Configuration rapide de l’imagerie des microréseaux de tissus et des zones en mosaïque sur le microscope d’imagerie à faisceau d’ions multiplexé à l’aide de l’interface Tile/SED/Array
September 15th, 2023
L’imagerie par faisceau d’ions multiplexés (MIBI) est souvent utilisée pour imager des microréseaux de tissus et des zones de tissus contiguës en mosaïques, mais les logiciels actuels pour mettre en place ces expériences sont lourds. L’interface tile/SED/array est un outil graphique intuitif et interactif développé pour simplifier et accélérer considérablement la configuration de l’exécution MIBI.
L’imagerie par faisceau d’ions multiplexés, ou MIBI, est une technique permettant d’imager l’expression des protéines dans les tissus histologiques sur des dizaines de protéines simultanément. À l’aide de MIBI, les chercheurs peuvent identifier, localiser et caractériser les cellules dans leurs environnements tissulaires natifs. L’un des principaux goulets d’étranglement dans le fonctionnement de l’instrument MIBI est la configuration des champs de vision pour l’imagerie.
Les FOV sont de 200 x 200 microns à 800 x 800 microns sur la lame, que les utilisateurs positionnent pour couvrir les régions tissulaires d’intérêt. Le positionnement des champs de vision pour de grandes zones contiguës de tissus et de grandes puces à tissus est difficile à utiliser à l’aide de l’interface du fabricant. Nous avons développé l’interface tuile/SED/matrice pour aider les utilisateurs à positionner rapidement un grand nombre de FOV à l’aide d’une interface graphique intuitive et interactive.
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Aperçu
Cette étude aborde le défi de la configuration des champs de vue d'imagerie (FOV) en imagerie par faisceau d'ions multiplexé (MIBI) pour les réseaux de tissus et les zones de tissus contigus. La recherche présente un outil graphique intuitif appelé interface de réseau SED en tuiles, qui simplifie et accélère considérablement le processus de configuration des exécutions MIBI.
Composants clés de l'étude
Domaine de recherche
- Imagerie par faisceau d'ions multiplexé (MIBI)
- Réseaux de tissus
- Optimisation de la configuration d'imagerie
Contexte
- Comprendre l'expression des protéines dans les tissus histologiques
- Besoin d'un positionnement efficace des FOV pour l'imagerie
- Défis avec les interfaces existantes pour MIBI
Méthodes utilisées
- Développement de l'interface de réseau SED en tuiles (TSAI)
- Interface utilisateur graphique pour le positionnement des FOV
- Outils web pour la co-enregistrement et la manipulation d'images
Résultats principaux
- Efficacité améliorée dans la configuration des FOV pour l'imagerie des tissus
- Réduction des erreurs utilisateurs lors de l'acquisition d'images
- Visualisation améliorée des tissus histologiques
Conclusions
- L'étude démontre une nouvelle approche pour optimiser la configuration des exécutions MIBI
- Elle souligne l'importance d'outils intuitifs pour faire progresser la recherche en imagerie biologique
