Uso del ensayo de escisión bajo objetivos y etiquetado (CUT&Tag) en la investigación de mioblastos de ratón

La investigación de nuestro grupo se centra en cómo se regula y mantiene la estructura del genoma y la transcripción en las células madre adultas del músculo esquelético, particularmente durante los cambios de sulfato, como el compromiso, la diferenciación y la tinasis de las células madre. Las células madre del músculo esquelético adulto, que comprenden solo el 1% de las células mononucleadas en el tejido muscular, presentan un desafío para los estudios de características de la cromatina que utilizan High-C, ChIPs y ATAC seq, debido a su escasez en suspensiones unicelulares obtenidas de la digestión muscular. La inmunoprecipitación de cromatina, ChIP, ha sido una herramienta clave para perfilar las características del genoma.

Una técnica de corte y etiquetado más simple y eficiente, desarrollada por el Dr. Steven Henikoff, a menudo supera a ChIP, especialmente en el estudio de la epigenética en poblaciones de células raras. Su facilidad de uso amplía la accesibilidad para los investigadores, incluidos los no expertos en epigenética.