Høyoppløselig kartlegging av protein-DNA interaksjoner i mus stamcelle-avledede nevroner ved hjelp av kromatin immunoprecipitation-exonuclease (ChIP-Exo)

Nøyaktig bestemmelse av proteinbindende steder på tvers av genomet er viktig for å forstå genregulering. Her beskriver vi en genomisk kartleggingsmetode som behandler kromatin-immunoprecipitated DNA med exonuclease fordøyelse (ChIP-exo) etterfulgt av høy gjennomstrømning sekvensering. Denne metoden oppdager protein-DNA-interaksjoner med nær base-pair kartløsning og høyt signal-til-støy-forhold i pattedyrnevroner.