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Une interface utilisateur graphique pour le suivi assisté par logiciel de la concentration de pro...
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JoVE Journal Biology
A Graphical User Interface for Software-assisted Tracking of Protein Concentration in Dynamic Cellular Protrusions

Une interface utilisateur graphique pour le suivi assisté par logiciel de la concentration de protéines dans les protrusions cellulaires dynamiques

Full Text
7,776 Views
08:12 min
July 11, 2017

DOI: 10.3791/55653-v

Tanumoy Saha1, Isabel Rathmann1, Milos Galic1

1DFG Cluster of Excellence 'Cells in Motion', (EXC 1003), Institute of Medical Physics and Biophysics,University of Muenster

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Nous présentons une solution logicielle pour le suivi semi automatisé de la concentration relative de protéines sur toute la longueur des protrusions cellulaires dynamiques.

L’objectif global de ce logiciel d’analyse d’images est l’analyse parallèle de la dynamique de protrusion et de la concentration relative en protéines sur toute la longueur du filopodial. Cette méthode peut vraiment nous aider à comprendre des questions clés en biologie cellulaire, en particulier les protéines individuelles impliquées dans l’extension et la rétraction des filopodes. Le principal avantage de la technique est que l’algorithme de suivi de forme adaptatif fourni permet une évaluation quantitative de la dynamique de la saillie et la localisation des protéines résolue dans l’espace.

Pour commencer, cultivez des neurones, des cellules HeLa ou COS, dans un milieu supplémenté comme détaillé dans le protocole de texte. Une fois que la confluence de 40 % est atteinte, transvectez les cellules avec les constructions de votre choix, à l’aide d’un réactif de transvection selon les instructions du fabricant. Conservez les cellules transvectées dans un incubateur à 37 degrés Celsius et 5 % de CO2 pendant 15 à 18 heures.

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