建图像。 |
| Fiji(Fiji 即 ImageJ) | ImageJ.net | N/A | 可向 Fiji 添加 TrakEM2 插件以辅助手动分割。 |
| 显微图像浏览器(MIB) | 赫尔辛基大学生物技术研究所 | N/A | |
| Reconstruct 软件 | Neural Systems Lab | N/A | |
| SuRVoS Workbench | Diamond Light Source & 诺丁汉大学 | N/A | |
| SyGlass | IstoVisio, Inc. | N/A | 支持在虚拟现实中进行重建以及基于直方图的重建方法。 |
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