微球 PCR 使用与其表面的寡核苷酸偶联的微小球体,从而能够优先扩增单链 DNA。
要开始微球 PCR,取包含模板单链 DNA 链、带有附加核苷酸标签的正向引物、热稳定 DNA 聚合酶、dNTP 和显示单链寡核苷酸探针的微球的反应混合物。
将试管放入热循环仪中,并在定义的条件下运行。
在第一个循环中,在退火温度下,模板 DNA 与微球表面的探针结合,使模板 DNA 起到正义链的作用。在延伸过程中,聚合酶延伸 DNA,双链体保持附着在微球上。
在下一个循环中,在变性过程中,模板 DNA 与微球分离,留下探针链与表面结合——作为新链的模板。
在退火过程中,标记的引物与反义链结合。随后,聚合酶将其延伸以合成带有核苷酸标签的正义链。
重复该循环数次,生成多个正义单链 DNA 拷贝,这些 DNA 进入溶液中,同时双链污染物保持附着。
将 PCR 产物转移到含有上样缓冲液的试管中。将产品和标记物上样到凝胶的不同孔中,并使用琼脂糖凝胶电泳进行分离。
模板 DNA 形成一个微弱的低分子量条带,而一个强烈的高分子量条带证实了单链 DNA 扩增。